布魯克：利用CCS檢測和深度學習研究4D蛋白質組學
近日，Matthias Mann教授團隊和Fabian Theis教授組*共同在《Nature Communication》上發表開創性成果，標題為“Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from a million experiment alvalues”。（doi.org/10.1038/s41467-021-21352-8）1。 * Matthias Mann教授在德國馬克斯·普朗克生物化學研究所和丹麥哥本哈根大學Novo-Nordisk基金會蛋白質研究中心擔任雙重職務。Fabian Theis教授在慕尼黑亥姆霍茲中心的德國環境衛生研究中心和德國慕尼黑大學數學系擔任雙重職務。 研究亮點 * 在timsTOF Pro系統上，通過捕集離子淌度（TIMS）和平行累積連續碎裂（PASEF）技術，獲得了5種生物體蛋白質組全裂......閱讀全文
離子淌度
在外電場作用下，溶液中的正離子向陰極遷移，負離子向陽極遷移。離子在電場中遷移速度，除了與離子本性(離子半徑和電荷等)和溶劑性質有關外，還與電位梯度有關。因此，它們的關系可表達為：地電化學成暈機制、方法技術及找礦研究式中：u+(u-)——離子遷移速度；——電位梯度；υ+(υ-)——比例常數，稱為離子淌
什么是離子淌度
又稱離子遷移率。某種離子在一定的溶劑中，當電位梯度為每米1伏特時的遷移速率稱為此種離子的淌度，單位是米2?秒-1?伏特-1。離子淌度是代表離子遷移速率特征的物理量。
朱正江：基于離子淌度質譜的非靶向代謝組學研究
分析測試百科網訊 2020年9月14日，由中國質譜學會（中國物理學會質譜分會）主辦，分析測試百科網和中國質譜學會網承辦的2020年中國質譜學會質譜網絡研討會（2020 CMSS）正式開幕。本屆質譜網絡研討會正值中國質譜學會成立40周年，按報告內容涉及領域包括生命科學與組學、藥物藥理毒理分析、元素
影響離子淌度大小的原因
溶液的電導率κ與溶液中各種離子的濃度ci（摩爾/升）、離子的價數Zi
捕集離子淌度質譜帶來磷酸化蛋白質組研究新的深度
Yasushi Ishihama 教授 京都大學分子與細胞生物分析實驗室 2021年1月發表于www.ddw-online.com 目前，在蛋白質生物化學和蛋白質組學相關研究中，質譜（MS）已廣泛應用于鑒定和表征蛋白質。且隨著技術的不斷發展，質譜已經實現了更高的覆蓋深度、更快的分析速度和更
布魯克推出基于timsTOF Pro的突破性diaPASEF工作流程
分析測試百科網訊 2019年9月16日 在第18屆人類蛋白質組組織世界大會上（HUPO 2019），布魯克發布了全新diaPASEF工作流程，這是一種基于timsTOF Pro質譜平臺的新型數據非依賴性采集（DIA）方法。擁有捕集離子淌度（TIMS）和平行累積連續碎裂（PASEF）技術的tims
探索蛋白質組學的“第四維度”分析
就在幾年前，蛋白質組學研究人員成功在單個或少量樣本中識別出蛋白質、肽段和蛋白質的翻譯修飾。十年過去了，這個領域已經發生了翻天覆地的變化。 如今，科學家們希望對蛋白質進行更大范圍的分析，使樣本數量從數百個擴展到數千個。然而，考慮到蛋白質組學在個性化醫學和生物標志物檢測領域的應用，這種分析必須具有
布魯克攜手timsTOF Pro、PASEF推動蛋白質組學高精度分析
分析測試百科網訊 2018年11月15日，第十屆中國蛋白質組學大會（CNHUPO）在廣州召開。布魯克攜捕獲型離子淌度質譜timsTOF Pro、超高分辨磁共振質譜scimaX等眾多明星產品參加了本次盛會。會后，分析測試百科網訊采訪到了布魯克董事總經理兼執行副總裁Dr. Rohan Thakur，
應用四極桿離子淌度飛行時間質譜進行蛋白質組學分析二
在該實驗中，每次調查掃描執行15次并行MS/MS實驗。如圖3所示，結果表明將DDA與HD-DDA對比時，MS/MS總離子流（TIC）的增加與MS/MS通道數呈函數關系。每次運行的平均增加量為420%，與圖2中所示結果一致。插圖是15次MS/MS通道的示例，證明了可從樣品中存在的較低豐度的肽中輕松獲取
應用四極桿離子淌度飛行時間質譜進行蛋白質組學分析一
1沃特世公司 （英國曼徹斯特）?2慕尼黑理工大學 （德國弗賴辛）應用優勢 ? ■ 改善蛋白質識別，增加蛋白質組覆蓋范圍? ■ 即使在極低濃度下也能實現可靠鑒定? ■ 更有效地進行LC/MS/MS分析從而加快決策過程簡介隨著自下而上（bottom-up）蛋白質組學分析的復雜性不斷增加，對于質譜儀的能力
布魯克：利用CCS檢測和深度學習研究4D-蛋白質組學
近日，Matthias Mann教授團隊和Fabian Theis教授組*共同在《Nature Communication》上發表開創性成果，標題為“Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from
如何打開waters離子淌度譜圖
如何打開waters離子質譜沒用過，液相是保存在一個文件夾里的，然后拷貝出來在另臺電腦上用工作站打開就行了。看你是用的什么工作站，waters和安捷倫的儀器軟件里都可以導出asciii數據的。液相，譜圖可以導出為bmp文件，也可以導出為txt文件再用其他軟件處理。
毛細管電泳儀淌度、絕對淌度和有效淌度
帶電粒子在直流電場作用下于一定介質（溶劑）中所發生的定向運動稱為電泳。單位電場下的電泳速度稱為淌度。在無限稀釋溶液中（稀溶液數據外推）測得的淌度稱為絕對淌度。 電場中帶電離子運動除了受到電場力的作用外，還會受到溶劑阻力的作用。一定時間后，兩種力的作用就會達到平衡，此時離子作勻速運動，電泳進入穩
電解質溶液離子淌度的概念
二電極間電位梯度為1V/cm時離子的移動速度，又稱離子絕對移動速度。離子淌度隨溶液濃度增大而減小，隨溫度升高而增大。電解質的離子淌度越大，其當量電導也越大。
離子淌度質譜儀器的技術特點等介紹
技術特點：Waters是第一個將淌度技術商品化的公司，無論是在硬件還是在軟件，在使用淌度技術方面都積累了豐富的經驗，同時，Waters的客戶也使用淌度技術發表了大量的文章。近年來，Waters新推出的帶離子淌度的高分辨質譜Vion IMS QTof，可以說是淌度質譜里程碑式的產品，它將復雜的淌度
更快更靈敏的timsTOF Pro：為蛋白質組學而生
分析測試百科網訊，今年9月國際人類蛋白質組學大會（HUPO）上，布魯克公司發布timsTOF Pro捕集離子淌度飛行時間質譜，該產品獲得了由分析測試百科網組織評選的2017 ANTOP大獎，獎項名稱為“蛋白質組學創新質譜技術獎” 。BCEIA展會上，分析測試百科網編輯采訪到布魯克道爾頓中國區高級
timsTOF Pro和PASEF一雙慧眼 探究更多組學奧秘
離子淌度技術發展幾十年，布魯克這個致力于挑戰極限的公司，2016年一出手就推出業界最高淌度分辨的timsTOF質譜，在完成硬件的挑戰后，布魯克同德國馬普研究所的Matthias Mann合作PASEF技術，于去年HUPO推出了timsTOF Pro，在蛋白質組學領域刷新了“鳥槍”法鑒定的速度、靈
布魯克總裁專訪：科學大咖靈感加磅 timsTOF創新廣泛開花
分析測試百科網訊 東方人的思維更偏向于實用主義，比如大家常認為創新來自于應用驅動；世界上還有一種創新首先來自于技術或理論的突破，然后再去尋找應用的方向，布魯克的timsTOF便是后者。2016年發布Trapped Ion Mobility捕集離子淌度質譜后，引起了組學和臨床領域科學大咖們的廣泛興
timsTOF Pro最新4D高通量超高靈敏度蛋白組學研究技術
分析測試百科網訊 近日在第15屆美國人類蛋白質組學年會上，布魯克宣布了Evosep One低流速色譜與timsTOF Pro液質聯用系統在高靈敏度、高通量血漿蛋白質組學方面取得的進展。布魯克還重點介紹了PEAKS，Protein Metrics和MaxQuant 4D蛋白質組學軟件的進展，這些軟
離子淌度技術不同領域新應用，等你來pick
離子淌度技術作為一種質譜技術，“提供多一維的分離，提高峰容量”、“選擇性好”、“分離結構類似物或同分異構體”、“碰撞橫截面積CCS”等都成為IMS技術的標簽，被越來越多的科學家運用到不同的科學研究領域，如制藥、組學研究和臨床前研究、食品環境、化工領域等，都開始逐漸體現出它無可比擬的價值。 為了
布魯克亮相 ASMS 2020 引領 MALDI 和 4D-蛋白質組學技術發展
?全新MALDI-2離子源大幅提高小分子檢測靈敏度；CCS值加持讓4D-蛋白質組學技術更加強大MALDI-2離子源將小分子分析靈敏度提升1-2個數量級新的prm-PASEF方法增強4D-蛋白質組學分析大規模高精度CCS值測量用于機器深度學習短梯度dia-PASEF方法進一步提高4D-蛋白質組學通
布魯克PASEF技術榮膺EuPA 2019最佳技術獎
分析測試百科網訊 近日，在德國波茲坦舉辦的PROTEOMIC FORUM 2019 上，布魯克在EupPA2019上發布timsTOF Pro 最新功能。布魯克PASEF技術因其在蛋白組學研究技術上的杰出表現，榮膺EuPA最佳技術獎。 ·最新的DIA-PASEF技術具有出色的肽和蛋白質定量分析
烏得勒支大學和布魯克合作開發4D結構蛋白組學方法
Albert Heck 和Richard Scheltema團隊與布魯克共同推進PhoX交聯劑和TIMS/PASEF技術聯合增強交聯質譜（XL-MS）研究 近日，布魯克宣布與烏得勒支大學合作，共同推進質譜在蛋白質3D結構與相互作用方面的研究工作。在蛋白質組學、用質譜研究蛋白質結構和相互作用方面，合
布魯克和Radboudumc TML成立轉化組學聯合卓越中心
分析測試百科網訊 2019年4月16日，在荷蘭X-omics計劃的開幕活動中，布魯克和拉德堡德大學醫學中心（UMC）轉化代謝實驗室（TML）宣布為轉化組學成立聯合卓越中心（CoE）。 在Alain van Gool教授的領導下，聯合卓越中心將專注于使用各種組學方法進行創新代謝分析的臨床轉化。該合
4D-蛋白質組學：如何通過軟件創新變得更強大？
在過去的二十年中，新技術、新方法的重大進步使蛋白質組學成為蛋白質科學家、生物學家和臨床研究人員的一個極其強大的工具1。隨著分析儀器的不斷發展，蛋白質組學研究的每一項技術進步都會產生更多的數據。與此同時也給生物信息學軟件的開發帶來了新挑戰。 當代基于高通量質譜的蛋白質組學方法使人們對生命過程獲得
通過軟件創新打造更強大的4D-蛋白質組學技術
在過去的二十年中，新技術、新方法的重大進步使蛋白質組學成為蛋白質科學家、生物學家和臨床研究人員的一個極其強大的工具1。隨著分析儀器的不斷發展，蛋白質組學研究的每一項技術進步都會產生更多的數據。與此同時也給生物信息學軟件的開發帶來了新挑戰。 當代基于高通量質譜的蛋白質組學方法使人們對生命過程獲得
布魯克推出全新timsTOF? Pro捕集離子淌度質譜
分析測試百科網訊 在近日召開的第十六屆人類蛋白質組學年度世界大會（HUPO）上，布魯克推出了基于平行累積連續碎裂（Parallel Accumulation Serial Fragmentation，PASEF）技術的timsTOF Pro質譜系統。憑借其專有的捕集離子淌度質譜（TIMS）技術，
布魯克發布timsTOF fleX? 為空間定位組學配置ESI/MALDI雙源
——timsTOF Pro?系統進一步增強用于4D蛋白質組學的MBR-ddaPASEF和diaPASEF性能——timsTOF Pro超高靈敏度的4D蛋白質組學和4D脂質組學性能推進單細胞生物學研究——在ASMS 2019上還發布了用于4D蛋白質組學的新消耗品、軟件合作伙伴及軟件產品 分析測試百科
重磅！布魯克宣布收購IP2蛋白質組學軟件
2020年9月30日，布魯克對外宣布最近收購了IP2（Integrated Proteomics Pipeline）搜索引擎和蛋白質組學工作流程軟件平臺。IP2搜索引擎由美國Scripps研究所John Yates III教授與Robin Park、Tao Xu博士共同創立Integrated
蛋白質組與蛋白質組學簡介-2
3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合，然后將DNA從被修飾的堿基處切割，電泳分離，結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾，不能切斷，可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白