單細胞的可靠全基因組擴增
目前多種新型分析技術,如新一代測序和芯片,都是為細胞群體而設計的,需要一定的樣本量。對于一些臨床或法醫樣本,如腫瘤細胞或循環胎兒細胞等,它們的細胞數量有限,直接限制了其下游應用。例如,在分析腫瘤細胞中的體細胞DNA突變或單個細菌基因組時,單細胞中的DNA無法滿足測序的mg級樣品量需求。為了從少量樣品中獲得更多信息,全基因組擴增技術(WGA)應運而生。全基因組擴增的目的是在沒有序列偏向性的前提下大幅增加DNA的總量。之前常用的技術有DOP-PCR和PEP-PCR等。然而,這些基于PCR的方法會產生非特異的擴增假象,影響實驗結果。為此,QIAGEN推出了全基因組擴增產品REPLI-g Single Cell Kit,讓研究人員在使用測序和芯片平臺時能獲得值得信賴的結果。REPLI-g Single Cell Kit能夠從單細胞(如分離的腫瘤細胞或細菌)中獲得高產量的擴增DNA。它可用在廣泛的應用中,使用各種臨床和非臨床研究樣品,包括......閱讀全文
Nature發布單細胞基因組學新技術
胚胎是如何形成我們肺臟、肌肉、神經和其他組織中的細胞的?一種新的方法可以解碼使得胚胎萬能細胞能夠增殖并轉變為機體許多特化細胞類型的遺傳指令。 一開始是一團相同的細胞,隨著增殖不斷地改變形狀和功能,最終變為我們肺臟、肌肉、神經和機體所有其他特化組織中的細胞。胚胎擁有這種創造奇跡的能力。
單細胞基因組學:通往個體化醫療之門
隨著第二代測序技術的普及,單細胞測序迎來了迅猛發展。 近日,南方科技大學生物學系副教授賀建奎在美國冷泉港參加了單細胞分析會議后,在科學網博客里寫道:“這是一個非常令人激動的前沿學術會議,我深深地體會到了單細胞基因組學時代的來臨。” 他對《中國科學報》表示:“單細胞基因測序技術的突破,只是開了
Nature論述:單細胞基因組學揭開“免疫新世界”
人類對生命的好奇,從來沒有減退。一個多世紀以來,科學家們一直試圖解析構成我們機體的成千上萬億個細胞,從一米長的神經元到8微米寬的紅細胞。他們希望從中找到解析重要生理、病理過程,挖掘重要的細胞類型和信號通路。 但是,過去幾十年,包括熒光抗體標記技術、DNA和RNA測序技術等在內的研究工具卻不能解
Nature子刊發表單細胞基因組學重要進展
最近,一種用于RNA序列分析的新方法,可讓研究人員確定新的細胞亞型,從看似全然混亂的狀態創造出秩序。這項新技術發表在最新一期的Nature旗下子刊《Nature Biotechnology》,是由歐洲生物信息研究所歐洲分子生物學實驗室(EMBL-EBI)的科學家開發,標志著我們向單細胞基因組邁進
單細胞測序揭示肺癌腫瘤免疫細胞亞型的細胞圖譜
最近免疫療法的出現標志著多種癌癥的研究和護理發生了巨大變化,給世界各地的患者和家庭帶來了新的希望。對于那些對治療有反應的人來說,結果可能是激動人心的。激活病人的癌癥免疫系統可以殺死或縮小腫瘤,在某些情況下,會導致完全緩解。 盡管取得了重大進展,但只有少數人從免疫治療中獲益,原因尚不清楚。 免
Science:構建腫瘤浸潤T細胞的泛癌單細胞圖譜
靶向腫瘤特異性T細胞的癌癥免疫療法已使許多癌癥患者受益,但是針對不同類型的癌癥的臨床療效差異很大。腫瘤浸潤T細胞經常進入功能失調狀態,這一現象被廣泛稱為T細胞衰竭(T cell exhaustion),而效應T細胞的抗腫瘤功能受多種因素調節,包括調節性T細胞(Treg細胞)的存在。T細胞的狀態和
基于單細胞測序繪制腫瘤微環境相關細胞代謝圖譜
腫瘤作為一個異常復雜的“生態系統”,不同類型的腫瘤細胞與非腫瘤細胞共同構成了腫瘤微環境。腫瘤存在腫瘤間異質性和腫瘤內異質性,可以說腫瘤內每種細胞都存在于不同的微環境中,每種細胞都可能有不同的代謝狀態。由于異質性,腫瘤細胞會通過改變自身代謝模式(即“代謝重編程”)來適應不同的微環境,以滿足其對能量
人類胸腺單細胞圖譜助力腫瘤免疫治療
胸腺是T細胞的分化、發育和成熟的場所,是組成免疫系統的重要器官。到目前為止,還不清楚在整個生命過程中,人體胸腺中的早期免疫前體細胞如何發育為T細胞。盡管已通過各種動物模型對胸腺進行了廣泛的研究,但是還未有詳細的人類胸腺細胞圖譜得以報道。 由來自VIB炎癥研究中心(VIB Center for
腫瘤基因專家致力挖掘單細胞大數據潛能
近年來,隨著測序技術的迅猛發展,單細胞測序技術已逐漸走入人們視野。2013年,單細胞測序技術成為《自然》評選的“Method of the Year”。大多數的基于NGS的基因檢測,都是在大量細胞宏觀水平上,對整個細胞群進行遺傳分析。單細胞測序技術則是在單個細胞的水平上,對其遺傳物質進行檢測,從
PerkinElmer以0.28美元/股現金收購單細胞基因組學公司RHS
分析測試百科網訊 近日,據外媒報道,PerkinElmer同意支付約1980萬美元現金(每股0.28美元)收購澳大利亞細胞基因組學公司RHS Ltd,這項決議得到了RHS公司全體董事會的支持。 RHS董事長David Brookes說:“PKI提案受到了董事會的歡迎,作為獎勵股東忠誠度并在重要
新型基因組學工具ECCITE-seq擴展多模態單細胞分析
單細胞RNA測序是基因組研究的重要領域之一。其能夠幫助研究人員深入探索單細胞的特性,有效區分不同的細胞類型,并在單細胞水平下研究多種人類疾病的發病機制。隨著對復雜人體組織甚至整個生物體的研究進展,研究人員越來越認識到需要大規模并行技術及數據集才能更加深入地揭示微妙的細胞狀態。 近日,一種新型單
單細胞分離用于單細胞基因擴增
單細胞分離連接不同管徑大小的毛細玻璃針,可分離捕獲各種非貼壁狀態的單細胞和微粒等,如細菌、酵母、藻類細胞、植物花粉、原生動物單細胞、懸浮細胞、血液細胞、免疫細胞、卵細胞、各種懸液中單細胞及特殊標記的單細胞等。 單細胞分離用于各種類型的細胞分離培養、純化、檢測;獲得單克隆細胞;用于單細胞基因擴增,
Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序
2018年11月,Namocell與CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞,并且將其進行單細胞測序,為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序(scRNA-s
微流控芯片技術的肺癌循環腫瘤細胞檢測及單細胞分析
我國是肺癌高發國家,近十年肺癌的發病率分別占男性和女性惡性腫瘤的第一和第二位,并且發病年齡有下降的趨勢。肺癌的死亡率在惡性腫瘤中始終居于首位,根本原因是肺癌的高轉移能力。因為肺癌具有極強的侵襲性及轉移能力,大多數患者就診時已處于晚期(III期、IV期),失去最佳的治療機會。因此,提高肺癌檢出率、控制
CloneSelect?單細胞分離系統?OR?傳統單細胞克隆方法
CloneSelect??Single-Cell?Printer??f.sight??(?f.sight?)被開發用于滿足這些需求,?它可以柔和地接種單個細胞至微孔,同時記錄整個細胞接種過程,提供單克隆性的圖像證據以及優異的接種后細胞生長用于細胞株開發在這個研究中,我們開展了六組實驗,用無血清培養基
Namocell單細胞分離儀應用介紹——藻類單細胞分離
Namocell單細胞分離儀最新應用:隨著人們對環境研究的不斷深入,研究人員逐漸將目光轉向藻類的單細胞層面:有些需要對藻類進行單細胞級別的分析(如藻類單細胞測序等),也有需要對單細胞藻類進行培養。這樣就面臨一個棘手的問題,那就是如何獲取藻類的單個細胞。通常實驗室里的方式,是在顯微鏡下用毛細管吸取。這
單細胞凝膠電泳法檢測單細胞DNA損傷
單細胞凝膠電泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又稱慧星試驗(comet assay)是一項較新的電泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于檢驗DNA單鏈斷裂以來,經過不斷的改進,已成為一種快速、靈敏、簡便的檢測DNA損傷的方法,廣泛地應用
循環腫瘤細胞捕獲及單細胞分析樣機在大連研制成功
由大連醫科大學牽頭,與中國科學院深圳先進技術研究院等多家單位合作,在國家科技計劃支持下,歷經三年研發,成功構建了具有自主知識產權的循環腫瘤細胞(circulating tumor cell,CTC)捕獲及單細胞分析樣機,顯示出較好的應用前景。 CTC是存在于患者外周血中的各類腫瘤細胞的統稱,對
基因組學推進腫瘤研究未來發展
——訪億明達腫瘤業務營銷副總裁約翰·萊特 基因組學正在改變腫瘤研究,其最終目標是推進癌癥的診斷、治療、監控及最終的篩查方式。 癌癥通常按照形態進行分類,這指的是病理學家在顯微鏡下看到的內容。“如今,癌癥分類依據已經開始從形態特征轉變為更有效的治療方式,其中的主要轉變在很大程度上歸功于基因組研
單細胞是什么
單細胞既可以指單細胞生物,比如細菌等,也可以指從多細胞生命體分離的單個細胞,比如實驗室培養的人體細胞等。此外,受精卵也是單細胞,屬于可以發育成完整生命體的全能干細胞。
單細胞分離技術
單細胞測序日趨火爆的原因很大程度上得益于單細胞分離技術的不斷完善。這一講,我們將跟大家一起回顧傳統的單細胞分離技術,并重點介紹單細胞分離技術的新寵微孔芯片技術及微流控技術。圖1為目前常見單細胞分離設備。圖1:目前常見單細胞分離設備傳統單細胞分離技術相信許多實驗人員,都見過下面我們要介紹的傳統的單細胞
什么是單細胞
單細胞生物 生物可以根據構成的細胞數目分為單細胞生物(Protozoa)和多細胞生物(Metazoa)。單細胞生物只由單個細胞組成,個體微小,用肉眼很難看的見,大多數單細胞生物生活在水域環境中,有些寄生在我們身上。單細胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在適宜的環境下出芽繁殖)單細胞生物包括所有古細菌和真細菌和
單細胞分離對單細胞測序領域有著很大的幫助
單細胞分離可以采用特制的毛細管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來,然后移到合適的培養基進行培養,分離法對操作技術有比較高的要求,多限于高度專業化的科學研究中采用。 它不僅僅可以用于分離單細胞,還可以用于nl級別試劑的分配和磁珠的分選,對于單細胞測序領域有著很大的幫助。快速高效接種單個活細胞
Namocell單細胞分離儀在單細胞測序領域的應用
9月26至27日2019年細胞產業大會暨2019第四屆(上海)細胞與腫瘤醫療高峰論壇在上海新南雅酒店舉行。本屆會議,邀請了全國30位專家學者、人物演講、40家企業參展,400余人報名參會,逾500人參加了會議,就細胞儲存、細胞治療、細胞培養、細胞工程、細胞銀行、細胞能量與代謝、細胞免疫學、細胞生理學
單細胞研究指南:細胞分離
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過,近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們,每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制,即使是同類型細胞,基因表達也會出現差異。 那么,細胞之間的哪些差異有生物學意義,哪些差異來自于技術偏好呢?要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢?這
分選率95.2%—循環腫瘤細胞捕獲及單細胞分析樣機研制成功
由大連醫科大學牽頭,與中國科學院深圳先進技術研究院等多家單位合作,在國家科技計劃支持下,歷經三年研發,成功構建了具有自主知識產權的循環腫瘤細胞(circulating tumor cell,CTC)捕獲及單細胞分析樣機,顯示出較好的應用前景。 CTC是存在于患者外周血中的各類腫瘤細胞的統稱,
單細胞表觀組學:單細胞ChIP-seq解碼細胞命運決定機制
在國家重點研發計劃“干細胞及轉化”重點專項(批準號:2017YFA0103402)等資助下,北京大學分子醫學研究所、北大-清華生命科學聯合中心何愛彬課題組近期突破單細胞表觀遺傳研究的瓶頸,開發了兩種具有普適性、操作簡單、風格迥異的單細胞ChIP-seq技術,可適應于不同課題研究需要,解析發育與疾
單細胞分析揭示癌癥異質性
2013年度基因組生物學大會(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美國紐約冷泉港實驗室召開。這是基因組學領域最大的會議之一,吸引了多個著名研究所的大牛參加。會議主題包括高通量基因組學和遺傳學、復雜性狀的遺傳學、功能和癌癥基因組學、計算基因組學、進化基因組學以
單細胞分離儀在單細胞測序領域有著很大的幫助
???單細胞分離儀可以實現從微孔芯片轉移單細胞到細胞收集管中。單細胞轉移分離系統集單細胞成像,單細胞隔離,單細胞選擇功能于一體,自動聚焦成像。? ? 轉移單細胞到微管,PCR微孔板或其它反應微管中,在隔離單細胞后,它可以對選定收集的細胞進行掃描并成像,采用倒置熒光顯微鏡,配備自動掃描顯微鏡載物臺,自
單細胞分離技術應用于眾多領域的單細胞分析
單細胞分離目前主要有三種選擇:手動分離、熒光激活細胞分選和微流體技術。當然,除了成熟的方法,巧妙的新方法也在不斷涌現,能以更高的準確性和特異性來分離單細胞。 將細胞分散到懸液中,會失去它們在組織里的位置信息。如果想了解單細胞所處的環境,就需要用到激光捕獲顯微切割技術,這種技術通過掃描組織切片來