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    質譜技術幫助科學家發現蛋白質組學重要成果

    最近,來自瑞士和荷蘭的科學家,對在22種不同生長條件下大腸桿菌表達的蛋白質,進行了定量和定性分析。確定了超過2300個蛋白質,其中一些處于每個細胞一個副本的平均水平。由此產生的數據集描述了細胞中大多數(> 90%)的蛋白質量,對細胞生物學家來說這將是一個寶藏。相關研究結果發表在十二月出版的《Nature Biotechnology》。為了了解細胞內的基因組信息和它們的生理機能之間的關系,重要的是要評估哪些基因在不同條件下積極參與產生蛋白質。收集這些信息的最直接的方式是,對細胞中存在的蛋白質進行定量測量。隨著技術的進步,最近才使得絕對蛋白質水平的大規模測量成為可能。來自巴塞爾大學和蘇黎世大學(瑞士)、格羅寧根大學(荷蘭)的科學家們,聯手測量在22種不同條件下生長的大腸桿菌中的蛋白質。使用質譜法為基礎的蛋白質組學方法,他們不僅確定了存在哪些蛋白質,而且還確定了每個細胞中有多少個副本。大型數據集系統生物學教授Matthias......閱讀全文

    質譜技術幫助科學家發現蛋白質組學重要成果

    最近,來自瑞士和荷蘭的科學家,對在22種不同生長條件下大腸桿菌表達的蛋白質,進行了定量和定性分析。確定了超過2300個蛋白質,其中一些處于每個細胞一個副本的平均水平。由此產生的數據集描述了細胞中大多數(> 90%)的蛋白質量,對細胞生物學家來說這將是一個寶藏。相關研究結果發表在十二月出版的《Na

    定量蛋白質組學質譜采集技術進展(一)

    摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋

    定量蛋白質組學質譜采集技術進展(四)

    無論是相對定量還是絕對定量方法,DIA很好地克服了DDA鳥槍法和SRM目標監測的種種不足, 在定量蛋白質組學中具有良好的應用前景。然而,目前DIA 方法的循環時間仍然較長,只能與納流液相聯用,并使用較長的梯度以獲得足夠的色譜峰寬,限制了DIA 的應用范圍。這也是DIA 技術下一步需要解決

    定量蛋白質組學質譜采集技術進展(二)

    同步母離子選擇(Synchronous precursor selection, SPS)技術的出現徹底解決了MS3 響應弱的問題。SPS 技術利用多頻切跡的選擇波形電壓(MultiNotch) [27] ,在線性離子阱中實現一次選擇同時獲得多個離子,最多可同時選擇15 個(圖2A)。利用這一原理,

    定量蛋白質組學質譜采集技術進展(三)

    然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有

    蛋白質組學牛人Nature發表重要成果

      第一次結合兩種新興的大規模實驗技術:多通道質譜分析法和具有高水平自然遺傳多樣性的小鼠種群,哈佛醫學院(HMS)和Jackson實驗室(JAX)的研究人員解決了生物學和醫學中一個懸而未決的問題:遺傳變異是如何影響蛋白質水平的?  蛋白質是構成所有細胞和生物結構與功能“零件表”的氨基酸鏈。因此,了解

    質譜和蛋白質組學:擊中目標

    Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)?? 作者:Nathan Blow?? 分析測試百科? 譯 ??? 近年來,質譜儀大幅提高了動態范圍和靈敏度,使研究者們在疾病生物標志物的發現和驗證方面,更從容地面對挑戰。 ??? 在2008年6月的美國質譜大會(ASMS)

    Science重要成果:蛋白質組繪圖新技術

      為了更清楚地了解細胞內正在發生的事件,科學家們需要知道數以千計蛋白質和其他分子的定位。麻省理工學院的化學家們現在開發了一項新技術,可以標記細胞某一特定區域中所有的蛋白質,從而更準確地繪制這些蛋白質的圖像。   領導這一研究的是著名華裔女科學家、化學副教授Alice Ting,她曾

    綜述:基于質譜技術的糖蛋白質組學與糖組學研究進展

       糖是組成生命體的四大類重要分子之一,糖蛋白質是由糖鏈與肽鏈中的特定氨基酸殘基以糖苷鍵共價連接而成的蛋白質。糖蛋白質普遍存在于生物體內,在很多生命過程中起著重要作用,如蛋白質的折疊、細胞之間的相互識別、炎癥反應等。同時,糖基化修飾在疾病中,特別是腫瘤的發生、發展和轉移過程中也起到重要作用,許多疾

    AB SCIEX推出創新的蛋白質組學質譜應用新技術

      將與蘇黎世聯邦理工學院通力合作,專注發展 TripleTOF 5600 系統上的 SWATH? 采集方式,來研究全面的系統蛋白質組學  馬薩諸塞州弗雷明漢市2011年6月7日電 /美通社亞洲/? --蘇黎世聯邦理工學院及 AB SCIEX(全球領

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