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如今，單細胞生物學是一個熱門話題。而在這一領域中，最前沿的則是單細胞RNA測序（scRNA-seq）。傳統“批量的”RNA測序方法（RNA-seq）可以一次處理成千上萬個細胞，并得到變異的平均水平。但是沒有兩個細胞是完全相同的，而scRNA-seq則可以揭示出每個細胞獨特的微妙變化，甚至可以揭示全新的細胞類型。例如，在使用scRNA-seq技術檢測了約2,400個免疫細胞后，位于馬薩諸塞州劍橋市Broad研究所的Aviv Regev及其同事發現了一些具有強大T細胞刺激活性的樹突細胞。Regev表示，一種能夠刺激這些細胞的疫苗可能會潛在地增強免疫系統功能，并預防癌癥。這些發現來之不易，操縱單個細胞比大群體要困難得多，而且因為每個細胞只產生少量的RNA，所以沒有任何犯錯的余地。此外，另一個問題是如何分析海量數據產生的結果，因為我們目前所使用的工具可能不是直觀的。通常，研究人員需要費力地在Unix操作系統中鍵入命令來分析RNA......閱讀全文
一、概述隨著現代生物學的發展，細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題，為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。單細胞測序正在成為科研熱點。二、單細胞測序倍受青睞的原因人們最初以為一個細胞類群是均質的（即各細胞都是
細胞是生物學的基本單位，近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術，該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列
細胞是生物學的基本單位，近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術，該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列比較已經開始
RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中，轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本，可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時，cDNA測序也極大
RNA測序已經在生物學和醫學的各個領域取得了前所未有的發展。在包括癌癥在內的諸多疾病中，轉錄異構體的表達和用途是健康組織和患病組織之間變異的重要來源。鑒定差異剪接的異構體和融合轉錄本，可以為疾病的診斷和治療提供信息。RNA測序還有助于揭示從單細胞到整個組織的轉錄組動力學。同時，cDNA測序也極大
一背景概況單細胞測序技術是指能夠在單個細胞的水平上，對基因組或轉錄組進行高通量測序分析的一項新技術。與傳統高通量測序相比，單細胞測序不僅能夠分析相同表型細胞的異質性，還能獲取難以培養微生物的遺傳信息以及珍貴的臨床樣本的信息，具有廣闊的應用前景。細胞是生命的單位，目前大部分的基因檢測均是從組織中抽提D
細胞是構成生命體的結構和功能的基本單位，不同類型的細胞形態迥異，功能也各不相同。即使是同類細胞間看似相同，相互間也存在著廣泛的細胞異質性。傳統的群體細胞分析檢測能更快速方便的獲得大量數據并利于進行有效的統計學分析，但是隨著研究的深入，這種基于群體細胞分析所獲得的平均性數據，往往忽略了細胞個體間的
近年來，隨著測序技術的迅猛發展，單細胞測序技術已逐漸走入人們視野。2013年，單細胞測序技術成為《自然》評選的“Method of the Year”。大多數的基于NGS的基因檢測，都是在大量細胞宏觀水平上，對整個細胞群進行遺傳分析。單細胞測序技術則是在單個細胞的水平上，對其遺傳物質進行檢測，從
單細胞生物學最近幾年是非常熱門的研究方向。在這一領域中，最前沿的則是單細胞測序技術。傳統測序方法一次處理成千上萬個細胞，得到的變異水平也是成千上萬個細胞的平均后水平。但是，就如同世界上沒有完全相同的兩片樹葉一樣，沒有兩個細胞是完全相同的。所以，單細胞測序對于研究單個細胞就顯得至關重要。單細胞測序可以
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制，即使是同類型細胞，基因表達也會出現差異。 那么，細胞之間的哪些差異有生物學意義，哪些差異來自于技術偏好呢？要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢？這
??多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。不同類型的細胞激活特定組合的機制，即使是同類型細胞，基因表達也會出現差異。??那么，細胞之間的哪些差異有生物學意義，哪些差異來自于技術偏好呢？要獲得可靠的結果又需要研究多少細胞呢？這
1.單細胞測序單細胞測序（Single Cell Squencing）：簡稱SCS，是指從單個細胞提取DNA或RNA樣品進行DNA或RNA的測序。該技術自2009年問世，2013年被Nature Methods評為年度技術以來，越來越多地被應用在科研領域。2015年以來，10X Geno
多細胞生物的每個細胞都攜帶著相同的遺傳學信息。不過，近年來蓬勃發展的單細胞研究告訴我們，每一個細胞都是獨一無二的。The Scientist雜志最近聯系了單細胞研究領域的一些專家，請他們分享了在單細胞中進行轉錄研究的秘訣。希望幫助研究者們更好地構建文庫，處理和分析結果數據。 那么，細胞之間的哪
本文中，小編整理了近年來單細胞測序領域的重磅級研究成果，與大家一起學習！ 【1】Cell：開發出空間單細胞測序技術，有助揭示早期乳腺癌產生浸潤性之謎 doi：10.1016/j.cell.2017.12.007 在一項新的研究中，來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員報道一種新的遺傳
《Nature Methods》是專門用來對生命科學研究領域具有顯著性意義的新方法和研究技術改進的經典雜志。單細胞轉錄組測序是2019年不折不扣的熱點領域，截至2019年9月，Nature Methods總共發表了10篇關于單細胞轉錄組測序相關的研究報道。本期，小編和大家一起分享這些重要的研究成
《Nature Methods》是專門用來對生命科學研究領域具有顯著性意義的新方法和研究技術改進的經典雜志。單細胞轉錄組測序是2019年不折不扣的熱點領域，截至2019年9月，Nature Methods總共發表了10篇關于單細胞轉錄組測序相關的研究報道。本期，小編和大家一起分享這些重要的研究成
作者：Carrie 單細胞測序技術 基因測序在體外診斷市場中的重要性日益突出。其中，單細胞測序技術自2009年問世，2013年被Nature Methods評為年度技術以來，越來越多地被應用在科研領域。2015年以來，10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、S
DroNC-seq10月，Broad研究所張鋒教授團隊在Nature Methods上發表題為“Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq with DroNc-Seq (doi: 10.1038/nmeth.4407)” 的文章，提出了一個新的測
近日，發表在《Nature Communications》上的一項研究中，研究人員利用單細胞RNA測序深入了解了皰疹病毒，為預防皰疹感染帶來了新的見解。 如果你的嘴唇開始刺痛發癢，通常意味著你將患上唇皰疹，這是一種小而令人疼痛的水泡，里面充滿了具有高度傳染性的單純皰疹病毒（HSV）。 單純皰疹
單細胞測序被評為2013年年度技術 2014 年首刊，《Nature Methods》雜志將2013年度技術(Method of the Year 2013)授予了單細胞測序(single-cell sequencing)。同時，雜志還介紹了2014年值得關注的技術，包括
近年來，高通量單細胞轉錄組測序已廣泛應用于動物細胞研究，但只在少數植物物種和組織的研究中存在報道。其主要原因是因為植物細胞比動物多了一層細胞壁，使得植物單細胞RNA-seq必須先消化細胞壁并制備原生質體。而原生質體的制備對于許多組織都非常困難，且制備過程會影響細胞的轉錄狀態而引入不必要的干擾。因
近年來，高通量單細胞轉錄組測序已廣泛應用于動物細胞研究，但只在少數植物物種和組織的研究中存在報道。其主要原因是因為植物細胞比動物多了一層細胞壁，使得植物單細胞RNA-seq必須先消化細胞壁并制備原生質體。而原生質體的制備對于許多組織都非常困難，且制備過程會影響細胞的轉錄狀態而引入不必要的干擾。因
人腦是由多種不同類別細胞組成的極其復雜的器官。傳統的細胞分類方法只能根據少數已知的細胞的標記分子（marker）對細胞進行分類，對每一類細胞的認識也非常有限。斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其團隊利用單細胞測序技術，對466個人大腦皮層的單細胞進行了轉錄組測序，通過數據分析發
多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。 多細胞測序和單細胞測序，你pick誰？如今，大多數研究人員也許會選擇后者，因為不一樣的角度，會帶來不一樣的見解。單細胞測序的最初動力來自癌癥研究，可幫助人們了解腫瘤異質性和腫瘤微環
麻省綜合醫院（MGH）、MIT布羅德研究所、哈佛大學近日在Science雜志上發表了一篇文章（3月31日），使用單細胞RNA測序技術，并結合癌癥基因組圖譜分析了星形細胞瘤（astrocytomas）和少突神經膠質瘤（oligodendrogliomas）兩種腦神經膠質瘤（gliomas）的細胞組
單細胞基因組旨在通過組學方法研究單個細胞。近年來隨著技術的發展，這一年輕的領域正在迅速成熟起來。單細胞基因組研究的前身可以追溯到用芯片檢測單細胞的基因表達。不過，新一代DNA測序才是單細胞基因組學的大功臣，這些技術的出現讓單細胞基因組研究最終一飛沖天。 2012年7月，Nature Biote
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一，在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是，肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%，就能夠完全再生的內臟器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一，也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要，但健康
3 在神經科學中的應用單細胞測序技術幫助科學家更深入的了解大腦神經細胞。2017年，Salk生物研究所領導的團隊根據甲基化和調控特征，區分小鼠和人類大腦樣本中的神經元亞型，并鑒定出人類額葉皮質中一組新的神經元[6]。研究人員利用單細胞甲基化測序分析小鼠和人類額葉皮質樣本中近6200個神經元，并根據甲
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一，在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是，肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%，就能夠完全再生的內臟器官。另外，包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一，也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要，但健康
蘇黎世聯邦理工學院（ETH Zurich）的研究人員開發了確保測序質量的有效方法，并在此基礎上獲得了全面且準確的抗體圖譜。這項研究發表在最近的Science Advances雜志上。 為了跟蹤免疫系統激活后的抗體生成情況，研究人員對攜帶抗體生產指令的mRNA進行了測序分析。“近年來測序技術取得