揭示基因“無用”序列穩定染色質三維結構及細胞穩態機制
人類基因組中的非編碼序列在多種生物學過程中發揮著至關重要的作用，如非編碼RNA、啟動子、增強子和轉座子等。作為在基因組中占比約98%的非編碼區域，仍有大量是功能未知的，這些曾被認為是基因組中“垃圾”的區域，已被逐漸證實存在重要功能。基因組的三維結構會影響基因的轉錄調控或其他細胞生命活動，然而，除了研究較多的增強子-啟動子成環所形成的三維結構在調控基因表達上的作用外，其他大量非編碼序列在形成和維持正確三維染色質結構上是否具有潛在功能，在目前的研究中是被忽視的一個方向。之前有研究表明，改變非編碼序列能夠改變染色質結構，如切除一些拓撲結構相關結構域（TAD）的邊界序列能夠導致異常的基因表達，誘發疾病產生。除了TAD邊界序列這一特殊類型，非編碼序列在結構上的重要性目前還沒有系統性的研究，尤其是一些與TAD無關、無任何表觀遺傳信號或功能元件注釋的區域。 加州大學圣地亞哥分校（UCSD）王巍課題組與北京大學魏文勝教授課題組在Scien......閱讀全文
研究發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系，其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
染色體級別的銀杏參考基因組公開
銀杏果實 曹福亮供圖 作為裸子植物銀杏綱唯一的孑遺物種，銀杏不僅具有特殊的科學研究價值，而且具有重要的應用價值。 近日，南京林業大學聯合中國農業科學院農業基因組研究所在《自然—植物》在線發表了染色體級別的銀杏參考基因組，是目前已發表的組裝質量最高的裸子植物參考基因組。 論文共同通訊作者、中國工
Science：宏基因組研究挑戰DNA編碼規則
人們一直認為DNA編碼的指令是所有生命通用的，例外情況極少。但本期Science雜志上的一項新研究顯示，自然界中的生物又一次打破了既定的規則。 美國能源部聯合基因組研究所的Edward Rubin領導研究團隊，獲得來自1776種環境（包括17個人體區域）的微生物宏基因組數據，以便在其中尋找重編
迄今最全面的非編碼基因組圖譜問世
生命科學 非編碼 DNA 延伸段在發育和基因調控中發揮著關鍵作用。2 月 3 日發表在《自然》（Nature）上的一項新研究稱，來自美國麻省理工學院（MIT）的研究團隊發表了迄今為止最全面的非編碼基因組圖譜，EpiMap（Epigenome Integration across Multi
昆明動物所發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系，其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與
用比較基因組雜交描述染色體結構異常實驗
實驗方法原理比較基因組雜交（CGH)是一種能夠在一步全基因組篩查程序，描述G帶不能發現的細胞遺傳物質增加或減少的分子細胞遺傳學技術。CGH優于進行全染色體涂染（wcp)的常規熒光原位雜交（FISH)和多色FISH之處，是它不僅能夠識別增加的未知片段的染色體來源，而且還可將該片段定位于特定的染色體區帶
上海師大團隊破解染色體級別基因組密碼
中新網上海12月16日電 (記者 許婧)上海師范大學16日發布消息稱，該校王全華研究團隊在菠菜基因組研究領域又取得一項重大標志性研究成果。團隊聯合康奈爾大學Boyce Thompson研究所(BTI)費章君教授課題組等多家科研機構完成了新一代菠菜基因組精細圖譜繪制、重要農藝性狀遺傳基礎和菠菜馴化
染色體級別橡膠基因組研究揭秘乳膠生物合成
橡膠樹是大戟科植物。在植物界大約2500種產膠植物中，橡膠樹產生的以聚異戊二烯為主要功能成分的天然膠乳約占全球天然橡膠的98% 以上。圖片來源于網絡 比起可能造成巨大環境污染的人工合成橡膠產業，天然橡膠因其良好的彈性、伸展性、耐老化等綜合理化性能而具有不可替代性，是任何國家必須具備的重要戰略
染色體級別的鐵線蕨基因組首次繪制
日前，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合國內外8家科研院所首次繪制了染色體級別的鐵線蕨基因組，揭示了蕨類植物孢子發育、真葉植物起源和種子演化、茉莉素信號通路進化等分子機制。相關研究成果發表在《自然—植物（Nature Plants）》。 真蕨植物以孢子體和配子體均具有光合自養能力為主要特
龍井茶樹染色體級別基因組組裝成功
? ?龍井43 ?? 中國農科院供圖 近日，《自然—通訊》在線發表了我國科學家在茶樹全基因組組裝和茶樹起源演化研究上取得的重要突破。該項研究由中國農業科學院茶葉研究所（以下簡稱茶葉所）和中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下簡稱基因組所）主導并攜手中國科學院昆明動物研究所（以下簡稱昆