核酸酶和連接酶:核酸酶是能夠切割DNA鏈的酶,因為它們催化磷酸二酯鍵的水解。從位于DNA鏈末端的核苷酸開始水解DNA的核酸酶稱為核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA鏈的那些是內切核酸酶。分子生物學中使用最廣泛的核酸酶,稱為限制性內切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,這種酶通過在進入細菌細胞時消化噬菌體DNA來保護細菌免受噬菌體感染。通常,限制性核酸酶識別特定的回文核苷酸序列,稱為限制性位點。這些酶廣泛用于涉及在載體內亞克隆DNA的技術中。DNA連接酶:是能夠使用來自ATP或NAD的化學能將先前切割或斷裂的DNA鏈聚集在一起的酶。連接酶在DNA滯后鏈復制中特別重要,因為它們將岡崎碎片組合成DNA鏈。連接酶在DNA修復和基因重組中也發揮重要作用。拓撲異構酶和解旋酶: 拓撲異構酶是具有活性核酸酶和連接酶的酶。這些酶能夠改變DNA的拓撲特性。它們中的一些通過切割DNA螺旋并允許其旋轉,降低其超螺旋程度,然后通過連接酶將兩端連接。另......閱讀全文
核酸酶和連接酶:核酸酶是能夠切割DNA鏈的酶,因為它們催化磷酸二酯鍵的水解。從位于DNA鏈末端的核苷酸開始水解DNA的核酸酶稱為核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA鏈的那些是內切核酸酶。分子生物學中使用最廣泛的核酸酶,稱為限制性內切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,這種酶通過在進入細菌細胞時消
本方案介紹在放射性標記的 DNA 片段上確定蛋白質結合位點的作圖方法。本方案使用 DNA 酶 I 切割 DNA, 而在替代方案中是用羥自由基斷裂 DNA。如果希望得到優化足跡法反應的建議,請參見本方案最后部分的疑難解析以及優化 DNA 酶 I 足跡法反應的欄目。本實驗來源于分子克隆實驗指南(第三版)
實驗材料 新鮮組織、培養的細胞、來自細胞或組織的蛋白成分試劑、試劑盒 細胞勻漿緩沖液細胞重懸緩沖液細胞淋洗緩沖液乙醇Ficoll 400甲酰胺染色液MgCl2 CaCl2 溶液NaClNonidetP-40酚:氯仿磷酸鹽緩沖液聚乙烯醇終止液組織勻漿液組織重懸緩沖液臺盼藍染料DNA 酶 I
DNA 酶 I 足跡法對 DNA 上的蛋白質結合位點作圖實驗 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 新鮮組織、培養的細胞、來自細胞或組織的蛋白成分
結構蛋白可與DNA結合,是非專一性DNA-蛋白質交互作用的常見例子。染色體中的結構蛋白與DNA組合成復合物,使DNA組織成緊密結實的染色質構造。對真核生物來說,染色質是由脫DNA與一種稱為組織蛋白的小型堿性蛋白質所組合而成;而原核生物體內的此種結構,則摻雜了多種類型的蛋白質。DNA可在組織蛋白的表面
? ⑴ 酶與抗體的活性 常用瓊脂擴散或免疫電泳法,使抗原與抗體形成沉淀線,經PBS漂洗1天,再以蒸餾水浸泡1小時,將瓊脂凝膠片浸于酶底物溶液中著色,如果出現應有的顏色反應,再用生理鹽水浸泡,顏色仍然不褪,表示結合物既有酶的活性,也有抗體活性。良好的結合物在顯色后,瓊擴滴度應在1:16以上。另一個測定
本實驗主要用于檢測粗制提取物中序列特異性的DNA結合蛋白。實驗方法原理本分析方法是一種簡單、快速和極為靈敏的用于檢測粗制提取物中序列特異性的DNA結合蛋白的方法。在電泳時,與末端標記的DNA片段特異結合的蛋白質阻滯了片段的遷移,因而產生對應于蛋白-DNA復合物的清晰電泳條帶。實驗材料質粒DNA試劑、
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本分析方法是一種簡單、快速和極為靈敏的用于檢測粗制提取物中序列特異性的DNA結合蛋白的方法。在電泳時,與末端標記的DNA片段特異結合的蛋白質阻滯了片段的遷移,因而產生對應于蛋白-DNA復合物的清晰電泳條帶。
實驗材料 質粒DNA試劑、試劑盒 dNTPDNA聚合酶Klenow酶TETAE溴化乙錠TEMED過硫酸銨BSA儀器、耗材 培養箱離心管實驗步驟 1. ?用一種或多種限制性內切酶在100 μl 體積中消化10 μg 質粒人,產生25~100 bp ?的含有結合位點的DNA片段,并至少有一端是5’突出的
E2s家族成員都含有一個由150-200個氨基酸組成的高度保守的泛素結合結構域(UBC)。該結構域的分子量大約為14-16kDa,并且其中有35%的序列在不同的E2s成員中是保守的,它可以為泛素活化酶E1s,泛素連接酶E3s和活化的Ub或UBL提供結合位點。UBL是一種類泛素蛋白,如SUMO,ISG