科學家構建涵蓋五大植物類群的150+物種參考代謝組及數據庫
11月11日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心李軒團隊在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)上,在線發表了題為RefMetaPlant: reference metabolome database for plants across five major phyla的研究成果。該研究闡述了植物“參考代謝組”概念,發展了參考代謝組圖譜的組裝方法,完成構建了五大植物類群——苔蘚植物、石松植物、蕨類植物、裸子植物和被子植物等類群的150多個植物物種的參考代謝組圖譜。同時,該研究開發了一系列與基因組分析工具(如BLAST)相似的代謝組分析工具(如RefMetaBlast),為探討植物代謝組多樣性和代謝物功能,提供了數據共享和分析平臺。 植物“參考代謝組”是指一個植物物種所有代謝物的總和。一個植物物種“參考代謝組”與代謝物之間的關系,類似于植物物種“參考基因組”與基因之間的關系。在億萬年進化過程中,植物發展......閱讀全文
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的? 代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的? 代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的?? ? ? ?代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學?代謝組學是用來解決什么問題的? 代謝組學(Metabonomics/Metabolomics)是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組服務介紹??
代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發展起來的一門學科,是系統生物學的重要組成部分。基因組學和蛋白質組學分別從基因和蛋白質層面探尋生命的活動,而實際上細胞內許多生命活動是與代謝物相關的,如細胞信號(cell signaling)、能量傳遞等都是受代謝物調控的。代謝組學正是研究代謝物——在某一
長壽的代謝特征代謝組學研究的啟示
長生不老是人類自古以來的夙愿。 中國古代神話故事中,有菩提老祖的大品天仙訣,王母娘娘盛會上的蟠桃,太上老祖煉丹爐里的不老丹,還有妖怪們夢寐以求的唐僧肉都可以實現長生不老。在史學瀚海中,《史記》記載秦始皇東巡碣石,攜童男童女入海求仙,尋求長生不老藥;在現代科學中,衰老仍然是生物醫學領域熱門主題之
中藥基礎物質、代謝及代謝組學研究方案
中藥組成成分復雜、作用環節多樣,中藥藥效物質基礎以及臨床療效機理的闡明,已成為中醫藥現代化研究的重要內容。如何快速地從海量的質譜數據中獲取有價值的信息,減輕繁重的數據處理工作量,成為廣大中醫藥研究工作者的心聲。 賽默飛的Compound Discoverer軟件針對中藥成分鑒定、體內代謝轉化和
代謝組學-|-腫瘤治療之靶向葡萄糖代謝
能量代謝重編程是腫瘤的十大特征之一,其中葡萄糖代謝異常是腫瘤代謝最突出的特征。在氧氣充足的情況下,腫瘤細胞依然傾向于進行糖酵解,將葡萄糖代謝為乳酸。腫瘤細胞有氧糖酵解能力是正常細胞的20 ~ 30倍,為腫瘤代謝提供 大量能量和中間產物。因此,靶向糖酵解等異常環節的代謝酶是抗腫瘤治療的重點。一些研
琥珀酰化修飾組代謝組揭示水產動物病原菌代謝調控機制
隨著組學研究步入后基因組時代,蛋白質組、修飾蛋白質組、代謝組、多組學研究逐步向生命科學研究的各個領域滲透。盡管,相對于發展迅速的醫學等領域,水產科學中對修飾組等較新組學技術的應用起步較晚,但目前已有不少高質量文章發表,這為水產科學研究領域打開了新的研究視角。 本期,小編將為大家帶來一篇1
琥珀酰化修飾組代謝組揭示水產動物病原菌代謝調控機制
隨著組學研究步入后基因組時代,蛋白質組、修飾蛋白質組、代謝組、多組學研究逐步向生命科學研究的各個領域滲透。盡管,相對于發展迅速的醫學等領域,水產科學中對修飾組等較新組學技術的應用起步較晚,但目前已有不少高質量文章發表,這為水產科學研究領域打開了新的研究視角。 本期,小編將為大家帶來一篇
代謝組學科學哲學思路
代謝組學突出的是一種整體性的研究思路。它通過現代超高效液相色譜/高分辨質譜聯用儀等技術分析體液中的代謝物組成譜,并利用多變量統計分析技術,把所有代謝物的組成信息都整合到一起,為在系統和整體的層面上比較和分析生物的代謝特性。 眾所周知,西方醫學的哲學基礎是從分析開始的,如魏爾嘯的細胞論。隨著分析
代謝物組的定義
中文名稱代謝物組英文名稱metabolome定 義細胞內在某一特定生理和發育階段的所有小分子量的代謝物質。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),總論(二級學科)
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
代謝組學新工具:METLIN
METLIN是由美國Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak開發出的新型數據庫,將能用于解決代謝組學等領域研究中關于數據處理這個大問題。 超過上萬個代謝物 目前METLIN包括有超過10,000個代謝產物中帶有詳細,高分辨率串聯質譜信息的六萬化合物,
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
質譜儀在代謝組學和代謝研究中有著杰出表現
質譜儀以離子源、質量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過多的能量會進一步碎裂成較小質量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場作用下獲取具有相同能量的平均動能而進入質量分析器。質量分析器是將同時進入其中的不同質量的離子,按質荷比m/e大小分
代謝組學前沿與熱點——定性代謝流解決方案
作為代謝組學領域先進解決方案的一貫領導者,安捷倫近期隆重推出了全新的定性代謝流解決方案—— MassHunter VistaFlux 工作流程,旨在關注代謝組學的前沿和熱點,提供更快、更準、更完整的高效工作流程,助力科研工作者拓展組學研究的精度與深度。 下面將從五個方面助您了解定性代謝流及安捷
GCMS-HRAM-代謝組學數據庫-探索代謝組學的奧秘
鹽城4公分厚外墻巖棉板報價 巖棉制品是以精選的優質玄武巖為主要原料、經沖天爐熔化后,采用的四輥離心制棉工序,將玄武巖高溫熔體甩扭成4-7μm的非連續性纖維,再在巖棉纖維中加入一定量的粘結劑、防塵油、憎水劑,經過沉降、固化、切割等工藝,根據不同用途制成棉氈、半硬板、保溫帶、管殼等系列產品。
利用精確血漿代謝組學方法揭示衰老相關代謝特征
過去二十年里,代謝(脂質)組學研究得到了迅速發展。液相色譜與高分辨質譜聯用(LC-HRMS)技術是目前內源性代謝物最常用的手段,然而困擾LC-HRMS技術的分析精度和結構鑒定的瓶頸問題仍然存在。尤其是血漿樣本,其組分化學性質各異,同時復雜的基質會顯著減低代謝物定性與定量結果的準確性,導致生物學信
Cell:廣泛靶向代謝組技術揭示番茄代謝育種與馴化歷史
繼廣泛靶向代謝組技術成果在NG、NC、PNAS發表后,2018年1月11日,《Cell》在線發表了題為“Rewiring of the fruit metabolome in tomato breeding”的研究論文。論文的通訊作者為邁維代謝首席科學家華中農業大學羅杰教授與中國農業科學院深圳農
非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫?
據相關介紹表明非靶向代謝組學的研究成果為眾多的藥物靶學、疾病機理研究以及疾病診斷提供有力依據。它還推動了免疫組化以及免疫熒光等技術的發展,事實上長期供應非靶向代謝組學更是由此迅速推進了研究步伐,現在就非靶向代謝組學更適宜選用哪些代謝組學通路數據庫作簡要闡述:1.HMDB非靶向代謝組學的代謝通路必須借
代謝組學,妙手何來?|邁理奧,開拓代謝組學新科技的先鋒
今天要講到的代謝組學妙手來自何方??來自我們優秀的用戶——邁理奧(Meliomics)。邁理奧的快速崛起,源自于他們對代謝組學領域的深刻理解和持續創新,而安捷倫出色的儀器和解決方案也為其提供了重要支持。日前,我們有幸采訪到了邁理奧首席科學家厲良教授(加拿大皇家科學院院士)和學術總監李佳博士,深入了解
非靶向代謝組學與靶向代謝組學的區別主要表現在哪些...
非靶向代謝組學與靶向代謝組學的區別主要表現在哪些方面?非靶向代謝組學已實現了對眾多生物體系代謝物進行定性和相對定量分析,其結果的分析為各類醫學研究以及藥物開發提供重要參考數據。特別是那些比較好的非靶向代謝組學更是致力挖掘基因與細胞間更深層的關系,現在就非靶向代謝組學與靶向代謝組學的區別主要表現在哪些
代謝組鑒定質控標準正式建立
蛋白質組和代謝組技術都基于質譜,但相比于蓬勃發展的蛋白質組學技術,代謝組雖然技術流程更簡單,但其應用卻一直十分緩慢。究其原因,是因為蛋白質組學卻很早就基于Target-Decoy策略建立了FDR(假發現率)質控策略,可以保證鑒定結果的可靠性;而代謝組全譜鑒定一直缺乏有效的質控手段對鑒定結果進行
代謝組學:未來新方向
加拿大阿伯特大學生命科學與計算科學教授David Wishart說,我們自身其實就是一大組生化反應,“因此,基因組和蛋白質組不斷進化來支持代謝組,而不是相反的路徑。” Wishart說,有別于其他組學方法,代謝組學提供了一種更加直接的生理狀態檢測方式。代謝組反應營養、脅迫或者疾病狀態的速度比轉
做好代謝組學研究的關鍵
首先明確代謝組學的核心任務。對小分子代謝物的定性、定量分析并發現差異代謝物:(1)對生物體系中的內源性代謝物及其變化規律進行表征;(2)以差異代謝物作為核心對生命奧秘進行解析。而基于色譜/質譜聯用的分離分析技術具有靈敏度高、選擇性好、動態范圍寬、信息豐富等優點,已成為代謝組學研究的主流技術平臺。其次
如何看待代謝組學的前景
是不錯的,但是代謝組本身還是一個發展中的新型學科,一些關鍵性技術還有待突破,如果你只想使用代謝組學而不去深入的研究它的話就應該沒問題,如果想要進一步研究代謝組學方法就需要有相當的分析化學知識。現在世界前十的藥廠都在使用代謝組學進行藥學研究,所以它在里面的前景肯定是不會差的。隨著技術的發展肯定會越來越
如何看待代謝組學的前景
是不錯的,但是代謝組本身還是一個發展中的新型學科,一些關鍵性技術還有待突破,如果你只想使用代謝組學而不去深入的研究它的話就應該沒問題,如果想要進一步研究代謝組學方法就需要有相當的分析化學知識。現在世界前十的藥廠都在使用代謝組學進行藥學研究,所以它在里面的前景肯定是不會差的。隨著技術的發展肯定會越來越
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為:“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”,兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度
進入前景光明的代謝組學
內容概要: 一、代謝組學在藥物研發中的應用 二、SiDMAP技術在疾病診斷中的應用 三、儀器公司的研究開發:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研發分析代謝物的更為靈敏的檢測方法,而Bio-Rad公司正在發展用Holly Grail作