植物多組學比較和進化研究平臺發布
近日,西北農林科技大學生命科學學院馬闖教授團隊發布了植物多組學數據跨物種比較和進化研究的在線分析平臺,相關成果發表在Molecular Biology and Evolution上。進化是植物性狀遺傳多樣性和適應生存環境的基礎,而基因變異是物種進化的源動力。隨著后基因組時代高通量技術的發展和應用,在DNA、RNA、蛋白等多個層面產生了大量的植物組學數據,為深入研究植物基因變異和物種進化機制提供了豐富的實驗資源。由于不同來源的多組學數據具有規模大、維度高、噪音大、異質性強等特點,給數據的有效整合和植物進化研究造成了極大的障礙。為了解決上述問題,研究團隊歷時五年成功研發了用于植物多組學數據跨物種比較和進化研究的IPOP平臺。該項研究涉及苔蘚、單子葉和雙子葉三大類植物物種,收錄了包括群體基因組、三維基因組、染色質可及性、轉錄組、DNA修飾、RNA修飾、組蛋白修飾等多維度的組學數據,采用統一標準化的流程對組學特征進行質量控制和整合分析,......閱讀全文
植物多組學比較和進化研究平臺發布
近日,西北農林科技大學生命科學學院馬闖教授團隊發布了植物多組學數據跨物種比較和進化研究的在線分析平臺,相關成果發表在Molecular Biology and Evolution上。進化是植物性狀遺傳多樣性和適應生存環境的基礎,而基因變異是物種進化的源動力。隨著后基因組時代高通量技術的發展和應用,在
空間多組學技術對闡明藥用植物合成途徑起推進作用
陜西省西安植物園資源植物功能基因挖掘與應用團隊探討了空間多組學技術的應用對進一步闡明紅豆杉、長春花等藥用植物天然產物合成途徑的推進作用,并系統闡明了細胞水平合成通路的解析作為合成生物學的藍圖扮演的重要角色以及未來工業化進程中面臨的挑戰,近日相關研究內容受邀發表在Trends in Plant Sci
植物多組學數據驅動的上下游調控因子挖掘平臺發布
9月8日,The Plant Journal 期刊在線發表中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所張一婧研究組搭建的挖掘植物基因及基因組位點上下游調控因子的網絡平臺,論文題為Plant Regulomics: A Data‐driven Interface for Retrievi
中藥多組學研究取得重大突破
中藥材基因資源是國家戰略資源,其挖掘、保護和利用是中藥資源可持續發展的首要關鍵。近期,中國中醫科學院中藥研究所團隊基于多組學技術成功揭示了紫蘇、黃連、大青葉等藥用植物的基因遺傳背景,相關研究成果以三篇研究論文形式連續發表在國際著名權威學術期刊《自然通訊》上,引起了國際學術界對我國中藥應用基礎性研
中藥多組學研究取得重大突破
中藥材基因資源是國家戰略資源,其挖掘、保護和利用是中藥資源可持續發展的首要關鍵。近期,中國中醫科學院中藥研究所團隊基于多組學技術成功揭示了紫蘇、黃連、大青葉等藥用植物的基因遺傳背景,相關研究成果以三篇研究論文形式連續發表在國際著名權威學術期刊《自然通訊》上,引起了國際學術界對我國中藥應用基礎性研
單細胞多組學高通量測序平臺(一)
一單細胞多組學高通量測序技術簡介通過測序手段檢測細胞多層次信息,如基因組、表觀組、轉錄組甚至蛋白組已經成為生物學研究的重要手段。幾乎一切生命體的活動都圍繞著DNA->RNA->蛋白質的過程,而現有的組學技術也圍繞這一過程獲取信息(如DNA層面的基因序列),從而解讀生物體運行機制,應用于疾病的診斷和治
單細胞多組學高通量測序平臺(二)
雖然single-cell sequencing的方法仍在不斷推出,但是目前使用最為廣泛、商業化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系統。1.2以RNA-seq為例介紹高通量單細胞測序技術單細胞測序的最主要難點是如何在短時間內分離得到最可能多的單個細胞,早期的技術代表F
CASMS分論壇:多組學整合與大數據
分析測試百科網訊 美國東部時間2021年8月9日-13日,首屆美國華人質譜學會(CASMS)學術研討會暨展覽會在Gather.Town隆重舉行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分論壇中,哈沃德醫學院Steven Gygi博士、太平洋西北國家實驗
首個免疫衰老多組學數據庫設立
記者12月17日從中國科學院基因組所(國家生物信息中心)了解到,該所研究員張維綺團隊、鮑一明團隊與中國科學院動物研究所研究員劉光慧、曲靜研究組合作,建立了免疫衰老領域首個多組學數據庫Immunosenescence Inventory,旨在為整合和分析與免疫衰老相關數據提供一體化平臺。隨著全球人口老
解析腫瘤HiC多組學研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整個細胞核為研究對象,利用高通量測序技術,結合生物信息分析方法,研究全基因組范圍內整個染色質DNA在空間位置上的關系,獲得高分辨率的染色質調控元件相互作用圖譜。Hi-C可以與RNA-S
多組學手段揭示苦蕎“不怕冷”的奧秘
苦蕎 ? ? ? 董玉梅攝低溫脅迫是影響植物生化、分子、代謝調控的主要環境因素之一。長期在暴露于低溫而引導植物脅迫耐受性的提高,即耐寒性或冷馴化。闡明植物對低溫響應的分子機制對育種和基因發掘至關重要。有研究表明苦蕎可以通過增加花色苷和原花青素的積累增強其耐寒性。苦蕎的每個器官幾乎都含有蘆丁,包括種子
多組學研究助力玉米種質資源創新利用
近日,中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》(英文版)(Science Bulletin)上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑,是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯
多組學研究助力玉米種質資源創新利用
近日,中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》(英文版)(Science Bulletin)上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑,是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯
單細胞多組學整合技術有了新突破
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日,軍事科學院軍事醫學研究院應曉敏團隊在國際著名學術期刊《自然·生物技術》以Article類長文形式在線發表重大原創研究成果。該團隊自主研發的用于單細胞多組學數據馬賽克整合的人工智能
單細胞多組學整合技術有了新突破
近日,軍事科學院軍事醫學研究院應曉敏團隊在國際著名學術期刊《自然·生物技術》以Article類長文形式在線發表重大原創研究成果。該團隊自主研發的用于單細胞多組學數據馬賽克整合的人工智能算法取得新突破。細胞是生物體內發揮功能的基本結構單元。單細胞測序技術是近年來生命科學領域的突破性技術,能夠檢測單個細
多組學研究助力玉米種質資源創新利用
近日,中國農業大學農學院、國家玉米改良中心王向峰教授在《科學通報》(英文版)(Science Bulletin)上發表了方法學研究論文。 農作物種質資源精準鑒定與基因挖掘是從源頭上實現種業創新、保障糧食安全的根本路徑,是生物育種重點攻關的關鍵技術之一。全基因組關聯分析(GWAS)是通過推斷
空間多組學質譜技術研討會(2023)
空間多組學技術結合了組學技術(如基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、金屬組學等)和組織學技術,有助于更好地理解生物體內各種生物分子與金屬元素在空間上的分布、相互作用及其對生理功能和疾病發生發展的影響。 質譜成像技術是近年來快速發展的空間多組學技術之一,可以在組織的空間層面上同時測定多種生物分子(如
P4-China-2016多組學與系統生物學論壇
P4 China 2016國際精準醫療大會將于2016年12月16-18日于北京召開,由中國生物工程學會,上海商圖信息咨詢有限公司(BMAP)等多家單位聯合舉辦。峰會將會邀請近60位演講嘉賓,預計近800位精準醫療行業與臨床科研資深人士與會。 個體化精準診療醫學是近年衛生保健領域發展最廣泛、最
P4-China-2016多組學與系統生物學論壇
自從精準醫學概念提出以來,它一直都是全球最熱的研究領域,政府的大力支持也了推動精準醫療行業的蓬勃發展。對于任意一項劃時代的大工程而言,基礎科研永遠是其第一驅動力。P4 China 2016 多組學與系統生物學論壇,從系統生物學出發,對生物信息學與生命組學技術進行了深入探討,并分享了科研成果應用于
動物所等建立衰老生物學多組學數據庫
隨著人口老齡化程度加劇,實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題。近年來,隨著衰老相關研究成果的不斷增多以及高通量測序技術的日益發展,衰老相關多組學數據層出疊見。然而,目前尚缺乏綜合性的整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫。 中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組,與北京基因組研
研究人員建立衰老生物學多組學數據庫
隨著人口老齡化程度加劇,實現健康老齡化是亟待解決的社會問題和科學問題。近年來,隨著衰老相關研究成果的不斷增多和高通量測序技術的日益發展,衰老相關多組學數據層出疊見。然而,目前尚缺乏綜合性的整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫。 中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組,與北京基因組研究所(
研究團隊部合作建立衰老生物學多組學數據庫
隨全球人口老齡化程度加劇,實現健康老齡化是目前亟待解決的社會問題和科學問題.近年來,隨衰老相關研究成果不斷增多及高通量測序技術日益發展,衰老相關多組學數據逐漸增多.然而目前,尚缺乏一個綜合性的、整合衰老生物學多組學數據的數據資源庫. 中國科學院北京基因組研究所(國家生物信息中心)研究員鮑一明研
科學家合作構建再生生物學多組學數據庫
隨著細胞重編程、基因編輯、合成生物學、高通量測序等技術的快速發展,再生生物學進入前所未有的蓬勃發展時期,助力解決組織替代、功能修復、衰老干預、疾病治療等一系列生命醫學領域的重要科學難題。面對科學數據的爆炸式增長,亟需建立以再生生物學為核心的開放數據庫,以存儲世界范圍內的組學研究數據為基礎,推動再
多組學數據庫“齊聚薈”-助力油菜“全能”競技
油菜產業集觀賞、蜜源、生態、經濟作物等多種功能于一身,是新興的“全能選手”。圍繞油菜,我國科學家近年來實現了從理論、技術、產品到轉化的鏈式創新,推動了我國油菜基礎研究與應用步入世界第一方陣。 然而,如何將基礎研究中長期積累的資源和多組學數據優勢轉化成育種優勢,仍是當前乃至未來很長一段時期油
科學家開發出新型空間多組學技術
5月25日,中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院彭廣敦課題組在《自然-方法》(Nature methods)上,發表了題為Simultaneous profiling of spatial gene expression and chromatin accessibility during mou
多組學大數據與醫學發展論壇在南寧召開
7月2-3日,多組學大數據與醫學發展論壇在廣西南寧召開,主題為“多組學大數據促進生物醫藥創新發展”。論壇圍繞基因等多組學大數據整合與標準化、新藥靶點挖掘、數據安全與隱私保護,數據可視化與交互、基因大數據倫理與法律問題、醫藥產業轉化等領域的現狀與未來發展,展開跨學科學術研討。論壇堅持學術為本的原則,組
布魯克質譜:拓展多組學研究邊界-推動臨床轉化
--布魯克中國區經理何磊先生專訪 分析測試百科網訊,自2017年推出timsTOF以來,布魯克每年都在為科學家們帶來創新的產品,今年六月就推出了第二代timsTOF Pro 2和單細胞蛋白質組研究平臺timsTOF SCP。布魯克質譜中國區業務快速增長,不僅來源于創新的產品,也同中國團隊的努力
犬科動物多組學資源庫iDog-2.0建立
近日,國家生物信息中心研究員趙文明團隊與昆明動物研究所副研究員柳延虎團隊合作,發布犬科動物多組學資源庫iDog 2.0,提供了更加全面的多組學數據資源及更加豐富的在線分析工具,為全球犬類研究者提供更高質量的數據服務。家犬是自然界中種內遺傳多樣性最為豐富的物種之一,也是研究人類遺傳性疾病的重要動物模型
GCMS+多組學軟件包高效開展合成生物學代謝途徑分析
?合成生物學領域是備受關注的新興領域。通過設計和構建新的生物系統,或者改造現有的生物系統,合成生物技術能夠實現生物體的功能改造和新功能的創造。合成生物學在醫藥領域具有巨大的應用潛力。通過合成基因組和基因編輯技術,設計特定的藥物合成途徑,并改造微生物,使其能夠高效地生產藥物及中間體。這對于藥物開發和生
大咖云集,共襄單細胞多組學及空間組學線上峰會
2009年,第一篇單細胞mRNA測序的文章的發表,標志著單細胞轉錄組測序的時代正式來臨。2013年,單細胞測序技術被《Nature Methods》評為年度技術。同年,《Science》將單細胞測序列為年度最值得關注的六大領域榜首,認為該技術將改變生物界和醫學界的許多領域。 目前,基于單細胞技