Nature揭示基因調控新機制
由來自新加坡國立癌癥中心、法國國家科研中心分子細胞及遺傳學研究所等處的科學家們組成的一個研究小組,獲得了一項有關基因調控機制的重要研究發現。這項研究發表在1月30日的《自然》(Nature)雜志上。 利用新加坡國立癌癥中心炎癥生物學實驗室Patrick Reilly博士開發的一種轉基因小鼠,研究人員證實活細胞中的DNA結構在一定程度上是通過一種叫做ANP32E的蛋白進行維持。ANP32E是一種人類蛋白質。 Reilly 博士說:“盡管DNA通常被描述為雙鏈螺旋結構,細胞中實際包含的DNA總量意味著這些DNA鏈必須被壓縮成稱之為染色質的復雜結構,在限制DNA體積的同時確保能夠讀取到編碼信息。在大量的發育疾病和各種類型的癌癥中都發現存在染色質結構錯誤。通過了解控制染色質結構的這些過程,我們希望能夠改良我們的工具,以實現實時調控特異的基因,由此逆轉許多疾病所造成的影響,開發出新型抗癌藥物。” 在過去的數十......閱讀全文
調控基因表達的“染色質環”新因子篩選獲進展
? 中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院、生物島實驗室研究員姚紅杰課題組通過系統性篩選在基因組上與CTCF共定位的轉錄因子,鑒定出大量與CTCF存在高共定位率的新轉錄因子,并選取了轉錄因子BHLHE40進行后續的功能驗證,發現BHLHE40可以調控CTCF在基因組上的結合,進而影響其介導的遠距離染色質
研究揭示染色質修飾調控植物基因表達新機制
8月6日,中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心植物分子遺傳國家重點實驗室何躍輝研究組(與劉仁義研究組合作)和杜嘉木研究組(與美國威斯康辛大學鐘雪花研究組合作)在《自然-遺傳學》背靠背分別發表題為Polycomb-mediated gene silencin
超高分辨直接觀測基因表達的染色質時空調控
生命科學的一個基本問題是在個體發育中,單個細胞如何分化成各種類型的組織細胞。這個過程高度依賴于基因表達的精確時空調控,而這種細胞特異基因表達與染色質的調控密切相關。比如,不同的順式調控原件增強子能夠在不同細胞中選擇性地激活目標基因。每個基因經常由分布在千堿基(kb)甚至兆堿基(Mb)以外的多個增
利用納米孔測序技術揭示基因表達的染色質調控基礎
作為染色質的基本單元,核小體由大約147 bp的DNA和組蛋白八聚體(H2A, H2B, H3和H4)組成。核小體的動態定位和折疊組織會產生兩種不同的染色質狀態:“開放”(open)和“閉合”(closed)。核小體的定位和染色質狀態的動態變化對以DNA為模板的生物學過程(比如,轉錄、DNA復制
擬南芥基因組加倍導致的三維染色質結構及基因表達調控
6月11日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物分子遺傳國家重點實驗室方玉達研究組題為The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
染色質修飾如何調控基因表達? 中國學者提出新見解
中科院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心的研究人員最新發表兩篇Nature Genetics文章,利用生化、分子、遺傳、組學及結構生物學等研究方法,分別揭示了植物特有染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的SHL和EBS形成BAH-EMF1復合體而介導植物基因沉默
染色質結構對轉錄調控的影響
真核細胞中染色質分為兩部分,一部分為固縮狀態,如間期細胞著絲粒區、端粒、次溢痕,染色體臂的某些節段部分的重復序列和巴氏小體均不能表達,通常把該部分稱為異染色質。與異染色質相反的是活化的常染色質。真核基因的活躍轉錄是在常染色質進行的。轉錄發生之前,常染色質往往在特定區域被解旋或松弛,形成自由DNA,這
由染色質調控的基因隱秘轉錄參與哺乳動物干細胞衰老
細胞老化有其獨特而明顯的分子表型特征,但其誘導機制尚不完全清楚,基因隱秘轉錄 (cryptic transcription) 便是其中之一。基因隱秘轉錄現象是指基因在某些突變體中或應激情況下,開始從本應該被抑制的下游“類啟動子 (promoter-like) ”區域起始轉錄,并產生與基因原功能不
由染色質調控的基因隱秘轉錄參與哺乳動物干細胞衰老
細胞老化有其獨特而明顯的分子表型特征,但其誘導機制尚不完全清楚,基因隱秘轉錄 (cryptic transcription) 便是其中之一。基因隱秘轉錄現象是指基因在某些突變體中或應激情況下,開始從本應該被抑制的下游“類啟動子 (promoter-like) ”區域起始轉錄,并產生與基因原功能不
染色質蛋白非組蛋白的介紹
非組蛋白主要是指與特異DNA序列相結合的蛋白質,所以又稱序列特異性DNA結合蛋白(sequence specific DNA binding protein)。利用凝膠延滯實驗(gel retardation assay),可以在細胞抽提物中進行檢測。首先制備一段帶有放射性標記的已知特異序列的D