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  • CNCP2014在京開幕面向蛋白質組學大數據

    2014年11月12日, “第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP-2014)”在中國科學院計算技術研究所舉行。CNCP-2014由中國人類蛋白質組組織、中國科學院計算技術研究所、北京蛋白質組研究中心、北京生命科學研究所主辦,中國科學院計算技術研究所pFind團隊承辦,會議得到了賽默飛科技(中國)、布魯克(北京)公司的贊助。相比前兩屆CNCP,CNCP-2014設置特別研究專題,同一個研究專題又從干濕兩個方面組織報告,并在關注各領域最新進展的同時適度回顧領域的總體進展,更好地推動了中國的計算蛋白質組......閱讀全文

    第四屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP2016)

      一、CNCP會議簡介  隨著蛋白質組學的興起,特別是質譜技術的快速發展,蛋白質組學研究中產生的數據規模越來越大,必須通過先進的計算機算法、高效的軟件與硬件來自動處理大批量的蛋白質組數據,這已經成為蛋白質組學研究的一個重要分 支,即"計算蛋白質組學"(Co

    CNCP2018在京開幕-計算蛋白質組學——小人物的學術盛會

      分析測試百科網訊 2018年08月22日,“第五屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP-2018)”在中國科學院計算技術研究所舉行。CNCP-2018由中國科學院計算技術研究所、中國人類蛋白質組學會(CNHUPO)、北京蛋白質組研究中心徐平實驗室、北京生命科學研究所董夢秋實驗室、中國科學院大連化學

    2014第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)學術報告(一)

      2014年11月12日, “2014第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)”在中國科學院計算技術研究所

    2014第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)學術報告(二)

      2014年11月12日, “2014第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)”在中國科學院計算技術研究所舉行。CN

    CNCP蛋白質組學生物質譜技術評測揭榜-這家中心獲第一!

      由賀思敏老師,劉超老師率領中國科學院計算技術研究所 pFind 團隊聯合CNCP組織單位,進行的CNCP-2020蛋白質組學生物質譜技術評測近日終于揭榜。共有來自15家單位的20個實驗室采集到的26套數據參與此次測評,參與者針對Thermo公司提供的HeLa細胞標準品,利用各自實驗室認為最合適的

    蛋白質組和蛋白質組學分析

    ?隨著人類基因 組計劃研究成果的公布,人們對基因的認識逐漸清晰,但基因數量的有限性和基因結構的相對穩定性,與生命現象的復雜性和多樣性之間存在巨大反差。如何了解眾多的基因與危害人類身心健康的疾病之間的關系,對生命科學研究者來說仍是一項長期而艱巨的任務。因此,作為生命活動的直接承擔者――蛋白質,成為后基

    蛋白質組與蛋白質組學簡介2

    3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白

    蛋白質組與蛋白質組學簡介1

    一、蛋白質組概念:一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表

    蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線

    基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類

    蛋白質組,蛋白質組學及研究技術路線

    基因組(genome)包含的遺傳信息經轉錄產生mRNA,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類的mRNA稱為轉錄子組(transcriptome)。很顯然,不同細胞在不同生理或病理狀態下轉錄子組包含的mRNA的種類不盡相同。mRNA經翻譯產生蛋白質,一個細胞在特定生理或病理狀態下表達的所有種類

    楊芃原教授宣布第三屆中國計算蛋白質組學研討會圓滿閉幕

      2014年11月13日,“第三屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP-2014)”在中國科學院計算技術研究所落下帷幕,

    首屆中國計算蛋白質組學研討會在計算所召開

    會議現場  11月10日,中科院計算技術研究所前瞻研究實驗室生物信息學研究組主辦的“首屆中國計算蛋白質組學研討會”在計算所開幕。   “計算蛋白質組學”是生物信息學中一個新的研究方向,其最基本的內容是蛋白質序列、結構和功能的規模化研究,一個簡明的定義是“系統生物學的高通量分析”。美國

    蛋白質(二)相關計算

    相關計算原子數由m個氨基酸,n條肽鏈組成的蛋白質分子,至少含有n個—COOH,至少含有n個—NH2,肽鍵m-n個,O原子m+n個。分子質量設氨基酸的平均相對分子質量為a,蛋白質的相對分子質量=ma-18(m-n)基因控制基因中的核苷酸6信使RNA中的核苷酸 3蛋白質中氨基酸 1

    蛋白質濃度計算

    1ml蛋白質,你稀釋到了100ml, 說明現在里面有1%的蛋白質。然后取0.6毫升,對考馬斯和蒸餾水,里面現在有(0.6/6.0)×0.01毫升的蛋白質。測完光,對完標準曲線后,得到的12.777ug/ml 是0.001毫升的蛋白質的濃度哦。所以, 總的蛋白質濃度,也就是一開始的那1毫升里的蛋白質濃

    蛋白質濃度計算

    1ml蛋白質,你稀釋到了100ml, 說明現在里面有1%的蛋白質。然后取0.6毫升,對考馬斯和蒸餾水,里面現在有(0.6/6.0)×0.01毫升的蛋白質。測完光,對完標準曲線后,得到的12.777ug/ml 是0.001毫升的蛋白質的濃度哦。所以, 總的蛋白質濃度,也就是一開始的那1毫升里的蛋白質濃

    蛋白質組鑒定技術

    如果目前分離蛋白質組的最好技術是2-DE,那么隨之而來的挑戰是數百數千個蛋白如何被鑒定. 在這里,我們不考慮傳統的蛋白鑒定方法,如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一個有機體中有意義的基因的過表達. 并不是因為這些方法無效,而是因為它們通常耗時

    蛋白質組是什么

    蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一個基因組(genOME),或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(PROTein). 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變. 在轉錄時,一個基因可以多種mRNA形式剪接,一個蛋白質組不是一個

    蛋白質組鑒定技術

    如果目前分離蛋白質組的最好技術是2-DE,那么隨之而來的挑戰是數百數千個蛋白如何被鑒定. 在這里,我們不考慮傳統的蛋白鑒定方法,如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一個有機體中有意義的基因的過表達. 并不是因為這些方法無效,而是因為它們通常耗時、耗

    蛋白質組鑒定技術

    ?如果目前分離蛋白質組的最好技術是2-DE,那么隨之而來的挑戰是數百數千個蛋白如何被鑒定. 在這里,我們不考慮傳統的蛋白鑒定方法,如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一個有機體中有意義的基因的過表達. 并不是因為這些方法無效,而是因為它們通常耗時、耗力,不

    蛋白質組是什么

    蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一個基因組(genOME),或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(PROTein). 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變. 在轉錄時,一個基因可以多種mRNA形式剪接,一個蛋白質組不是一個

    蛋白質組的概念

    蛋白質組(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一個基因組(Genome),或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(protein). 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變。?在轉錄時,一個基因可以多種mRNA形式剪接,一個蛋白質組不是一個

    蛋白質組服務介紹?

    基因是生物體的基本遺傳單位。然而,基因本身并不能直接行使功能,其功能的發揮最終需要通過表達出的蛋白質體現出來。蛋白質是細胞所有功能的主要執行者,其功能的發揮決定了人體健康與疾病的各種狀態。蛋白質組是在宏觀的角度全面、系統地解析蛋白質狀態與功能的科學,是“后基因組”時代的核心研究內容。蛋白質組是比基因

    蛋白質組研究系統

    4700 TOF/TOF蛋白質組分析系統4700TOF/TOF蛋白質組分析系統是全球第一臺TOF/TOF 串聯飛行質譜儀,它作為目前的最新質譜技術,它一問世即被世界各大蛋白組研究中心和著名蛋白質實驗室所爭相采用。它由兩級TOF和高能碰撞池組成,其工作原理是離子在MALDI源中產生并被加速和聚焦;對于

    首屆中國計算蛋白質組學研討會第一輪通知

      The First China Workshop on Computational Proteomics (CNCP2010)   2010年11月10日至11日, 北京   一.會議簡介   隨著蛋白質組學的興起,特別是質譜技術的快速發展,蛋白質組學研究中產生的數據規模越來越大。依靠簡單

    學術小人物的學術盛會-第二屆中國計算蛋白質組學會議

    “2012第二屆中國計算蛋白質組學研討會(CNCP)”在北京舉行   【導語】蛋白質組學研究產生大量的數據,簡單的手工處理無法滿足需求。將計算機算法與軟件工具結合自動處理蛋白質組數據,成為蛋白質組學研究的重要分 支,這就是“計算蛋白質組學”,以解

    蛋白質組的鑒定方法

    如蛋白質鑒定結果、蛋白質的亞細胞定位、蛋白質在不同條件下的表達水平等信息。目前應用最普遍的數據庫是NRDB和dbEST 數據庫。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等幾個數據庫組成,dbEST是由美國國家生物技術信息中心(NCBI)和歐洲生物信息學研究所(EBI)共同編輯的核酸數據庫;

    蛋白質組技術(Proteomic-Techniques)

    一、研究材料1995年,Wasinger等在第一篇蛋白質組研究文章中研究的對象為目前已知最小但能自主復制的原核微生物——支原體Mycoplasma genitalium。1996年,研究對象即擴展到單細胞真核生物——酵母以及人體正常組織及病理標本[28],進而突破了早期人們普遍認為的“蛋白質組研

    蛋白質組的鑒定方法

    如蛋白質鑒定結果、蛋白質的亞細胞定位、蛋白質在不同條件下的表達水平等信息。目前應用最普遍的數據庫是NRDB和dbEST 數據庫。NRDB由SWISS2PROT 和GENPETP 等幾個數據庫組成,dbEST是由美國國家生物技術信息中心(NCBI)和歐洲生物信息學研究所(EBI)共同編輯的核酸數據庫;

    蛋白質組鑒定技術簡述

    如果目前分離蛋白質組的最好技術是2-DE,那么隨之而來的挑戰是數百數千個蛋白如何被鑒定。在這里,我們不考慮傳統的蛋白鑒定方法,如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的comigration分析,或者在一個有機體中有意義的基因的過表達。并不是因為這些方法無效,而是因為它們通常耗時、耗力,不

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