蛋白質組學的標準化(上)
Tim Wehr 由于人類基因序列的建立已經接近完成，人們認識到生物科學屆的下一項任務將是表征基因組的產物——其中絕大部分是蛋白質。作為正在興起的研究領域，蛋白質組學將其研究目標定位于：鑒定和測量在一個細胞或組織中的所有蛋白質，這樣做的預期是，將能發現那些能夠成為疾病生物標志物(biomarker)或藥物靶標的候選蛋白質。經證明，這是一項令人望而生畏的工作，難度之一在于，25,000個基因中的每一個都會產生拼接、翻譯后修飾，最后表達的蛋白質數量將會大大增加。另一個增加難度的因素是蛋白質的濃度范圍太廣——通常為許多個數量級——并且很可能大多數人們感興趣的都是那些低豐度的蛋白。 目前，已有大量的技術和實驗方法用于解決蛋白質組學的問題。其中應用最廣泛的是“自下而上”的方法。用蛋白質水解酶(典型的為胰蛋白酶)將細胞提取液或溶胞產物中的所有蛋白質酶解，接著用反相液相色譜(LC)分離，然后在線引入電噴霧源的質譜。一種參考的液......閱讀全文
近800萬中標蛋白質組質譜離子淌度分析系統
近日，上海同霖進出口有限公司發布《國科大杭州高等研究院蛋白質組質譜離子淌度分析系統中標(成交)結果公告》，花費7999000.00元采購蛋白質組質譜離子淌度分析系統。詳細信息如下：一、項目編號：ZJ-2362483二、項目名稱：國科大杭州高等研究院蛋白質組質譜離子淌度分析系統三、中標（成交）信息1.
ASMS－2023丨布魯克質譜新品繼續引領單細胞蛋白質組學
MS/MS掃描速度提升至300Hz的timsTOF Ultra，進一步推進空間蛋白質組學和單細胞多組學；新型離子源和微升流噴霧針、采集方法和軟件帶來更穩定、更靈敏、更快速的4D-蛋白質組學 01.timsTOF Ultra 質譜儀 timsTOF Ultra PASEF掃描速度提高至300
島津攜手質譜專家，北京共話組學發展?——2023北京質譜專家沙龍組學專題會議
2023年8月17日，島津企業管理（中國）有限公司舉辦的“2023質譜專家沙龍-組學專題會議”在北京成功召開。會議旨在促進質譜及組學行業專業人士交流、學習與合作。來自于國內各大高校及科研院所的四十余位專家學者參加了本次會議。?會議現場?主持人?島津企業管理（中國）有限公司，分析計測事業部營業部，北京
質譜檢測法與蛋白質分析
在生命科學研究工作中有一個重要問題，就是發現、鑒定蛋白質并弄清楚它們的一級結構。知道了蛋白質的氨基酸序列信息，我們就可以通過遺傳密碼將其與編碼序列對應起來，從原則上來說，也就將細胞的生理學與遺傳學聯系起來了。發現、鑒定出了一個蛋白質就好像給我們打開了一扇窗，透過這個窗口，我們就能夠對復雜的細胞調控網
質譜檢測法與蛋白質分析
? ? 質譜分析法是蛋白質研究領域和生物大分子研究領域中最重要的分析技術。由于我們對蛋白質鑒定、定量和分析的要求越來越高，希望檢測技術的靈敏度也越來越高，同時能夠對更為復雜的樣品進行分析處理，因此推動了質譜檢測技術的發展，出現了一大批新興的質譜分析方法和儀器。? ? 在生命科學研究工作中有一個重要問
賽默飛世爾科技精彩亮相第六屆AOHUPO大會
2012年5月5~7日，第六屆亞太人類蛋白質組組織(AOHUPO)大會在國家會議中心卡隆重召開，這是亞太地區規模最大、影響最廣、學術水平最高的蛋白質組學學術峰會。賽默飛世爾科技作為此次大會的金牌贊助商，展示了其蛋白質組學領域的最新產品技術及解決方案。賽默飛世爾科技展臺大會入口處擺設了賽
暨大研發另類質譜鑒定算法，大幅提高蛋白質組鑒定能力
暨南大學的研究人員利用翻譯組測序(RNC-seq)數據作為穩態細胞內蛋白質的“標準答案”，并另辟蹊徑，提出了蛋白水平上的一種簡單有效的多算法結果整合策略，不用做額外的實驗，零成本輕松提高蛋白質組鑒定數量，同時有效降低假陽性率。 鳥槍法質譜(shotgun mass spectrometry)是
楊芃原：色譜質譜聯用中的保留時間校正和蛋白質組定量
2014年4月20日上午，第十屆全國生物醫藥色譜及相關技術學術交流會大會報告在威海盛大召開。來自復旦大學的楊芃原教授作為本次大會的嘉賓，帶來了題為《色譜-質譜聯用中的保留時間校正和蛋白質組定量》的報告。 復旦大學 楊芃原教授 楊芃原教授首先說道現今蛋白質組的色譜分離和分析已經產
CASMS分論壇：Topdown蛋白質組學和原位質譜新進展
分析測試百科網訊 美國東部時間2021年8月9日-13日，首屆美國華人質譜學會（CASMS）學術研討會暨展覽會在Gather.Town隆重舉行。在12日“New Advances in Top-down Proteomics and Native Mass Spectrometry”分論壇中，加
《Nature》：新方法提高單細胞蛋白質組學質譜定量準確度
單細胞蛋白質組學在蛋白豐度檢測、轉錄修飾和翻譯后修飾方面填補了單細胞轉錄組學的空白。單細胞蛋白質組學質譜（SCoPE-MS）是近年來興起的一種定量分析多功能單細胞蛋白質組的方法，這種方法采用同位素標記和載體蛋白質組學來分析單個細胞【1】。同位素標記具有相同質量的化學標簽，其中包含了獨特的質量條碼
1200萬！南京農業大學采購單細胞蛋白質組學質譜
近日，南京農業大學發布2022年11月政府采購意向，計劃以1200萬元預算采購單細胞蛋白質組學質譜。詳情如下：單細胞蛋白質組學質譜項目所在采購意向：南京農業大學2022年11月政府采購意向采購單位：南京農業大學采購項目名稱：單細胞蛋白質組學質譜預算金額：1200.000000萬元(人民幣)采購品目：
質譜檢測法與蛋白質分析（二）
? 離子回旋加速器與軌道離子阱質譜儀 隨著功能強大的帶有外部離子源的傅里葉變換-離子回旋加速器(FT-ICR)質譜儀的出現以及商業化，我們在質譜儀的分辨率與準確性方面取得了質的飛躍。有了這種新型的質譜儀，我們現在可以對ppm級乃至亞ppm級的樣品進行分析了。該質譜儀的高分辨率特性不僅提高了數
質譜研究蛋白質相互作用（一）
質譜技術已經成為了蛋白質組學研究的主力。這種技術方法能精確的檢測多肽，從而幫助研究人員識別并測序多肽分子，分析它們的特征，了解它們如何進行化學修飾的。 但大多數蛋白質并不是單獨行動的，一些關鍵的生物學過程，如DNA 復制、轉錄、翻譯、細胞分裂和能量生成都依賴于大型蛋白復合物的行為，這些蛋白復合
質譜檢測法與蛋白質分析（三）
Protein(s)：待測蛋白質樣品;Enz. Digestion：酶解;Pep. Mixture：裂解產物混合物; MS Analysis：質譜檢測分析;DB Search：數據庫比對搜索;Identities：鑒定; Prot.DB ：蛋白質數據庫;Proteom
質譜檢測法與蛋白質分析（二）
傳統的和最新的蛋白質組學研究策略雖然到目前為止，還沒有一種蛋白質組學研究策略能夠對某個蛋白質組進行常規的、完整的分析，但是現在的技術已經非常強大，我們相信，很快就能進行全蛋白質組學研究了。而且，對某個亞蛋白質組（比如某個細胞器或亞細胞結構的蛋白質組）進行研究早就已經不是什么難題了，這已經成為了一種常
質譜檢測法與蛋白質分析（一）
? 質譜分析法是蛋白質研究領域和生物大分子研究領域中最重要的分析技術。由于我們對蛋白質鑒定、定量和分析的要求越來越高，希望檢測技術的靈敏度也越來越高，同時能夠對更為復雜的樣品進行分析處理，因此推動了質譜檢測技術的發展，出現了一大批新興的質譜分析方法和儀器。本文將對近幾年質譜技術的發展以及質譜技術在蛋
質譜檢測法與蛋白質分析（一）
質譜分析法是蛋白質研究領域和生物大分子研究領域中最重要的分析技術。由于我們對蛋白質鑒定、定量和分析的要求越來越高，希望檢測技術的靈敏度也越來越高，同時能夠對更為復雜的樣品進行分析處理，因此推動了質譜檢測技術的發展，出現了一大批新興的質譜分析方法和儀器。本文將對近幾年質譜技術的發展以及質譜技術在蛋白質
島津攜手質譜專家，北京共話組學發展
——2023北京質譜專家沙龍-組學專題會議2023年8月17日，島津企業管理（中國）有限公司舉辦的“2023質譜專家沙龍-組學專題會議”在北京成功召開。會議旨在促進質譜及組學行業專業人士交流、學習與合作。來自于國內各大高校及科研院所的四十余位專家學者參加了本次會議。分析測試百科網為您報道精彩內容
暨大另類質譜鑒定算法策略大幅提高蛋白質組鑒定能力
鳥槍法質譜(shotgun mass spectrometry)是蛋白質組研究的標準研究方法。從質譜譜圖中鑒定蛋白質需要依賴搜庫算法,現有許多算法被開發出來，常見的如Andromeda(Maxquant), Mascot, COMPASS, X!Tandem, pFind, InsPecT, P
賽默飛世爾舉辦“蛋白質組學及質譜基礎知識”網絡講座
2011年3月23日，賽默飛世爾科技借分析測試百科網這一平臺成功舉辦了本月第三場網絡視頻講座——蛋白質組學及質譜基礎知識。賽默飛世爾科技蛋白質組學市場專員唐佳工程師為大家介紹了蛋白質組學、生物質譜的發展歷史、基本原理、最新進展以及The
捕集離子淌度質譜帶來磷酸化蛋白質組研究新的深度
Yasushi Ishihama 教授 京都大學分子與細胞生物分析實驗室 2021年1月發表于www.ddw-online.com 目前，在蛋白質生物化學和蛋白質組學相關研究中，質譜（MS）已廣泛應用于鑒定和表征蛋白質。且隨著技術的不斷發展，質譜已經實現了更高的覆蓋深度、更快的分析速度和更
第二屆西湖臨床質譜研討會－探討臨床蛋白質組學
Progresses and Perspectives of?Mass Spectrometry-based?Clinical Proteomics 基于質譜的臨床蛋白質組學的研究進展與展望聯合主席：Steve Pennington 賀福初 郭天南主辦單位：西湖大學 CNHUPO HUPO會議
第三屆質譜論壇：質譜技術在組學研究中的應用
技術講座 沃特世科技（上海）有限公司技術專家 賈偉博士 來自沃特世科技（上海）有限公司技術專家賈偉博士帶來了題為《蛋白質結構質譜分析技術進行》的報告。賈博士在報告中重點介紹了蛋白質修飾分析、蛋白高級結構分析和蛋白差異構象分析這三方面內容。 蛋白質修飾分析 蛋白質
基于QOTqIT質譜系統的蛋白質組學快速鑒定（四）
A: 1 μg HeLa結果比較; B: 50 ng HeLa結果比較. 以每項最高值為100%?3 討論 隨著“一小時酵母蛋白質組”全覆蓋的實現, 蛋白質組深度覆蓋研究迎來新的時代[6]. 在復雜樣本蛋白質組研究中, 傳統方法需要進行二維分離、分級的方式簡化樣本、充分分離, 這樣不僅操作費力,
基于液質聯用的單細胞蛋白質組學研究進展
摘要????蛋白質是細胞功能的主要執行者，由于其無法在體外進行擴增，單細胞蛋白質組學技術相較單細胞基因組學和轉錄組學技術而言發展相對滯后。傳統的蛋白質組學技術可獲得大量細胞蛋白表達的平均值，但忽略了細胞亞型及細胞異質性等信息。單細胞水平的蛋白質分析有助于闡明細胞不同表型與異質性的分子基礎。隨著質譜儀
HUPO－2011：AB－SCIEX研討會上啟動新的人類蛋白質組計劃
HUPO2011上 全球蛋白質組學研究者匯聚一堂推進人類蛋白質組計劃 瑞士日內瓦，蛋白質組研究領域的領袖們在HUPO 2011上匯聚一堂，為人類蛋白質組計劃(Human Proteome Project , HPP) 定義新的短期里程碑。這一全球范圍內的
PB反應結緣小型質譜，脂質組學研究再添利器
近日，Nature Methods雜志（IF25.06）報道了清華大學歐陽證教授和瑕瑜教授在質譜小型化及脂質同分異構體研究領域取得的研究進展。圖片來源于Nature Methods PB反應解鎖脂類C=C雙鍵位置 哺乳動物細胞脂質組中含有較多的同分異構體，這對于脂質的定量和分析是一個挑戰。近
質譜在蛋白質組學中的應用實驗
實驗材料 冷凍干燥樣品試劑、試劑盒 校準標準品基質溶液甲醇儀器、耗材 MALDI 質譜儀MALDI 板實驗步驟 1.吸取 0.5ul 的基質溶液，加到 MALDI-MS 分析所用的金屬樣品板上的樣品孔中（為了準確起見，請使用2ul 的移液器）。2.在基質干燥之前，迅速加入 0.5ul 的標準品或樣品
質譜在蛋白質組學中的應用實驗
方案1 蛋白質和多肽 MALDI-MS 分析的一般方法 方案2 反相微型層析柱的制備實驗 方案3 固定化酶微型層析柱的制備 方案4 用于蛋白質組分析的微毛細管 HPLC 色譜及 ESI —體化裝置的制備和使用 方案5 利用 Nano-LC