NK/T細胞淋巴瘤好發于鼻咽部位,是一類高發于亞洲和南美洲的惡性淋巴瘤。EB病毒感染被認為是NK/T細胞淋巴瘤發病的重要誘因,但其中的具體分子機制尚未被完全揭曉;并且,相對于95%以上成人已攜帶EB病毒,EB病毒感染與多種其他腫瘤相關的現象讓EB病毒感染的致癌作用和機制更顯神秘。
近日,中山大學腫瘤防治中心貝錦新和曾益新課題組首次發現NK/T細胞淋巴瘤中EB病毒的特征圖譜,其重要疾病特異序列特征和分子事件,提示EB病毒致病機制可能類似于HPV和HBV,通過病毒基因整合插入致宿主基因表達干擾,進而導致腫瘤發生發展的新機制。
這一研究以“Genomic and transcriptomic landscapes of Epstein-Barr virus in extranodal natural killer T-cell lymphoma(結外NK/T細胞淋巴瘤中EB病毒基因組學與轉錄組學圖譜)”為題,公布在Leukemia上(IF=10.023)。
為揭示EB病毒在NK/T細胞淋巴瘤發病中扮演的角色,中山大學腫瘤防治中心貝錦新和曾益新課題組利用高通量測序技術獲取了NK/T細胞淋巴瘤中EB病毒基因組與表達譜信息,并與公共數據庫相應數據進行比較分析。
結果發現,NK/T細胞淋巴瘤中存在特異的EB病毒基因組序列突變特征,而且EB病毒編碼基因表達圖譜與鼻咽癌、胃癌等EB病毒相關腫瘤存在顯著區別,說明EB病毒可能通過獨特的分子機制參與NK/T細胞淋巴瘤發生發展,提示存在特定轉化能力的疾病特異EB病毒亞型。
進一步分析發現,NK/T細胞淋巴瘤樣本中EB病毒基因組存在多克隆現象,同時普遍存在大片段缺失事件,包括重要的BART基因區域;深入分析還發現,患者腫瘤基因組中存在EB病毒基因片段整合插入事件;這些分子事件,均造成相應區域基因的干擾現象,比如BART區域miRNA的表達缺失、NHEJ1的異常低表達等。已有的研究證實這些關鍵基因異常與多種腫瘤發生發展有關,提示了EB病毒參與致癌貢獻的新機制。
這一研究首次在多組學水平繪制了NK/T細胞淋巴瘤中EB病毒的特征圖譜,發現EB病毒的重要疾病特異序列特征和分子事件,提示了類似于HPV和HBV的病毒整合插入致使的宿主基因表達干擾可能是EB病毒參與腫瘤發生發展的新機制,為EB病毒的可致癌潛力提供了又一重要證據,為研發EB病毒疫苗和篩選腫瘤治療靶點提供了新的依據和思路。《自然》子刊《白血病》在短短兩個月內直接接受并在線發表了這項成果。
中山大學腫瘤防治中心貝錦新研究員、曾益新院士和新加坡國立癌癥中心Choon Kiat Ong研究員為本文的通訊作者,彭柔君副主任醫師、韓博煒特聘副研究員、蔡清清主任醫師為共同第一作者。
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