數字PCR在臨床和預后融合基因檢測的應用

眾所周知，融合基因檢測對臨床診斷及預后指導都具有十分重要的意義。那么究竟什么是融合基因呢？

融合基因的發現始于上個世紀60年代，它是指染色體斷裂后又重新拼接。如果恰巧拼接時發生了錯誤，使兩個不同基因互相融合，大多數情況下，它會造成某些序列或功能異常的蛋白表達，亦或者是某些基因表達失調，從而促進腫瘤的發生。

傳統的數字PCR檢測融合基因的方法主要有顯微觀察，原位雜交等；新一點的方法有高通量測序等，但多因為發生基因融合原因的多樣性，融合基因的表達量較低等因素而達不到精確的測定。

目前，新的定量技術-數字PCR方法的發展使得精確檢測融合基因變成了可能。如一篇文章中報道所示

毛細胞星形細胞瘤（Pilocytic astrocytomas）是年輕患者中最常見的神經膠質瘤亞型，占所有神經膠質瘤的5.4％。KIAA1549基因和BRAF基因融合是毛細胞星形細胞瘤的標志，能夠精確檢測到二者的融合對于診斷至關重要。此外，由于KIAA1549-BRAF融合性地激活MAP激酶途徑，因此它也代表了諸如MEK抑制劑之類的藥物的靶標。研究人員用數字PCR的方式檢測了一批福爾馬林固定石蠟包埋組織上的KIAA1549-BRAF基因融合情況，包括40個毛細血管星形細胞瘤，27個難以分類的神經上皮腫瘤，15個胚胎發育不良的神經上皮瘤和18個神經膠質瘤。并將該結果和檢測KIAA1549-BRAF融合狀態的金標準技術RNA測序方法進行比較，結果發現與RNA測序相比，數字PCR檢測的靈敏度和特異性為100％。

到目前為止，人們已經發現了大約2萬個融合基因，但是它們在癌癥發展中相關機制仍知之甚少。因此，能夠精準的檢測出融合基因并對其進行相關研究，是癌癥精準醫療中的重要一步。目前采用數字PCR進行融合基因的檢測正逐漸變成一種主流方法。

微滴芯片數字PCR系統，利用cutting-edge微流體創新型芯片——Sapphire芯片作為數字PCR過程的唯一耗材。樣品通過毛細通道網格以30,000個微滴的形式進入2D芯片中。并且還是首款3色熒光檢測儀器，整個流程只需要兩個半小時。結合強大的圖像分析技術和直觀可視的檢測功能，從而達到了數字PCR定量卓越的置信水平，獲得的數據真實可信。