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  • 發布時間:2020-02-24 10:49 原文鏈接: 基因研究證實新冠病毒并非來自華南海鮮市場

      1月27日,Science在線發表了一篇新聞報道,有研究人員推測新型冠狀病毒可能并非源自華南海鮮市場。理由是,最初的一個病例在12月1日患病,但與華南海鮮市場無關。

      如今,這個推測被中國科學家最新的基因研究成果所證實。相關研究已發表在中國科學院科技論文預發布平臺ChinaXiv。

      截止2月12日,中國科學院西雙版納熱帶植物園聯合華南農業大學和北京腦科中心的科研人員一起收集了全世界各領域共享到GISAID EpiFluTM數據庫中覆蓋了四大洲12個國家的93個新型冠狀病毒樣本的基因組數據,通過全基因組數據解析,追溯傳染源及擴散路徑。研究結果發現:

      新型冠狀病毒并非來自武漢華南海鮮市場

      研究收到的93個樣本包含58種單倍型,單倍型演化關系顯示,單倍型H13和H38是比較“古老的”單倍型,通過一個中間載體(mv1,可能是一個祖先單倍型,可能是來自中間宿主或者“零號病人”)與蝙蝠冠狀病毒RaTG13關聯,并通過單倍型H3衍生出了單倍型H1。

      與華南海鮮市場有關聯的患者樣品單倍型都是H1及其衍生的單倍型H2、H8-H12,而一份武漢樣品單倍型H3與華南海鮮市場無關。可見,華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其他地方傳入進來,在市場中發生快速傳播蔓延到市場之外。

      新冠病毒發生過2次明顯的種群擴張

      根據新型冠狀病毒基因組發生重組時間推算,1月之前的種群擴張發生時間是12月8日。這一結果也暗示了,病毒可能在12月初,甚至11月下旬已經開始有人際傳播,隨后在華南海鮮市場加快了人際傳播。

      另一次種群擴張發生在1月6日,這可能與元旦假期有關聯。也是在這一天,國家疾控中心發布了2級應急響應。當時的預警起到了一些警示作用,公眾活動和出行都有所減少。如果當時的警示能引起大眾更廣泛的重視,那么1月份中下旬向全國和全球蔓延的病例會有所降低。

      該研究進一步確認了,我國其他9個省區和其他11個國家的感染病例基本都是從武漢直接或者間接輸入而來。

      現擴散的病例至少來自于3個途徑

      為了能夠細分來源,研究人員將58種單倍型分成了五組,包括3個古老超級傳播者單倍型(H1, H3和H13)和2個新的超級傳播者單倍型(H56和mv2)。

      以此鑒別出廣東的病毒可能有三個來源,重慶和中國臺灣的病毒有兩個來源。其中,廣東深圳一家人在早期就通過人傳人進行了傳播。澳大利亞、法國、日本、美國的樣本相對較多,這些患者感染源至少有兩個,而美國甚至包括了五個來源。

      特別值得關注的是H56這個超級傳播者單倍型,它同時是澳大利亞、法國、美國,以及中國臺灣患者的傳染源。

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