Nature重要成果：繪制癌癥的全面分子圖譜

根據一項獲得美國國立衛生研究院（NIH）支持的新研究發現一種乳腺癌亞型與難治性高分級漿液性卵巢癌具有許多共同的遺傳特征。研究結果表明兩種癌癥具有相似的分子起源，這可能推動比較乳腺癌和卵巢癌亞型的治療學數據。

研究人員利用癌癥基因組圖譜（TCGA）生成的部分數據，根據來自825名乳腺癌患者樣本的綜合特征鑒定描述了對四個標準分子亞型的新認識。

這些研究獲得了來自NIH下屬的美國國家癌癥研究所（NCI）和國立人類基因組研究所（NHGRI）的經費支持，相關論文在線發布在9月23日的《自然》（Nature）雜志上。

“TCGA對于他們高質量樣本的綜合特征鑒定使得研究人員能夠對這些乳腺癌亞型獲得前所未有的認識，”NIH主任Francis S. Collins博士說。

基因組數據分析證實存在有4種主要的乳腺癌亞型：每一種都具有其獨特的生物學和生存觀。以大量的乳腺癌樣本為基礎，這些TCGA研究結果獲得了基因組改變的全面圖譜。這四組乳腺癌的固有亞型是：HER2富集(HER2E)、管腔A型(LumA)、管腔B型 (LumB)和基底樣（basal-like）。發現的第五種亞型稱作正常樣（Normal-like），因為數量少（只有8個樣本）研究人員無法嚴格地對其進行研究。

TCGA研究網絡揭示了基底樣亞型和漿液性卵巢癌之間顯著的基因組相似性。兩種癌癥類型的突變譜或基因組突變類型及頻率很大程度上相同。進一步的研究發現了一些額外的共同基因組特征，例如基因突變頻率，表明不同的基因組變異可以集中于有限數量的癌癥亞型。

計算分析表明基底樣乳腺癌和漿液性卵巢癌可能都對抑制血管生長、切斷腫瘤血供的藥物以及靶向DNA修復的化合物，其中包括諸如順鉑等化療藥物敏感。

基底樣亞型也被稱作三陰性乳腺癌，這是因為許多（但并非全部）的基底樣腫瘤三種受體測試均為陰性，包括雌激素受體、孕激素受體和人類表皮生長因子受體2 (HER2)。這些受體可以觸發有力的生長反應，并像名牌一樣起作用辨識細胞至環境。缺乏這些受體意味著靶向它們的治療將極可能是無效的。

“在乳腺癌的一個主要亞型中發現了卵巢癌的分子相似性，為我們比較這兩種癌癥的治療和結局提供了更多的支持。這一遺傳信息的無主寶藏需要詳細地展開研究以確定我們如何能夠在功能上和臨床上利用它。”

根據世界衛生組織（WHO）統計，全世界每年大約有130萬新增乳腺癌病例和45萬死亡。乳腺癌是婦女最常見的癌癥。大多數病例是散發的，這意味著沒有乳腺癌家族史，與遺傳性乳腺癌中基因使得某人易于罹患這一疾病相反。男性也會形成乳腺癌，但其占乳腺癌病例的不到1%。

具有HER2的乳腺腫瘤稱作HER2陽性，沒有的則稱作HER2陰性。當研究人員分析來自標準細胞檢測確定為HER2陽性腫瘤的基因組研究結果時，他們發現只有一半的樣品特征上屬于HER2E亞型。另一半的特征為Luminal亞型，表明臨床上定義的HEF2陽性腫瘤至少存在兩種類型。

一般來說，管腔型（Luminal subtype）具有最低的總突變率，但相比之下，具有最大數量顯著突變的基因。這表明在管腔型中每個被確定為顯著突變的基因都更有可能對推動癌癥進程起重要作用。這些管腔型以特異表達多個所謂的轉錄因子基因包括ESR1、GATA3、FOXA1、XBP1和cMYB的標記為特征。這些基因具有復雜的相互作用，在一系列有組織的激活作用中協作。GATA3和FOXA1經常發生突變，但這些突變是相互排斥的，這意味著這些突變要么是在GATA3或FOXA1中看到，而不會同時存在于兩者。但ERS1 和XBP1就只是高表達而很少突變。

TCGA計劃的規模使得研究人員能夠展開綜合分析，檢測這些基因組改變和相互作用的復雜模式。這種對癌癥基因組的密切調查將促成更深入地了解癌癥進程必需的突變，在該研究中還鑒別了幾個新的候選突變。作者們期望發現這些突變將是朝改善乳腺癌治療邁出的關鍵的一步。

這篇論文將焦點放在了與825名乳腺癌病例數據有關的一個綜合分析生成的研究發現上。這些數據是從TCGA數據庫（TCGA Data）免費獲取。

“由TCGA計劃生成的數據組成了一個龐大的資源，研究人員未來數年將一直從事這些資源的分析工作。關于乳腺癌基因組的信息資源將無疑推動癌癥研究團體無數的研究發現，”NHGRI主任Eric D. Green博士說。

迄今為止，癌癥基因組圖譜研究網絡已經發布了以下癌癥的分析結果：

?多形性膠質母細胞瘤
?卵巢漿液性腺癌
?結直腸腺癌
?肺鱗狀細胞癌