冰島deCODE發現前列腺癌的稀有變異

　　由冰島deCODE genetics公司領導的國際研究小組通過全基因組測序，鑒定出歐洲群體中8號染色體上一個與前列腺癌相關的稀有變異。該成果在線發表于10月28日的《Nature Genetics》上。

　　在西方國家，前列腺癌是男性中最常見的癌癥。之前的GWAS研究發現了幾十個與前列腺癌相關的常見變異，然而，每個SNP的風險水平都往往是中等或低。于是，在這項研究中，研究人員致力于發現那些在人群中發生頻率較低的前列腺癌相關變異，因為他們懷疑，稀有變異可能對疾病風險有著更為顯著的影響。

　　為了探索這種可能性，研究小組利用了71,700多名冰島人的基因分型數據。同時，他們還對1,795名冰島人開展了全基因組測序，覆蓋度至少為 10倍。這些信息幫助研究小組在發現階段追蹤了數百個前列腺癌相關的SNP，這主要集中在5,141名患有前列腺癌的冰島男性以及54,444名未受影響的男性對照。

　　變異主要分布在8號和17號染色體，而過去的研究也表明它們與前列腺癌有關。這促使研究人員進一步分析與疾病風險獨立相關的新變異。研究小組將范圍縮小到8號染色體上的一對SNP，之后在五組前列腺癌病例和對照中檢測了這兩個變異。這五組研究對象都有著歐洲血統，來自歐洲和美國。結果表明，兩個變異都與前列腺癌風險顯著相關。

　　之后，研究人員又對498名來自香港的前列腺癌患者以及467名來自芝加哥的非洲裔美國人對照進行了分析，發現這兩個SNP在非歐洲血統的個體中不呈現多態性。

　　在他們的后續分析中，研究人員集中在其中一個8號染色體變異(rs188140481)上。這個SNP比之前發現的常見變異更靠近染色體的端粒一端。此外，冰島人群以及其他歐洲血統人群的前列腺癌病例和對照的數據暗示，此SNP與前列腺癌的較早期診斷相關。rs188140481的攜帶者比未攜帶者早一年多診斷出前列腺癌。這說明比之前發現的常見變異相比，它與前列腺癌有著更密切的關系。

　　研究人員表示，他們還需要更多研究來確定這個新變異的功能作用。但到目前為止的結果表明，與之前GWAS研究發現的常見變異相比，它與歐洲人群中前列腺癌的更高風險相關。