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  • 發布時間:2013-03-15 15:09 原文鏈接: 昆明動物所構建秀麗線蟲脂代謝途徑網絡

      動物模型對研究脂代謝調控和代謝性疾病是必不可少的。模式生物秀麗線蟲(Caenorhabditis elegans)是第一個全基因組被測序的真核生物(1998年)。在過去的10多年中,由于其生活周期短、低成本、易培養和操作等優點,秀麗線蟲成為一個研究脂代謝調控、肥胖和肥胖相關代謝性疾病發病機理的良好模式動物。然而,至今為止,我們不清楚,秀麗線蟲基因組中有多少編碼脂代謝酶的基因和參與的代謝途徑,以及它們在果蠅、小鼠、大鼠和人中的保守性等。

      中國科學院昆明動物研究所梁斌研究員課題組張玉茹博士等人研究秀麗線蟲基因組發現,秀麗線蟲21000個左右的基因中,至少有471個基因是編碼脂代謝酶的基因,參與16條不同脂類的代謝途徑。由此,該研究團隊構建了第一個秀麗線蟲脂代謝基因數據庫,繪制了第一張秀麗線蟲脂代謝途徑網絡圖。同時,通過比較基因組學方法,他們進一步從人、小鼠、大鼠和果蠅基因組中分別發掘到581、585、563和428個脂代謝基因,其中,237個脂代謝基因在5個物種中都具有,70%以上的秀麗線蟲脂代謝基因在人中是保守的。在581個人的脂代謝基因中,97個和代謝性疾病有關,其中有94個在秀麗線蟲基因組中存在,表明秀麗線蟲和人的脂代謝基因高度保守。隨后,利用秀麗線蟲全基因組RNAi文庫的優勢,他們分析了356個脂代謝基因的生物學功能,發現有21個基因顯著影響脂肪含量和生長發育等。

      該研究第一次從基因組的角度分析了秀麗線蟲脂代謝基因及其代謝途徑,為該領域未來的研究提供了大量有益的資源,同時也進一步支持秀麗線蟲是研究脂代謝和代謝性疾病的良好動物模型。

      該文章近期在線發表于BMC Genomics。

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