目前,弗吉尼亞大學醫學院的研究人員設計出一種方法,檢測風靡科學界的CRISPR/Cas9基因編輯系統中意想不到的副作用。相關研究結果發表在最近的《Nature Biotechnology》。
稱為CRISPR的基因打靶系統,可讓我們編輯基因組中特定靶位點的遺傳信息。這種新方法揭示的系統,有可能會結合意想不到的位點,導致其中一些位點發生基因突變,這些突變可能對藥物療法的研究與開發,產生嚴重的后果。
然而,這種新方法也可以確定一些途徑,幫助阻止那些潛在危險的“脫靶”影響,讓科學家們可以改進這種重要的新基因編輯系統所得到的結果。
基因突變和如何避免它們
弗吉尼亞大學生物化學和分子遺傳學系的Mazhar Adli解釋說,基因操作的一個主要目標是糾正有害突變,所以避免突變的意外引入,是至關重要的。
他說:“我們知道,基因突變是疾病的標志。總體目標是,改變這些明顯的遺傳突變——去糾正這些突變。我們想,僅在靶向空間、靶向位點改變這些信息。如果你想改變任何其他信息,從根本上說,你就會引入你不想要的突變。你糾正一個基因,可能你就會在10個其他基因和基因組中的其他許多部位引入突變。”
CRISPR:“研究的圣杯”
Adli的新研究,揭示了CRISPR/Cas9基因編輯系統潛在的脫靶作用。該系統非常的受歡迎,因為它可讓科學家操作活體哺乳動物基因組的特定部分,成為科學研究一種極其重要的工具。它已被迅速而廣泛地采用,包括用于人類細胞研究,因為它相對簡單,許多實驗室都有資源來使用它。
Adli稱:“從根本上說,你可以靶定活細胞中的任何基因組區域,并改變遺傳信息,這在過去幾十年里一直是研究中的圣杯。從根本上說,能夠靶定和改變活細胞中的遺傳信息,是一個夢想。”
這一新研究有助于解釋支持CRISPR系統的機制,以及為什么它很容易受到脫靶基因突變的影響。
Adli稱:“我們不僅發現了它在基因組中的結合區域,還研究了為什么它定位到基因組中的這些區域。通過分析這些脫靶效應背后的特定序列,我們也找出了決定因素——為什么它靶定目標,而且也轉到這些脫靶區域?我們的研究表明,它定位在那里,是因為與原始靶向區域的一些相似性。”
“所以,我們的結果將有助于提高系統的特異性,以使我們能夠最大限度地減少脫靶。”
主要的突變影響
Adli的這項研究也表明,在CRISPR系統使用的一種關鍵酶的自然野生型,與其改變的、不常用的酶形式相比,可引入更多的突變。前者在基因編輯過程中,切割DNA的雙鏈,使突變發生,而后者只切割DNA的單鏈,使細胞能夠修復損傷,而不引入突變。
他說:“很遺憾,野生型(自然發生的酶)更容易處理。所以,該領域的每個人都使用野生型酶。現在這篇論文和其他即將發表的論文中,他們將要停止使用野生型酶。他們必須使用改變了的酶形式,來克服脫靶效應。”
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