DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記，在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用，不同物種所采用的機制亦各不相同。因而，整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析，可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異，并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。
中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室章張研究組、劉江研究組以及所級中心信息室組成的開發團隊，在研究所高性能計算平臺和大數據存儲平臺的有力支撐下，共同開發完成“基于高通量測序的單堿基精度DNA甲基化重編程數據庫MethBank”，該成果于2014年10月在國際生物信息學領域期刊Nucleic Acids Research 在線發表。
MethBank是面向多種模式生物配子和早期胚胎多個不同發育時期的DNA甲基化組重編程數據庫，整合的數據包括甲基化水平、差異甲基化區域、CpG島甲基化水平等，全部是全基因組單堿基精度的DNA甲基化數據，且集成了其它包括基因表達信息、SNP信息等在內的相關組學數據信息。此外，MethBank提供一個支持多組學數據的交互式甲基化瀏覽器，能夠高分辨度地實現DNA甲基化圖譜以及其它相關數據的可視化。
MethBank現今整合集成了斑馬魚和小鼠各自9個不同發育時期的全基因組單堿基精度DNA甲基化數據，每個時期包含全基因組約90%CG位點的甲基化信息，且對應的數據庫表存有上千萬條記錄，數據庫存儲大小分別為15G和9G。MethBank的開發建立實現了海量甲基化大數據的整合與可視化，為后續其它多個物種的大數據整合提供了流程方法和數據平臺。
該項研究得到了中國科學院、科技部和國家自然科學基金委的資助。
數據庫頁面
中國科學院分子細胞科學卓越創新中心研究員石建濤，聯合上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院教授方海，在《基因組研究》（GenomeResearch）上，在線發表了題為ADNAmethylationhaplot......
微藻在全球光合作用、二氧化碳固定及初級生產力中貢獻卓著，是頗有前景的合成生物學底盤細胞。為了探索工業固碳產油微藻的表觀遺傳機制和生理作用，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心以海洋微擬球藻......
9月14日，《自然-通訊》（NatureCommunications）在線發表了中國科學院分子細胞科學卓越創新中心石建濤組完成的最新合作研究成果（DNAmethylationprofilingtode......
自閉癥（ASD）和精神分裂癥（SCZ）是常見的慢性精神疾病，在行為、遺傳學和神經病理學等方面存在相當多的重疊特征，提示自閉癥和精神分裂癥可能存在共同的神經發病機制。衰老與表觀遺傳效應的動態變化密切相關......
衰老，是一個復雜、多階段、漸進的過程，發生在生命的整個過程。隨著時間的流逝，人體的器官、肌肉會逐漸衰老，一些疾病也伴隨著年齡的增長而發生，包括癌癥、糖尿病、心血管疾病等。DNA甲基化，是一種DNA上的......
“新冠疫情早期，我們就研發出了核酸檢測試劑，可以確定誰被感染、誰需要隔離和治療。但遺憾的是，人類有很多種嚴重疾病，例如癌癥，目前為止還沒有出現像新冠核酸檢測這樣簡單的方法，甄別誰容易得或者要得癌癥。”......
竹類植物作為一種特殊的禾草，其筍期的快速生長這一特殊性狀備受關注，但以往研究集中在細胞微觀結構、轉錄組、代謝組、蛋白質組、小RNA以及新基因等方面。DNA甲基化作為重要的表觀遺傳修飾，主要參與轉座子沉......
檢測DNA甲基化的方法有很多種，在眾多方法中，研究人員常常會使用到一項技術，那就是亞硫酸氫鹽轉化。DNA的亞硫酸氫鹽處理將未甲基化的胞嘧啶轉化成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變。隨后用測序、定量PCR......
由LMU和HelmholtzMunich免疫學家VigoHeissmeyer和TakuIto-Kureha組成的研究小組揭示了T細胞中m6A修飾的基本功能。甲基化是核酸的化學修飾，不僅存在于DNA上，......
癌癥對每個人和家庭來說都是一場災難，對國家來說是一筆極大的公共衛生項目支出，根據2019年國家癌癥中心發布的中國惡性腫瘤流行情況分析報告顯示，隨著惡性腫瘤發病數持續上升，我國每年所需的相關醫療花費超過......