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  • 發布時間:2014-12-02 15:43 原文鏈接: 何川、賈桂芳Nature子刊發布表觀遺傳學新成果

      來自芝加哥大學、北京大學的研究人員在新研究中,揭示出了擬南芥m6A甲基化組(methylome)的獨特特征。他們的研究結果發表在11月28日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。

      芝加哥大學的何川(Chuan He)教授、Joy Bergelson教授以及北京大學的賈桂芳(Guifang Jia)副教授是這篇論文的共同通訊作者。

      N6-甲基腺苷(N6-methyl-adenosine(m6A))是發生在堿基A第六位N原子上的甲基化形式,作為真核生物RNA最常見的一種RNA轉錄后修飾,其導致了超過80%的RNA堿基甲基化,在各種物種都可以觀察到這種RNA修飾。

      這種修飾方式是在2012年由來自康奈爾大學維爾醫學院的研究人員所發現。當時研究人員發現長期被視作是生成蛋白質的簡單藍圖的信使RNA(mRNA),它的一個堿基腺嘌呤上往往會被添加一個甲基而發生化學修飾。過去mRNA被認為只包含4個堿基,這一研究表明第5個堿基——m6A遍布轉錄組。

      隨后,科學家們在哺乳動物和酵母中繪制出了m6A甲基化組圖譜,揭示出這一RNA修飾具有潛在的調控功能。在植物中,m6A甲基轉移酶缺陷可導致胚胎致死性表型,表明了m6A對植物發育也起著至關重要的作用。

      在這篇文章中,研究人員報告稱他們繪制出了兩種擬南芥中的m6A全轉錄組圖譜,揭示出在植物中m6A是高度保守的mRNA修飾形式。不同于哺乳動物中的m6A,擬南芥中m6A不僅富集于終止密碼子周圍和3'-非翻譯區(3'-UTR)內,在起始密碼子的周圍也有著豐富的m6A。

      借助于基因本體學分析(Gene Ontology Analysis),研究人員證實m6A在擬南芥中m6A的獨特分布和與葉綠體相關的一些植物特異性信號通路有關聯。此外,他們還發現了m6A堆積和mRNA豐度之間存在正相關關系,表明m6A對植物基因的表達起重要的調控作用。

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