中國科學院團隊成功繪制新冠首批死亡患者高分辨率空間蛋白質圖譜

　　不久前，中國科學院武漢病毒研究所石正麗團隊與南方科技大學田瑞軍團隊以及華中科技大學同濟醫學院周亦武團隊在 BioRxiv 發布創新性研究Deep spatial proteomic exploration of severe COVID-19-related pulmonary injury in post-mortem specimens，通過整合 H&E 組織切片染色、單細胞精度激光顯微切割（LMD）和超靈敏空間蛋白質組學技術（SISPROT），對武漢大流行第一批死亡患者留存的 FFPE 樣品進行高深度空間蛋白質組學檢測，建立了 COVID-19 患者肺部七個主要病理區域的高分辨定量蛋白質組學圖譜，在 71 個解剖的 FFPE 死后標本中定量分析了超過 10,000 種蛋白質，比較發現了 COVID-19 誘導的蛋白譜和信號通路失調，為過渡態肺細胞增殖提供了證據。

　　本研究為了解 COVID-19 引起的肺損傷提供了空間蛋白質組學信息，為重癥肺炎的治療干預提供重要理論依據^[1]。

圖片來源：文獻截圖

圖1. COVID-19 尸檢中肺損傷的空間蛋白質組分析

A. 實驗流程：隊列設計、尸檢標本采集、激光顯微切割、蛋白質組學樣品制備、基于質譜的深度蛋白質組學分析、生物信息學分析。對 COVID-19 重癥患者和非 COVID-19 對照個體的肺組織十個區域進行分析。B. 組織切片 H&E 染色分析。C. 人體肺結構示意圖。D. 每個區域已識別蛋白質組的總數（條形圖）和平均值 (折線圖)。

　　空間蛋白質組學可以定量表征特定細胞類型的數千種蛋白質，同時保留其空間相對位置信息。對于解析微環境中不同細胞類型的分子特征和相互作用提供重要工具，加深對疾病進程的理解。尤其空間蛋白質組學是對組織檢測深度和精度的進一步提升，在基礎研究和臨床病理分析中應用潛力無窮！

　　貝普奧生物 H&E 空間蛋白質組學將空間維度的激光顯微切割技術和獨家專利的 SISPROT 樣本前處理技術整合在同一張切片上進行染色分析、自動化切割、精準收集和深度質譜檢測。2 小時內即可完成高靈敏度的蛋白質樣品前處理，并兼顧了前處理過程中的穩定性、重復性。結合高分辨率高靈敏度的液相質譜平臺，為最終獲得高質量的深度蛋白質組數據奠定扎實的技術基礎。

　　1.技術流程及優勢

　　完整的空間蛋白質組學技術流程包括：獲取組織切片（FF/FFPE）、H&E 染色、自動化激光顯微切割、SISPROT 超微量樣品前處理、高分辨率高靈敏度的液相質譜平臺以及獲得最終生信分析結果。

　　空間蛋白質組學技術特點：

　　（1）基于 H&E 染色，可在同一張切片上輕松實現組織微環境的高效準確區分、輪廓標注和激光顯微切割。

　　（2）自動化精準切割、精準定位和 100% 目標樣本收集，保證了目標樣本質譜檢測的一致性，提升蛋白定量的準確性和穩定性。

　　（3）完美實現顯微切割樣本的高通量、高深度蛋白質組鑒定，納克級微量樣本也可進行高效分析。

　　2.在疾病研究中應用

　　空間蛋白質組學因其獨特的技術優勢，在組織微環境結構功能和異質性研究中具有重要價值。包括組織細微結構功能、細胞組成及類型的異質性和區域獨特性、細胞間以及細胞與微環境的相互作用等。此外在腫瘤研究中，可用于生物標志物的鑒定和耐藥性分析，開發新型免疫療法。

　　年終歲末，為了給大家提供更好的空間蛋白質組學技術支持，貝普奧生物推出 2 周年鉅惠活動，H&E 空間蛋白質組限時超值優惠、10 天極速交付結果，做空間蛋白質組學的你千萬別錯過！