通過序列雜交和條形碼進行單細胞原位分析
現代系統生物學有兩種革新技術:基因組學和單細胞生物學,前者具備同時監測生物體中所有基因和蛋白質的能力,后者則可以在自然微環境中跟蹤單細胞的一些特定基因。 兩種技術都很強大,但具有互補的局限性:基因組學平均了一個細胞群的異質性和空間復雜性,而單細胞技術一次只能探測幾個基因。因此,將基因組學與單細胞結合的生物學方法是下一階段的主要挑戰。生物和生物工程教授Long Cai致力于開發合成基因組學與單細胞的革新方法。 通過序列雜交和條形碼進行單細胞原位分析 過去幾年,Cai教授實驗室采用FISH的原位“測序”來分析單細胞的基因表達。為了檢測每一個mRNA,他們的序貫FISH(seqFISH)策略在概念上類似于用FISH探針對單個細胞中的轉錄序列進行測序,用FISH探針進行序列雜交,對mRNA進行編碼。在一輪雜交過程中,每個轉錄物都被一組標有單一熒光團的FISH探針作為目標,然后對樣品進行成像,利用酶消化去除FISH探針。在隨后的......閱讀全文
重疊基因的調控序列
①在5′端轉錄起始點上游約20~30個核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一個短的核苷酸序列,其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序,它是RNA聚合酶的重要的接觸點,它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時,mRN
基因序列儀的分類介紹
根據電泳類型分為平板型電泳和毛細管電泳兩類:1. 平板型電泳:平板型電泳的凝膠灌制在兩塊玻璃板中,聚合后厚度一般小于0.4mm或更薄,因此又稱為超薄片層凝膠電泳。是經典的電泳技術,具有樣品判讀序列長(600-900bp)、一塊凝膠板上可同時進行多個樣品測序的優點。2. 毛細管電泳:將凝膠高分子聚合物
什么是基因的核心序列?
中文名稱核心序列英文名稱core sequence定 義重復序列共有的核苷酸序列。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
功能基因cDNA序列的分析
(一) cDNA序列的測定一.原理DNA 序列測定技術,目前主要是根據Sanger 等提出的酶法和Maxam和Gilber 提出的化學降解法,這兩種方法的原理大致相同。這里主要介紹Sanger 的酶法——雙脫氧鏈終止法。雙脫氧鏈終止法是Sanger 等人于1977 年建立起來的。它是利用了2'
細胞化學詞匯SD序列
中文名稱:SD序列外文名稱:Shine-Dalgarno sequence定?????? 義:Shine-Dalgarno (SD)是細菌和古細菌中信使RNA中核糖體結合位點序列。通常位于翻譯起始密碼子AUG上游約8~10個堿基位置。SD序列幫助招募核糖體RNA,并將核糖體比對并結合到信使RNA(m
細胞化學詞匯匹配序列
中文名稱:匹配序列英文名稱:matched sequence定 義:在序列排比中,兩條多核苷酸鏈或兩條多肽鏈上彼此相同的核苷酸或氨基酸序列。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
細胞化學詞匯互補序列
中文名稱:互補序列英文名稱:complementary sequence定 義:在雙鏈核酸中,一條多核苷酸鏈可與另一條多核苷酸鏈互補的那部分序列。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源:monticelloshop.org 近日,法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味,廣受稱贊,這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日,相關論文在線刊登于《自然
割裂基因的調控序列種類介紹
①在5′端轉錄起始點上游約20~30個核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。 TATA框是一個短的核苷酸序列,其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序,它是RNA聚合酶的重要的接觸點,它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時,
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
什么是基因的間插序列?
中文名稱間插序列英文名稱intervening sequence;IVS定 義基因間或基因內的非編碼序列。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
細胞化學詞匯間插序列
中文名稱:間插序列英文名稱:intervening sequence;IVS定 義:基因間或基因內的非編碼序列。應用學科:遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
細胞化學詞匯旁側序列
中文名稱:旁側序列英文名稱:flanking sequence定 義:結構基因兩側的核苷酸序列,對基因的表達及表達水平具有調控作用。應用學科:遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
細胞化學詞匯遠側序列
中文名稱:遠側序列英文名稱:distal sequence定 義:一般指處于基因上游200 bp以上位置的DNA序列。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
細胞化學詞匯質粒維持序列
中文名稱:質粒維持序列英文名稱:plasmid maintenance sequence定 義:存在于重組質粒中的、與保持其在宿主中穩定復制有關的序列。如乳酸菌質粒pGT232的一段由雙鏈復制起點和編碼復制起始蛋白repA的基因所組成的1.7 kb的序列。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科)
細胞化學基礎端粒DNA序列
端粒DNA 序列(telomere DNA sequence,TEL)端粒的功能是與端粒酶結合,完成染色體末端復制。端粒酶以其自身的RNA 為模板,在染色體端部添加上端粒的重復序列。作為模板的RNA 比較短,含有1.5 個端粒重復單元。端粒結構還能防止染色體融合及降解。端粒是保護DNA分子中的基因的
DNA微陣列檢測基因表達水平及識別基因序列
Schena等1996年用擬南芥光調基因微陣列,以不同器官中的mRNA為探針,檢測其基因表達水平,結果表明葉mRNA的表達水平是根的500倍。Shelon等1996年將釀酒酵母基因組DNA克隆制成微陣列,用6條最大染色體和10條最小染色體DNA探針分別標記上紅,綠熒光標記進行雜交檢測,結果表明9
基因序列揭示非洲人早期歷史
人類在非洲的早期歷史正日益成為人們關注的焦點。一項新的研究對源自這片大陸的十幾個族群的180個基因組進行了研究,其中一些基因組之前從未被分析過。 初步研究結果表明,在4萬多年前,其中兩個族群(桑人和巴卡人)的規模相當于當時其他族群的兩倍,并且這兩個族群生活在中東部非洲或南部非洲。 研究人員在
3000株水稻基因序列公開發表
近日,3000株水稻基因組測序文章在GigaScience正式發表,且整套水稻基因序列以可引用形式在該雜志的附屬開放獲取數據庫GigaDB中公開。 該項目產生的數據是目前已公開水稻序列數據量的四倍。該成果標志著3000株水稻基因組項目第一階段的完成,主要由中國農業科學院、國際水稻研究
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中,有超過100種已經進行了基因組測序,但是,只有9種爬行動物(在10000個物種當中)的基因組對科學界來說是可用的。最近,瑞士日內瓦大學(UNIGE)的一個研究小組,構建了一個大的數據庫,其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序,這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
結構基因的側翼序列的介紹
1、前導區和尾部區 此二區被轉錄并參與成熟mRNA的組成,但不被翻譯,前者位于轉錄起始點和第一外顯子之間,相當于mRNA5’端的非翻譯區(5’UT);后者位于最末外顯子和終止子之間,相當于mRNA3’端非翻譯區(3'UT)。前導區和尾部區轉錄后的相應序列在mRNA中起維持mRNA穩定性的
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月,在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序,它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先,這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列;其次,這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前,人們通過傳統的遺傳學方法已確定
如何設計基因cds序列的pcr引物
提取細胞總RNA然后用試劑盒反轉錄成cDNA,用cDNA作為模板擴增基因的CDS區,然后想要轉染進細胞中。比如MYOD1基因,首先在NCBI找到它的mRNA序列,然后找到它的CDS序列,全部復制下來,在primer5.0中。正向引物直接從CDS的第一個核酸開始(比如18bp),反向引物從CDS最后一
細胞化學詞匯自主復制序列
ARS(autonomously replicating sequence)。在真核生物中發現的一類能啟動DNA復制的序列,含有一個AT富集區。最早在酵母中分離得到,隨后在其它真核生物中也發現了ARS序列的存在。這些序列是在人工合成的環形質粒中作為復制器起作用的。
細胞化學詞匯末端反向重復[序列]
中文名稱:末端反向重復[序列]英文名稱:inverted terminal repeat;ITR定 義:排列順序相反的、等同的或密切相關的核苷酸序列。常出現于某些轉座子的末端。應用學科:生物化學與分子生物學(一級學科),核酸與基因(二級學科)
揭示基因“無用”序列穩定染色質三維結構及細胞穩態機制
人類基因組中的非編碼序列在多種生物學過程中發揮著至關重要的作用,如非編碼RNA、啟動子、增強子和轉座子等。作為在基因組中占比約98%的非編碼區域,仍有大量是功能未知的,這些曾被認為是基因組中“垃圾”的區域,已被逐漸證實存在重要功能。基因組的三維結構會影響基因的轉錄調控或其他細胞生命活動,然而,除
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日,由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
科學家首次發現重度抑郁基因序列
【新聞事件】:本周《自然》發表了一篇重要論文。在分析5303例漢族女性重度抑郁患者和5337名對照的DNA序列后發現兩個和重度抑郁相關的基因序列。一個緊靠SIRT1,另一個是LHPP的內含子。這是科學家第一次把重度抑郁和某個基因序列可靠地聯系在一起,為以后藥物開發打下基礎。 【藥源解析】:抑郁
關于斷裂基因的調控序列種類介紹
①在5′端轉錄起始點上游約20~30個核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一個短的核苷酸序列,其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序,它是RNA聚合酶的重要的接觸點,它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時,m
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱,他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序,繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱,這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程,對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜