實驗方法原理針對核酸序列的分析就是在核酸序列中尋找基因,找出基因的位置和功能位點的位置,以及標記已知的序列模式等過程。在此過程中,確認一段 DNA 序列是一個基因需要有多個證據的支持。一般而言,在重復片段頻繁出現的區域里,基因編碼區和調控區不太可能出現;如果某段 DNA 片段的假想產物與某個已知的蛋白質或其它基因的產物具有較高序列相似性的話,那么這個 DNA 片段就非常可能屬于外顯子片段;在一段 DNA 序列上出現統計上的規律性,即所謂的“密碼子偏好性”,也是說明這段 DNA 是蛋白質編碼區的有力證據;其它的證據包括與“模板”序列的模式相匹配、簡單序列模式如 TATA Box 等相匹配等。一般而言,確定基因的位置和結構需要多個方法綜合運用,而且需要遵循一定的規則:對于真核生物序列,在進行預測之前先要進行重復序列分析,把重復序列標記出來并除去;選用預測程序時要注意程序的物種特異性;要弄清程序適用的是基因組序列還是 cDN......閱讀全文
常用生物軟件(windows)全面介紹一、基因芯片1、基因芯片綜合分析軟件。 ArrayVision 7.0 一種功能強大的商業版基因芯片分析軟件,不僅可以進行圖像分析,還可以進行數據處理,方便protocol的管理功能強大,商業版正式版:6900美元。 Arraypro 4.0
【實驗目的】1、 掌握已知或未知序列接受號的核酸序列檢索的基本步驟;2、 掌握使用BioEdit軟件進行核酸序列的基本分析;3、 熟悉基于核酸序列比對分析的真核基因結構分析(內含子/外顯子分析);4、 了解基因的電子表達譜分析。【實驗原理】針對核酸序列的分析就
生物信息學可指利用信息技術管理和分析生物學數據。這就意味著生物信息學所涉及的范圍相當廣泛,從人工智能、機器人一直到基因組(genome)分析。就基因組分析這一角度來看,生物信息學主要是指核酸和蛋白質序列數據的計算機處理和分析。近年來,蛋白質結構數據的快速增長,使蛋白質三維結構的處理分析也歸入到生物信
一、Microarray軟件1. Array Designer 4.25 Build 42501,為微陣列批量設計cDNA引物和寡核苷酸引物的工具,適用于Windows和Linux系統。斯坦福編寫的軟件系列:2. ScanAlyze,Microarray圖像分析軟件,從單一或雙色熒光雜交產生的熒光圖
為加強第二代測序技術檢測試劑的規范和指導,進一步保證和提高相關產品的質量,8月8日,中國食品藥品檢定研究院(中檢院)組織制定了《第二代測序技術檢測試劑質量評價通用技術指導原則》(下稱《指導原則》)。 該文件是中檢院發布的首個質量評價技術指導原則,旨在對產品設計、研發及驗證的各關鍵環節進行規范,
一.前言 本指導原則主要針對第二代測序(next generation sequencing,NGS)技術檢測試劑(以下簡稱“NGS檢測試劑”)產品質量提出指導性要求,涉及基本原則、主要原材料、檢測流程及性能評價等方面。 本指導原則是對企業和檢驗人員的指導性文件,但不包括注冊審批所涉及的行政
相關專題隨著ncbi 數據庫各種資源的涌現,NCBI已經成為科研工作者必不可少的資料查找,數據分析的工具。那么NCBI數據如何使用,新手入門一步一步教你認識和使用NCBI數據庫。一 綜合數據庫NCBI數據庫集美國國立生物技術信息中心(National Center for Biotechnology
關于印發餐飲服務食品安全檢驗機構技術裝備基本標準和現場快速檢測設備配備基本標準的通知 國食藥監食[2011]130號 各省、自治區、直轄市及新疆生產建設兵團食品藥品監督管理局: 為貫徹落實《食品安全法》、《食品安全法實施條例》以及《餐飲服務食品安全監督管理辦法》,逐步建立
分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料,用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常,從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。其基本原理是檢測DNA或RNA的結構是否變化、量的多少及表達功能是否異常,以確定受檢者有無基因水平的異常變化,對疾病的預防、預測、診斷、治療和預后具有重要意義。通俗
一、基于分子雜交的分子診斷技術 上世紀60年代至80年代是分子雜交技術發展最為迅猛的20年,由于當時尚無法對樣本中靶基因進行人為擴增,人們只能通過已知基因序列的探針對靶序列進行捕獲檢測。其中液相和固相雜交基礎理論、探針固定包被技術與cDNA探針人工合成的出現,為基于分子雜交的體外診斷方法進行了
蛋白組學分析軟件 StartFragmentProtParam 瑞士蛋白質專家分析系統中的子程序,適用于蛋白質序列的物理-化學參數(氨基酸、原子組成,等電點,消光系數等) MultiIdent 瑞士蛋白質專家分析系統中的子程序,適用于通過等電點、分子量、氨基酸組成、序列標簽、肽指
1.電子天平:食品檢驗用試劑、樣品和標準品的稱量; 2.酸度計:食品檢驗過程中pH值的測定; 3.冷凍離心機:食品檢驗過程中營養成分或者污染物等的提取分離; 4.離心機:食品檢驗過程中營養成分或者污染物等的提取分離; 5.超凈工作臺:食品檢驗過程中提供局部超凈工作環境; 6.生物安全柜
一、雜交通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交可在DNA與DNA、RNA與RNA或RNA與DNA的
一、概述 前面已經介紹了核酸分子單鏈之間有互補的堿基順序,通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交
一、概述 前面已經介紹了核酸分子單鏈之間有互補的堿基順序,通過堿基對之間非共價鍵(主要是氫鍵)的形成即出現穩定的雙鏈區,這是核酸分子雜交的基礎。雜交分子的形成并不要求兩條單鏈的堿基順序完全互補,所以不同來源的核酸單鏈只要彼此之間有一定程度的互補順序(即某種程度的同源性)就可以形成雜交雙鏈。分子雜交
在獲得一個基因序列后,需要對其進行生物信息學分析,從中盡量發掘信息,從而指導進一步的實驗研究。通過染色體定位分析、內含子/外顯子分析、ORF分析、表達譜分析等,能夠闡明基因的基本信息。通過啟動子預測、CpG島分析和轉錄因子分析等,識別調控區的順式作用元件,可以為基因的調控研究提供基礎。通過蛋白質基本
20世紀90年代初,PCR技術日趨成熟,也滲入到FMD的診斷中。這一技術特異性強,靈敏度高,可檢測多種組織樣品,檢測病毒RNA的PCR方法已經成為FMDV檢測方法中的一種,PCR方法具有極高的靈敏度(其理論值為一個病毒粒子的核酸),因為它僅需要極少量的反應模板,而且可以設計多循環PCR反
核酸分子雜交技術由于核酸分子雜交的高度特異性及檢測方法的靈敏性,它已成為分子生物學中最常用的基本技術,被廣泛應用于基因克隆的篩選,酶切圖譜的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突變的檢測等。其基本原理是具有一定同源性的原條核酸單鏈在一定的條件下(適宜的溫室度及離子強度等)可按堿基互補原成雙鏈。雜交的
(2)輸出:除了以文本形式外,還可以通過JalView顯示和編輯結果。此外,還可以另外使用GeneDoc(常見于文獻)及DNAStar軟件等顯示結果。多序列比對的結果還用于進一步繪制進化樹。3、ORF(Open Reading Frame)分析從核酸序列翻譯得到蛋白質序列,需要進行ORF分析,每個生
實驗材料dCTP
常用分子生物學和細胞生物學實驗技術介紹! 核酸分子雜交技術 由于核酸分子雜交的高度特異性及檢測方法的靈敏性,它已成為分子生物學中最常用的基本技術,被廣泛應用于基因克隆的篩選,酶切圖譜的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突變的檢測等。其基本原理是具有一定同源性的原條核酸單鏈在一定
實驗材料dCTP試劑、試劑盒乙醇次氯酸鈉β-葡萄糖醛酸酶基因活性測定液溴化乙錠儀器、耗材培養室MS 培養基實驗步驟一、轉基因插入位點的數目第一代( T0)轉基因植株外源基因的插入位點數目,一般都是通過遺傳方法進行鑒定。雖然遺傳分析可以在任何世代進行,但是一般選擇轉基因植株自交,或與野生型測交后得到的
分子診斷技術是指以DNA和RNA為診斷材料,用分子生物學技術通過檢測基因的存在、缺陷或表達異常,從而對人體狀態和疾病作出診斷的技術。其基本原理是檢測DNA或RNA的結構是否變化、量的多少及表達功能是否異常,以確定受檢者有無基因水平的異常變化,對疾病的預防、預測、診斷、治療和預后具有重要意義。通俗
感染是病原體以某種傳播方式從傳染源傳播到易感者,并在宿主體內生長繁殖、釋放毒素或導至機體內微生態平衡失調的病理生理過程,大多數病原體是由外界侵入的,受病原體侵襲力、致病力及宿主免疫狀態等多種因素的影響,其破壞人體內的微生態平衡后機體產生各種不同的感染狀態,出現感染性疾病。 為了確定感染的發
DNA重組技術(或基因工程)是20世紀生物學的偉大成就,并已滲透到生命科學包括醫學 各個領域,為腫瘤的實驗研究和臨床診斷及治療提供了嶄新的技術和有用的工具。本附錄扼要介紹在分子腫瘤學領域中常用的分子生物學基本技術及其在腫瘤研究中的應用,著重介紹它們的原理和應用。至于具體的技術方法和操作步驟可參閱《分
一、酸雜交技術檢驗方法建立的基本要素是特異性和靈敏度,在復雜的物體中,使無法感覺的特定物質進入人類的觀察范圍。核酸雜交檢測技術就是利用核酸堿基嚴格配對的特異性,核酸標記物的靈敏度而建立的檢測核酸結構與功能的方法。該法建立以來已有二十年,目前研究實驗室用得多,臨床實驗室用得較少,除成本高外,關鍵是操作
核酸電泳是進行核酸研究的重要手段,可以用于:(1)核酸探針;(2)核酸擴增;(3)序列分析等技術。實驗方法原理帶電荷的物質在電場中的趨向運動稱為電泳。核酸電泳是進行核酸研究的重要手段,是核酸探針、核酸擴增和序列分析等技術所不可或缺的組成部分。核酸電泳通常 在瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠中進行,濃度不同
細胞內的核酸包括DNA與RNA兩種分子,均與蛋白質結合成核蛋白(nucleoprotein)。DNA與蛋白質結合成脫氧核糖核蛋白(deoxyribonucleoprotein,DNP),RNA與蛋白質結合成核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)。其中真核生物的DNA又有染色體DNA
進化遺傳學具有兩個并列的研究方向:系統發育的重建和種群分析。自1962年, Zuckerkandl和Pauling提出蛋白質序列和基因序列的比較可以象分子種一樣用于標志 現存物種分化的時間以來,各種生化方法被用于系統發育的研究。在最初二十年內, 同功酶的電泳分析、免疫學比較和蛋白質序列分析被廣泛地應
一種生物體的基因組規定了所有構成該生物體的蛋白質,基因規定了組成蛋白質的氨基酸序列。雖然蛋白質由氨基酸的線性序列組成,但是,它們只有折疊成特定的空間構象才能具有相應的活性和相應的生物學功能。了解蛋白質的空間結構不僅有利于認識蛋白質的功能,也有利于認識蛋白質是如何執行其功能的。確定蛋白質的結構對于生物