PNAS：“破譯”DNA的更好方法
越來越多的研究表明，轉錄因子與DNA結合位點的突變與疾病有關。然而現有的測序技術并不能解析這些位點信息。現在，哥倫比亞大學的科學家們開發出一種計算工具，能夠解析基因組中最難翻譯的部分。有了這個工具，科學家們可以更深入地了解DNA指導生長發育、衰老、疾病等所有的生命過程。利用NRLB，逐漸消除低親和結合位點（從左往右），從而逐漸降低基因表達（白色）。（圖片來源：Mann Lab/Columbia's Zuckerman Institute） “即便是簡單的生物，依然有大量基因信息因為技術的局限而未能被破譯。” 哥倫比亞大學Mortimer B. Zuckerman心理大腦行為研究所的首席研究員Richard Mann表示，“讓我們開心的是，新算法能夠掃描數百萬行的遺傳密碼，甚至于能夠識別出最微弱的信號，從而更完整地繪制DNA編碼的藍圖。” Hox基因 DNA中隱藏著太多的秘密，其中一個謎團涉及一個特別普遍的基因，......閱讀全文
PNAS：科學家找到更好“破譯”DNA秘密的方法
十分之一的人類基因會表達一種特殊的蛋白——轉錄因子（TFs），通過與基因組結合讀取相應區域DNA 信息。這一結合是調控基因表達與否的關鍵。4月初，《PNAS》期刊最新發表一篇文章，揭示了一種新的計算工具，可以完美量化基因組中這一“蛋白-DNA”的結合。 利用NRLB，逐漸消除低親和結合位點
PNAS：“破譯”DNA的更好方法
越來越多的研究表明，轉錄因子與DNA結合位點的突變與疾病有關。然而現有的測序技術并不能解析這些位點信息。現在，哥倫比亞大學的科學家們開發出一種計算工具，能夠解析基因組中最難翻譯的部分。有了這個工具，科學家們可以更深入地了解DNA指導生長發育、衰老、疾病等所有的生命過程。利用NRLB，逐漸消除低親
各物種的Hox基因
果蠅果蠅（這里指黑腹果蠅）的Hox基因皆位在其3號染色體右臂上，可分為兩個群集。一群稱作雙胸復合群（Bithorax complex，BX-C），此群集中的Ubx基因若突變，會使第3胸節（T3）變成第2胸節（T2），而且由于正常狀態下的翅膀是長在T2之上，因此這樣的突變同時會使果蠅長出兩對翅膀，并使
Hox基因的定義和作用機制
Hox基因（英語：Hox genes）全名同源基因（英語：homeotic genes）或同源異型基因。是生物體中一類專門調控生物形體的基因，一旦這些基因發生突變，就會使身體的一部分變形。其作用機制，主要是調控其他有關于細胞分裂、紡錘體方向，以及硬毛、附肢等部位發育的基因。Hox基因屬于同源異型盒（
新技術可構建細胞發育指導基因
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/7/481918.shtm 科技日報北京6月30日電 （記者張夢然）美國紐約大學研究人員利用新的合成DNA技術和干細胞基因工程，創造了人工Hox基因，其能規劃和指導細胞去哪里發育組織或器官。近日發表在《科學
Cell－Rep：科學家發現Hox如何控制攝食行為
在生物黑腹果蠅實驗模式中，海德堡大學生物學家對果蠅如何編碼和控制攝食行為有了新的見解。博士教授領導的研究小組關于生物有機體研究中心(COS)研究Hox基因家族特殊的發展基因的功能。這個基因對維持果蠅頭部運動單位至關重要，包括肌肉和刺激果蠅進食的神經元。如果Hox基因的功能有損壞或有缺陷，沒有或只
調節基因的作用
控制另一些遠離基因的產物合成速率的基因。能控制阻礙物的合成，后者能抑制操縱基因的作用，從而停止它所控制的操縱子中的結構基因的轉錄。這種基因，主要的功能是產生一類抑制物，以制約其他基因的活動。也就是，一段有效的DNA片段，它可轉錄翻譯而產生調節蛋白，該蛋白質與操縱基因相互作用，而對操縱子的活動進行控制
關于調節基因的基本作用介紹
控制另一些遠離基因的產物合成速率的基因。能控制阻礙物的合成，后者能抑制操縱基因的作用，從而停止它所控制的操縱子中的結構基因的轉錄。這種基因，主要的功能是產生一類抑制物，以制約其他基因的活動。也就是，一段有效的DNA片段，它可轉錄翻譯而產生調節蛋白，該蛋白質與操縱基因相互作用，而對操縱子的活動進行
Cancer－Dis：白血病治療新方法讓癌基因變“乏力”
2016年10月15日/生物谷BIOON/--一些基因的重新激活會導致造血干細胞發生異常自我更新從而發生白血病，這些與自我更新有關的基因發生異常激活可能由DNA包裝過程中的一些結構性修飾引起。最近一項研究發現有兩種染色質調節因子能夠介導這些表觀遺傳修飾的變化，并且白血病細胞非常依賴這兩種因子。
合肥研究院城市HOx自由基觀測與模擬研究取得進展
近期，中國科學院合肥物質科學研究院安徽光學精密機械研究所研究員謝品華課題組在大城市OH和HO2自由基觀測與模擬研究方面取得新進展，相關研究成果發表在Science of the Total Environment上。 自由基是大氣二次污染生成的核心驅動力，基于目前大氣復合污染的現狀，我國開始重
中國醫學科學院最新文章解析HOX基因表達模式
“核心刊物”迎來了新期刊：科學通報，中國科學C輯:生命科學，這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的，我國學術期刊中的知名品牌，被國內外各主要檢索系統收錄，如國內的《中國科學論文與引文數據庫》（CSTPCD）、《中國科學引文數據庫》（CSCD）等；美國的SCI、CA、EI，英
解讀BhCTLA4/hOX40雙免疫檢查點人源化小鼠
導讀隨著腫瘤免疫療法應用如火如荼地展開，不同抗體藥物之間的聯合用藥開始被大家關注。而抗體藥物聯用的藥效究竟如何？探究的過程中難免要用到雙免疫檢查點的人源化小鼠。今天就為大家介紹一種雙免疫檢查點人源化小鼠——B-hCTLA4/hOX40小鼠。基因背景細胞毒T淋巴細胞相關抗原4（CTLA4, cytot
Nature發表衰老研究成果：胚胎基因再激活導致肌肉衰老
生物通報道：發育基因和途徑嚴格調控著胚胎的發育。這個過程是由所謂的Hox基因強烈驅動的。現在，來自德國Leibniz老化研究所（FLI）的研究人員發現，這些基因當中的一個——Hoxa9，在老年時期被重新激活。這限制了肌肉干細胞的功能，因此，限制了骨骼肌的再生能力。具有諷刺意味的是，這些研究結果表
人源化小鼠BhOX40L－mice對免疫治療新進程的影響
Hello，艾瑞巴得看官們，又到了收獲知識的時刻啦，小編想想就很激動，真是迫不及待的想要分享今天的主題，話不多說，放大招——那就是我們的明星人源化小鼠“B-hOX40L mice”，一起來簡單了解下吧~ 基本信息 基因功能簡介 OX40L(又稱CD134L或CD252)
人源化小鼠BhOX40L－mice對免疫治療新進程的影響
基本信息?基因功能簡介OX40L(又稱CD134L或CD252)是腫瘤壞死因子受體超家族成員4(OX40)（又稱CD134或TNFRSF4）的配體，含183個氨基酸（胞外139個氨基酸，跨膜21個氨基酸，胞內23個氨基酸），屬TNF家族成員，為Ⅱ型跨膜糖蛋白，在許多抗原呈遞細胞如DC2s、巨噬細胞、
我國學者揭示海洋軟體動物發育演化機制假說
近日，美國科學院院刊PNAS在線刊發海洋所劉保忠研究組題為“Dorsoventral decoupling of Hox gene expression underpins the diversification of molluscs”的研究論文。該研究基于Hox基因在軟體動物早期發育中的表達
人源化小鼠OX40評估抗體體內藥效的有力工具
hello，大家好呀，炎炎夏日，沒有小編的產品推廣，想必你們一定不適應。近年來免疫檢查點藥物成為癌癥治療中一類重要新藥，今天就為各位寶寶們介紹一種免疫檢查點人源化小鼠，同時作為小編內心的消暑神器——hOX40小鼠。當當當，那我們就趕緊進入正題吧~ OX40基因功能簡介 OX40，又名
人源化小鼠OX40——評估抗體體內藥效的有力工具
OX40基因功能簡介OX40，又名Tnfrsf4（Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4），主要在表達于激活的CD4+和CD8+T細胞表面，和OX40配體結合可以刺激CD8+T細胞的活化。通過OX40/OX40L信號的共激活效應，T細
英國研究人員研制出治癌新藥HXR9
針對與癌癥有關的基因表達，英國專家研制出一種治癌新藥，并且發現了有望用于前列腺癌檢測的一種新方法。?據英國科學促進會主辦的“阿爾法伽利略”科學網站報道，英國薩里大學的研究人員研制的這種新藥名為HXR9，它可以抑制一種叫做HOX的基因的活動。?研究人員說，HOX基因對確定早期胚胎中細胞和組織的特性至關
PLoS－Genet：新研究為揭示遺傳性疾病的發病機制提供希望
近日，來自麥基爾大學等處的研究人員通過研究，揭示了染色質結構對于控制基因活性，尤其是胚胎的正常發育的重要性，相關研究刊登于國際著名遺傳學雜志PLoS Genetics上，這項研究對于揭示遺傳性疾病的診斷及發病機制有著重要的意義。 機體中的每一個細胞都包含有完整的一套DNA遺傳信息，研究
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定3
2．利用末端轉移酶和α-32P-ddNTP標記DNA的3ˊ-末端 在二價陽離子存在下，末端轉移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羥基末端，如果作為底物的核苷酸經過修飾（如ddNTP），則可以在DNA的3ˊ-OH上僅加入一個核苷酸。對于雙鏈DNA片段，亦存在DNA的兩側均被標記問題，可通過上述同
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定2
目前應用的兩種快速序列測定技術是Sanger等（1977）提出的酶法（雙脫氧鏈終止法）和Maxam（1977）提出的化學降解法。雖然其原理大相徑庭，但這兩種方法都同樣生成相互獨立的若干組帶放射性標記的寡核苷酸，每組核苷酸都有共同的起點，卻隨機終止于一種（或多種）特定的殘基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA序列測定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，選用合適的DNA聚合酶進行測序反應也是保證測序質量的重要因素之一。常用于雙脫氧末端終止法測序的有幾種不同的酶： 1．大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger測序的酶。但通常會有兩個問題：①Klenow片段的持續合成能力較
DNA重組技術(DNA－Recombination)
一、DNA 的酶切與連接（1）酶切反應：同質粒DNA 的鑒定，只不過是質粒DNA 換為載體DNA 。若大量酶切，則成比例增加。（2）加2倍體積的預冷無水乙醇和1/10體積的3mol/l NaAc混勻，-20℃2h以上。（3）15000rpm離心15min，棄上清。（4）加入75%乙醇洗滌2次，離心棄
免疫激活劑靶點界之星——OX40靶點
基因背景OX40，又名Tnfrsf4（Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4），主要在表達于激活的CD4+和CD8+?T細胞表面，和OX40配體結合可以刺激CD8+?T細胞的活化。通過OX40/OX40L信號的共激活效應，T細胞的功能
PNAS：科學家闡明維持細胞平衡狀態的遺傳互作機制
近日，一項刊登于國際雜志PNAS上的研究報告中，來自美國密蘇里州托瓦斯醫學研究所（Stowers Institute for Medical Research）的研究人員通過研究發現，與調節性基因“互相交流”進行競爭或能幫助維持細胞狀態的平衡；相關研究或為研究人員提供Nanog基因和Hox基因之
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體1
載體（vector）是攜帶靶DNA（目的DNA）片段進入宿主細胞進行擴增和表達的運載工具。常用的載體是通過改造天然的細菌質粒、噬菌體和病毒等構建而成。目前已構建成的載體主要有質粒載體、噬菌體載體、病毒載體和人工染色體等多種類型，亦可根據其用途不同分為克隆載體和表達載體二類。載體的構建和選擇應考慮以下
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組的載體3
在作為載體時，這些噬菌體有一個很大的優點，即克隆到M13mp載體的外源DNA片段（雙鏈），在子代噬菌體便成為了單鏈形式。故應用M13mp進行克隆，可方便地分離到大量含有外源DNA某一單鏈的DNA分子。這種單鏈DNA可在下列工作中作模板：①主要用作雙脫氧鏈終止法進行DNA序列測定的模板；②制備僅有一條
DNA重組（DNA－recombination）技術：DNA重組與鑒定3
當多克隆位點有外源DNA片段插入時，破壞此酶的N端閱讀框架，產生無α互補功能的N端片段，因此在帶有外源DNA片段的細菌在含有IPTG/X-gal的培養基上呈白色，見圖7-11 。如果外源DNA插入片段相當短，不破壞β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的閱讀框，有時產生的重組體菌落不呈白色而是呈淺藍色。4