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黃三文，1971年出生于湖南岳陽。中國農業科學院蔬菜花卉所研究員，博士生導師。1996年碩士畢業于北京農業大學，2005年獲荷蘭瓦赫寧根大學博士學位。現任深圳農業基因組所副所長，國家“973”項目“主要蔬菜重要品質性狀形成的遺傳機理與分子改良”首席科學家、國際黃瓜基因組計劃首席科學家、國際茄科基因組研究聯盟的執行委員等；獲國家科技進步二等獎1項，2012年獲“國家杰出青年科學基金”“華耐園藝科技獎”，入選科技部中青年科技創新領軍人才、“百千萬人才工程”國家級人選等。 “吃黃瓜快吃到瓜蒂時，往往會變得非常苦。關于黃瓜苦味問題，科學家一直沒找到原因。”中國農科院蔬菜花卉所研究員、深圳農業基因組所副所長黃三文高興地說，“經5年努力，我們終于找到了合成苦味物質葫蘆素c的9個基因，也找到了調控黃瓜苦味的兩個‘主開關’。” 今年11月28日出版的《科學》雜志以長篇論文形式發表了該成果，這也是近5年來《科學》《自然》和《自然遺傳學......閱讀全文
摘要：農作物基因組學研究的發展，對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展，已經實現對重要農作物，如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序，在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了２０１７年度主要農作物基因組
⑵小麥基因組研究小麥是全球最重要的糧食作物之一，小麥的穩產和增產對我國乃至全世界糧食安全的影響舉足輕重。近年來由于全球氣候變化、環境變化的影響，小麥生產面臨嚴峻的挑戰，對于小麥的育種和品種改良工作提出了新的要求。普通小麥（Ｔｒｉｔｉｃｕｍ ａｅｓｔｉｖｕｍ Ｌ．）是３個不同亞基因組形成的異源
1. Retrovirology：整合到人基因組中的古老逆轉錄病毒有助抵抗HIV-1感染 doi:10.1186/s12977-017-0351-8 在我們的進化過程中，病毒持續地感染人體。一些早期的病毒已整合到我們的基因組中，如今它們被稱作為人內源性逆轉錄病毒（human endogeno
近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，歷時兩年的牡蠣基因組序列圖譜終于繪制完成。這是世界上第一張養殖貝類的全基因組序列圖譜，標志著基于短序列的高雜合度基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破。據悉，目前的基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖
2012年11月29日至12月1日，為期三天的第七屆國際基因組學大會暨2012年亞太區生物信息學峰會在香港九龍成功召開。本次會議由華大基因主辦，《GigaScience》雜志協辦。來自全球300多名專家學者云集香港，共同探討了基因組學、生物信息學、云計算、生物倫理等研究領域內的最新進展，并深入探
2012年11月29日至12月1日，為期三天的第七屆國際基因組學大會暨2012年亞太區生物信息學峰會在香港九龍成功召開。本次會議由華大基因主辦，《GigaScience》雜志協辦。來自全球300多名專家學者云集香港，共同探討了基因組學、生物信息學、云計算、生物倫理等研究領域內的最新進展，并深入探
2010年下旬，河南安陽曹操墓真偽之辯正酣。而一則來自上海的重磅消息更是引發了多方關注。復旦大學現代人類學教育部重點實驗室宣布，向全國征集曹姓男性DNA樣本，擬用基因組科學的手段驗證出土的頭骨是否為曹操本人。 一下子，基因組科學成為熱門，這一話題“落入尋常百姓家”。 事實上，伴隨著2
10月11日，深圳華大基因研究院宣布，大熊貓晶晶的基因組框架圖繪制完成，這是世界首例用短序列進行新物種測序與組裝新技術完成的大型基因組序列圖。 深圳華大基因研究院大熊貓基因組項目負責人田埂博士在接受記者采訪時表示：“目前的基因組框架圖涵蓋基因組95%區域，覆蓋基因區約98%。雖然這還不是最終的基因
基因組學研究一直都存在著不同水平的偏向性（bias）。種族偏向性自不必說，美國“我們所有人（All of Us）”大規模研究計劃的目標之一就是對過去代表性不足的群體進行抽樣，比如非裔美國人。 同時，歷史偏向性也一直存在。某些基因與疾病有著很強的相關性，但好像就是不入科學家的法眼，始終躺在角落里
直到不久之前，宏基因組學研究還因為高費用、低流通量以及在應用Sanger-方法克隆步驟中出現的結果不準確而受到限制。而今借助于新一代序列測定方法即可獲得宏基因組樣品全面的圖像。宏基因組學研究（metagenomics）是指研究一種復雜微生物群體在其生命空間的全部基因信息。研究的主要目的在于刻畫
生命是“能夠自我營養并獨立生長和衰敗的力量”，這是亞里士多德（Aristotle，公元前384—322）通過動物、植物的研究對生命的哲學概括。動物也成為古代先哲們探索生命奧秘的主要對象之一，蓋倫（Galen，公元130—200）開創了動物解剖學和實驗生理學，他將來源于動物的知識推廣到對人體的認識
于軍，紐約大學醫學院生物醫學科學博士，師從臺灣中研院院士孫同天教授；博士后研究追隨美國“人類基因組計劃”的領導者和設計者之一，著名基因組學家、美國科學院院士Maynard V.Olson。 1993年，于軍參與“
基因組學研究是近20年來最受關注的科研項目之一，許多媒體曾宣傳它在癌癥、糖尿病、老年癡呆癥等疑難雜癥治療方面具有廣闊前景，投入大量科研經費的多國政府也對其寄予厚望。6月13日，美國《紐約時報》在頭版刊出“唱衰”基因組學研究的評論文章，認為這項研究還停留在基礎階段，要用于臨床還有很長的路
核酸分子雜交技術由于核酸分子雜交的高度特異性及檢測方法的靈敏性，它已成為分子生物學中最常用的基本技術，被廣泛應用于基因克隆的篩選，酶切圖譜的制作，基因序列的定量和定性分析及基因突變的檢測等。其基本原理是具有一定同源性的原條核酸單鏈在一定的條件下（適宜的溫室度及離子強度等）可按堿基互補原成雙鏈。雜交的
《韓非子·外儲說左上》有云 ：“夫良藥苦于口，而智者勸而飲之，知其入而已己疾也”，良藥苦口由此而來。最近，國內研究團隊揭開了這類“苦口良藥”的神秘面紗，成果相繼發表在Nature Genetics（2013）、Science（2014）和Nature Plants（2016）等國際知名學術期刊上
孤獨癥譜系障礙，簡稱“孤獨癥”，又稱“自閉癥”。其核心癥狀表現為社會溝通和社會交往的缺陷和局限的、重復性行為、興趣或活動，是一種嚴重影響兒童健康的神經發育障礙性疾病。 據最新統計數據顯示，目前，中國孤獨癥患者已超過1000萬，其中0～14歲的患兒超過200萬。不僅如此，中國孤獨癥發病率依然在不
第二軍醫大學細胞生物學教研室；上海200433 何志穎；姚玉成（綜述）；胡以平（審校）關鍵詞：EST技術；“電子”基因克隆；生物信息學；基因摘要： 隨著人類基因組計劃的順利進行，EST技術被廣泛應用于基因識別、繪制基因表達圖譜、尋找新基因等研究領域。利用人類基因組研究不斷產生的數據，從ES
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展，但是解析復雜的基
上一期為大家介紹了過去一年里CRISPR技術在動物造模及單堿基技術方面取得的重大突破。本期繼續為大家從功能基因組篩選、細胞譜系示蹤及疾病診斷方面談談CRISPR-Cas系統的技術運用。 一、大規模基因功能的篩選 盡管測序和基因組編輯技術取得了重大進展，但是解析復雜的基因型-表型關系仍
斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點，近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。 近日，英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)
基因產業正受到前所未有的重視。今年，精準醫學不僅被納入“十三五”規劃，作為精準醫學的“排頭兵”，基因組學也被納入“十三五”百大項目名單，要“加速推動基因組學等生物技術大規模應用”。 對著名基因組學專家、中國基因組學奠基人于軍教授來說，基因組學引領的技術應用得到如此重視，既讓他感到欣慰———20
為深入貫徹《國家中長期科學和技術發展規劃綱要(2006-2020年)》和2012年中央一號文件精神，做好2013年農村領域備選項目公開征集工作，按照科技部關于《農村領域國家科技計劃管理改革暫行辦法》，制定本指南。 一、推薦領域與方向 專題1：生物種業 (一)研究方向：超級稻新品
2019年6月21日，西北工業大學王文團體同時發表了3篇Science 文章，這些研究使用基因組分析來解決主要反芻動物譜系之間的進化關系，確定參與頭帶進化的基因，并研究馴鹿如何適應北極地區漫長的日夜。這些研究使我們能夠更好地了解熟悉的家養奶牛，綿羊和鹿及其野生近緣種，并深入了解占據世界草原的羚羊
磷，是作物生長發育、產量提高不可或缺的營養物質。盡管農民每年都施用大量磷肥，但磷肥的當季利用效率卻始終很低，且磷的累積還加重了土壤和環境污染。據統計，磷肥當季利用率一般只有10% -25%。 如何提高作物對土壤磷的再次利用能力，一直是農業生產中亟需解決的一大難題。 近日，《自然—通訊》雜志聚
自1999年中國作為唯一的一個發展中國家加入人類基因組計劃，到目前為止，已經獨立完成了水稻和家蠶等大型基因組研究，并參與了家雞、家豬、木瓜等多個重要動植物基因組圖譜制作，在2007年還首次向世界公布了第一個中國人的個體化基因組序列。 中國雖然在這一領域起步較晚，但發展迅猛…… 在深圳
2013年2月6日，中科院昆明動物所、深圳華大基因研究院等單位對樹進行了全基因組測序，并對其分類地位和相關生物學特征進行了深度解析。樹基因組的完成，將為其在生物醫學研究中用作動物模型奠定重要的遺傳學基礎，進而使其更好的應用于生物醫藥研究。研究成果在《自然?通訊》(Nature Communi
作為世界三大糧食作物之一，小麥養活了全球40%的人口，提供人類營養所需的20%的熱能和蛋白質。 隨著基因組學的發展，水稻和玉米的基因組相繼被破譯，但關于小麥基因組的測序研究依然困難重重、進展緩慢，小麥基因組成了橫在科學家面前的一座大山。 中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工
美國科學家于1985年率先提出人類基因組計劃，1990年正式啟動，美國、英國、法國、德國、日本和中國科學家都參與了這一預算達30億美元的人類基因組計劃。之后，2000年6月26日，六國科學家共同宣布，人類基因組草圖的繪制工作已經完成。在這場規模宏大、影響世界的基因測序項目落幕后，全球內陸續又有不
近期的醫學網絡熱詞，莫過于“精準醫療”了，因為給它做廣告的是美國總統奧巴馬，而在奧巴馬身后，是現任NIH（美國國立衛生研究院）的主任Francis Collins和NCI（美國國家癌癥研究所）的所長Harold E. Varmus兩位大牛。這兩位人物管理著美國醫學研究最主要的研究領域。如此高調、
目前生物芯片尤其是基因芯片已廣泛用于醫學研究之中，已有很多商業化生產的生物芯片產品銷售，研究者直接可以選擇成型的產品使用，不需要自己制備芯片，因此如何正確使用芯片解決研究中的生物學問題是研究者更關注的。 基因芯片設計是最重要的部分，它關系到最終結果能否