海洋所科研人員繪制完成牡蠣全基因組序列圖譜
近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，歷時兩年的牡蠣基因組序列圖譜終于繪制完成。這是世界上第一張養殖貝類的全基因組序列圖譜，標志著基于短序列的高雜合度基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破。據悉，目前的基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖譜標準。 近年來，我國的海水養殖業取得了長足發展。根據資料顯示，2007年全國水產養殖總產量已達到3490萬噸，占世界水產養殖產量的70%，其中海水養殖產量為1384萬噸，占到我國水產養殖產量的41%。我國海水養殖產量75%以上是貝類，貝類養殖產業規模和產量均居世界首位。而牡蠣作為貝類的“模式種”，一直受到科學家們的廣泛關注。 鑒于國家海洋經濟發展戰略和現代生物學科的發展需求、牡蠣優越的經濟價值及其潛在的基礎研究價值，2008年5月，中國科學院海洋研究所研究員張國范博士和美國新澤西州立大學教授郭希明博士聯合發起了牡蠣基因組計劃，并......閱讀全文
海洋所科研人員繪制完成牡蠣全基因組序列圖譜
近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，歷時兩年的牡蠣基因組序列圖譜終于繪制完成。這是世界上第一張養殖貝類的全基因組序列圖譜，標志著基于短序列的高雜合度基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破。據悉，目前的基因組圖譜已達到國際領先的基因組圖
中科院、華大基因發表Nature新文章
由中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院領導的一個國際研究小組完成了對太平洋牡蠣(Pacific oyster)的測序、組裝與分析，這是第一個測序的軟體動物基因組，將有助于填補我們對于種類豐富而較少研究的軟體動物家族的了解空白。這一研究在線發布在9月19日的《自然》(Nature)雜志上，
海洋所等在海洋生物對逆境適應進化研究中取得重要進展
??? 9月20日，由中國科學院海洋研究所聯合華大基因、美國新澤西州立大學等多家單位完成的牡蠣對潮間帶逆境適應機制的研究成果，由《自然》（Nature）雜志以長篇論文（Article）形式在線發表。 該研究利用新一代測序技術和全新的組裝策略，構建了牡蠣全基因組序列圖譜，證實了牡蠣基因組序列具有極
牡蠣基因組測序項目在中科院海洋所正式啟動
牡蠣基因組測序項目(OGP)日前在中科院海洋所正式啟動。 中國科學院海洋研究所介紹，開展牡蠣全基因組測序和組學研究，揭示牡蠣各種特異性狀的基因組學基礎，可以提升貝類和海洋基因組學研究水平，促進發展貝類養殖產業健康和可持續發展。 中國是牡蠣的故鄉，分布有近20種牡蠣。牡蠣是一種重要的海洋生物資源，
中國完成海帶等7種海洋生物全基因組測序
中國科學家10月30日在青島首次披露了海帶、櫛孔扇貝和南美白對蝦全基因組測序的部分成果，至此中國已完成7種大型海洋生物的全基因組測序，為改良這些海洋生物品質、提高產量奠定了科學基礎。 中國的海洋生物基因組學研究雖然起步較晚，但現在一些研究成果已達到國際前沿水準。目前，人類完成全基因組測序的
中國學者9月參與發表多篇Nature文章
進入九月份，中國學者參與的多項研究在Nature雜志及其重要子刊上發表，其中主要包括的是太平洋牡蠣(Pacific oyster)基因組的測序、組裝與分析，一種腸道細菌中的重要蛋白：Tir的作用，以及增強型綠色熒光蛋白的熒光會由于激光而被關閉等。 首先由中國科學院海洋研究所和深圳華大基
攻克基因組測序難題－探究茶樹生物學奧秘
我國現存最早的中醫醫藥典籍《本草經》記載：“神農嘗百草，日遇七十二毒，得荼（茶）而解之。”這說明了茶的神奇功效。茶樹起源于我國的云南、四川等地，在從中國向世界各地數千年漫長傳播歷程里，與全球多元文化邂逅交融，發展形成了今天地球上復雜而美妙的茶文化。茶之所以廣受歡迎，除了有迷人的香氣和令人愉悅的滋
《PLoS生物學》：老鼠全基因組測序圖公布
最新一期的開放存取的《公共科學圖書館·生物學》(PLoS Biology)雜志上，美國、英國和瑞典的研究人員公布了老鼠的全基因組測序圖。老鼠成為繼人類之后第二個完成全基因組測序的哺乳動物。 在對人類和老鼠的基因測序圖進行綜合性比較后，研究人員發現兩者之間的遺傳差異要比人們預想的大得多。老鼠
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃（OGP）團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，
活躍基因詮釋牡蠣生存智慧
昨天凌晨，英國《自然》雜志網站在線發表了來自中國科學家的一項成果：他們完成了牡蠣的基因組測序，并從中窺視到了牡蠣應對極端生活環境的種種生存智慧。 牡蠣是動物界中的一大支系――冠輪動物（特點為身體柔軟，體型多變）的代表，是一種具有重要經濟、生態價值的貝類。論文通訊作者、中國科學院海洋研究所張國范研
《基因組生物學》：一種超級細菌的基因組測序完成
最近，英國桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作，研究結果顯示，這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論
海洋所在牡蠣基因組編輯方面獲進展
近日，中國科學院海洋研究所實驗海洋生物學重點實驗室張琳琳團隊在牡蠣基因組編輯方面獲新進展。相關研究成果發表在Frontiers in Marine Science（DOI：10.3389/fmars.2022.912409）上。 隨著高品質動物蛋白需求的增長，水產養殖正成為人類食用海產品的主要
“千種動植物基因組計劃”一期啟動100多種測序
由深圳華大基因研究院發起的“千種動植物基因組計劃”，一期已啟動100多種動植物基因組測序分析項目，其中近一半的項目已經完成或接近尾聲。 華大基因5月13日召開發布會稱，該“千種計劃”在重要物種基因組學研究領域和巨型基因組數據庫構建上取得階段性進展，該計劃將加速全球基因組學研
揭示近江牡蠣種質資源格局的形成機制
近日，中國科學院海洋研究所貝類遺傳與進化研發團隊在《通訊-生物學》（Communications Biology）上在線刊發了關于牡蠣環境適應演化機制的研究論文Genome of the estuarine oyster provides insights into climate impact
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
“千種動植物基因組計劃”一期完成
記者近日從深圳華大基因研究院獲悉，由該院發起的“千種動植物基因組計劃”一期在重要物種基因組學研究領域和巨型基因組數據庫構建上取得階段性進展。 于2010年1月正式啟動的“千種動植物基因組計劃”（簡稱“千種”計劃）預計在未來兩年內將破譯千種具有重要經濟和科研價值的動植物物種基因
探秘海洋生物－賦能藍色產業
談到我國海洋生物學的發展，不能不提位于青島黃海之畔的中國科學院海洋研究所（以下簡稱海洋所）。它是發源于70年前新中國第一個海洋生物研究機構。 今天，海洋所已為我國海洋生物研究練就一支生力軍，培育了一個完整的鏈條。從探秘生命奧秘到建設“藍色糧倉”，從發展海洋生物高技術到開發利用藍色基因資源，從這
長牡蠣和櫛孔扇貝全基因組框架圖繪制完成
日前，長牡蠣和櫛孔扇貝全基因組框架圖繪制完成，并篩查得到與重要性狀相關的基因或信號通路，在國際上填補了冠輪動物基因組學研究空白。 這是在國家863計劃支持下，由中國海洋大學、中國科學院海洋研究所、中國水產科學研究院黃海水產研究所、中國科學院南海海洋研究所、威海長青海洋科技股份有限公司、大連獐子
著名海洋生物學家劉瑞玉院士逝世
中國共產黨黨員、九三學社社員、中國科學院資深院士，第六屆全國人大代表，中國科協全國委員會委員、第四屆山東省政協常委、九三學社山東省第二屆副主委、山東省科協第二和第三屆副主席、青島市政協第八屆副主席，九三學社青島市第八屆主委、中國海洋湖沼學會名譽理事長、國際黃海研究學會名譽主席、國際甲殼動物學會理
海洋生物學家海中遭大白鯊跟蹤
北京時間1月10日消息，據英國《每日郵報》報道，獨自乘坐一條小橡皮艇的海洋生物學家特雷·斯諾曾希望悄悄跟蹤一只大白鯊。但是最近他卻被這種世界上最可怕的殺手所跟蹤。 大白鯊跟蹤獨木舟 最初，這只體型龐大的動物潛入海底，從下面觀察特雷乘坐的皮船，然后以具有威脅性的方式浮出水面。然而對特雷來
PCR技術在－生態及海洋生物學的應用
對分析來說,傳統分子技術所需的組織樣品用量相對較多。尤其是許多無脊椎動 物,它們對于進行分子檢測所用的一般操作方法來講太小。因此,對于小生物、共生 生物或那些在培養基中不易生長的生物個體的直接分析是困難。聚合酶鏈反應有和來 擴大能進行分子檢測的生物范圍。現在可以直接研究象原生物和藻類等單細胞生物自
全基因組測序的竹亞科及生物學性狀的比較基因組學研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，約有12000種，是水稻、小麥、玉米等人類糧食和牲畜飼料的主要來源，也為人類提供了加工淀粉、制糖、釀酒、造紙、編織和建筑等方面的重要原料。同時，禾本科又是植物遺傳學和基因組學研究的模式類群。竹亞科（竹子）是禾本科的12個亞科之一，與早熟禾亞科、稻亞科組成BOP
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
海洋所合作在牡蠣適應進化研究中取得新進展
中國科學院海洋研究所研究員張國范團隊與美國新澤西州立大學教授郭希明、佛羅里達大學教授Gary Litman合作，在長牡蠣免疫相關基因的進化和功能分化研究方面取得新進展。 該研究發現，牡蠣免疫基因除高度擴張外，更為有趣的是多個基因家族以及家族中的不同成員均在病原和非病原類脅迫防御中發揮著重要作用
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
我國完成小麥A基因組測序
本報訊（記者丁佳）5月10日，《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果，該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究，全面揭示了小麥A基因組的結構和
測序解讀基因組，真的好嗎？
測序解讀基因組，真的好嗎？ “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire，在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說，“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年，但