一提起癌癥,人們往往談虎色變。的確,癌癥是全球發病和死亡的主要原因。據WHO統計,2012年有820萬例癌癥相關的死亡。所幸,DNA測序技術的快速發展正在改變我們對癌癥的認識,也在轉變癌癥的篩查、診斷和治療。 如今,新一代測序主要應用在癌癥預防和治療中的哪些方面?美國罕見病基因組研究所的研究人員不久前在《Frontiers in Genetics》雜志上進行了詳細介紹。在這篇文章中,他們回顧了新一代測序近期的科研和臨床應用,同時,他們強調了100%基因組測序的重要性,也就是測序高度重復的非編碼序列。 利用新一代測序(NGS)技術,人們已經完成了多種癌癥的外顯子組測序和基因組測序,并提出了癌癥分型的新標準。以乳腺癌為例,癌癥基因組圖譜(Cancer Genome Atlas)測序了510個乳腺癌外顯子組,將其分為四個亞型:luminal A、 luminal B、HER2-enriched和basal-like。 測序所......閱讀全文
3. 新一代測序技術的前景在2007年6月,James Watson的基因組序列登錄到了GenBank數據庫當中,這是第一次使用非Sanger測序法獲得了人類個體基因組序列,并且第一次將個人基因組序列公之于眾。整個測序過程在兩個月之內就完成了,花費不到100萬美元,這只占耗時10年之久的人類
近年來,基因測序技術飛速發展,使得幾十個甚至上百個基因的測序能夠在幾天之內完成,測序的成本也下降到普通百姓可以承受的范圍,這使得基因測序的臨床應用成為可能。在臨床研究方面,外顯子組甚至全基因組的基因測序大大加速了疾病分子標志物的尋找,使得多種疾病病因的診斷與分型與以往相比更加精確,在用藥時也能更
三、新一代DNA測序技術DNA測序技術已廣泛應用于生物學研究的各個領域,很多生物學問題都可以借助高通量DNA測序技術予以解決。過去三年,大規模平行 測序平臺(massively parallel DNA sequencing platform)已經發展為主流的測序技術,這項測序技術的出現不僅
新一代非基于“桑格技術”的基因測序法以空前的快速測序速度問世了,它為人類帶來了重大的科學成果和先進的生物學應用軟件。然而,要研發出新一代基因測序法,必須克服30年來以桑格技術為基礎的慣性思維。 1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson發表了兩篇關于快速測序技
高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(de
法醫 DNA檢測平臺的研究進展與比較研究摘要:現代科學技術帶動了 DNA檢測技術在法醫領域的不斷發展.以目前世界上比較先進的三個 DNA檢測平臺為例,探討法醫 DNA檢測平臺的研究與應用.每項技術有其優缺點,在實際的法醫 DNA檢 測中,要靈活地選用檢測平臺,以促進工作的順利開展.近幾年來,中國
最新的新一代測序儀操作只需一個人,24小時內可產生與幾百臺桑格毛細管測序儀同樣多的序列數據。此外,樣品中DNA損傷與常溫貯藏的狀態以及新一代測序誤差等因素往往超過了序列變異,因此很難確定樣品來源于現代人類還是古穴人。相比較而言,斷言長毛象的某一特定順序是來源于古代標本,而不是現代污染物更容易,因為現
一、高通量測序的應用 高通量測序可以幫助研究者跨過文庫構建這一實驗步驟,避免了亞克隆過程中引入的偏差。 依靠后期強大的生物信息學分析能力,對照一個參比基因組(reference genome)高通量測序技術可以非常輕松完成基因組重測序(re-sequence),2007年van Orsouw
454測序儀的出現極大促進了測序業務的開展,科研人員已經將測序技術作為解決科研工作中許多常見 問題的利器。這是因為454測序儀在以下幾個方面取得了質的突破:首先是解決了高通量測序問題;其次它簡 化了樣品準備步驟,將以往轉化大腸桿菌擴增質粒的繁瑣過程全部用簡單的體外PCR擴增法替代了;最后, 它縮小了
摘要: CRISPR/Cas9基因組編輯技術和新一代測序技術(也稱高通量測序技術),是當今對生命科學研究有重大影響的兩項技術。二者并非毫不相干。有效地將二者聯用,有時可以大大加速科研進程。兩者之間有什么樣的聯系呢?在哪些研究領域或方向上可以聯用呢?上海伯豪生物根據在這兩個領域的技術服務經驗
一、我們將如何應對海量的基因信息新一代測序技術帶給人們大量遺傳信息的同時,卻成為限制其廣泛應用的一個障礙。1980年,英國生物化學家Frederick Sanger與美國生物化學家Walter Gilbert建立了DNA測序技術并獲得諾貝爾化學獎,至今已有近三十年了。在這三十年,DNA測序技
【摘要】 2005年454公司首推劃時代的新一代測序儀,從而引發了測序市場上454、Illumina、ABI等公司在新一代測序技術上的比拼高潮。也正是這種你追我趕,讓繪制人類全基因組圖譜由過去的耗費4.37億美元和13年時間,驟然縮短到如今SOLiD 3運行一次即獲得50GB可定位測序數據。新一代
【摘要】2005年454公司首推劃時代的新一代測序儀,從而引發了測序市場上454、Illumina、ABI等公司在新一代測序技術上的比拼高潮。也正是這種你追我趕,讓繪制人類全基因組圖譜由過去的耗費4.37億美元和13年時間,驟然縮短到如今SOLiD 3運行一次即獲得50GB可定位測序數據。新一代測序
2. 用于處理新一代測序技術數據的軟件和標準各種新一代測序儀的飛速發展面臨著一個極其重要的問題,那就是生物信息學問題,這些問題包括序列質量評分(sequence quality scoring)問題、序列比對問題、序列組裝問題、數據發布問題等。下面將逐個進行討論。2.1 序列質量問題目前,序列質量評
新一代測序技術現在越來越多使用在新興生物藥的開發和疫苗生產上。目前藥物研發部門使用的各種高通量技術,例如基因芯片、代謝組學建模、酵母雙雜、蛋白質組學、高通量化學篩選、電子雜交定位,有望被新一代測序技術替代或作為補充
基因測序也稱DNA測序,是現代生物學研究中重要的手段之一。基因測序技術經過了三個發展階段。第一代DNA測序技術是1975年由桑格(Sanger)和考爾森(Coulson)提出的鏈終止法。第一代技術準確率高,讀取長,
四.CRISPR/Cas9技術與新一代測序技術的聯用 革命性技術總是發展迅速、應用廣泛的。作為另一項革命性的生命科學研究技術,DNA新一代測序技術在近五、六年得到快速發展和推廣。它已經用于生命科學相關領域的許多方面。同樣地,也可以用在CRISPR/Cas9相關的研究中。兩者之間的應用領域有
在完成的基因組的復興時代,科學家使用由第三代測序技術提供的長讀取,來填補基因組裝配中的缺口(gap)。新一代測序能趕得上嗎? 新一代測序,可讓科學家們以比Sanger測序更快的速度和更低的價格,進行基因組測序,為1000美元基因組測序鋪平了道路。但是這種方法犧牲了長讀取速度,將平均讀長減少至大
著名的生物技術公司Life Technologies(納斯達克股票代碼:LIFE)3月28日宣布,在中國推出新的臺式基因測序儀:Ion Proton?。借助該技術產品,只需 1000 美元即可在一天時間內完成個人全基因組測序。 這一新型測序儀采用了新一代半導體測序技術。此前推出的同樣基于這
Qiagen公司在周一收市后宣布,它已經收購了新一代測序公司Intelligent Bio-Systems(IBS),并推出一項舉措,旨在將測序技術推向分子診斷和臨床研究市場。 私人持有的IBS公司在今年3月召開的“Association of Biomolecular Resour
【摘要】5月16日,在杭州舉辦的“2014轉化醫學高峰論壇”上,賽默飛世爾科技公司旗下Life Technologies中國區儀器平臺銷售總監張焱女士指出,基因組工具的發展突飛猛進,轉化醫學正從一個平臺深入到醫療領域的方方面面,創新技術和方法令人應接不暇,臨床應用迎來了前所未有的機遇期。 十年
至今,新一代測序技術已經遍布全球上百個基因組測序中心 ――明斯特大學Dag Harmsen 在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過
安捷倫科技公司與Covaris公司簽署合作開發市場協議 將靶向序列富集與DNA剪切技術結合 用于新一代測序分析 2010年1月5日,北京安捷倫科技公司(NYSE: A)與Covaris 公司于今日宣布了一項合作開發市場協議,該協議表明,未來Covaris S2 DNA剪切技術將與安捷倫 S
2008年12月 作為上世紀生命科學領域最重要的技術發明之一,測序技術深刻地改變了我們對生命本質的理解和掌控能力。假如沒有測序技術,基因序列就無法確定,酶切、克隆、反轉錄、cDNA、PCR、SNP、RNAi等等研究技術也就根本無從談起,生命科學領域也不會有今日的蓬勃發展。無人不曉的GenBank;
人類基因組計劃、基因芯片、個性化分子診斷、生物云計算……這些在21世紀第一個十年里吸引無數眼球的熱門詞匯,都和一個產業頗有淵源——DNA測序。生物技術和信息技術在這片創意新天地里水乳交融,如果用一句詩來形容坐擁兩大技術護航的DNA測序產業,那就是——天生麗質難自棄。隨著人類基因組計劃的完成,人類對自
在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過50人的生命(德國范圍內),在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。 Harmsen 教授在這
美國DeNovix公司超微量/熒光全功能光度計在新一代測序樣品質量上的應用對于新一代測序,待測樣品的質量和濃度,是文庫成功構建的兩個非常關鍵因素,也是新一代測序成功與否的關鍵。它可以最大程度上減小序列的偏差,并且輸出可靠的序列信息。嚴格把關送測樣品的濃度和質量,是確保新一代測序的數據準確、以及高通量
說起全自動測序儀,Applied Biosystems(ABI)那是絕對的領頭羊,其3730旗艦測序儀在人類基因組計劃中立下赫赫戰功。然而,在新一代測序方面,454和Solexa搶了先機,率先推出了NGS儀器。ABI當然不會作壁上觀,讓客戶的實驗室里擺滿對手的儀器。 于是,它在2006年斥資1
基因測序是一個革命性技術,所帶來的應用領域非常寬廣,是一片未開發的藍海領域。近幾年來,隨著基因測序技術的進步,基因測序行業進入高速發展時期。 在基因測序產業鏈中,最上游基因測序儀的研發和生產是產業的命門,長期以來,基因測序儀的生產一直被國外所壟斷,而從今年開始,中國制造的基因測序儀將逐步替代
在去年召開的美國微生物學會上,來自明斯特大學的醫學微生物學家Dag Harmsen開始聽到了有關德國大腸桿菌疫情爆發的傳言,這場疫情首先在德國北部地區爆發,感染了至少4000人,奪去了超過50人的生命(德國范圍內),在德國以外的歐洲地區也發現了76名患者。 Harmsen教授在這場疫情