基因芯片檢測原理(二)
1.熒光標記雜交信號的檢測方法使用熒光標記物的研究者最多,因而相應的探測方法也就最多、最成熟。由于熒光顯微鏡可以選擇性地激發和探測樣品中的混合熒光標記物,并具有很好的空間分辨率和熱分辨率,特別是當熒光顯微鏡中使用了共焦激光掃描時,分辨能力在實際應用中可接近由數值孔徑和光波長決定的空間分辨率,而在傳統的顯微鏡是很難做到的,這便為DNA芯片進一步微型化提供了重要的檢測方法的基礎。大多數方法都是在人射照明式熒光顯微鏡(epifluoescence microscope)基礎上發展起來的,包括激光掃描熒光顯微鏡、激光共焦掃描顯微鏡、使用了CCD相機的改進的熒光顯微鏡以及將DNA芯片直接制作在光纖維束切面上并結合熒光顯微鏡的光纖傳感器微陣列。這些方法基本上都是將待雜交對象 以熒光物質標記,如熒光素或麗絲膠(lissamine)等,雜交后經過SSC和SDS的混合溶液或SSPE等緩沖液清洗。(1)激光掃描熒光顯微鏡探測裝置比較典型......閱讀全文
基因芯片
基因芯片(genechip)(又稱DNA芯片、生物芯片)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的測序原理是雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應位置的
基因芯片-簡介
隨著人類基因組(測序)計劃( Human genome project )的逐步實施以及分子生物學相關學科的迅猛發展,越來越多的動植物、微生物基因組序列得以測定,基因序列數據正在以前所未有的速度迅速增長。然而 , 怎樣去研究如此眾多基因在生命過程中所擔負的功能就成了全世界生命科學工作者共
基因芯片概念
基因芯片(又稱 DNA 芯片、生物芯片)技術就是順應這一科學發展要求的產物,它的出現為解決此類問題提供了光輝的前景。該技術系指將大量(通常每平方厘米點陣密度高于 400 )探針分子固定于支持物上后與標記的樣品分子進行雜交,通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取樣品分子的數量和序列信息。通俗地說,
基因芯片-原理
基因芯片(gene chip)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的測序原理是雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,可以基因芯片的測序原理用圖11-5-1來說明。在一塊基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探針。當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與
基因芯片簡介
隨著人類基因組(測序)計劃(Human genome project)的逐步實施以及分子生物學相關學科的迅猛發展,越來越多的動植物、微生物基因組序列得以測定,基因序列數據正在以前所未有的速度迅速增長。然而,怎樣去研究如此眾多基因在生命過程中所擔負的功能就成了全世界生命科學工作者共同的課題。為此,建立
基因芯片主要類型
目前已有多種方法可以將寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。這些方法總體上有兩種,即原位合成( in situ synthesis )與合成點樣兩種。支持物有多種如玻璃片、硅片、聚丙烯膜、硝酸纖維素膜、尼龍膜等,但需經特殊處理。作原位合成的支持物在聚合反應前要先使其表面衍生出羥基或氨基(視所要固定基因芯
基因芯片相關技術
樣品的準備及雜交檢測目前,由于靈敏度所限,多數方法需要在標記和分析前對樣品進行適當程序的擴增,不過也有不少人試圖繞過這一問題,如 Mosaic Technologies 公司引入的固相 PCR 方法,引物特異性強,無交叉污染并且省去了液相處理的煩瑣; Lynx Therapeutics 公司引入
基因芯片的應用
1998 年底美國科學促進會將基因芯片技術列為 1998 年度自然科學領域十大進展之一,足見其在科學史上的意義。現在,基因芯片這一時代的寵兒已被應用到生物科學眾多的領域之中。它以其可同時、快速、準確地分析數以千計基因組信息的本領而顯示出了巨大的威力。這些應用主要包括基因表達檢測、突變檢測、基因組多態
基因芯片發展歷史
俄羅斯科學院恩格爾哈得分子生物學研究所和美國阿貢國家實驗室(ANL)的科學家們最早在文獻中提出了用雜交法測定核酸序列(SBH)新技術的想法。當時用的是多聚寡核酸探針。幾乎與此同時英國牛津大學生化系的Sourthern等也取得了在載體固定寡核苷酸及雜交法測序的國際ZL。在這些技術儲備的基礎上,1994
基因芯片檢測原理
雜交信號的檢測是DNA芯片技術中的重要組成部分。以往的研究中已形成許多種探測分子雜交的方法,如熒光顯微鏡、隱逝波傳感器、光散射表面共振、電化傳感器、化學發光、熒光各向異性等等,但并非每種方法都適用于DNA芯片。由于DNA芯片本身的結構及性質,需要確定雜交信號在芯片上的位置,尤其是大規模DNA芯片由于
基因芯片的應用
DNA芯片技術就是指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接將大量的DNA探針以顯微打印的方式有序地固化于支持物表面,然后與標記的樣品雜交,通過對雜交信號的檢測分析,即可獲得樣品的遺傳信息。是伴隨“人類基因組計劃”的研究進展而快速發展起來的一門高新技術。通俗地說,基因芯片是通過微加工技術,將數以萬計、
基因芯片的應用
1998 年底 美國科學促進會將基因芯片技術列為 1998 年度自然科學領域十大進展之一,足見其在科學史上的意義。現在,基因芯片這一時代的寵兒已被應用到 生物科學眾多的領域之中。它以其可同時、快速、準確地分析數以千計 基因組信息的本領而顯示出了巨大的威力。這些應用主要包括 基因表達檢測、突變檢測
什么是基因芯片?
基因芯片(genechip)(又稱DNA芯片、生物芯片)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的測序原理是雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應位置的
基因芯片的原理
基因芯片(gene chip)的原型是80年代中期提出的。基因芯片的測序原理是雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,可以用圖11-5-1來說明。在一塊基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探針。當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應位置
基因芯片:春天在哪里
俞菁(化名)是一名手語翻譯,她的媽媽因為小時候一次注射慶大霉素致聾,但她自己的聽力得以保持健全。俞菁有一位好姐妹,情況卻正好相反,她媽媽聽力正常,而她自己在小時候在一次藥物注射后變成了聽障患者。 去年,她們都參加了北京市的一個高危人群致聾基因篩查,結果兩個人都是致聾基因的攜帶者,只是因為俞
基因芯片的測序原理
基因芯片的測序原理是雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應位置的核酸探針產生互補匹配時,通過確定熒光強度最強的探針位置,獲得一組序列完全互補的探針序
基因芯片的功能介紹
DNA芯片又叫做基因芯片(gene chip)或基因微陣列(microarray),寡核酸芯片,或DNA微陣列,它是通過微陣列技術將高密度DNA片段陣列以一定的排列方式使其附著在玻璃、尼龍等材料上面。由于常用計算機硅芯片作為固相支持物,所以稱為DNA芯片。
基因芯片的主要類型
目前已有多種方法可以將寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。這些方法總體上有兩種,即原位合成(in situ synthesis)與合成點樣兩種。支持物有多種如玻璃片、硅片、聚丙烯膜、硝酸纖維素膜、尼龍膜等,但需經特殊處理。作原位合成的支持物在聚合反應前要先使其表面衍生出羥基或氨基(視所要固定的分子為核
基因芯片的背景介紹
高通量、全基因組的DNA芯片已經成為生物領域十分有用的工具。然而,芯片實驗產生的數據量日益增長,由于不同的分析方法,會得出不同結論,因而分析起著關鍵作用。 基因芯片分析就是為了通過生物信息學方法從這些芯片數據中發現可能對生物效應起作用的關鍵基因,從中尋找特定模式并對每個基因給予注釋,從而挖掘出
基因芯片——生物信息精靈
基因芯片,也叫DNA芯片,是在90年代中期發展出來的高科技產物。基因芯片大小如指甲蓋一般,其基質一般是經過處理后的玻璃片。每個芯片的基面上都可劃分出數萬至數百萬個小區。在指定的小區內,可固定大量具有特定功能、長約20個堿基序列的核酸分子(也叫分子探針)。由于被固定的分子探針在基質上形成不同的探針陣列
基因芯片與SNP分析
基因芯片技術作為一種新興的生物技術,近年來得到迅速發展,其應用具有巨大的潛力。單核苷酸多態性(SNP)作為新的遺傳標記對基因定位及相關疾病研究的意義亦非常重大。本文主要介紹了DNA 芯片技術的原理和分類、單核苷酸多態性檢測方法及DNA 芯片技術在單核苷酸多態性檢測方面的應用。生物芯片技術是90
基因芯片檢測原理(一)
基因芯片的基本原理同芯片技術中雜交測序(sequencing by hybridization, SBH)。即任何線狀的單鏈DNA或RNA序列均可被分解為一個序列固定、錯落而重疊的寡核苷酸,又稱亞序列(subsequence)。例如可把寡核苷酸序列TTAGCTCATATG分解成5個8 nt亞
基因芯片檢測原理(二)
1.熒光標記雜交信號的檢測方法使用熒光標記物的研究者最多,因而相應的探測方法也就最多、最成熟。由于熒光顯微鏡可以選擇性地激發和探測樣品中的混合熒光標記物,并具有很好的空間分辨率和熱分辨率,特別是當熒光顯微鏡中使用了共焦激光掃描時,分辨能力在實際應用中可接近由數值孔徑和光波長決定的空間分辨率,而在傳統
LDR臨床檢測基因芯片
基因芯片生物芯片是指采用光導原位合成或微量點樣等方法,將大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子、組織切片、細胞等等生物樣品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝膠、尼龍膜等載體)的表面,組成密集二維分子排列,然后與已標記的待測生物樣品中靶分子雜交,通過特定的儀器比如激光共聚焦掃描對雜交信號的強
基因芯片技術的簡介
隨著人類基因組( human genome p roject, HGP) 、多種模式生物(model organism)和部分病原體基因組測序的完成,基因序列數據以前所未有的速度不斷增長。傳統實驗方法已無法系統地獲得和詮釋日益龐大的基因序列信息,研究者們迫切需要一種新的手段,以便大規模、高通量地
基因芯片的主要類型
目前已有多種方法可以將寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。這些方法總體上有兩種,即原位合成( in situ synthesis )與合成點樣兩種。支持物有多種如玻璃片、硅片、聚丙烯膜、硝酸纖維素膜、尼龍膜等,但需經特殊處理。作原位合成的支持物在聚合反應前要先使其表面衍生出羥基或氨基(視所要固定的
基因芯片的制備方法
基因芯片的片基主要有硅片、玻璃片、硝酸纖維膜、聚丙烯膜等寡核苷酸芯片以人工合成的寡核苷酸片斷作為探針,制備方法主要有原位合成法和合成后點樣法。而 cDNA 芯片以長片斷的 PCR 產物作為探針,制備方法主要為合成后點樣法。(1)原位合成法? 制備寡核苷酸芯片原位合成法設備昂貴,技術復雜。(2)合成后
基因芯片實驗的步驟
(1)樣品制備和標記? 為了獲得目的基因的雜交信號必須對目的基因進行標記,由于目前常用的熒光檢測系統的靈敏度還不夠高,為了提高檢測靈敏度,需要在對樣品核酸進行熒光標記時,對目的基因進行擴增。生物樣品成分復雜,往往含有較多的抑制物,在對樣品進行擴增、熒光標記之前,必須先提取、純化樣品核酸。目前普遍采用
基因芯片的測序原理
基因芯片的測序原理是雜交測序方法,即通過與一組已知序列的核酸探針雜交進行核酸序列測定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探針。當溶液中帶有熒光標記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對應位置的核酸探針產生互補匹配時,通過確定熒光強度最強的探針位置,獲得一組序列完全互補的探針序
基因芯片的主要類型
目前已有多種方法可以將寡核苷酸或短肽固定到固相支持物上。這些方法總體上有兩種,即原位合成(in situ synthesis)與合成點樣兩種。支持物有多種如玻璃片、硅片、聚丙烯膜、硝酸纖維素膜、尼龍膜等,但需經特殊處理。作原位合成的支持物在聚合反應前要先使其表面衍生出羥基或氨基(視所要固定的分子為核