體外轉錄合成單鏈RNA探針
實驗方法原理 制備特異性的單鏈 RNA 探針不僅比 DNA 探針更容易，在雜交反應中一般也比具相同比活性的 DNA 探針產生更強的信號，這可能是由于含有 RNA 的雜合鏈固有的更高穩定性的緣故（Casey and Davidson 1977)。雖然 DNA 探針仍普遍地應用于 Northern 和 Southern 雜交，但當分析哺乳動物基因的轉錄時，放射性標記的 RNA 目前是首選探針。由于 RNA 酶 A 既耐用又容易控制，可用 RNA 酶 A 來消化 RNA-RNA 雜合體，而不必用特異性 S1 核酸酶來消化 DNA-RNA 雜合分子，RNA 酶 A 可在較寬的濃度范圍內使用而不影響實驗結果（Zirmetal. 1983; Mehonetal. 1984)。 ......閱讀全文
單鏈DNA探針技術簡介
用雙鏈探針雜交檢測另一個遠緣DNA時,探針序列與被檢測序列間有很多錯配。而兩條探針互補鏈之間的配對卻十分穩定,即形成自身的無效雜交,結果使檢測效率下降。采用單鏈探針則可解決這一問題。單鏈DNA探針的合成方法主要有下列兩種:(1) 以M13載體衍生序列為模板,用Klenow片段合成單鏈探針; (2)
細胞化學詞匯單鏈RNA
中文名稱：單鏈RNA英文名稱：single-stranded RNA;ssRNA定 義：只含有一條鏈的RNA分子。生物體中絕大部分RNA是單鏈RNA，形成二級結構時，是既有單鏈、又有雙鏈結構域的RNA分子；只有某些RNA病毒是由兩條鏈互補而成的雙鏈RNA。應用學科：生物化學與分子生物學（一級學科）
單鏈RNA的結構特點
中文名稱單鏈RNA英文名稱single-stranded RNA;ssRNA定 義只含有一條鏈的RNA分子。生物體中絕大部分RNA是單鏈RNA，形成二級結構時，是既有單鏈、又有雙鏈結構域的RNA分子；只有某些RNA病毒是由兩條鏈互補而成的雙鏈RNA。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與
體外轉錄合成單鏈RNA探針
實驗方法原理?制備特異性的單鏈 RNA 探針不僅比 DNA 探針更容易，在雜交反應中一般也比具相同比活性的 DNA 探針產生更強的信號，這可能是由于含有 RNA 的雜合鏈固有的更高穩定性的緣故（Casey and Davidson 1977)。雖然 DNA 探針仍普遍地應用于 Norther
體外轉錄合成單鏈RNA探針
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 制備特異性的單鏈 RNA 探針不僅比 DNA 探針更容易，在雜交反應中一般也比具相同比活性的 DNA 探針產生更強的信號，這可能是由于含有 RNA 的雜合鏈固有的更高穩定性的緣故（Casey and Davidson 197
單鏈RNA的基本信息
中文名稱單鏈RNA英文名稱single-stranded RNA;ssRNA定 義只含有一條鏈的RNA分子。生物體中絕大部分RNA是單鏈RNA，形成二級結構時，是既有單鏈、又有雙鏈結構域的RNA分子；只有某些RNA病毒是由兩條鏈互補而成的雙鏈RNA。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），核酸與
半制備規模單鏈RNA純化
寡核苷酸合成是非常高效和高產率的過程。在固相載體上進行寡核苷酸反應的典型產率為每耦合階98～99.5%。在典型的多階寡核苷酸合成中，雜質聚集在一起，即使是一般大小的21基體寡核苷酸的總產率也達到67～90%，較長鏈的寡核苷酸的產率相應較低。研究人員通常需要使用純度高于初步合成混合物的材料。因此，
半制備規模單鏈RNA純化
引言寡核苷酸合成是非常高效和高產率的過程。在固相載體上進行寡核苷酸反應的典型產率為每耦合階98～99.5%。在典型的多階寡核苷酸合成中，雜質聚集在一起，即使是一般大小的21基體寡核苷酸的總產率也達到67～90%，較長鏈的寡核苷酸的產率相應較低。研究人員通常需要使用純度高于初步合成混合物的材料。因此，
單鏈RNA的基本信息介紹
一般來說生物學家是根據RNA能否直接起mRNA作用而分成正鏈ssRNA病毒與負鏈ssRNA病毒兩種。 (1)正鏈RNA病毒（如脊髓灰質炎病毒）的ssRNA可直接起mRNA作用，轉譯早期蛋白質，包括RNA多聚酶和抑制宿主細胞合成代謝的調控蛋白。然后在RNA多聚酶的作用下，以ssRNA（正鏈）為模板
半制備規模單鏈RNA純化（一）
Sean M. McCarthy and Martin GilarWaters Corporation, Milford, MA, U.S.引言寡核苷酸合成是非常高效和高產率的過程。在固相載體上進行寡核苷酸反應的典型產率為每耦合階98～99.5%。在典型的多階寡核苷酸合成中，雜質聚集在一起，即使是一
半制備規模單鏈RNA純化（二）
圖2中所示被選中的餾份收集窗表示不同的質量負荷。峰值采集后，樣品可以根據需要對等分和干燥，以便長期儲存。TEAA的揮發性使離子對緩沖組分的去除非常容易。溶劑蒸發后被純化的寡核苷酸實際上是不含鹽的。?UPLC條件純化RNA寡核苷酸的純度通過ACQUITY UPLC系統來驗證。如圖3所示，我們的純化方法
體外轉錄合成單鏈RNA探針:體外轉錄法
體外轉錄法l????????體外轉錄合成單鏈RNA探針1.??????用適當的限制酶消化超螺旋質粒DNA制備5 pmol的線性模板DNA。取一小份消化的DNA（100ng）進行瓊脂糖凝膠電泳分析。如有必要，再補加限制性酶進行溫育，直至不再殘存痕量的未消化DNA。2.??????如必須用產生3’突出端
Science：重大進展！開發出單鏈DNA/RNA折紙術
DNA折紙術科學家們正在夢想著各種各樣的比人的頭發小一千倍的形狀，并希望這些形狀有朝一日引發計算、電子學和醫學變革。 如今，在一項新的研究中，來自美國亞利桑那州立大學和哈佛大學的研究人員在DNA納米技術上取得一項重大的新進展。他們開發出的一種被稱作單鏈折紙術（single-stranded o
研究揭示正單鏈RNA病毒編碼小蛋白新策略
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510524.shtm
RNA探針的概念
RNA探針是一類很有前途的核酸探針，由于RNA是單鏈分子，所以它與靶序列的雜交反應效率極高。早期采用的RNA探針是細胞mRNA探針和病毒RNA探針，這些RNA是在細胞基因轉錄或病毒復制過程中得到標記的，標記效率往往不高，且受到多種因素的制約。
RNA探針技術簡介
許多載體如pBluescript, pGEM等均帶有來自噬菌體SP6或E.coli噬菌體T7或T3的啟動子,它們能特異性地被各自噬菌體編碼的依賴于DNA的RNA聚合酶所識別,合成特異性的RNA。在反應體系中若加入經標記的NTP，則可合成RNA探針。RNA探針一般都是單鏈,它具有單鏈DNA探針的優點,
RNA探針的簡介
許多載體如pBluescript, pGEM等均帶有來自噬菌體SP6或E.coli噬菌體T7或T3的啟動子,它們能特異性地被各自噬菌體編碼的依賴于DNA的RNA聚合酶所識別,合成特異性的RNA。在反應體系中若加入經標記的NTP,則可合成RNA探針。RNA探針一般都是單鏈,它具有單鏈DNA探針的優
新型跨界侵染植物與真菌負單鏈RNA病毒被發現
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519441.shtm西北農林科技大學植物保護學院教授孫麗英課題組發現了一種新型跨界侵染植物與真菌的負單鏈RNA病毒（VmNSRV1），相關研究成果近日發表在PNAS上。 ???該研究發現的新型真菌
新型跨界侵染植物與真菌負單鏈RNA病毒被發現
西北農林科技大學植物保護學院教授孫麗英課題組發現了一種新型跨界侵染植物與真菌的負單鏈RNA病毒（VmNSRV1），相關研究成果近日發表在PNAS上。???該研究發現的新型真菌病毒VmNSRV1分離自蘋果樹腐爛病的病原菌（Valsa mali）。（課題組供圖）該研究發現的新型真菌病毒VmNSRV1分離
RNA探針的應用介紹
這類RNA探針主要用于研究目的，而不是用于檢測。例如，在篩選逆轉錄病毒人類免疫缺陷病毒（HIV）的基因組DNA克隆時，因無DNA探針可利用，就利用HIV的全套標記mRNA作為探針，成功地篩選到多株HIV基因組DNA克隆。又如進行中的轉錄分析（nuclear run on transcrip－tion
常見RNA探針及其特點
常見RNA探針及其特點：RNA探針是指帶有標記的能與組織內相對應的核苷酸序列互補結合的一段單鏈cDNA或cRNA分子。根據在RNA雜交中所使用的探針依其來源可分為三種：即特異性cDNA、cRNA探針和人工合成寡核苷酸探針。?cRNA探針：是以cDNA為模板，通過體外轉錄而獲得的。因為它是一種單鏈探針
雙鏈DNA探針標記法
分子生物研究中，最常用的探針即為雙鏈DNA探針，它廣泛應用于基因的鑒定、臨床診斷等方面。 雙鏈DNA探針的合成方法主要有下列兩種:切口平移法和隨機引物合成法。 1.切口平移法(nick translation) 當雙鏈DNA分子的一條鏈上產生切口時,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可將核苷酸連
從M13噬菌體模板合成固定長度的單鏈DNA探針
? ? ? ? ? ? 實驗材料 大腸桿菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段 限制性內切核酸酶 模板 DNA 寡核苷酸引物 試劑、試
從M13噬菌體模板合成固定長度的單鏈DNA探針
實驗材料 大腸桿菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性內切核酸酶模板 DNA寡核苷酸引物試劑、試劑盒 乙酸銨DTTEDTA乙醇NaCl酚氯仿TBE 電泳緩沖液Tris-ClKlenow 基礎緩沖液dNTP 溶液儀器、耗材 變性聚丙烯酰胺凝膠或堿性瓊脂糖凝膠黏性貼片或磷光黏性貼片Sephad
從M13噬菌體模板合成固定長度的單鏈DNA探針
實驗材料大腸桿菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性內切核酸酶模板 DNA寡核苷酸引物試劑、試劑盒乙酸銨DTTEDTA乙醇NaCl酚氯仿TBE 電泳緩沖液Tris-ClKlenow 基礎緩沖液dNTP 溶液儀器、耗材變性聚丙烯酰胺凝膠或堿性瓊脂糖凝膠黏性貼片或磷光黏性貼片Sephadex
常見RNA探針的技術特點
cRNA探針：是以cDNA為模板，通過體外轉錄而獲得的。因為它是一種單鏈探針，因此也避免了應用雙鏈cDNA探針做雜交反應時存在的兩條之間的復性問題。cRNA與RNA之間形成的雜交體要比cDNA-RNA雜交體穩定。cRNA-RNA之間形成的雜交體不受RNA酶的影響。因此雜交反應后可用RNA酶處理，以除
研究發展RNA“緩沖熒光探針”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519783.shtm
研究發展RNA“緩沖熒光探針”
近日，中國科學院大連化學物理研究所副研究員喬慶龍和徐兆超研究員團隊發展了能夠與RNA特異性可逆結合，在活細胞內對細胞核核仁穩定成像的“緩沖熒光探針”Nu-AN，實現了對核仁動態輪廓的成像，并通過活細胞內藥物誘導下核仁特定形態的可視化，為核仁應激試劑的篩選提供可視化的工具。相關成果發表在《先進科學》。
RNA探針的概念和分類
RNA探針是指帶有標記的能與組織內相對應的核苷酸序列互補結合的一段單鏈cDNA或cRNA分子。根據在RNA雜交中所使用的探針依其來源可分為三種：即特異性cDNA、cRNA探針和人工合成寡核苷酸探針。
RNA探針技術的應用介紹
這類RNA探針主要用于研究目的，而不是用于檢測。例如，在篩選逆轉錄病毒人類免疫缺陷病毒（HIV）的基因組DNA克隆時，因無DNA探針可利用，就利用HIV的全套標記mRNA作為探針，成功地篩選到多株HIV基因組DNA克隆。又如進行中的轉錄分析（nuclear run on transcrip－tion