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引言數據非依賴性的掃描模式（data-independent acquisition, DIA）是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式[1]。它的理念是用二級碎片離子進行蛋白相對/絕對定量。 DIA 掃描模式中，超高分辨質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂，采集所有母離子的碎片離子，并快速地依次掃描相鄰的母離子寬口內的所有碎片離子。 DIA 的數據中包含了所有碎片離子的保留時間和強度信息。用非常小的質量偏差寬口（如 10 ppm）目標性地抽提同一肽段的多個子離子，計算子離子的強度，就能對該肽段進行鑒定和定量。 DIA 定量相比傳統的基于母離子強度的 DDA 定量有選擇性好，定量準確等優點[1]，所以 DIA 成為定量蛋白組學新的發展方向。Q Exactive HF 是賽默飛世爾科技在 2014 年的 ASMS 上推出的全新靜電場軌道阱超高分辨質譜儀（圖 1）[2,3]。 Q Exactive HF ......閱讀全文
對10 條肽段的分析結果匯總(表1),結果表明,3 種DIA 方法在fg ~ pg 數量級肽段范圍內均顯示出良好的線性、重現性和靈敏度。3 種方法的最低定量限均達到amol 級,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限達14 amol,超越了常規SRM 和PRM 的定量水平。比
今天跟大家分享的是Orbitrap Exploris? 480的第1篇文獻，作者是來自丹麥哥本哈根大學的Jesper V. Olsen教授，文中對Exploris 480聯合FAIMS Pro的性能進行了全面測試，包括DDA與DIA鑒定，靈敏度測試，組織樣品測試，磷酸化樣品測試，以及TMT與DIA定
500 ng Hela 細胞裂解液用相同的色譜柱，相同的色譜梯度，將 QE HF 切換至 DIA 掃描模式進行 3 次 DIA 數據采集。在一次掃描循環中，目標母離子質核比范圍 400–1000，四極桿的隔離窗口為 12 Da，包含 50 次 MS/MS 掃描。每一張 MS/MS 譜圖中
Skyline 中嵌入的 mProphet 軟件會根據同一肽段的多個子離子峰的 feature 進行打分。 Feature 包括子離子共流出峰形、保留時間偏差、 dotp 值、信噪比等。為了區分假陽性的子離子峰， mProphet 可以建立 decoy 庫，也可以將打分排名第二的肽段作為decoy，
創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質的定量分析摘要 數據非依賴性采集(DIA)是隨著定量蛋白質組學而建立的質譜掃描技術。DIA 能夠獲得掃描范圍內所有母離子及二級子離子信息,不會造成低豐度離子信息的丟失,同時突破了高分辨質譜二級定量的通量限制。本研究基于靜電場軌道阱Q-qIT-OT 三
引言數據非依賴性的掃描模式（data-independent acquisition, DIA）是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式[1]。它的理念是用二級碎片離子進行蛋白相對/絕對定量。DIA 掃描模式中，超高分辨質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂，采集所有母離子的碎片離子，并快
質譜實驗的QC方法包括：樣品準備、液相色譜、質譜采集以及譜圖質量等。前兩期關于質譜污染物的防控，大部分是屬于樣品準備階段的質控工作。質控專題共分三期內容：1. 質譜污染的來源與防控篇2. 質譜原始數據中的污染物信息篇3. 質譜數據質控篇——Quic軟件介紹點擊目錄鏈接可以回顧往期，本期質控專題進行到
A: 1 μg HeLa結果比較; B: 50 ng HeLa結果比較. 以每項最高值為100% 3 討論 隨著“一小時酵母蛋白質組”全覆蓋的實現, 蛋白質組深度覆蓋研究迎來新的時代[6]. 在復雜樣本蛋白質組研究中, 傳統方法需要進行二維分離、分級的方式簡化樣本、充分分離, 這樣不僅
2014年4月27日下午，中國化學會首屆全國質譜分析學術研討會組學及生命分析分會在北京西郊賓館召開。在此次的組學及生命分析分會報告中邀請了清華大學化學系/分析中心的梁瓊麟教授； 中國科學院大連化學物理研究所的張麗華教授；中國科學院北京基因組研究所的劉斯奇教授； 復旦大學的陸豪杰
分析測試百科網訊 布魯克一直以MALDI技術聞名全球，并已在成像領域占據領導地位；自去年推出timsTOF Pro創新組學系統后，在深度覆蓋和高通量蛋白質組學分析中取得了突破性的進展，并且迅速和國內院校和企業開展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列，已和北京大學、清華大學、復旦大學、廈門大
肽段納流液相分離的出峰時間一般在30 s 以上,因此在合適的循環時間內,3 種DIA 方法可以根據樣本復雜程度靈活調節質量范圍、分辨率、選擇窗口等參數,達到最佳分析效果。例如,分析分子量較大的肽段時,質量范圍可以調整為m / z 400 ~1200 或更寬。 圖1 基于
——timsTOF Pro?系統進一步增強用于4D蛋白質組學的MBR-ddaPASEF和diaPASEF性能——timsTOF Pro超高靈敏度的4D蛋白質組學和4D脂質組學性能推進單細胞生物學研究——在ASMS 2019上還發布了用于4D蛋白質組學的新消耗品、軟件合作伙伴及軟件產品 分析測試百科