Science探索癌癥的未知世界
由耶魯大學領導的一個研究小組，通過對人類自然遺傳變異和癌腫瘤變異進行海量數據分析，揭示了數十個乳腺癌和前列腺癌形成過程中的突變。研究結果發表在10月4日的《科學》(Science)雜志上。 新發現的這些突變均位于不編碼蛋白質但卻能影響其他基因活性的DNA區域。科學家們認為，這些區域代表了一個未知的世界，研究人員和醫生們可從中獲得關于癌癥病因和治療的新認識。 論文的共同資深作者、生物醫學信息學教授Mark Gerstein說：“這使得我們能夠采用一種系統的研究方法來闡析癌癥基因組。現在我們不必再將自身鎖定在編碼蛋白質的約1%的基因組區域上，而是能夠探索我們其余的DNA區域。” 這一分析是將幾個龐大的研究計劃進行了統計學合并，其中的每項計劃均提供了有關我們的基因組――生命遺傳藍圖的一些突破性認識。 千人基因組計劃(1000 Genomes Project)主要編譯大量個體的個人基因組。這一數據有助......閱讀全文
迄今最全面的非編碼基因組圖譜問世
生命科學 非編碼 DNA 延伸段在發育和基因調控中發揮著關鍵作用。2 月 3 日發表在《自然》（Nature）上的一項新研究稱，來自美國麻省理工學院（MIT）的研究團隊發表了迄今為止最全面的非編碼基因組圖譜，EpiMap（Epigenome Integration across Multi
基因組所發表長非編碼RNA分類問題綜述文章
近日，中國科學院北京基因組研究所基因組科學與信息重點實驗室的“百人計劃”研究員章張及其團隊，與沙特阿卜杜拉國王科技大學(King Abdullah University of Science and Technology)開展科研合作，對長非編碼RNA的分類問題進行了系統綜述，相關論文在RN
Nature子刊：非編碼RNA癌癥藥物基因組圖譜新突破
近日，匹茲堡大學藥物遺傳研究中心的楊達和張敏課題組借力于一種名為彈性網絡回歸（Elastic Net regression）的機器學習模型，從1,001個腫瘤細胞系的高通量長非編碼RNA表達譜（long noncoding RNAs, lncRNAs）與265種抗癌藥物敏感性數據中，挖掘出了27
非編碼區的定義
基因是由成千上萬個核苷酸對組成。組成基因的核苷酸序列可以分為不同區段。在基因表達的過程中,不同區段所起的作用不同。能夠轉錄為相應信使RNA,進而指導蛋白質合成(也就是能編碼蛋白質)的區段叫做編碼區。不能編碼蛋白質的區段叫做非編碼區。非編碼區位于編碼區前后,同屬于一個基因,控制基因的表達和強弱 。
非編碼區的作用
非編碼區雖然不能編碼蛋白質,但對于遺傳信息表達是不可缺少的。在它上面有調控遺傳信息表達的核苷酸序列,是有遺傳效應的。比如RNA聚合酶結合位點。非編碼區對目的基因是不可缺少的。非編碼區上有與RNA聚合酶的結合位點,具有調控作用。基因非編碼區的堿基的插入、缺失和替代也屬于基因突變事件,盡管大多數的研究是
人類癌癥基因組非編碼區域中鑒別出關鍵的致癌突變
近日，一項刊登在國際雜志Nature上的研究報告中，來自加拿大安大略省癌癥研究所的科學家們通過研究在人類癌癥基因組中的大量非編碼區域（也被稱之為人類癌癥DNA的“暗物質”）中發現了一種新型的致癌突變；這種突變或能作為一種新型潛在的治療靶點，幫助科學家們開發治療多種類型癌癥的新型療法，包括腦癌、肝
NAR：人類基因組中或含有超過20％的非編碼基因
近日，一項刊登在國際雜志Nucleic Acids Research上的研究報告中，來自美國國家癌癥研究中心的科學家們通過研究發現，高達20%的編碼基因可能根本就無法進行編碼，因為這些基因具有非編碼或偽基因（即過時的編碼基因）的特征，由此導致的人類基因組的縮小或許會對生物醫學領域產生重要的影響，
Cell驚人發現：誰說非編碼RNA不編碼？
來自德克薩斯大學西南醫學中心的Eric Olson和同事們在分析梳理肌肉特異性的長鏈非編碼RNAs(lncRNAs)以了解它們的功能時，發現了一種在骨骼肌中特異性表達的lncRNA。盡管這一RNA以往被歸類為是非編碼RNA，它的序列中包含的一小段卻看上去好像一個編碼區域。這一研究發現發布在《細胞
北京基因組所合作開發完成長非編碼RNA數據庫
長非編碼RNA（Long non-coding RNA, lncRNA）是近年來國際研究的新熱點,與人類癌癥、神經系統等疾病發生密切相關，在疾病診療方面表現出了潛在的重大應用價值。雖然長非編碼RNA表達量相對較低，但由于其在轉錄、基因組印記、翻譯、可變剪切、轉錄后表達調控、蛋白運輸與定位等過程的
非編碼序列的定義
中文名稱非編碼序列英文名稱non-coding sequence定 ?義基因中不具有編碼功能的序列。如真核生物基因的內含子、啟動子等。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)
非編碼序列的概念
中文名稱非編碼序列英文名稱non-coding sequence定 義基因中不具有編碼功能的序列。如真核生物基因的內含子、啟動子等。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），基因表達與調控（二級學科）
簡述非編碼RNA的成熟
多數生物體中的非編碼基因（ncRNA）被轉錄為需要進一步加工的前體。核糖體RNA（rRNA）通常被轉錄為含有一個或多個rRNA的前體rRNA,前體rRNA后來在特定位點被大約150種不同的snoRNA切割和修飾。轉移RNA（tRNA）的5'和3'端序列分別被RNase P和tRN
華人學者Nature－Genetics發布lncRNA重要發現
研究人員通過研究遺傳變異準確地找到了45個與前列腺癌疾病發生發展有關的基因。 項目負責人、大學健康網絡瑪格麗特公主癌癥中心科學家、多倫多大學醫學生物物理學系助理教授Hansen He說，發布在《自然遺傳學》（Nature Genetics）上的研究結果，闡明了這些稱作為“長鏈非編碼RNA”(l
Science探索癌癥的未知世界
由耶魯大學領導的一個研究小組，通過對人類自然遺傳變異和癌腫瘤變異進行海量數據分析，揭示了數十個乳腺癌和前列腺癌形成過程中的突變。研究結果發表在10月4日的《科學》(Science)雜志上。 新發現的這些突變均位于不編碼蛋白質但卻能影響其他基因活性的DNA區域。科學家們認為，這些區域代表了一
我國發現一類新型長非編碼RNA－基因組“暗物質”不斷“正名”
國際著名學術期刊Molecular Cell近日在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于長非編碼RNA的最新進展。該研究發現，一類新型長非編碼RNA，或與小胖威利綜合征的發生發展密切相關。 人類基因組中存在大量被稱為基因組“暗物質”的非編碼序列，包括基因
Nature發布迄今為止表觀遺傳最全面圖譜
30,000個人類疾病為什么出現的原因 二十年前的這個月，第一張人類基因組草圖公布。這一項目帶來的主要驚喜是，人們發現只有1.5％的人類基因組由蛋白質編碼基因組成。 在過去的二十年間，那些最初被認為是“垃圾DNA”的非編碼DNA片段被證明在發育和基因調控中起著至關重要的作用。而在一項最新研究
長非編碼RNA與肺癌轉移
我們體內的大多數DNA(約80%)并沒有編碼蛋白，不過它們會轉錄為RNA。這些非編碼的RNA分子負責在細胞中實現多種功能。microRNA等小RNA已經被研究得很多了，近年來人們又發現了一類長非編碼RNA，這些RNA擁有兩百個以上的核苷酸。 長非編碼RNA對細胞周期、細胞生長和細胞死亡等細
良好的開端：破譯非編碼突變！
12月14日，《Science》雜志報道，一項針對將近2000個家庭的全基因組測序研究顯示，自閉癥患者基因組的“啟動子”區發生了突變，首次在全基因組分析背景下，揭示了人類基因組中非編碼突變的作用。 大多數自閉癥等疾病的測序研究都集中在基因組的編碼區，因為人們認為編碼基因是構建蛋白質的“食譜”。
《自然》：研究揭示mRNA非編碼功能
由1962年諾貝爾生理學或醫學獎獲得者英國科學家克里克和美國科學家沃森提出的分子生物學中心法則認為，遺傳信息是從DNA（脫氧核糖核酸）傳遞給mRNA（信使核糖核酸），再從mRNA傳遞給功能蛋白質，由此來完成遺傳信息的轉錄和翻譯過程的。 根據這一中心法則，mRNA似乎只有唯一的功
Nature解析癌癥與非編碼RNA
人類基因組可生成1萬多種長鏈非編碼RNA(lncRNA) 分子，但人們至今卻只知道其中幾十種轉錄物的功能。在發表在8月14日《自然》(Nature)雜志上的一篇新研究中，來自加州大學的楊柳青(Liuqing Yang，音譯)等研究人員揭示，兩種lncRNAs結合并控制了雄激素受體的功能。
細胞化學詞匯非編碼小RNA
中文名稱：非編碼小RNA英文名稱：small non-messenger RNA;snmRNA定 義：細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科：生物化學
新研究構建出小麥屬全基因組遺傳變異圖譜
小麥是人類歷史上最成功的作物之一，它起源于新月沃地一個狹小的核心區域，一萬年間，從地區性的野生植物迅速轉變成為全球種植面積最廣的作物之一，在多種多樣的環境下為人類提供大量的碳水化合物和蛋白質。然而，小麥對自然環境和人類糧食需求兩方面同時適應的遺傳機制尚不清楚，理解小麥適應性進化對氣候變化條件下小
超級泛基因組助水稻種質資源遺傳變異挖掘利用
?水稻泛NLRs家族基因的共線性位點（左）；基于全基因組SNPs的水稻系統發生樹（右）。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所與國內多家高校、科研單位合作，組裝了251份高質量的水稻基因組，構建了目前植物中群體規模最大、基因組充分注釋、稻屬中最為系統的超級泛基因組。該圖譜
研究繪制迄今最大規模個人表觀基因組圖譜
日前，復旦大學類腦智能科學與技術研究院楊禹丞等DNA元件百科全書計劃國際合作團隊，首次繪制迄今全球最大規模個人表觀基因組圖譜。作為人類基因組計劃以來最大的基因組學協作計劃，“DNA元件百科全書計劃”（Encyclopedia of DNA Elements）從2003年啟動至今整整20周年；本研
研究繪制迄今最大規模個人表觀基因組圖譜
日前，復旦大學類腦智能科學與技術研究院楊禹丞等DNA元件百科全書計劃國際合作團隊，首次繪制迄今全球最大規模個人表觀基因組圖譜。作為人類基因組計劃以來最大的基因組學協作計劃，“DNA元件百科全書計劃”（Encyclopedia of DNA Elements）從2003年啟動至今整整20周年；本研
研究繪制迄今最大規模個人表觀基因組圖譜
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497746.shtm 日前，復旦大學類腦智能科學與技術研究院楊禹丞等DNA元件百科全書計劃國際合作團隊，首次繪制迄今全球最大規模個人表觀基因組圖譜。作為人類基因組計劃以來最大的基因組學協作計劃，“DN
Cell繪制廣泛的人類基因組互作圖譜
來自歐洲分子生物學實驗室(EMBL)、斯坦福大學的科學家們闡明了，我們的基因表達在DNA中受控的機制。發表在《細胞》(Cell)雜志上的這項新研究，將促成更好地了解某些遺傳變異可以開啟或關閉控制基因表達的調控元件，最終表現為個體特征和疾病易感性的機制。 這些變異存在于非直接負責編碼基因，而是發
黃病毒屬長鏈非編碼亞基因組RNA的溶液結構研究中新進展
9月10日，生命學院方顯楊課題組和軍事科學院軍事醫學研究院微生物流行病研究所秦成峰課題組合作，在《歐洲分子生物學報道》（EMBO Reports）上發表了題為“黃病毒屬長鏈非編碼亞基因組RNA在溶液中具有伸展的三維結構并具有柔性”(Long non-coding subgenomic flavi
長鏈非編碼－RNA－測序案例分析
背景：人類壽命的延長伴隨著神經退行性疾病的發病幾率的增加，因而價格不貴的血液診斷的發展迫在眉睫。通過 RNA-seq 分析血液細胞的轉錄本是發現新的生物標志物的非常高效的途徑。 目的：利用 Illumina 測序平臺對帕金森病人白血球中 lncRNAs 進行分析，探討其對 mRNA 選擇性剪接的
非編碼小RNA的基本信息
中文名稱非編碼小RNA英文名稱small non-messenger RNA;snmRNA定 義細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科生物化學與分子生