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    11月王牌聚焦:各種重大圖譜成果撲面而來

    時近年末,各種重大成果好似扎堆一樣接踵而來,人類蛋白質互作組圖譜、人類基因組重組圖譜、ENCODE重大成果接連公布,讓人眼花繚亂,科學界“過年”的氛圍撲面而來。 首先是科學家們公布了迄今為止最大規模的人類基因組編碼蛋白直接互作圖譜,并預測出了與癌癥相關的幾十個新基因。這一新“人類互作組(interactome)”圖譜描述了蛋白質之間的1.4萬個直接相互作用。這一互作組是由蛋白質和“連接在一起”的其他細胞元件所形成的一個網絡。新圖譜比以往這一類的所有圖譜要大4倍以上,包含了比以往所有研究匯總到一起還要多的高質量相互作用。 這項研究第一次證實癌蛋白更有可能彼此相互聯系,而不是與隨機選擇的非癌蛋白聯系。而且也揭示出的蛋白質互作網絡覆蓋的基因范圍比過去的一些研究要廣闊得多。一些研究往往將焦點放在已知與疾病相關,或是因其他原因而讓人感興趣的“普通”蛋白質上,導致我們對于相互作用的理解存在偏差。 其次來自美國國立衛生研究院NIH,......閱讀全文

    桿狀病毒-昆蟲細胞表達系統

    實驗步驟 一、桿狀病毒表達載體 最簡單的經典桿狀病毒表達載體是一個重組的桿狀病毒,其基因組含有一段外源核酸序列,通常為編碼目標蛋白質的dDNA,在多角體蛋白啟動子控制下進行轉錄。這個嵌合的基因由多角體蛋白啟動子和外源蛋白編碼序列組成

    基因突變致蛋白質合成異常分析(一)

       蛋白質性質是由DNA分子上堿基數量和順序決定的。如果DNA分子的堿基數量或順序發生變化,由它編碼的蛋白質結構就發生相應的改變。由于基因突變導致蛋白質分子質和量異常,從而引起機體功能障礙的一類疾病稱為分子病(molecular disease)。  分子病種類很多,根據各種蛋

    桿狀病毒-昆蟲細胞表達系統2

    五、親代桿狀病毒基因組的改進就像轉移質粒的改進,對親代桿狀病毒基因組的改進也是為了滿足各種不同的需要。起初,最主要的目的是找到克服重組桿狀病毒載體構建和分離低效率的方法,這也是最初的桿狀病毒-昆蟲細胞系統存在的主要問題。現在已經知道這個問題的根源在于, 在共轉染的昆蟲細胞系中,轉移質粒和親代桿狀病毒

    高冠軍/戴俊彪合作果蠅組蛋白H3/H4系統解析組蛋白劑量

      組蛋白(Histone)在真核生物染色體中扮演著重要的角色,是染色體結構單元核小體的重要組成部分。由核心組蛋白H3,H4,H2A,H2B形成的八聚體是DNA纏繞的主要承載體【1】。除了用以裝配染色體外,組蛋白的另外一個重要功能是參與基因組信息的表達調控。組蛋白氨基酸殘基上的翻譯后修飾如乙酰化、甲

    PCR技術應用一:診斷單基因疾病

       自1987年秋以來,PCR技術的應用開創性地推動了產前單基因缺陷者及攜帶者的 診斷。目前PCR還不能用于診斷所有已知缺陷疾病,但極大地擴大了實驗診斷學家對 診斷方法的選擇。JohnHopkins大學的研究人員表明,在診斷基因缺陷疾病方面PCR技 術具有快速、準確、操作靈活等特點。每項

    發展階段/生物反應器

    生物反應器(bioreactor)經歷了三個發展階段:細菌基因工程、細胞基因工程、轉基因動物生物反應器。轉基因動物生物反應器的出現之所以受到人們極大的關注,是因為它克服了前兩者的缺陷,即細菌基因工程產物往往不具備生物活性,必須經過糖基化、羥基化等一系列修飾加工后才能成為有效的藥物,而細胞基因工程又因

    生物反應器的發展階段(一)

    發展階段生物反應器(bioreactor)經歷了三個發展階段:細菌基因工程、細胞基因工程、轉基因動物生物反應器。轉基因動物生物反應器的出現之所以受到人們極大的關注,是因為它克服了前兩者的缺陷,即細菌基因工程產物往往不具備生物活性,必須經過糖基化、羥基化等一系列修飾加工后才能成為有效的藥物,而細胞基因

    基因敲除真把整個基因敲掉嗎?

    一般我們把基因分成兩類:編碼蛋白的基因不編碼蛋白的基因這兩類基因的敲除方式有著很大的區別編碼蛋白的基因這些基因的功能主要是通過編碼區中的三聯體密碼所編碼的蛋白來實現的。基因敲除的最終目的是讓這個基因的蛋白產物不能發揮功能,或者蛋白不能表達。整個編碼區統統刪掉所有的密碼都沒了,當然就不能翻譯出蛋白啦!

    血紅蛋白病及其檢驗

    1)定義 血紅蛋白病是一組遺傳性或基因突變所致的血紅蛋白合成障礙性疾病。根據其缺陷的不同又分為珠蛋白肽連數目合成異常或結構異常兩大類。前者被稱為珠蛋白生成障礙性貧血, 是常染色體隱性遺傳性疾病,包括常見的β-珠蛋白生成障礙性貧血和少見的α-珠蛋白生成障礙性貧血;后者被成為狹義的血紅蛋白病,

    一文了解hiv基因組結構

      HIV屬逆轉錄病毒科慢病毒屬。為逆轉錄RNA病毒。形狀為圓形或桿狀,直徑100~140nm.  1.HIV的結構蛋白:①包膜蛋白:含外膜蛋白和跨膜蛋白,信號肽。②核心蛋白:在細胞內合成,包括p24、pl7和p12三種結構蛋白、RNA逆轉錄酶、蛋白酶和整合酶。  2.HIV基因組:基因組為兩條相同

    “點亮了生物學”的故事

      熒光蛋白標記神經細胞是研究大腦的一項重要的工具,帶動了腦彩虹等技術的發展。剛剛去世的華裔科學家錢永健則為改造綠色熒光蛋白做出了重要的工作,改變了熒光蛋白分子的一個氨基酸,使其發光更強、更穩定。  美國喬治城大學吳建永教授曾在2014年介紹腦彩虹技術時著重介紹了熒光蛋白的故事。為紀念錢永健博士對科

    真核細胞表達系統的類型與常用真核細胞表達載體

    原核表達系統是常被用來研究基因功能的成熟系統,由于原核表達系統具有包涵體蛋白不易純化、蛋白修飾不完整等缺陷,人們也開始利用真核細胞表達系統來研究基因。自上世紀70年代基因工程 技術誕生以來,基因表達技術已滲透到生命科學研究的各個領域。并隨著人類基因組計劃實施的進行,在技術方法上得到了很大發展,時至今

    真核生物基因組-2

    (二) 中度重復序列中度重復序列是指在真核基因組中重復數十至數萬次(<105)的重復序列。其復性速度快于單拷貝順序,但慢于高度重復序列。少數在基因組中成串排列在一個區域,大多數與單拷貝基因間隔排列。依據重復序列的長度,中度重復序列可分為兩種類型。1.短分散片段(short interspers

    ChIP-seq&mRNA-seq在外周淋巴瘤的藥物聯用實驗中的應用

      上海交通大學附屬瑞金醫院血液研究所趙維蒞教授團隊針對外周淋巴瘤的研究。近期,該課題組應用ChIP-seq聯合分析揭示了聯用西達本胺和地西他濱對組蛋白修飾基因突變的外周淋巴瘤的作用機制。該研究成果于月發表在血液科權威雜志《Haematologica》(影響因子7.7)上。(ChIP-seq及mRN

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      上海交通大學附屬瑞金醫院血液研究所趙維蒞教授團隊針對外周淋巴瘤的研究。近期,該課題組應用ChIP-seq聯合分析揭示了聯用西達本胺和地西他濱對組蛋白修飾基因突變的外周淋巴瘤的作用機制。該研究成果于月發表在血液科權威雜志《Haematologica》(影響因子7.7)上。(ChIP-seq及mRN

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    上海交通大學附屬瑞金醫院血液研究所趙維蒞教授團隊針對外周淋巴瘤的研究。近期,該課題組應用ChIP-seq聯合分析揭示了聯用西達本胺和地西他濱對組蛋白修飾基因突變的外周淋巴瘤的作用機制。該研究成果于月發表在血液科權威雜志《Haematologica》(影響因子7.7)上。(ChIP-seq及mRNA-

    基因分離克隆的方法

    1 基因芯片技術分離目的基因生物芯片是高密度固定在固相支持介質上的生物信息分子的微列陣。列陣中每個分子的序列及位置都是已知的,并按預先設定好的順序點陣。基因芯片是生物芯片的一種,其上固定的是核算類物質,主要用于DNA、RNA分析。分為DNA芯片和微點陣兩種。分離目的基因是是指從基因組中發現或找出某個

    人類蛋白質組學計劃將從啟動階段進入全面實施階段

      ——訪中國蛋白質組學專業委員會副主任、復旦大學楊芃原教授   不久前,第六屆中國蛋白質組學大會在江蘇泰州成功召開,會議盛況空前,可以看出我國的蛋白質組學研究隊伍的壯大。會后的間隙,我們有幸采訪到了主要參與會議組織的中國蛋白質組學專業委員會副主任、復旦大學楊芃原教授,希望楊教授為大家介紹一下國際

    首個山羊基因組圖譜在《自然?生物技術》雜志發表

      2012年12月24日,由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成的首個山羊全基因組圖譜在《自然?生物技術》(Nature Biotechnology)雜志在線發表。本研究采用新一代測序技術(NGS)與全基因組酶切圖譜(Whole-genome mapping)技術相結

    袁鈞瑛院士本月發表兩項重要成果

      現任職于中科院上海有機化學研究所和哈佛醫學院的袁鈞瑛(Junying Yuan)教授多年從事于細胞凋亡機制的研究,是世界細胞凋亡研究領域的開拓者之一,并且是世界上第一個細胞凋亡基因的發現者。該發現為世界細胞凋亡研究 領域奠定了研究基礎,引發了世界上眾多的實驗室從不同的角度開始對細胞凋亡進行系統的

    袁鈞瑛院士Science發表程序性壞死研究新成果

      來自哈佛醫學院、麻省總醫院等機構的研究人員證實,在肌萎縮側索硬化癥(ALS)中RIPK1通過促進炎癥及壞死性凋亡(necroptosis,又稱程序性壞死)介導了軸突退行性病變。這一重要的研究發現發布在8月5日的《科學》(Science)雜志上。  現任職于哈佛醫學院和中科院上海有機化學研究所的袁

    PCR技術應用七:地中海貧血

      地中海貧血是由組成珠蛋白的X珠蛋白鏈和B珠蛋白鏈基因突變的引起,它包括X 地中海貧血和B地中海貧血,世界疾病在我國南方各省區的發病率相當高,個別地區 可達18%,它的嚴重的影響人口的質量.一、地中海貧血的臨床  (一)X地中海貧血的臨床:X地中海貧血在臨床上可分為四 種類型①HbBarst胎兒水

    2018年生物領域獲獎專題盤點

      2018年即將過去,年末為大家獻上本年度生物領域獲獎專題盤點,希望讀者朋友們能夠喜歡。1. “諾獎風向標”榜單揭曉 4名科學家榮獲2018拉斯克獎  拉斯克獎是全球最為著名的醫學類獎項之一,也有“諾貝爾風向標”之稱。這是因為在諸多拉斯克獎得主中,已有87人獲得了諾貝爾獎。2015年諾貝爾生理學或

    組蛋白研究進展速覽!

      本文中,小編盤點了多篇研究報告,共同解析科學家們在組蛋白研究上取得的新成就,與大家一起學習!圖片來源:Daniel N. Weinberg et al,doi:10.1038/s41586-019-1534-3  【1】Nature:揭示組蛋白標記H3K36me2招募DNMT3A并影響基因間DN

    Nature:合成生物學,細胞內的精準時鐘

      活細胞通過分子組件來跟蹤時間,盡管這些分子組件極易受到不可避免的隨機波動影響,但活細胞對時間的追蹤非常精確。例如,單細胞藍細菌中,自然晝夜鐘可以追蹤一天24小時。這些生物時鐘的準確性經過了進化的考驗,可以被認為是生物學家Richard Dawkin形容的“盲眼鐘表匠”的杰作——Dawkins用這

    羅氏獲DMD基因療法授權

      今日,羅氏(Roche)和Sarepta Therapeutics公司共同宣布,雙方達成許可授權協議,羅氏將獲得治療杜氏肌營養不良癥(DMD)的基因療法SRP-9001在美國以外地區的獨家推廣權益。Sarepta將總計獲得11.5億美元前期付款(包括7.5億美元現金和4億美元股權投資)和潛在17

    基因組所等在混合性白血病基因組研究方面取得新進展

      近日,中國科學院北京基因組研究所“百人計劃”研究員王前飛與美國芝加哥大學血液學教授Michael J. Thirman合作開展的“MLL融合蛋白在急性白血病中的致病機制研究”取得階段性進展,其研究論文《MLL融合蛋白在白血病基因組中選擇性調控MLL野生型的部分靶基因》(MLL Fusio

    獲得性免疫缺陷綜合征簡介

    獲得性免疫缺陷綜合征(AIDS)又稱艾滋病,它是由人類免疫缺陷病毒(HIV)所引起的。本病主要是通過性接觸和體液傳播,病毒主要侵犯和破壞輔助性T淋巴細胞(CD4+T淋巴細胞),使機體細胞免疫功能受損,最后并發各種嚴重的機會性感染和腫瘤。一、HIV的結構及基因組HIV屬逆轉錄病毒科慢病毒屬。為逆轉錄R

    Science:梳理患兒腫瘤細胞的基因組尋求答案

      組蛋白翻譯后修飾方式出現異常,以及組蛋白修飾位置出現異常都會導致腫瘤發生。   高通量DNA測序技術的快速擴張讓我們能夠以前所未有的速度和精細度對人體疾病展開遺傳學分析,尤其是對罕見的小兒疾病進行全基因組測序(whole-genome sequencing)更是有助于我們對兒童發育,以及多

    DNA重組(DNA recombination)技術:外源基因的蛋白表達-1

    通過外源DNA的重組、克隆、以及鑒定,可以獲得所需的特異DNA克隆。外源克隆基因在某種表達載體及適宜的宿主細胞中可表達為相應的蛋白質,這就組成了外源基因的蛋白表達系統。表達后的蛋白質必須具有原來的生物學活性,這是基于正確的基因轉錄、轉錄后加工、mRNA翻譯及翻譯后修飾,同時與表達載體的結構和表達體系

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