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    環境DNA或成生物多樣性調查新途徑

    不用捕撈或潛水觀察,從海中舀一杯水,就能知道最近有哪些魚類曾在附近出沒,這是什么神仙技能? 上世紀80年代,環境DNA的概念被首次提出,用于研究陸地動物食性或淡水環境中的微生物組成等。如今科學家又有了頗具野心的計劃:用環境DNA調查海洋中的生物多樣性。 2018年,首屆海洋環境DNA會議在美國洛克菲勒大學舉行,會議指出對漁業、瀕危物種進行監控時,應該讓海水中的環境DNA“物盡其用”。 海水中能提取出的遺傳信息很多,比如海洋生物掉落的皮膚細胞、鱗片等組織,這些都屬于環境DNA,它們能為準確識別物種提供幫助。不止是告訴人們海洋中有哪些動物,環境DNA還能告訴人們哪些地方有常見的食用魚類出沒,或者檢測到哪些水域可能存在污染。 不過,廈門大學海洋與地球學院教授丁少雄告訴《中國科學報》,“這是一項不錯的技術,但目前還存在不少缺陷”。 告別拖網 2017年夏天,美國國家海洋和大氣管理局(NOAA)東北部漁業科學中心的研究人員......閱讀全文

    《Science》:沒有骨頭,古墓也能做人類DNA檢測了

      沉積物(sediments)形成了富含骨骼殘骸的考古遺址的地質層,但是這些沉積物地層中的剩余DNA一直不受古人類學者的重視。直到今天,一隊由西班牙國家研究委員會(CSIC)主導的國際研究小組開發出了一種新技術,可以用于追蹤這些沉積物中的DNA,甚至在沒有骸骨的洞穴或地層中,也可以檢測到古代遺留下

    北京色譜年會十周年 濃墨重彩話色譜

    中科院大連化學物理研究所 張玉奎院士   來自中科院大連化學物理研究所的張玉奎院士與大家分享的報告題為《色譜進展—機遇和挑戰》。   從1990年至2010年,中國色譜論文的總量達28324篇,占全球總數的22%;GC、HPLC、CE研究呈明顯增長。近20年來,中國的色譜研究在全球

    PNAS:疏水力使得DNA結構穩定

      近日,來自瑞典查爾默斯理工大學的研究人員提出了關于DNA組裝機制的新理論。此前的主流理論認為,氫鍵是將兩條DNA鏈結合在一起的關鍵,而這一新的研究表明水分子才是其中的關鍵。這一發現為醫學和生命科學研究領域的提供了新的認知。相關結果表在《PNAS》雜志上。  DNA分子包括兩條鏈,由糖分子和磷酸基

    科學家用環境DNA研究最大魚類

      新技術可廉價簡單的分析海洋動物種群及健康情況  科學家如今僅僅通過漂浮在海洋中的廢棄細胞的脫氧核糖核酸(DNA),已經能夠確定地球上最大和最神秘的魚類——鯨鯊的種群規模以及遺傳特征。  這項工作標志著研究人員第一次能夠利用所謂的環境DNA(eDNA)評估一種水生物種的遺傳特征,并且這種技術能夠幫

    癌癥“壞運氣”?Science:近2/3癌癥突變源于DNA復制出錯!

      “近2/3的癌癥突變源于DNA復制過程中隨機發生的錯誤!”  這是來自于約翰?霍普金斯大學基默爾癌癥中心(Johns Hopkins Kimmel Cancer Center)的科學家們在3月24日發表于《Science》期刊上的一篇最新學術論文的結論。它意味著,DNA復制出錯是導致癌變的主要因

    滅絕時間遠超DNA壽命:復活恐龍還有戲嗎

      一位科學家從一只吸了恐龍血、嵌于樹脂化石中的蚊子身上提取出恐龍DNA,成功復制出恐龍,并最終建成了一座恐龍公園,這是電影《侏羅紀公園》中的故事情節。在現實生活中,恐龍,這個滅絕了上千萬年的物種,牽動著很多人的神經,人們對它充滿了好奇和渴望,甚至有大膽的科學家想要復活這個史前巨獸。

    時空穿越 TA們的DNA“飛”入太空

       隨著長征十一號運載火箭的一聲轟鳴,在地球上幾近消失的華南虎DNA(脫氧核糖核酸)被存儲在特制容器中向太空飛去。與華南虎DNA干粉同行的,還有金絲猴、天行長臂猿、蕙蘭、水稻、大豆、三七、蒲公英等動植物的基因樣本。  據報道,此前不久的2018年10月底,科幻作家劉慈欣等人的DNA樣本,通過長二丙

    非程序DNA合成檢測實驗

    實驗方法原理 非程序DNA合成(Unscheduled DNA Synthesis:UDS)即S期外的DNA合成。在一般情況下細胞內DNA合成只見于S期,但當處于非S期細胞DNA受損傷時,隨著DNA損傷的修復也將發生DNA合成現象,即UDS。在化學致突變物、致癌物作用誘發細胞DNA損傷時,也誘導DN

    達爾文加拉馬克,可能才是完整的進化論

      隨著科學的進一步發展,達爾文理論也顯示出了一些不足之處。  所謂物競天擇,適者生存,現代生物學的許多主流研究方向都以查爾斯·達爾文(Charles Darwin)“自然選擇”的進化論為基礎:只有最能適應環境的生命體才能在物種演化的洪流中獲得生存和繁衍的權利。這個自然選擇的過程也被稱為適應,而最容

    免疫細胞的衰老,主因是環境 | Cell揭示根源

      來自于斯坦福大學醫學院的科學家們完成了這一龐大的工作,分析了大量免疫細胞。他們發現,相比于年輕人,老年人的免疫細胞攜帶更多的染色質修飾。而且,這些修飾差異主要來源于環境。  研究團隊的關注點在于組蛋白(與細胞核內DNA緊密結合的蛋白結構)修飾,是表觀遺傳學的重要部分,后者在健康、疾病領域有著不容

    海洋不同生境總基因組DNA的提取

    實驗概要本實驗采用NaI/玻璃粉方法、溶菌酶與蛋白酶K/離心吸附柱方法以及試劑盒PowerSoil  DNA Isolation Kit (MO BIO  Laboratories,Inc.)三種方法對海洋岸邊土壤、海水以及沉積物三種樣品進行DNA抽提。為比較不同方法的抽提效果,

    非程序DNA合成檢測實驗

    實驗方法原理非程序DNA合成(Unscheduled DNA Synthesis:UDS)即S期外的DNA合成。在一般情況下細胞內DNA合成只見于S期,但當處于非S期細胞DNA受損傷時,隨著DNA損傷的修復也將發生DNA合成現象,即UDS。在化學致突變物、致癌物作用誘發細胞DNA損傷時,也誘導DNA

    在纖毛蟲鑒定了DNA6mA甲基轉移酶復合物及闡明生物學功能

      DNA甲基化是表觀遺傳調控的重要組成部分,在調控基因組印記,X染色體失活,轉座子抑制,基因表達,胚胎發育等方面發揮重要作用。真核生物中最主要的DNA甲基化修飾是5-甲基胞嘧啶(5mC)。由于其在真核生物中的豐富性和重要性,以前的研究集中表征5mC。相反,N6-甲基腺嘌呤DNA(6mA)修飾是原核

    劉伯寧:后基因組時代10年間生命科學的發展與挑戰

      8月2日,我國科學家利用“全基因組關聯分析”的方法,在人類1號染色體上發現了肝癌的易感基因區域。這將為肝癌的風險預測、早期預防和個體化治療提供理論依據。  事實上,自2000年人類基因組草圖繪制完成迄今,科學家已經相繼發現70余種疾病的易感基因,基于此的基因診斷產業已經初現端倪,但10

    新測序技術——Ribose-seq

      核糖核苷酸是RNA的基本單位,它們會在DNA復制和修復過程中嵌入基因組DNA,進而影響基因組的穩定性。然而,迄今為止人們還無法鑒定和定位這些插入DNA的核糖核苷酸。  為此,喬治亞理工學院和科羅拉多大學的科學家們開發了一種新測序技術,Ribose-seq。該技術可以鑒定和分析插入基因組DNA的核

    哈佛大學研究:40%疾病由遺傳引發 25%由環境造成

       據英國《每日郵報》1月14日報道,美國哈佛大學的科學家們通過對4500萬美國人進行長達24年的跟蹤調查,研究哪些疾病是由基因引起的,而哪些疾病更容易受到環境的影響,是迄今為止同類研究中規模最大的研究。  據其最新發表在《自然遺傳學》(Nature Genetics)期刊上的研究結果顯示,在調查

    《Nature》子刊:同濟大學等成功制備神經干細胞衰老模型

      衰老是指隨時間推移身體組織的機能下降,經常引起衰老相關的退行性疾病,例如:三篇論文深入了解衰老帶來的神經元變化。越來越多證據表明,神經干細胞的衰老,對于中樞神經細胞衰老非常重要。然而,其根本分子機制的闡述卻因為缺乏合適的衰老模型而受阻。   2014 年3月13日,來自同濟大學、南通大學、清華

    Nature子刊報道:在納米尺度觀察DNA的合成

      美國癌癥協會數據顯示,2017年美國預計新增1688780例癌癥新病例,600920人將死于癌癥。  這些數字是如此的觸目驚心,引人唏噓不已。更糟糕的是,直到現在,人類仍然不知道為什么會得癌癥,應該如何阻止癌癥的蔓延。  美國肯特州立大學和日本京都大學的研究人員最近發表在自然雜志子刊《自然 納米

    青島能源所發明簡易高效的單細胞分選與測序對接技術

      為了滿足考察自然界中細胞“原位功能”這一共性科學需求,“現場”、“實時”的單細胞分選與測序已成為生命科學裝備研制領域的一個重要發展趨勢。盡管第三代測序技術已實現儀器微型化,但與測序對接的單細胞精準分選裝備卻仍然相當笨重和昂貴,難以支撐各種科學考察中針對微生物組功能的現場分析。最近,中國科學院青島

    能源所發明簡易高效的單細胞分選與測序對接技術

      為了滿足考察自然界中細胞“原位功能”這一共性科學需求,“現場”、“實時”的單細胞分選與測序已成為生命科學裝備研制領域的一個重要發展趨勢。盡管第三代測序技術已實現儀器微型化,但與測序對接的單細胞精準分選裝備卻仍然相當笨重和昂貴,難以支撐各種科學考察中針對微生物組功能的現場分析。最近,中國科學院青島

    Cell:細胞癌變需要一場“完美風暴”

      Cell雜志發表的一項最新研究,首次向人們展示了細胞癌變所需的“完美風暴”。劍橋大學和St Jude兒童醫院的科學家們發現,越容易滿足癌變條件的器官,發生癌癥的機率也就越大。  干細胞具有自我更新能力,能夠修復受損 的組織和替換衰老的細胞。研究人員指出,癌癥更容易發生在干細胞中,但干細胞發展出癌

    質粒提取的原理與常見問題

    現在較常用的質粒提取方法有三種:堿裂解法、煮沸法和去污劑裂解法,前兩種方法較為劇烈,適用于較小的質粒(<15Kb),而去污劑裂解法則比較溫合,一般用于分子量較大的質粒(>15Kb)。 堿裂解法是一種廣泛使用的制備質粒DNA的方法。其原理為:染色體DNA遠遠大于質粒DNA,染色體DNA為線狀

    高效管理實驗室冰柜與樣本建議

      實驗室中最大的耗能設備是冰柜,需要為此付出的成本相當高,采取合理化建議后,能夠降低該部分費用;2018年,將會有一場實驗室節能項目大競賽。   實驗室消耗資源巨大,尤其是電力能源系統,其中,冰箱或冰柜占據較大比重;冰柜,尤其是老型號冰柜每天耗能比單戶住宅高出30千瓦時。同時,實驗室

    神奇!Science重要發現:母愛竟會改變孩子DNA

      在這篇題為“Early life experience drives structural variation of neural genomes in mice”的論文中,來自Salk研究所的科學家們證實,雌性小鼠的育兒方式真的能改變后代的DNA。這項成果支持了先前關于“兒童環境如何影響人類大

    煮沸裂解法提取質粒DNA

      質粒是存在于細菌染色體外的一個或多個能獨立復制并穩定遺傳的小型環狀雙鏈DNA分子,其分子量一般在0.2-10KD范圍內。由于質粒分子小,便于分離和提取,可以攜帶目的基因進入細菌、動物細胞或植物體內進行擴增與表達。  質粒提取方法即去除 RNA,將質粒與細菌基因組 DNA分開,去除蛋白質及其它雜質

    磁珠法分離純化DNA原理及其步驟

        磁珠法純化DNA原理    磁珠法核酸純化技術采用了納米級磁珠微珠,這種磁珠微珠的表面標記了一種官能團,能同核酸發生吸附反應。硅磁(Magnetic Silica Particle)就是指磁珠微珠表面包裹一層硅材料,來吸附核

    核酸分離與純化的原理及其方法學進展

    核酸的分離與純化技術是生物化學與分子生物學的一項基本技術。隨著分子生物學技術廣泛應用于生物學、醫學及其相關等領域,核酸的分離與純化技術也得到進一步發展。各種新方法、經完善后的傳統經典方法以及商品試劑方法的不斷出現,極大地推動了分子生物學的發展。現就核酸分離與純化的原理及其方法學進展作一綜述。核酸分離

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    磁珠法分離純化DNA原理及其步驟

    磁珠法純化DNA主要是利用利息交換吸附材料吸附核酸,從而將核酸和蛋白質等其細胞中其他物質分離。本文主要概述了磁珠法純化DNA原理、核酸分離與純化的原則、核酸分離與純化的步驟。磁珠法 純化DNA原理磁珠法核酸純化技術采用了納米級磁珠微珠,這種磁珠微珠的表面標記了一種官能團,能同核酸發生吸附反應。硅磁(

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