用DNA芯片技術檢測基因的表達
一、芯片制備基因芯片的制備主要有兩種基本方法,一是在片合成法,另一種方法是點樣法。在片合成法是基于組合化學的合成原理,它通過一組定位模板來決定基片表面上不同化學單體的偶聯位點和次序。在片合成法制備DNA芯片的關鍵是高空間分辨率的模板定位技術和固相合成化學技術的精巧結合。目前,已有多種模板技術用于基因芯片的在片合成,如光去保護并行合成法、光刻膠保護合成法、微流體模板固相合成技術、分子印章多次壓印原位合成的方法、噴印合成法。在片合成法可以發揮微細加工技術的優勢,很適合制作大規模DNA探針陣列芯片,實現高密度芯片的標準化和規模化生產。美國Affymetrix公司制備的基因芯片產品在1.28*1.28cm2表面上可包含300,000個20至25mer寡核苷酸探針,每個探針單元的大小為10um X 10um。其實驗室芯片的陣列數已超過到1,000,000個探針。 基因芯片點樣法首先按常規方法制備cDNA(或寡核苷酸)探針庫,然后......閱讀全文
DNA芯片的概念
DNA芯片又叫做基因芯片(gene chip)或基因微陣列(microarray),寡核酸芯片,或DNA微陣列,它是通過微陣列技術將高密度DNA片段陣列以一定的排列方式使其附著在玻璃、尼龍等材料上面。由于常用計算機硅芯片作為固相支持物,所以稱為DNA芯片。
什么是DNA芯片?
DNA芯片又叫做基因芯片(gene chip)或基因微陣列(microarray),寡核酸芯片,或DNA微陣列,它是通過微陣列技術將高密度DNA片段陣列以一定的排列方式使其附著在玻璃、尼龍等材料上面。由于常用計算機硅芯片作為固相支持物,所以稱為DNA芯片。
DNA芯片的制備方式
DNA芯片又叫做基因芯片(gene chip)或基因微陣列(microarray),寡核酸芯片,或DNA微陣列,它是通過微陣列技術將高密度DNA片段陣列以一定的排列方式使其附著在玻璃、尼龍等材料上面。由于常用計算機硅芯片作為固相支持物,所以稱為DNA芯片。
DNA-芯片的制備與應用
DNA 芯片的制備與應用DNA 芯片的出現,是生物技術領域的一次革命,雖然現在無法預知它帶給我們的變化。但由于它在人類基因組計劃,基因表達和藥物篩選等方面的潛在用途。目前已有越來越多的公司和研究機構加入到DNA芯片的設計與開發。DNA芯片技術集成了集成電路制造,照相平板印刷,DNA合成,探針的熒光標
DNA芯片的基本概念
DNA芯片又叫做基因芯片(gene chip)或基因微陣列(microarray),寡核酸芯片,或DNA微陣列,它是通過微陣列技術將高密度DNA片段陣列以一定的排列方式使其附著在玻璃、尼龍等材料上面。由于常用計算機硅芯片作為固相支持物,所以稱為DNA芯片。
DNA芯片技術的原理與應用
DNA芯片技術就是指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接將大量的DNA探針以顯微打印的方式有序地固化于支持物表面,然后與標記的樣品雜交,通過對雜交信號的檢測分析,即可獲得樣品的遺傳信息。是伴隨“人類基因組計劃”的研究進展而快速發展起來的一門高新技術。通俗地說,基因芯片是通過微加工技術,將數以萬計、
DNA芯片技術的原理和應用
DNA芯片技術就是指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接將大量的DNA探針以顯微打印的方式有序地固化于支持物表面,然后與標記的樣品雜交,通過對雜交信號的檢測分析,即可獲得樣品的遺傳信息。是伴隨“人類基因組計劃”的研究進展而快速發展起來的一門高新技術。通俗地說,基因芯片是通過微加工技術,將數以萬計、
微流控芯片檢測微小衛星DNA
微小衛星DNA主要是指廣泛存在于高等動物、低等動物基因組中長度100~500 bp多態性的DNA序列且微小衛星DNA核心序列僅僅是2~5bp,其也稱為短串聯重復(STR),使用微流控芯片檢測可以積極克服傳統的垂直板凝膠電泳背景模糊、費時費力、誤差較大等,但是也有相對不穩定的部分缺點,微流控芯片檢測應
用DNA芯片技術檢測基因的表達
一、芯片制備基因芯片的制備主要有兩種基本方法,一是在片合成法,另一種方法是點樣法。在片合成法是基于組合化學的合成原理,它通過一組定位模板來決定基片表面上不同化學單體的偶聯位點和次序。在片合成法制備DNA芯片的關鍵是高空間分辨率的模板定位技術和固相合成化學技術的精巧結合。目前,已有多種模板技術用于基因
用DNA芯片技術檢測基因的表達
一、芯片制備基因芯片的制備主要有兩種基本方法,一是在片合成法,另一種方法是點樣法。在片合成法是基于組合化學的合成原理,它通過一組定位模板來決定基片表面上不同化學單體的偶聯位點和次序。在片合成法制備DNA芯片的關鍵是高空間分辨率的模板定位技術和固相合成化學技術的精巧結合。目前,已有多種模板技術用于基因
用DNA-芯片技術檢測基因的表達
實驗概要生物芯片是將生命科學研究中所涉及的不連續的分析過程(如樣品制備、化學反應和分析檢測),利用微電子、微機械、化學、物理技術、計算機技術在固體芯片表面構建的微流體分析單元和系統,使之連續化、集成化、微型化。生物芯片技術主要包括四個基本要點:芯片方陣的構建、樣品的制備、生物分子反應和信號的檢測。1
東芝最新電化學DNA芯片可在低濃度下檢測DNA
日本東芝公司(Toshiba)日前宣布研制成功高靈敏度的電化學DNA芯片,這種芯片能夠在非常低的濃度下檢測DNA。 這款新型芯片集成了目前廣泛使用的半導體電路技術之一的CMOS電路及傳感器,是對東芝先進DNA芯片系列產品及相關技術的最新補,可迅速投入的應用包括抗癌藥物的易感性分析及用于疾病起因
利用基因芯片檢測尿液游離DNA樣本
膀胱尿路上皮癌具有復雜多樣的特征,其中一部分原因是基因組多樣化所致。1,2Togneri等在《European Journal of Human Genetics》上發表的文章中稱,尿液樣本上清液中的游離DNA(cfDNA),與從制成顆粒的尿液細胞材料或傳統腫瘤組織樣本中獲得的DNA相比,檢測基
DNA芯片技術和RNA測序有啥不同?
?日本推理小說家東野圭吾的作品《白金數據》中描述了這樣一個未來世界:日本政府秘密建立名為“白金數據”的數據庫。該庫搜集了全國人民的DNA數據,通過對犯罪分子留在現場的毛發、體液等證物進行比對,警方可以高效、快速、準確鎖定真兇。借助“白金數據”的幫助,一個檢舉率100%、冤案率0%的理想法制社會構建完
關于DNA芯片的核苷酸多態性
SNP標記是美國學者Lander E于1996年提出的第三代DNA遺傳標記。SNP是指同一位點的不同等位基因之間僅有個別核苷酸的差異或只有小的插入、缺失等。從分子水平上對單個核苷酸的差異進行檢測,SNP 標記可幫助區分兩個個體遺傳物質的差異。人類基因組大約每 1250 bp SNP 出現一次,已
DNA“折紙術”有助研發更快更廉芯片
北京3月22日電 為了使計算機芯片速度更快、價格更便宜,電子產品制造商往往采用削減生產成本或者縮小元件尺寸的方法,但美國楊百翰大學的研究團隊報告稱,DNA“折紙術”可能有助實現這一目標。該團隊日前在美國化學學會第251屆全國會議暨博覽會上提交了相關成果。DNA芯片 參與研究的亞當·伍利博
美國研發DNA芯片-可追蹤火星上的生命跡象
為了分析火星上面的生命跡象,來自麻省理工學院、哈佛大學以及馬薩諸塞州綜合醫院的研究人員正在研制一種DNA測序芯片,用于檢測火星生命。 有一種理論認為,35億年前,一場流星暴在太陽系中爆發,在地球和火星兩個羽翼豐滿的行星之間交換了生命所需的各種材料。這場乒乓球游戲在這兩大行星之間創建了一種共
DNA計算機芯片制造模式有了雛形
美國杜克大學研究人員稱,他們利用攜帶全部生命信息的DNA(脫氧核糖核酸)的獨特雙螺旋結構,將經過改造的DNA片段和其他分子進行簡單混合,即可制造出無數個同樣的、細小的、像華夫餅干一樣的器件。利用這種技術,將來或只需一天時間就可達到現在全球每月的芯片生產量。 杜克大學電子和計
DNA標記物檢測的新貴——芯片上的實驗室
癌癥是美國的第二大死因,早期準確的診斷和治療是目前腫瘤研究的重點,腫瘤基因標記物則為診斷和新型治療模式(如免疫治療)提供了重要的信息。微芯片實驗室由于體積小、需要的樣品少且費用低廉等優點,已經成為了腫瘤診斷設備很有潛力的一個發展方向。 一個來自圣克魯斯加州大學和楊百翰大學的科學家及工程師團隊就
以微流控芯片技術為平臺的DNA計算機
DNA計算賴以實現的載體主要有三類,即試管、金表面和芯片。微流控芯片技術所具有不同操作單元,靈活組合、大規模集成的特點,為取代試管或表面積操作,構建一個嚴格意義上的DNA計算機提供了一種理想的平臺。微流控芯片作為一個多功能的技術平臺很適合DNA計算研究。DNA計算所涉及的各種生化反應和分離過程如雜交
動物細胞基因組DNA-SNP的生物芯片檢測1
實驗原理:1、SNP的概念及意義單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性。它是人類可遺傳的變異中最常見的一種。占所有已知多態性的90%以上。SNP在群體中的發生頻率不小于1%。SNP在
動物細胞基因組DNA-SNP的生物芯片檢測2
DNA (500 ng) is digested with Nsp I and Sty I restriction enzymes and ligated to adaptors that recognize the cohesive 4 bp overhangs. All fragment
Arraystar-DNA甲基化芯片干細胞移植改善骨質疏松表觀機制
施松濤教授任職于賓夕法尼亞大學,長期從事口腔再生醫學及其臨床轉化方面的研究工作。近期其研究團隊利用Arraystar DNA甲基化芯片研究移植間充質干細胞(MSC)通過表觀遺傳調控Notch信號改善紅斑狼瘡患者的骨質疏松。這一重要研究發現發布在Cell Metabolism雜志(IF:17.5
Arraystar-DNA甲基化芯片用于干細胞移植改善骨質疏松表...
Arraystar DNA甲基化芯片用于干細胞移植改善骨質疏松表觀機制的研究施松濤教授任職于賓夕法尼亞大學,長期從事口腔再生醫學及其臨床轉化方面的研究工作。近期其研究團隊利用Arraystar DNA甲基化芯片研究移植間充質干細胞(MSC)通過表觀遺傳調控Notch信號改善紅斑狼瘡患者的骨質疏松。這
動物細胞基因組DNA-SNP的生物芯片檢測3
3.3、寡核苷酸DNA微陣列芯片檢測SNP技術:寡核苷酸芯片檢測基因突變技術是基因芯片技術的一種。該技術用于檢測基因突變的基本原理是在玻璃、硅等載體上,根據檢測需要,設計、固定多個特異的寡核苷酸探針。而后將大量經擴增、體外轉錄等技術摻入熒光標記分子的待測DNA樣品與之雜交,若兩者存在至少一個堿基的差
生物芯片(DNA微陣列)熒光掃描儀中的激光共聚...(二)
釋放光采集熒光由目鏡的鏡頭來采集,該鏡頭聚焦于樣品上并將一定區域內的光線收集到裝置。收集的角度區域的大小非常關鍵,熒光釋放是球形的,目鏡對熒光的采集范圍是決定儀器的采集效率關鍵指標之一。目鏡采集光的角度由數值孔徑來表示,圖2表示了數值孔徑與光采集效率之間的變化關系。當數值孔徑為1.0時,目鏡將收集到
Dolomite微流控芯片成功用于高通量單細胞DNA/RNA測序
隨著現代生物學的發展,細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序通過對單個細胞進行測序,解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題,為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。 2011 年,《自然方法》雜志( Nature Methods )將單細胞測序列為年
生物芯片(DNA微陣列)熒光掃描儀中的激光共聚...(三)
以下要介紹共聚焦掃描微陣列的工作原理,顧名思義,共聚焦掃描儀將視野中的兩個聚焦點的影象裝配為二維圖象,工作過程如所示:平行的激光束通過光束分離器后進入目鏡,目鏡采集到部分球狀散射的熒光釋放光并使這些光成為平行的光束,此外還采集被反射的激光,這些激光的強度要比熒光強度大3-7倍。采集回來的光束再次通過
上海應物所合作研究實現“中國地圖”上的DNA納米芯片
Small雜志封面 基因芯片(DNA芯片)是遺傳分析領域的重要工具。常用的DNA芯片都是將DNA探針分子固定在固態基片上,因此往往會受到固液界面反應效率的限制。最近,中科院上海應用物理研究所物理生物學實驗室和上海交通大學Bio-X研究院的研究人員合作,發展了一種基
生物芯片(DNA微陣列)熒光掃描儀中的激光共聚...(一)
生物芯片(DNA微陣列)熒光掃描儀中的激光共聚焦掃描技術所有的微陣列上的熒光須經熒光掃描裝置來分析其上的熒光強度和分布,在這些裝置中,激光共聚焦掃描儀具有優越的性能,能獲取高質量的圖像和數據,本文將分別介紹微陣列的相關特性和各種類型的微陣列掃描儀,激光共聚焦掃描儀的設計和關鍵特性,另外還將介紹一種已