基因測序:數據深度挖掘和解讀難題待解
作為一種新型基因檢測技術,基因測序能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。正因如此,今年華大基因的上市,就引發了資本市場的熱烈追捧。 在日前在京召開的第四屆全國功能基因組學高峰論壇上,與會的眾多專家就基因技術發展方向及面臨的機遇與挑戰進行了深入的交流和研討。 基因測序用途廣泛 當前,基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用。有學者甚至認為,基因測序技術可能是下一個改變世界的技術,因為在自然界乃至人類世界,基因測序都有著有著無可替代的作用。 今年5月,由中科院昆明植物所牽頭的聯合科研團隊通過基因組建庫與測序等一系列關鍵技術,攻克了茶樹基因組測序的難題,在國際上率先獲得了高質量的茶樹基因組序列。 中科院昆明植物所研究員高立志坦言,這對揭示決定茶葉適制性、風味和品質,以及茶樹全球生態適應性的遺傳基礎都有重要促進作......閱讀全文
基因測序技術大升級
? DNA就像是漆黑的夜里螢火蟲發的光,第二代測序技術無法辨別每一只螢火蟲,所以就把上千只螢火蟲放在同一個袋子里,才能收集到它們的光。但第三代技術卻可以辨別每一只螢火蟲,而且可以同時測量很多個DNA片斷。 日前,南方科技大學生物系副教授賀建奎與另外幾名中美科學家聯合在生物醫學雜志BioRxiv上
5大玩家競逐下一代基因測序數據游戲
【導語】美國化學學會(ACS)出版的新聞周刊C&EN以基因測序為主題發表了封面文章“下一代基因測序是一場數據游戲”,文中指出:2013年基因測序市場規模為13億美元,其中Illumina市場占有率為71%;被賽默飛世爾收購的Life Tech居第二;羅氏排名第三;另外文中還公布了影響用戶購買測線
美洲大蠊基因組測序完成
中科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所詹帥及同事對美洲大蠊進行了基因組測序和分析,表明在已測基因組的昆蟲中,其基因組規模僅次于蝗蟲。這項研究3月21日在線發表于《自然—通訊》,文章揭示了該物種成功適應城市環境的遺傳學基礎的相關洞察。 美洲大蠊(Periplaneta americana
基因測序:數據深度挖掘和解讀難題待解
作為一種新型基因檢測技術,基因測序能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。正因如此,今年華大基因的上市,就引發了資本市場的熱烈追捧。 在日前在京召開的第四屆全國功能基因組學高峰論壇上,與會的眾多
基因測序:數據深度挖掘和解讀難題待解
作為一種新型基因檢測技術,基因測序能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。正因如此,今年華大基因的上市,就引發了資本市場的熱烈追捧。 在日前在京召開的第四屆全國功能基因組學高峰論壇上,與會的眾多專
-英公開埃博拉病毒基因測序數據
一個英國科研團隊成功完成了對埃博拉病毒的基因測序,并已將數據在網上公開發布,免費提供給全球科研人員使用。這有助于各國研發更高效的治療藥物和疫苗。 劍橋大學3日發布公告稱,2014年埃博拉疫情在西非暴發后,來自該校及英國多個科研機構的研究人員開始在塞拉利昂采集病毒樣本,并利用美國一家公司開發的新
基因測序全球大熱,誰會搶到市場先機
日前,美國總統奧巴馬在2015年國情咨文演講中提出“精確醫學計劃”,提議在2016財年向該計劃投入2.15億美元,推動個性化醫療發展。 在這筆2.15億美元預算中,1.3億美金將分配給NIH(美國國立衛生研究院),用于首批志愿者的招募和測序;7000萬美金給NIH的癌癥研究所,用于解
基因測序:數據處理與標準問題仍待解
【導讀】目前我國在數據行業標準方面概念還很模糊,這就導致科研機構、醫療機構、企業在利用基因數據的時候,沒有統一的規則,也造成基因測序行業良莠不齊。這種情況,亟須得到改變。 目前我國在數據行業標準方面概念還很模糊,這就導致科研機構、醫療機構、企業在利用基因數據的時候,沒有統一的規則,也造成基因測
基因測序:數據處理與標準問題仍待解
圖片來源:百度圖片 目前我國在數據行業標準方面概念還很模糊,這就導致科研機構、醫療機構、企業在利用基因數據的時候,沒有統一的規則,也造成基因測序行業良莠不齊。這種情況,亟須得到改變。 基因測序,一直被視為生命科學和生物技術發展的重大革命。在經歷過前些年的積累之后,今年的基因測序行
新一代腫瘤基因測序,數據質量是基石
腫瘤細胞的一個明確特點是其復雜的異質性,存在個體不同細胞間,不同個體間,另根據現有的研究基礎,已經發現腫瘤基因層面變異頻率普遍較低,各種因素告訴我們,在復雜的背景中確定腫瘤突變,首先測序堿基的準確率必須過關。原始數據的堿基識別準確性越高,使用的信息分析方法越合理標準,對測序深度的要求就會越低。在
科學家提出基因測序數據分類新標準
有助于開發出更有效的疫苗;更迅速應對潛在公共衛生突發事件 最近,美國洛斯阿拉莫斯國家實驗室(LANL)的一個遺傳學小組和一國際財團聯合提出了一套旨在闡明可公開獲取的基因測序數據信息的質量標準。新標準最終可使遺傳研究人員開發出更有效的疫苗,或有助于公共健康部門或安全人員更迅速地應對潛在的公共衛生
盤點:全球十大頂尖基因測序公司
新一代測序(NGS)的市場規模到底有多大?據BCC Research統計,到2022年NGS市場將達到105億美元。MarketsandMarkets則更加樂觀一些,估計屆時將達到124.5億美元。不過BIS Research的預測較為保守,認為市場增長速度將相對緩慢一些,預計2024年達到11
ctdna測序數據測序深度多少可用
ctdna測序數據測序深度多少可用2-氨基嘌呤等其他堿基結構類似物同樣具有誘變作用。②藥物或射線引起的化學變化 亞硝酸能夠作用于腺嘌呤(A)的氨基而使它變為次黃嘌呤(HX);可以作用于胞嘧啶(c)而使它變為尿嘧啶(U)。這兩種氨基到酮基的變化帶來堿基配對關系的改變,從而通過 DNA復制而造成A∶T→
基因測序
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術,是下一個改變世界的技術
基因測序
第1代測序技術——熒光標記的Sanger法 在第一臺全自動測序儀出現之前,使用最為廣泛的測序方法就是 Sanger 在 20 世紀 70 年代中期發明的末端終止法測序技術。 Sanger 也因此獲得 1980年的諾貝爾化學獎。 他的發明第一次為科研人員開啟了深入研究生命遺傳密碼的大門。G1.1? ?
測序“垃圾”數據變身寶藏
基因組測序中曾經被視為是垃圾的數據,現在能夠用來為人們提供重要的疾病線索。St. Jude兒童研究醫院——華盛頓大學兒童癌癥基因組項目的研究人員獨辟蹊徑,在染色體末端DNA重復片段的測序數據中,挖掘到了寶貴的癌癥信息。 染色體末端的DNA重復片段被稱為端粒,此前這種重復片段往往在二代測
首個中國地區古人全基因組數據被測序
近日,《當代生物學》發表了首次針對中國地區古人類的全基因組研究成果。該項目由中國科學院古脊椎動物與古人類研究所和德國馬普進化人類研究所等團隊合作完成,研究分析了距今4萬年前出土于北京房山田園洞的一具男性個體基因組,發現東亞早期人群組成十分復雜。 雖然歐洲和西伯利亞地區都有古人類樣本基因組被測序
最新Nature公布兩大基因組測序結果
6月11日的Nature雜志公布了兩項重要的基因組測序結果:巨桉樹基因組,以及櫛水母“太平洋側腕水母”的基因組,這些遺傳信息的解析將有助于我們更深入的了解生物功能基因變異,以及相關經濟產物的作用機理。 來自佛羅里達大學的研究人員發表了櫛水母“太平洋側腕水母”(Pleurobrachia bac
Nature:測序研究引發的思考,誰該擁有個人基因數據?
大樣本數據庫是影響基因數據分析解讀的重要因素,也是影響測序產業鏈發展的瓶頸之一。如今,越來越多的志愿者將自己的基因數據貢獻給科研,但是對于后續的數據反饋,卻是一個值得深思的問題。近日,一位遺傳學研究者在Nature網站上披露了如今遺傳學研究中存在的問題:是否有必要將原始數據反饋給參與者?以下為她
精準醫療時代已至-基因測序數據分析成為關鍵
隨著醫學技術提升、就醫環境改善,困擾人們的復雜疾病是否能夠得到更加有效的治療?相關統計顯示,針對城市居民死亡率較高的癌癥(惡性腫瘤)、心臟病、冠心病等復雜疾病,傳統醫療方案的治療效果并不佳。據WINSymposium公布的數據顯示,傳統醫療在腫瘤治療上用藥無效率高達75%。人們仍然談“癌”色變。
平價基因測序公司如何賺錢?高價賣數據才是生財之道
可能一天前你還在為已經降到“冰點”的基因測序市場價格而竊喜,卻不知后一天,基因測序公司已經將你的“基因秘密”高價轉手賣給了那些需要基因大數據的研究機構或者制藥公司,而后者據此研發的靶向治療生物藥物,一個療程就可能售價十幾萬美元。 平價基因測序時代來臨,基因測序業務門檻低、不賺錢已是行業內公開的
乳腺癌的8年數據,基因測序受患者青睞
隨著基因測序技術的發展,成本不斷降低,活躍在市場上的乳腺癌基因測序產品也越來越多。然而,患者對乳腺癌BRCA測序持何態度?BRCA基因測序是否對患者的治療決策有影響?2016年2月11日,《JAMA Oncology》雜志報道了年輕乳腺癌患者BRCA基因檢測的調查報告,經調查發現,近年來乳腺癌年
基因測序定義
基因測序是一種新型基因檢測技術,能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列,預測罹患多種疾病的可能性,個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因,提前預防和治療。 基因測序相關產品和技術已由實驗室研究演變到臨床使用,可以說基因測序技術是下一個改變世界的技術
蠶豆基因測序!
蠶豆的基因組終于被測序了,它擁有130億個堿基,超過了人類基因組的4倍。這項研究最近發表在《自然》雜志上。這一非凡的技術壯舉對于培育具有最佳營養成分和可持續生產的豆子的目標具有重要意義。由英國雷丁大學、丹麥奧胡斯大學和芬蘭赫爾辛基大學領導的一個來自歐洲和澳大利亞的研究小組合作進行了這項廣泛的測序工作
基因測序儀
原理編輯abi prism 310型基因分析儀采用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯酰胺平板電泳,應用該公司ZL的四色熒光染料標記的ddntp(標記終止物法),因此通過單引物pcr測序反應,DNA測序儀生成的pcr產物則是相差1個堿基的3''''末端為4種不同熒光染料
基因測序簡介
測序技術迄今為止已發展了三代,測序技術有4個指標:讀長、成本、準確度、通量。 成本、準確度這兩項指標都很好理解,成本下降使得單個人類基因組的花費已經從2001年的1億美元下降到了1000美元以下。準確度則是測序結果的準確程度,例如二代測序的solid可以達到99.9%,而唯一投入實用的三代測序
基因測序原理
基因是位于DNA上的,其測序的原理是一樣的DNA測序的方法有很多種.目前最常見的是雙脫氧終止法了.在測序用的緩沖液中含有四種dNTP及聚合酶.測序時分成四個反應,每個反應除上述成分外分別加入2,3-雙脫氧的A,C,G,T核苷三磷酸(稱為ddATP,ddCTP,ddGTP,ddTTP),然后進行聚合反
Science:華大參與三種鱷魚基因組測序
最近,德克薩斯理工大學的生物學家帶領一個50多名科學家的研究小組,測定了三種鱷魚——美洲鱷、咸水鱷和印度鱷的基因組序列。 生物學副教授David Ray指出,通過測定這些基因組序列,科學家們可以更好地了解鳥類的進化,它們是這類食肉動物的最近親緣種。該研究小組完成了這三種鱷魚的基因組,可以說真正
單分子測序在腫瘤基因檢測中的6大應用
腫瘤是當今導致人類主要死亡的主要疾病之。由于其發病隱匿、治療方法局限、多數預后不良,且分子生物學特征復雜多變,因而腫瘤的預防、早期篩查與診斷、臨床治療、預后評估一直是臨床醫生致力于解決的關鍵問題。隨著現代醫學技術的發展,腫瘤已經進人了個體化治療階段。腫瘤的基因組轉錄組和表觀遺傳特征在探究腫瘤的發
Science:華大參與三種鱷魚基因組測序
最近,德克薩斯理工大學的生物學家帶領一個50多名科學家的研究小組,測定了三種鱷魚——美洲鱷、咸水鱷和印度鱷的基因組序列。 生物學副教授David Ray指出,通過測定這些基因組序列,科學家們可以更好地了解鳥類的進化,它們是這類食肉動物的最近親緣種。該研究小組完成了這三種鱷魚的基因組,可以說真正