測序“垃圾”數據變身寶藏
基因組測序中曾經被視為是垃圾的數據，現在能夠用來為人們提供重要的疾病線索。St. Jude兒童研究醫院——華盛頓大學兒童癌癥基因組項目的研究人員獨辟蹊徑，在染色體末端DNA重復片段的測序數據中，挖掘到了寶貴的癌癥信息。 染色體末端的DNA重復片段被稱為端粒，此前這種重復片段往往在二代測序研究中被忽視。這是由于二代測序技術難以定位重復片段，為此這類數據常被研究者們視為垃圾。但現在，St. Jude兒童研究醫院的研究人員發現，端粒DNA量的改變與特定癌癥之間存在著關聯，文章發表在最近一期的Genome Biology雜志上。 機體中端粒DNA序列是不變的，但其重復的次數卻是不同的，這直接關系到端粒的長度，而端粒長度限制了細胞分裂的次數。端粒隨著細胞分裂逐漸縮短，直到細胞停止分裂。不過癌細胞能夠繞過端粒的縮短機制持續進行分裂，端粒的維持和延長也是癌細胞不斷分裂增值的標志。 超值的BioTek微孔板檢測儀，......閱讀全文
ctdna測序數據測序深度多少可用
ctdna測序數據測序深度多少可用2-氨基嘌呤等其他堿基結構類似物同樣具有誘變作用。②藥物或射線引起的化學變化 亞硝酸能夠作用于腺嘌呤(A）的氨基而使它變為次黃嘌呤(HX）；可以作用于胞嘧啶（c）而使它變為尿嘧啶（U）。這兩種氨基到酮基的變化帶來堿基配對關系的改變，從而通過 DNA復制而造成A∶T→
測序“垃圾”數據變身寶藏
基因組測序中曾經被視為是垃圾的數據，現在能夠用來為人們提供重要的疾病線索。St. Jude兒童研究醫院——華盛頓大學兒童癌癥基因組項目的研究人員獨辟蹊徑，在染色體末端DNA重復片段的測序數據中，挖掘到了寶貴的癌癥信息。 染色體末端的DNA重復片段被稱為端粒，此前這種重復片段往往在二代測
高通量測序數據分析
1. 是不是一定要用大型計算機? 除了序列拼接組裝以外，其它分析不是一定要大型計算機，在普通的PC上也可以進行一些處理，當然，買一臺或幾臺高性能的工作站電腦，能顯著加快數據處理的速度。 2. 是不是一定要用Linux系統? 也不一定非用Linux不可，在Window下可以完成部分數據處理。
三代測序數據漫談
三代明星：PacBio及其序列數據再來看看江湖呼聲漸漲的三代測序技術。目前三代測序市場上，表現最為搶眼的莫過于以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies為代表的納米孔單分子測序技術。與前兩代相比，三代測序最為核心的特點就是單分子測序，測序過程無需進
如何讀懂空間轉錄組測序數據結果
空間轉錄組學研究是很多老師非常感興趣的一種最新組學研究技術。做完空間轉錄組測序后，能拿到哪些結果，是不是存在買家秀和賣家秀的差距？本期，生物芯片生物信息團隊利用已發表數據的實操分析，為大家展示空間轉錄組測序數據結果。 我們分析了來自10x Genomics 的Visium技術生成的某腫瘤生
如何讀懂空間轉錄組測序數據結果
空間轉錄組學研究是很多老師非常感興趣的一種最新組學研究技術。做完空間轉錄組測序后，能拿到哪些結果，是不是存在買家秀和賣家秀的差距？本期，生物芯片生物信息團隊利用已發表數據的實操分析，為大家展示空間轉錄組測序數據結果。 我們分析了來自10x Genomics 的Visium技術生成的某腫瘤生
如何讀懂空間轉錄組測序數據結果
空間轉錄組學研究是很多老師非常感興趣的一種最新組學研究技術。做完空間轉錄組測序后，能拿到哪些結果，是不是存在買家秀和賣家秀的差距？本期，生物芯片生物信息團隊利用已發表數據的實操分析，為大家展示空間轉錄組測序數據結果。我們分析了來自10x Genomics 的Visium技術生成的某腫瘤生物學數據集，
英公開埃博拉病毒基因測序數據
一個英國科研團隊成功完成了對埃博拉病毒的基因測序，并已將數據在網上公開發布，免費提供給全球科研人員使用。這有助于各國研發更高效的治療藥物和疫苗。 劍橋大學３日發布公告稱，２０１４年埃博拉疫情在西非暴發后，來自該校及英國多個科研機構的研究人員開始在塞拉利昂采集病毒樣本，并利用美國一家公司開發的新
基因測序：數據深度挖掘和解讀難題待解
作為一種新型基因檢測技術，基因測序能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列，預測罹患多種疾病的可能性，個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因，提前預防和治療。正因如此，今年華大基因的上市，就引發了資本市場的熱烈追捧。 在日前在京召開的第四屆全國功能基因組學高峰論壇上，與會的眾多
基因測序：數據深度挖掘和解讀難題待解
作為一種新型基因檢測技術，基因測序能夠從血液或唾液中分析測定基因全序列，預測罹患多種疾病的可能性，個體的行為特征及行為合理。基因測序技術能鎖定個人病變基因，提前預防和治療。正因如此，今年華大基因的上市，就引發了資本市場的熱烈追捧。 在日前在京召開的第四屆全國功能基因組學高峰論壇上，與會的眾多專