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  • 2013新一代測序儀將走向何方

    盡管今年的摩根大通保健大會沒有出現去年的新品頻發的盛況,但新一代測序儀仍在不斷進步。讀長、準確性、通量、軟件,無一不在變化,讓測序更高、更快、更強。 Illumina公司在2012年第三季度推出了HiSeq 2000的升級版――HiSeq 2500。它是Illumina第一臺特有兩種運行模式的測序系統,包括快速運行和高產量運行模式,可使用一個或兩個流動槽,相當靈活。據 Illumina介紹,今年下半年會實現快速運行模式下對2x250 bp讀長的支持,這樣就能夠在大約60小時內獲得300 Gb。 同時,Illumina的個人型測序儀MiSeq很快也將支持2x300 bp末端配對讀取,產生15 Gb測序數據。不過,更為勁爆的消息在后面。Illumina在收購長讀取測序公司Moleculo之后,很快將提供新的文庫制備試劑盒及分析軟件,這有望使Illumina測序儀的讀長達到10 kb。 據Illu......閱讀全文

    基因組測序儀簡介

      基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。  技術指標  個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。  主要功能  樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。

    基因組測序

    如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的

    新突破!掌上測序儀首次完成人類全基因組測序

      最近,英國牛津大學(Oxford University)Wellcome Trust人類遺傳學中心(Wellcome Trust Centre for Human Genetics)和在基因組分析領域領先的英國公司Genomics plc宣布,首次使用掌上納米孔測序儀完成了多個人類全基因組測序和

    解碼“基因組學之父”桑格:測序,測序,測序

      “桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎,徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、   有一天,65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983

    PNAS:甜瓜基因組測序

      甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值,日前西班牙的九個研究中心通力合作,利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組,科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組,文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。   聯合國糧農組織2009年

    認識泛基因組測序

    什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

    紐約基因組中心購買4臺IonProton測序儀

      Life Technologies公司周二宣布,紐約基因組中心(NYGC)已經購買了4臺Ion Proton?測序儀,放在新的創新中心。這些測序儀能在幾小時內完成人類基因組的測序,且費用低于1000美元。新購置的這一批測序儀將放在紐約著名的Sloan-Kettering癌癥中心,以加速癌癥遺

    對話Life-Tech:Ion-Proton臺式基因組測序儀

      著名的生物技術公司Life Technologies(納斯達克股票代碼:LIFE)3月28日宣布,在中國推出新的臺式基因測序儀:Ion Proton?。借助該技術產品,只需 1000 美元即可在一天時間內完成個人全基因組測序。    這一新型測序儀采用了新一代半導體測序技術。此前推出的同樣基于這

    454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目

      一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代,其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1,科學家通過454全基因組測序,掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因,包括抗病能力、牛奶產量,這些性狀已通過北美的當

    我國完成小麥A基因組測序

    本報訊(記者丁佳)5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和

    測序解讀基因組,真的好嗎?

    測序解讀基因組,真的好嗎?   “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire,在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說,“尤其是對自己基因組信息的了解。”  雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年,但

    白肉靈芝完成基因組測序

    ?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日,中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉,這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3:基因,基因組,遺傳學》(G3-Genes Genomes Genet

    我國完成小麥A基因組測序

    ?? 5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和表達特征,對深入和

    盤點最新基因組測序成果

      the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者:  種屬:非洲腔棘魚(Latimeria chalumnae)  基因組:~2.86 billion bp  人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕,直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年

    簡化基因組測序好做嗎

    簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度,進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。這些技

    讓基因組測序繞過PCR

    ?在基因組測序中,PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而,PCR也帶來一些問題,包括不均勻擴增,導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序(NGS)平臺而言,測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-

    Nature完成桉樹基因組測序

      一個橫跨五大洲的科學團隊宣布,巨桉(Eucalyptus grandis)的基因組測序已經完成,巨桉是世界上最廣泛種植的樹木之一。這一成果于六月十一日發表在Nature雜志上。  巨桉生長速度快,可以用作燃料和木材,是纖維、紙漿、生物燃料、藥物和工業用油的重要可再生原料。這種樹木原產于澳大利亞東

    測序基因組勘探食品污染

       上周,兩家公司因李斯特菌食品感染發令召回其所有產品。Sabra Dippin召回30,000例鷹嘴豆泥制成的食品,至今疾病防治中心未發現因食用該公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而,堪薩斯州的藍鈴冰激淋工廠(Blue  Bell Creameries)已確認有少量食品原料已感染李斯特菌,目

    中國蓮基因組測序完成

      繼中國科學家成功完成水稻、玉米基因組測序工作后,近日,中國科學院武漢植物園研究人員與國外多家科研機構合作,順利完成中國蓮的基因組測序,構建了首張中國蓮全基因組圖譜,相關論文在線發表于《基因組生物學》雜志。   “該項目為將來的蓮分子育種提供了堅實的基礎,也標志著我國相關研究將對生物進

    基因組測序的具體過程

    講起來很復雜哈,簡單來說,就是邊合成邊測序,把所要測序的序列通過各種手段來建庫,然后加上5‘和3’都加上接頭,放在一個小玻璃片一樣的芯片上,上面一般是8個lane,把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合(之前的建庫時加的接頭與之反向互補),然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇,然

    什么是基因組測序技術

    自1998年美國塞萊拉遺傳公司組建以來,人類基因組研究開始由兩部分科學家同時展開,分別是由公共經費支持的人類基因組工程和美國塞萊拉遺傳公司。在研究過程中,他們也分別采用了兩種不同的測序和分析的方法。塞萊拉公司的核心分析方法被稱為"霰彈法",人類基因組工程則采用了"克隆法"。所謂"霰彈法",其實是一種

    人類全基因組測序計劃

      全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人類基因組測序的科學家之一。他認為如果能夠知道所有人類基因的序列,對癌癥的研究將會很有幫助。美國能源部(DOE)與美國國家衛生研究院(NIH),分別在1986年與1987年加入人類基

    Nature突破:香蕉基因組測序

      由法國的研究人員領導的一個國際小組近日完成了對香蕉品種小果野蕉(Musa acuminata)的基因組測序,并開始分析這一基因組草圖。相關研究成果發布在了7月11日的《自然》(Nature)雜志上。   研究人員采用Roche 454、Sanger和Illumina的測序方法繪制出了雙單倍

    基因組測序拯救鸮鸚鵡

      為了保護極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo,幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序,這為其保護管理提供了重要信息。  新西蘭鸮鸚鵡kakapo(Strigops habroptila)有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡,有的雄性甚至超過3公斤,被認為有達90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡,通過

    454用于西紅柿基因組測序

      最近,西紅柿基因組學會完成了一個農業種植西紅柿品系Solanum lycopersicum的基因組圖譜,以及一個野生型西紅柿品系S. pimpinellifolium的基因組圖譜,并將其與已知的土豆基因組以及其他植物比較,尋找與水果有些特性相關的基因,相關文獻在Nature雜志作為封面文章發

    Life-Technologies發布個人化操作基因組測序儀

      2010年3月17日,Life Technologies在其于北京舉辦的2011年生命科學新技術報告會上發布了利用半導體芯片實現高通量測序的Ion Torrent個人化操作基因組測序儀。報告會還介紹了Life Technologies包括分子生物體系、細胞體系與基因體系在內的三大業務領域

    DNA測序儀:454測序儀

    454測序儀的出現極大促進了測序業務的開展,科研人員已經將測序技術作為解決科研工作中許多常見 問題的利器。這是因為454測序儀在以下幾個方面取得了質的突破:首先是解決了高通量測序問題;其次它簡 化了樣品準備步驟,將以往轉化大腸桿菌擴增質粒的繁瑣過程全部用簡單的體外PCR擴增法替代了;最后, 它縮小了

    人人基因組時代到來缺什么?國產測序儀助力幾何

    原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500595.shtm2021年6月,四川大學華西醫院為“十萬例中國罕見病患者全基因組測序計劃”(GSRD-100K^WCH)項目采購檢測服務,這樣大規模臨床項目出現的背后是測序成本的降低。“當時我們已經把

    Cell公布最新基因組測序結果

      去年夏天西非埃博拉爆發的早期階段,科學家們以空前的規模和速度測序了這種致命病毒的基因組,為人們揭示了許多疫情蔓延的關鍵信息,比如說病毒只通過人與人接觸傳播,病毒在多次傳播中獲得了許多新突變等等。  雖然埃博拉爆發最糟糕的時期已經過去,但這場疫情并未結束,還有許多問題需要人們去解答。為此,哈佛大學

    小麥野生遠祖基因組測序完成

      11月15日出版的《自然》雜志刊登了一篇研究論文稱,美國加州大學戴維斯分校科學家領導的國際團隊,成功為小麥的一種野生遠祖——節節麥(Aegilops tauschii)進行了基因組測序,向破解小麥基因組難題邁進了一步。  作為全球主要糧食作物,小麥為人類提供了超過20%碳水化合物和23%蛋白質等

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