科學家破譯“組蛋白密碼”識別新機制
記者日前從中科院上海應用物理研究所獲悉，清華大學醫學院基礎醫學系和結構生物學中心李海濤課題組利用上海光源生物大分子晶體學線站，從結構生物學角度解析組蛋白甲基化修飾識別新機制，進一步揭開了錯綜復雜的表觀遺傳調控的神秘面紗。相關成果近期分別在線發表于《自然》和《基因與發育》雜志。 據了解，真核生物基因表達調控不僅依賴于特定的DNA序列元件，還受到特定組蛋白翻譯后修飾的精密調節。組蛋白變體和組蛋白修飾賦予組蛋白巨大的信息荷載能力，參與構成一層超越DNA序列的表觀遺傳信息，在染色質結構調節及基因表達調控等過程中起著關鍵作用。目前，研究發現很多疾病與組蛋白修飾異常有著非常重要的關聯，因此研究組蛋白修飾的產生、消除以及讀取機制，對深入了解基因功能調控機制以及疾病的發生和治療等有著重要意義。 據介紹，此次李海濤課題組利用上海光源生物大分子晶體學線站，解析了bromo-PWWP-H3.1K36me3復合物和bromo-PWWP-......閱讀全文
生物物理所等在組蛋白甲基化修飾識別方面取得新進展
10月17日，《美國國家科學院院刊》（Proceedings of the National Academy of Sciences）在線發表了生物大分子國家重點實驗室許瑞明、饒子和課題組和北京生命科學研究所（NIBS）朱冰課題組合作的最新研究成果Distinct mode of
研究揭示SHL蛋白對抑制和活性組蛋白修飾的識別機制
6月21日，《自然-通訊》（Nature Communications）雜志在線發表了中國科學院分子植物卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心植物分子遺傳國家重點實驗室杜嘉木研究組和威斯康辛大學麥迪遜分校鐘雪花研究組合作完成的題為Dual recognition of H3K4m
研究揭示SHL蛋白對抑制和活性組蛋白修飾的識別機制
6月21日,《自然-通訊》（Nature Communications）雜志在線發表了中國科學院分子植物卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心植物分子遺傳國家重點實驗室杜嘉木研究組和威斯康辛大學麥迪遜分校鐘雪花研究組合作完成的題為Dual recognition of H3K4m
組蛋白修飾的意義
通過影響組蛋白與DNA雙鏈的親和性，從而改變染色質的疏松或凝集狀態，或通過轉錄因子與結構基因啟動子的親和性來發揮基因調控作用。這些修飾之間存在協同和級聯效應，更為靈活地影響染色質的結構與功能，通過多種修飾方式的組合發揮其調控功能。
表觀遺傳之組蛋白修飾—組蛋白乙酰化
大家好，我又來啦~~今天給大家放送的是表觀遺傳之組蛋白修飾相關的內容噢，組蛋白修飾也是一個比較復雜的過程，今天呢，我們就給大家講講組蛋白乙酰化及相關的產品。?一 組蛋白修飾?真核生物染色質的基本結構單位是核小體，它由約 146 bp DNA 纏繞組蛋白八聚體組成，其中組蛋白八聚體包含 2 (H2
與組蛋白修飾相關因子介紹TAF
rna聚合酶ii啟動轉錄需要70多種多肽的活性。協調這些活動的蛋白質是基礎轉錄因子tfiid，它與核心啟動子結合以正確定位聚合酶，充當組裝其余轉錄復合物的支架，并充當調控信號的通道。tfiid由tata結合蛋白（tbp）和一組進化上保守的蛋白質（tbp相關因子或taf）組成。tafs可能參與基礎轉錄
組蛋白的合成修飾的相關介紹
這是形成組蛋白各組分微不均一性的主要原因。修飾的方式有： ①乙酰化。有兩種： 一種是H1、H2A、H4組蛋白的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰絲氨酸,組蛋白在細胞質內合成后輸入細胞核之前發生這一修飾。 另一種是在H2A、H2B、H3、H4的氨基末端區域的某些專一位置形成N6-乙酰賴氨酸。 ②
組蛋白修飾基因通路MEN1－基因
這個基因編碼腦膜，一種與多發性內分泌腫瘤1型綜合征相關的假定的腫瘤抑制因子。體外研究表明，腦膜定位于細胞核，具有兩種功能性核定位信號，并通過JUND抑制轉錄激活，但這種蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上檢測到兩條信息，但未對較大的信息進行描述。選擇性剪接導致多個轉錄變體。
組蛋白修飾基因通路HDAC2基因
該基因產物屬于組蛋白脫乙酰基酶家族。組蛋白脫乙酰基酶通過形成大的多蛋白復合物起作用，并負責核心組蛋白（H2A、H2B、H3和H4）N端賴氨酸殘基的脫乙酰化。這種蛋白通過與許多不同的蛋白質結合形成轉錄抑制復合物，包括哺乳動物鋅指轉錄因子YY1。因此，它在轉錄調控、細胞周期進展和發育事件中起著重要作用。
組蛋白修飾基因通路TAF1基因
rna聚合酶ii啟動轉錄需要70多種多肽的活性。協調這些活動的蛋白質是基礎轉錄因子tfiid，它與核心啟動子結合以正確定位聚合酶，充當組裝其余轉錄復合物的支架，并充當調控信號的通道。tfiid由tata結合蛋白（tbp）和一組進化上保守的蛋白質（tbp相關因子或taf）組成。tafs可能參與基礎轉錄
組蛋白修飾基因通路CHD4基因
該基因的產物屬于SNF2 / RAD54解旋酶家族。 它代表核小體重塑和脫乙酰基酶復合物的主要成分，并且在表觀遺傳轉錄抑制中起重要作用。 皮肌炎患者會產生針對這種蛋白質的抗體。 該基因的體細胞突變與漿膜性子宮內膜腫瘤有關。 選擇性剪接導致編碼不同同工型的多個轉錄變體。
組蛋白甲基化修飾研究再獲突破
日前，復旦大學徐彥輝課題組在組蛋白甲基化修飾研究領域獲得新進展，相關成果發布在《分子細胞》上，該項研究得到了國家自然科學基金面上項目的資助。 組蛋白甲基化修飾是一種非常重要的表觀遺傳修飾，參與調節異染色質形成、X染色體失活、基因印記及DNA的損傷修復等多種生命過程。關于組蛋白去甲基化酶的研究是
組蛋白修飾基因通路MEN1基因
這個基因編碼腦膜，一種與多發性內分泌腫瘤1型綜合征相關的假定的腫瘤抑制因子。體外研究表明，腦膜定位于細胞核，具有兩種功能性核定位信號，并通過JUND抑制轉錄激活，但這種蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上檢測到兩條信息，但未對較大的信息進行描述。選擇性剪接導致多個轉錄變體。
組蛋白修飾基因通路BRD4基因
該基因編碼的蛋白質與小鼠蛋白MCAP（有絲分裂過程中與染色體相關）和人類Ring3蛋白（絲氨酸/蘇氨酸激酶）同源。每一種蛋白質都包含兩個溴域，一個保守的序列基序，可能參與染色質靶向。該基因被認為是T（15；19）易位的19號染色體靶基因（q13；p13.1），它定義了年輕人的上呼吸道癌。已經描述了兩
組蛋白修飾基因通路HDAC1基因
多亞基復合物催化的組蛋白乙酰化和脫乙酰化在調節真核基因表達中起關鍵作用。 該基因編碼的蛋白質屬于組蛋白脫乙酰基酶/ acuc / apha家族，是組蛋白脫乙酰基酶復合物的組成部分。 它還與視網膜母細胞瘤腫瘤抑制蛋白相互作用，這種復合物是控制細胞增殖和分化的關鍵因素。 它與轉移相關蛋白2一起使p53脫
組蛋白修飾基因通路EP300基因
該基因編碼腺病毒E1A相關的細胞p300轉錄輔激活蛋白。作為組蛋白乙酰轉移酶，通過染色質重塑調節轉錄，在細胞增殖和分化過程中起重要作用。通過與磷酸化CREB蛋白特異性結合來介導cAMP基因調控。該基因也被鑒定為HIF1A（缺氧誘導因子1α）的共激活物，因此在缺氧誘導基因如VEGF的刺激中起到作用。這
組蛋白修飾基因通路KDM5A基因
該基因編碼Jumonji，富含AT的相互作用域1（JARID1）組蛋白脫甲基酶蛋白家族的成員。 編碼的蛋白質通過組蛋白編碼使組蛋白H3的賴氨酸4脫甲基，從而在基因調控中發揮作用。 編碼的蛋白質與許多其他蛋白質（包括成視網膜細胞瘤蛋白質）相互作用，并與Hox基因和細胞因子的轉錄調控有關。 該基因可能在
組蛋白修飾基因通路KMT2A基因
該基因編碼一個轉錄輔激活子，在早期發育和造血過程中起到調節基因表達的重要作用。編碼蛋白包含多個保守功能域。其中一個域，即集合域，負責其組蛋白H3賴氨酸4（H3K4）甲基轉移酶活性，介導與表觀遺傳轉錄激活相關的染色質修飾。這種蛋白由酶Taspase 1加工成兩個片段，MLL-C和MLL-N。這些片段重
組蛋白修飾基因通路KDM6A基因
該基因位于X染色體上，是編碼四肽重復序列（TPR）蛋白的Y連鎖基因的相應位點。該基因的編碼蛋白包含一個JMJC結構域，并催化三/二甲基化組蛋白H3的去甲基化。已發現該基因的多個選擇性剪接轉錄變體。
組蛋白修飾基因通路EP300基因
該基因編碼腺病毒E1A相關的細胞p300轉錄輔激活蛋白。作為組蛋白乙酰轉移酶，通過染色質重塑調節轉錄，在細胞增殖和分化過程中起重要作用。通過與磷酸化CREB蛋白特異性結合來介導cAMP基因調控。該基因也被鑒定為HIF1A（缺氧誘導因子1α）的共激活物，因此在缺氧誘導基因如VEGF的刺激中起到作用。這
組蛋白修飾基因通路HDAC2基因
該基因產物屬于組蛋白脫乙酰基酶家族。組蛋白脫乙酰基酶通過形成大的多蛋白復合物起作用，并負責核心組蛋白（H2A、H2B、H3和H4）N端賴氨酸殘基的脫乙酰化。這種蛋白通過與許多不同的蛋白質結合形成轉錄抑制復合物，包括哺乳動物鋅指轉錄因子YY1。因此，它在轉錄調控、細胞周期進展和發育事件中起著重要作用。
組蛋白修飾基因通路KAT6A基因
該基因編碼組蛋白乙酰基轉移酶的MOZ，YBFR2，SAS2，TIP60家族的成員。 該蛋白質由核定位域，與乙酰化組蛋白尾巴結合的雙C2H2鋅指結構域，組蛋白乙酰轉移酶域，富含谷氨酸/天冬氨酸的區域以及富含絲氨酸和蛋氨酸的反式激活域組成。 它是乙酰化組蛋白3中賴氨酸9殘基的復合物的一部分，此外，它還充
組蛋白修飾基因通路KMT2D基因
這個基因編碼的蛋白質是組蛋白甲基轉移酶，它甲基化組蛋白H3的Lys-4位置。編碼蛋白是一種叫做抗壞血酸的大蛋白復合物的一部分，它被證明是β-珠蛋白和雌激素受體基因的轉錄調節器。這種基因的突變被證明是導致歌舞伎綜合征的原因。
與組蛋白修飾相關因子介紹MEn1
這個基因編碼腦膜，一種與多發性內分泌腫瘤1型綜合征相關的假定的腫瘤抑制因子。體外研究表明，腦膜定位于細胞核，具有兩種功能性核定位信號，并通過JUND抑制轉錄激活，但這種蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上檢測到兩條信息，但未對較大的信息進行描述。選擇性剪接導致多個轉錄變體。This
與組蛋白修飾相關因子介紹KAT6A
該基因編碼組蛋白乙酰基轉移酶的MOZ，YBFR2，SAS2，TIP60家族的成員。 該蛋白質由核定位域，與乙酰化組蛋白尾巴結合的雙C2H2鋅指結構域，組蛋白乙酰轉移酶域，富含谷氨酸/天冬氨酸的區域以及富含絲氨酸和蛋氨酸的反式激活域組成。 它是乙酰化組蛋白3中賴氨酸9殘基的復合物的一部分，此外，它還充
與組蛋白修飾相關因子介紹BRD4
該基因編碼的蛋白質與小鼠蛋白MCAP（有絲分裂過程中與染色體相關）和人類Ring3蛋白（絲氨酸/蘇氨酸激酶）同源。每一種蛋白質都包含兩個溴域，一個保守的序列基序，可能參與染色質靶向。該基因被認為是T（15；19）易位的19號染色體靶基因（q13；p13.1），它定義了年輕人的上呼吸道癌。已經描述了兩
與組蛋白修飾相關因子介紹EZH2
EZH2基因編碼的是一種組蛋白賴氨酸N-甲基轉移酶，參與DNA甲基化從而抑制其他基因轉錄，EZH2也可甲基化組蛋白H3第27位賴氨酸。EZH2的甲基化活性促進異染色質的形成從而使基因沉默，是PRC2復合物的組分之一。EZH2的突變或者過表達與多種類型癌癥相關，如乳腺癌、前列腺癌、黑色素瘤和膀胱癌等。
與組蛋白修飾相關因子介紹HDAC1
多亞基復合物催化的組蛋白乙酰化和脫乙酰化在調節真核基因表達中起關鍵作用。 該基因編碼的蛋白質屬于組蛋白脫乙酰基酶/ acuc / apha家族，是組蛋白脫乙酰基酶復合物的組成部分。 它還與視網膜母細胞瘤腫瘤抑制蛋白相互作用，這種復合物是控制細胞增殖和分化的關鍵因素。 它與轉移相關蛋白2一起使p53脫
組蛋白修飾基因通路KMT2C基因
該基因是髓系/淋巴系或混合系白血病（MLL）家族的成員，編碼核蛋白，具有AT-Hook DNA結合域、DHHC型鋅指、六個PhD型鋅指、一個集合域、一個后集合域和一個環狀鋅指。該蛋白是ASC-2/NCOA6復合物（ASCOM）的成員，具有組蛋白甲基化活性，參與轉錄協同激活。
我國學者在組蛋白修飾領域取得進展
圖 Menin在核小體環境下識別H3K79me2的示意圖 在國家自然科學基金項目（批準號：21922708）資助下，香港大學李祥教授團隊在表觀遺傳領域取得新進展，破解了組蛋白H3賴氨酸79二甲基化（H3K79me2）修飾的表觀遺傳密碼，相關成果以“Menin在核小體環境中‘讀取’H3K79me2標