GenBank數據庫功能為一、提交獲取的基因序列;二、查找已知基因的序列生物學特性信息,例如編碼區,科學命名等。那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢? GenBank數據庫起源 GenBank數據庫是1982年由美國國立生物技術信息中心(NCBI)建立并維護的綜合性序列數據庫。大約每2個月會更新一次版本,截止到2004年9月最新的版本是Release143,共有37,343,937 條序列紀錄,大約包含了來源于約140,000個物種 的41,808,045,653個堿基。所有數據記錄被劃分在若干個文件里,如細菌類、病毒類、靈長類、嚙齒類,以及 EST 數據、基因組測序數據、大規模基因組序列數據等 16 類,其中 EST 數據等又被各自分成若干個文件。它的數據直接來源于測序工作者提交的序列;由測序中心提交的大量EST序列和其它測序數據;以及與其它數據機構協作交換數據......閱讀全文
實驗概要植物生物學研究數據庫實驗步驟http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英國 Top 植物種的snoRNA基因數據庫。 綜合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt
相關專題隨著ncbi 數據庫各種資源的涌現,NCBI已經成為科研工作者必不可少的資料查找,數據分析的工具。那么NCBI數據如何使用,新手入門一步一步教你認識和使用NCBI數據庫。一 綜合數據庫NCBI數據庫集美國國立生物技術信息中心(National Center for Biotechnology
6 基因組信息6.1 數據庫6.1.1 Entrez GenomeEntrez Genome數據庫收錄了850多種微生物、3100多種病毒以及1600多種真核生物細胞器的完整基因組數據以及將近50種動物、綠色植物和真菌的700多條染色體信息,總共收錄有6200多條序列,其中有882條是去年新增的序列
一蛋白質數據庫 1.UniProt (The Universal Protein Resource) 網址:http://www.uniprot.org/ http://www.ebi.ac.uk/uniprot/ 簡介:由EBI(歐洲生物信息研究所)、PIR(蛋白信息資源)和SIB(瑞
由于學術資源數據庫與學術期刊簽署“獨家協議”,為了查閱一個特定的學術期刊,讀者往往只能去購買那個特定的數據庫。難題隨之而來:各個數據庫分割了同一領域的學術期刊,各個都有自己的“獨家”,財力有限,該買誰? 讀者來信 “獨家協議”不利于學術交流 網絡的普及與發展,為科學研究學術資源
誰動了我的DNA? 藏匿20多年的連環殺手最終被警方抓捕,DNA數據庫在此過程中大顯神威。然而另一方面,警方采集和利用DNA數據的情況已經發生了巨大變化,無辜大眾的自由和隱私正受到越來越嚴重的威脅。為了保護海量DNA數據不被濫用,必須制定一系列法規了。 20世紀80年代中以來,一個連
分析測試百科網訊 2016年5月5日,SCIEX和上海詩丹德生物技術有限公司于上海博雅酒店聯合發布了中藥質譜數據庫(相關鏈接:SCIEX與詩丹德聯合發布中藥質譜數據庫)。據悉這款中藥質譜數據庫歷時兩年才完成,包含2萬2千多個天然產物的一級質譜數據庫,同時在《中國藥典》2
日前,國土資源部辦公廳發布《關于加快開展基本農田數據庫建設的通知》(以下簡稱《通知》),力圖進一步加快基本農田數據庫建設,提升基本農田管理效能,實現以圖說數、以圖管地的目標。近日,國土資源部耕地保護司有關負責人結合當前正在開展的基本農田劃定工作,就基本農田數據庫建設的背景、工作要求等進行了解答。
常用生物軟件(windows)全面介紹一、基因芯片1、基因芯片綜合分析軟件。 ArrayVision 7.0 一種功能強大的商業版基因芯片分析軟件,不僅可以進行圖像分析,還可以進行數據處理,方便protocol的管理功能強大,商業版正式版:6900美元。 Arraypro 4.0
科技部關于發布科技基礎資源調查專項2018年度項目指南的通知國科發基〔2017〕380號國務院各有關部門科技主管司局,各有關單位: 根據中央財政科技計劃(專項、基金等)管理改革的總體要求,科技部、財政部按照需求導向和分類整合的原則,在原“科技基礎性工作專項”基礎上,重新整合設立“科技基礎資源調查”
隨著電力體制改革的深人開展,廠網分開、競價上網己經成為必然的發展趨勢。這就要求各電廠必須重視整合企業現有的軟硬件資源,在整個電廠范圍內實現信息共享,做到管控一體化。而目前電廠中的分布式控制系統DCS(Distributed Control System)等往往將數據分散在不同的計算機或控制系統
自20世紀80年代起,質譜技術就已經成為科學研究中用于蛋白分析的強大工具。隨著技術的不斷成熟和廣泛使用,其在微生物檢驗常規診斷中的作用越來越受到關注,基質輔助激光解析電離飛行時間質譜技術(matrix-assisted laser desorption/ionization-time of fl
抗原表位預測適用于已知一級結構的蛋白質或多肽抗原的線性表位的預測。人們通過觀察抗原表位與已知氨基酸序列的蛋白質某些結構特征關系,發現一些蛋白質的序列或結構特征與抗原表位有關。在抗原抗體的結合反應中,抗原參與結合的部位稱為 B 細胞抗原決定簇或者表位。從空間結構上看,B 細胞表位可分為線性表位(也
EMBL數據庫結構EMBL數據庫的基本單位也是序列條目,包括核甘酸堿基排列順序和注釋兩部分。序列條目由字段組成,每個字段由標識字起始,后面為該字段的具體說明。有些字段又分若干次子字段,以次標識字或特性表說明符開始,最后以雙斜杠“//”作本序列條目結束標記。條目的關鍵字包括ID(序列名稱),DE(序列
實驗步驟:3.1 PROTICdb 概述在輸入或瀏覽數據時,每個最終用戶需要一個 PROTICdb 賬戶(由您的管理員創建 ) 。作為一個新用戶,首先要創建一個新的項目。一旦建立,該項目就屬于這個用戶,這個用戶有權授予其他用戶訪問權限。為確保數據一致性的精確度,盡量不要用手動輸入操作。因此,
儀器、耗材DBMS實驗步驟3.1 PROTICdb 概述在輸入或瀏覽數據時,每個最終用戶需要一個 PROTICdb 賬戶(由您的管理員創建 ) 。作為一個新用戶,首先要創建一個新的項目。一旦建立,該項目就屬于這個用戶,這個用戶有權授予其他用戶訪問權限。為確保數據一致性的精確度,盡量不要用手動輸入操作
代謝組主要是對小分子代謝物(一般50-1500 Da)進行高通量定性和定量分析,代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據,方便后續的代謝組學數據分析,揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD
安捷倫-詩丹德標準天然產物高分辨率質譜標準圖譜庫發布 分析測試百科網訊 2019年6月28日,世界中聯中藥分析專業委員會第十屆學術年會在上海召開。本次會議上,安捷倫科技公司(以下簡稱“安捷倫”)與上海詩丹德標準技術服務有限公司(以下簡稱“詩丹德”)聯合發布針對中藥藥效物質基礎研究的標準天然產物
“圖書館訂購的‘中國期刊網’(中國知網)系列數據庫2015年合同期已到,由于數據庫商漲價過高,圖書館目前正在全力與對方進行2016年的續訂談判,上一年度合同截止到2016年3月31日,期滿后數據庫商隨時可能中斷北大的訪問服務。”3月31日,北京大學官網上貼出中國知網(以下簡稱“知網”)即將停用的
第六節 自動化技術在微生物檢驗中的應用 微生物鑒定的自動化技術近十幾年得到了快速發展。數碼分類技術集數學、計算機、信息及自動化分析為一體,采用商品化和標準化的配套鑒定和抗菌藥物敏感試驗卡或條板,可快速準確地對臨床數百種常見分離菌進行自動分析鑒定和藥敏試驗。目前自動化微生物鑒定和藥敏分析系統已在世界
第六節 自動化技術在微生物檢驗中的應用 微生物鑒定的自動化技術近十幾年得到了快速發展。數碼分類技術集數學、計算機、信息及自動化分析為一體,采用商品化和標準化的配套鑒定和抗菌藥物敏感試驗卡或條板,可快速準確地對臨床數百種常見分離菌進行自動分析鑒定和藥敏試驗。目前自動化微生物鑒定和藥敏分析系統已
Web of ScienceTM核心合集作為全球權威的學術信息數據庫,50多年來一直遵循嚴格的選刊標準,遴選全球最具學術影響力的高質量期刊。 Web of ScienceTM核心合集的四大期刊庫分別是:1、Science Citation Index Expanded (科學引文索引):收錄了
為加強第二代測序技術檢測試劑的規范和指導,進一步保證和提高相關產品的質量,8月8日,中國食品藥品檢定研究院(中檢院)組織制定了《第二代測序技術檢測試劑質量評價通用技術指導原則》(下稱《指導原則》)。 該文件是中檢院發布的首個質量評價技術指導原則,旨在對產品設計、研發及驗證的各關鍵環節進行規范,
科技部關于發布科技基礎資源調查專項2016年度項目指南的通知國科發基〔2016〕228號國務院各有關部門,軍委科技委: 根據中央財政科技計劃(專項、基金等)管理改革的總體要求,科技部、財政部按照需求導向和分類整合的原則,在原“科技基礎性工作專項”基礎上,重新整合設立“科技基礎資源調查”專項。現將
基因表達譜 的發展有助于科研工作人員進一步的理論知識充實及應用到研發等領域中。基因芯片是最近幾年發展起來的基因表達重要工具,本文主要對這種技術的數據分析和管理方法作具體介紹。一、引言DNA微陣列(DNA microarray),也叫基因芯片,是近幾年發展起來的一種能快速、高效檢測DNA片段序列、基因
大規模基因組測序計劃的實施已改變生命科學的重心,在相當短的時期內,一些原核生物和某些低等真核生物的基因組序列已被測定. 1995年,流感嗜血桿菌基因組序列首次被破譯,在此后不到兩年的時間,近50個細菌的基因組序列已被完成. 然而,這僅僅是理解有機物功能的一個起點. 在基因組時代,許多DNA序列信息僅
3 蛋白質組技術的支柱---鑒定技術(Identification) 如果目前分離蛋白質組的最好技術是2-DE,那么隨之而來的挑戰是數百數千個蛋白如何被鑒定. 在這里,我們不考慮傳統的蛋白鑒定方法,如免疫印跡法、內肽的化學測序、已知或未知蛋白的comi
采用UNIFI鑒定綠茶提取物中的化學成分 本文介紹了使用以超高效液相色譜(UPLC?),四級桿飛行時間質譜(QTof MS)以及中藥數據庫為基礎的UNIFI?天然產物解決方案分析綠茶中化學成分的方法。方法將實驗采集、數據處理與中藥數據庫的導入有機結合起來, 使得復雜中藥體系中化學組分的定性
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1資金困境 作為世界上最具權威性的人類疾病相關的基因目錄第五十個生日時,它面臨著令人不安的變化。在接下來的幾年里,美國國家人類基因組研究所(NHGRI)預計退出作為基因組數據庫的始祖——稱為在線人類孟德爾遺傳(OMIM)唯一的資助者。誰將繼承標簽尚未明確。當美國國家衛生研究院(NIH)評估其數