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  • 單細胞基因組,一個新時代的到來

    單細胞基因組旨在通過組學方法研究單個細胞。近年來隨著技術的發展,這一年輕的領域正在迅速成熟起來。單細胞基因組研究的前身可以追溯到用芯片檢測單細胞的基因表達。不過,新一代DNA測序才是單細胞基因組學的大功臣,這些技術的出現讓單細胞基因組研究最終一飛沖天。 2012年7月,Nature Biotechnology雜志發表了具有里程碑意義的單細胞測序方法——Smart-Seq。Smart-Seq能夠覆蓋整個轉錄組生成全長cDNA,就算是現在,能做到這一點的單細胞測序方案也寥寥無幾。那幾年,許多研究者們都在埋頭改進各種單細胞測序技術的精確性和應用范圍,增加研究通量和減少實驗成本。 百花齊放的單細胞分析技術 如今,單細胞RNA-seq已經成為了成熟的日常操作,其他形式的單細胞分析開始百花齊放,包括DNA、蛋白質、染色質修飾等等。 單細胞DNA測序 單細胞全基因組DNA測序是一項富有挑戰性的工作,因為材料損失會導致序列丟失,測......閱讀全文

    當宏基因組遇上單細胞測序

      日前,科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。  16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性,但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上,研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本

    Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序

    2018年11月,Namocell與CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞,并且將其進行單細胞測序,為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序(scRNA-s

    對瘧原蟲的單細胞基因組測序

      美國圣安東尼奧,2014年5月8日——美國德克薩斯生物醫學研究所的科研人員和他們的同事開發出了一種分離單個瘧原蟲細胞然后對其基因組測序的新方法。這一進展將讓科學家能夠改進他們識別病人感染的多種類型的瘧原蟲的能力,而且還可帶來最佳的經設計的藥物何疫苗以應對這種主要的全球性殺手。瘧疾仍然是全世界最致

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。

    Nature:單細胞測序(下)

      隨著技術的飛速發展,成本大大降低,使得基因組測序成為常規技術。然而,大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序,它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。   該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序,研究小

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    Nature:單細胞測序(上)

      Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年,冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織,一并將這些DNA進行測序,生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序

    單細胞測序方法匯總

    單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整

    單細胞測序推進了基因組的發展領域

    單細胞測序能夠幫助我們了解那些難以培養的微生物的基因組功能、了解遺傳鑲嵌功能在普通生物學功能或是疾病發生中的作用、腫瘤內在異質性對腫瘤發展以及耐藥性的影響、重新定義細胞亞型等等。  單細胞測序可以揭示出每個細胞獨特的微妙變化,甚至可以揭示全新的細胞類型,測序技術可謂是科技發展的一大創舉,它推進了基因

    謝曉亮:單細胞全基因組測序曙光初現

      ?謝曉亮  12月21日出版的美國《科學》雜志發表了題為《單細胞全基因組測序探索精子重組規律和遺傳缺陷》的論文。同時,該期《科學》雜志也將單細胞全基因測序列為2013年六大值得關注的科學領域之一。  該論文由美國科學院院士、哈佛大學教授謝曉亮課題組與北京大學生物動態光學成像中心(

    單細胞基因組測序:從實驗到分析,步步解析

    隨著生命科學研究的微觀化,基于細胞群體的研究方法已不適用于某些研究領域(如腫瘤異質性、早期胚胎發育等)。單細胞基因組測序通過在單個細胞水平上進行測序,解決了用組織樣本無法獲得不同細胞間的異質性信息或樣本量太少無法進行常規測序的難題,為科學家研究單個細胞的行為、機制等提供了新的方向。【應用概覽】從20

    單細胞測序需要準備什么再去測序

    DNA測序的測序原理: DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)與鳥嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。

    單細胞分離對單細胞測序領域有著很大的幫助

     單細胞分離可以采用特制的毛細管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來,然后移到合適的培養基進行培養,分離法對操作技術有比較高的要求,多限于高度專業化的科學研究中采用。  它不僅僅可以用于分離單細胞,還可以用于nl級別試劑的分配和磁珠的分選,對于單細胞測序領域有著很大的幫助。快速高效接種單個活細胞

    Namocell單細胞分離儀在單細胞測序領域的應用

    9月26至27日2019年細胞產業大會暨2019第四屆(上海)細胞與腫瘤醫療高峰論壇在上海新南雅酒店舉行。本屆會議,邀請了全國30位專家學者、人物演講、40家企業參展,400余人報名參會,逾500人參加了會議,就細胞儲存、細胞治療、細胞培養、細胞工程、細胞銀行、細胞能量與代謝、細胞免疫學、細胞生理學

    單細胞分離儀在單細胞測序領域有著很大的幫助

    ???單細胞分離儀可以實現從微孔芯片轉移單細胞到細胞收集管中。單細胞轉移分離系統集單細胞成像,單細胞隔離,單細胞選擇功能于一體,自動聚焦成像。? ? 轉移單細胞到微管,PCR微孔板或其它反應微管中,在隔離單細胞后,它可以對選定收集的細胞進行掃描并成像,采用倒置熒光顯微鏡,配備自動掃描顯微鏡載物臺,自

    單細胞基因組測序測的是什么dna還是rna

    深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列,如測序前將dna打成小的片段,測序是從這個片段的兩端測的,即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組,這要看你做什么了,一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉,這其實要看你想做什么分析,如做轉

    單細胞基因組測序測的是什么dna還是rna

    深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列,如測序前將dna打成小的片段,測序是從這個片段的兩端測的,即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組,這要看你做什么了,一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉,這其實要看你想做什么分析,如做轉

    單細胞基因組測序測的是什么dna還是rna

    深度測序的read指的是高通量中雙端測序得到的一條條序列,如測序前將dna打成小的片段,測序是從這個片段的兩端測的,即會產生兩條reads。至于是mapping到基因組還是dna基因組,這要看你做什么了,一般基因組是指生物個體的全基因組。并不是所有測序都要rna反轉,這其實要看你想做什么分析,如做轉

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

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    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    如何讓單細胞測序變得簡單?

    單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且最前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整

    Fluidigm推出單細胞TCR測序產品

      解析細胞表型是免疫學中一個共同的單細胞分析目標。然而,T細胞受體V(D)J基因區域的隨機重排帶來了T細胞群體的復雜變化。這形成了龐大的T細胞部隊,以便識別特定的外源蛋白,引發有效的免疫反應。  為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析,Fluidigm近日在C1?系統上推出了一個全新的免疫學應用 –

    !單細胞測序的”CPU-2.0”時代

      對單個人類細胞的基因組進行準確的變異檢測和大范圍單倍體型分析一直以來都是測序領域的巔峰挑戰。單細胞測序使我們能在更高的分辨率下研究生命的機制。一方面,在像癌癥這樣的組織樣本中存在大量具有不同基因組類型的單個細胞,因此需要分析單細胞水平基因組而不是大量細胞的平均值;另一方面,對于非常珍貴的細胞樣品

    漫談單細胞測序及其臨床應用

    一、概述隨著現代生物學的發展,細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題,為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。單細胞測序正在成為科研熱點。二、單細胞測序倍受青睞的原因人們最初以為一個細胞類群是均質的(即各細胞都是

    華人學者Nature子刊單細胞基因組測序新突破

      在加州大學圣地亞哥分校生物工程師們的領導下,研究人員生成了來自單個大腸桿菌細胞以及人類大腦單個神經元的最完整基因組序列。采用一項新的單細胞基因組測序技術,他們在只有12納升體積、充滿液體的小孔中完成了基因組擴充,從而獲得了這一突破性的成果。該項研究發表在11月10日的《自然生物技術》(Natur

    單細胞基因組測序如何實現:從實驗到分析,步步解析

      隨著生命科學研究的微觀化,基于細胞群體的研究方法已不適用于某些研究領域(如腫瘤異質性、早期胚胎發育等)。單細胞基因組測序通過在單個細胞水平上進行測序,解決了用組織樣本無法獲得不同細胞間的異質性信息或樣本量太少無法進行常規測序的難題,為科學家研究單個細胞的行為、機制等提供了新的方向。  【應用概覽

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