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    當宏基因組遇上單細胞測序

    日前,科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性,但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上,研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本(北美和亞洲)中發現的一類新細菌Candidatus Kryptonia。這項研究共測序了22個Kryptonia基因組。 基因組分析顯示,Kryptonia屬于擬桿菌門。擬桿菌門的成員一般生存在腸道或海洋中,而Kryptonia是其中首個極端嗜熱菌。研究人員指出,Kryptonia可能是通過水平基因轉移從古生菌獲得這種能力的。 16s rRNA檢測無法發現這種細菌,這是因為在通用引物的結合處發生了刪除事件。Nikos Kyrpides領導團隊通過宏基因組測序和單細胞測序證實了這種細菌的存在,并將其命名為Kryptonia。 研......閱讀全文

    作物基因組學研究進展

      摘要:農作物基因組學研究的發展,對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展,已經實現對重要農作物,如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序,在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了2017年度主要農作物基因組

    第七屆國際基因組學大會在香港成功召開

      2012年11月29日至12月1日,為期三天的第七屆國際基因組學大會暨2012年亞太區生物信息學峰會在香港九龍成功召開。本次會議由華大基因主辦,《GigaScience》雜志協辦。來自全球300多名專家學者云集香港,共同探討了基因組學、生物信息學、云計算、生物倫理等研究領域內的最新進展,并深入探

    第七屆國際基因組學大會在香港成功召開

      2012年11月29日至12月1日,為期三天的第七屆國際基因組學大會暨2012年亞太區生物信息學峰會在香港九龍成功召開。本次會議由華大基因主辦,《GigaScience》雜志協辦。來自全球300多名專家學者云集香港,共同探討了基因組學、生物信息學、云計算、生物倫理等研究領域內的最新進展,并深入探

    “十二五”國家計劃農村領域2013年度備選項目征集

      為深入貫徹《國家中長期科學和技術發展規劃綱要(2006-2020年)》和2012年中央一號文件精神,做好2013年農村領域備選項目公開征集工作,按照科技部關于《農村領域國家科技計劃管理改革暫行辦法》,制定本指南。   一、推薦領域與方向   專題1:生物種業   (一)研究方向:超級稻新品

    于軍:從人類基因組計劃到精準醫學

      基因產業正受到前所未有的重視。今年,精準醫學不僅被納入“十三五”規劃,作為精準醫學的“排頭兵”,基因組學也被納入“十三五”百大項目名單,要“加速推動基因組學等生物技術大規模應用”。  對著名基因組學專家、中國基因組學奠基人于軍教授來說,基因組學引領的技術應用得到如此重視,既讓他感到欣慰———20

    于軍:人類基因組計劃是我的生命

            于軍,紐約大學醫學院生物醫學科學博士,師從臺灣中研院院士孫同天教授;博士后研究追隨美國“人類基因組計劃”的領導者和設計者之一,著名基因組學家、美國科學院院士Maynard V.Olson。  1993年,于軍參與“

    基因組學推動生命科學大步向前

      2010年下旬,河南安陽曹操墓真偽之辯正酣。而一則來自上海的重磅消息更是引發了多方關注。復旦大學現代人類學教育部重點實驗室宣布,向全國征集曹姓男性DNA樣本,擬用基因組科學的手段驗證出土的頭骨是否為曹操本人。   一下子,基因組科學成為熱門,這一話題“落入尋常百姓家”。   事實上,伴隨著2

    我國科學家首提“人類泛基因組”

    人類基因組存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因   經過不懈研究和攻關,我國科研人員在人類基因組研究中獲得新的重大進展――發現人類基因組中存在著種群特異甚至個體獨有的DNA序列和功能基因。科研人員還首次提出了“人類泛基因組”的概念。   由深圳華大基因研究院領銜,華南理工大學參與的研

    首屆國際基因組學大會美洲分會在費城成功召開

      2012年9月27日至28日,為期兩天的首屆國際基因組學大會美洲分會(The International Conference on Genomics in the Americas,ICG Americas 2012)在美國費城兒童醫院(CHOP)成功召開。本次會議由華大基因與費城兒童

    學科發展帶來的新趨勢對生物學家意味著什么

       作為生命科學領域最新的分支學科,基因測序等新的生物醫學技術正在顛覆傳統的生物學研究方法。海量的數據處理正在把生物學家們的工作從實驗臺上拉向電腦旁。如今,全世界的生物學家不得不承認這樣一種現實:要想成為一名生物學家,你還得是個統計學家,甚至是程序員。你得會寫算法才行。  學科發展帶來的新趨勢對生

    作物基因組學研究進展(一)

    作物基因組學研究進展農作物基因組學研究的發展,對于有效利用現代分子生物學手段進行物種的遺傳改良發揮了重要作用。隨著測序技術的發展,已經實現對重要農作物,如水稻、小麥、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因組的測序或重測序,在此基礎上完成對控制重要農藝性狀基因的克隆和鑒定。本文綜述了2018年度主要農

    華大基因從1%到中國人的個體化基因組研究

      自1999年中國作為唯一的一個發展中國家加入人類基因組計劃,到目前為止,已經獨立完成了水稻和家蠶等大型基因組研究,并參與了家雞、家豬、木瓜等多個重要動植物基因組圖譜制作,在2007年還首次向世界公布了第一個中國人的個體化基因組序列。   中國雖然在這一領域起步較晚,但發展迅猛……   在深圳

    DNA測序技術的現狀和發展(四)

    1.1.3.2 模板制備程序完全的體外大規模模板制備工作是達成高通量、低價格測序技術的前提。已廣泛使用的乳液PCR擴增技術就是一種很好的方法。不過,由于很難在熱循環測序反應中保證乳液微滴的穩定性,因此最開始實驗的模板擴增方法是恒溫擴增法(isothermal)。乳液PCR不需要借助細菌的幫助就能擴增

    中國科學家繪制小麥A、D基因組草圖

      作為世界三大糧食作物之一,小麥養活了全球40%的人口,提供人類營養所需的20%的熱能和蛋白質。   隨著基因組學的發展,水稻和玉米的基因組相繼被破譯,但關于小麥基因組的測序研究依然困難重重、進展緩慢,小麥基因組成了橫在科學家面前的一座大山。   中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工

    陳潤生: 當選院士意味承擔更大責任

    面對新當選中國科學院院士的耀眼頭銜,中國科學院生物物理研究所研究員陳潤生并沒有想象中的激動,而是心態平和地接受了《科學時報》記者的采訪。 “我想我這次能夠當選院士主要是評審專家對我兩方面工作的肯定。”陳潤生謙和地告訴記者,“一是我長期堅持在生物信息學方面進行研究,對基因組的研究作出了一定的

    基因組所國際合作項目椰棗基因組測序及功能研究獲進展

      最近,由中國科學院北京基因組研究所與沙特阿卜杜拉國王科技城(King Abdulaziz City for Science and Technology, KACST)共同啟動的合作項目“棗椰 (Phoenix dactylifera L.)基因組計劃”獲得系列進展,本月初其標志性研究—

    我國科學家完成鯉魚全基因組序列圖譜繪制

       近日,由中國水產科學研究院首席科學家孫效文牽頭,中國水產科學研究院聯合黑龍江水產研究所、中科院基因組研究所、哈佛大學、奧本大學等單位組建的國際合作研究團隊,完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪制,在國際上首個完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜。該研究成果于9月21日在國際生物學權威期刊《自然—

    華大智造測序儀進駐泰國國家基因工程和生物工程中心

      2019年8月5日,華大智造基因測序儀MGISEQ-2000RS 在泰國國家基因工程與生物工程中心(BIOTEC) 基因組研究實驗室正式裝機,標志著華大智造測序平臺首次在泰國國家級研究機構投入使用。這是華大智造測序儀走出國門的夯實一步,截止目前全球已有22個國家使用華大智造測序儀,這也將進一步助

    Nature 表觀遺傳學進展將遺傳學、環境與疾病聯系了起來!

      21世紀,表觀遺傳學的研究得到了快速發展,同時其產生了讓研究人員感興趣和憧憬的東西,當然了,這其中也存在一些大肆宣傳的成分,本文中,我們回顧了表觀遺傳學在過去幾十年里是如何演變的,同時分析了近年來改變科學家們對生物學理解的一些研究進展;我們討論了表觀遺傳學和DNA序列改變之間的相互作用,以及表觀

    NIH出資$3.13億用于疾病基因組測序研究

      美國國立衛生研究院(NIH)將資助一些基因組測序分析中心,致力于破解人類常見病和罕見病的基因信息。NIH下屬的國家人類基因組研究所(NHGRI)14日宣布成立“常見疾病基因組學中心(CCDG)”,該中心將利用基因組測序技術,從基因水平研究心臟病、糖尿病、中風以及自閉癥等常見疾病產生的原因。NHG

    研究解開冬瓜“保守”的秘密

      幾千年前,我們的祖先吃的蔬菜水果可沒有現在這么豐富多樣。  葫蘆科作物的千變萬化更是印證了這一點。很難想象,冬瓜、黃瓜、甜瓜、西瓜、葫蘆、南瓜、絲瓜等葫蘆科作物有著一個共同的祖先,是什么導致他們在歷史長河里發展成不同形態大小和風味的?科學家們對此產生了濃厚的興趣。  探究葫蘆科作物“變異”的脈絡

    中國科學家成功破譯樹鼩基因組

      2013年2月6日,中科院昆明動物所、深圳華大基因研究院等單位對樹進行了全基因組測序,并對其分類地位和相關生物學特征進行了深度解析。樹基因組的完成,將為其在生物醫學研究中用作動物模型奠定重要的遺傳學基礎,進而使其更好的應用于生物醫藥研究。研究成果在《自然?通訊》(Nature Communi

    人工合成4條酵母染色體我國科學家開啟“再造生命”新紀元

      大姑娘出嫁——頭一回!3月10日出版的國際頂級學術期刊《科學》,以封面的形式同時刊發了中國科學家的4篇研究長文!  由天津大學、清華大學和華大基因分別完成的這4篇長文,介紹了真核生物基因組設計與化學合成方面的系列重大突破:完成了4條真核生物釀酒酵母染色體的從頭設計與化學合成——要知道,釀酒酵母總

    從砍柴割草到“編寫生命密碼”——記基因組學家楊煥明院士

      在世界上首次利用全基因組“霰彈法”策略對大型植物基因組進行測序,獨立完成超級雜交水稻父本秈稻“9311”基因組的“工作框架圖”;在抗擊非典行動中研制了SARS的診斷用抗原、抗體和相關標記物,并在全球首個公布SARS診斷試劑……  他,就是中國科學院院士、深圳華大基因研究院研究員楊煥明,一名從砍柴

    楊煥明院士:曾在全球首個公布SARS診斷試劑

       在世界上首次利用全基因組“霰彈法”策略對大型植物基因組進行測序,獨立完成超級雜交水稻父本秈稻“9311”基因組的“工作框架圖”;在抗擊非典行動中研制了SARS的診斷用抗原、抗體和相關標記物,并在全球首個公布SARS診斷試劑……  他,就是中國科學院院士、深圳華大基因研究院研究員楊煥明,一名從砍

    精準醫學:是變革,還是新壺裝舊酒?

      2015年1月20日,美國總統奧巴馬在美國國會作國情咨文報告時提出精準醫學一詞,迅速成為新年伊始世界各國關注的熱點。很多人不禁要問,奧巴馬口中的精準醫學長什么樣子?為什么要在這個時候啟動精準醫學計劃?精準醫學的概念不是美國總統奧巴馬首次提出的,卻因他的大名而成為2015年醫學界最熱的關鍵詞。今年

    精準醫學:是變革,還是新壺裝舊酒

      精準醫學的概念不是美國總統奧巴馬首次提出的,卻因他的大名而成為2015年醫學界最熱的關鍵詞。今年,各種形式的醫學學術會上,精準醫學都成為必不可少的“座上賓”。  什么是精準醫學?  ——在生命科學和醫學實踐所處的重要轉折點上應運而生  2015年1月20日,美國總統奧巴馬在美國國會作國情咨文報告

    微縮化技術在宏基因組測序建庫中的應用

    2020年伊始,突如其來的新冠疫情牽動著每個人的心。自武漢衛健委首發肺炎疫情情況通報后的短短一個星期,新型冠狀病毒就在實驗室中被檢出,并獲得了該病毒的全基因組序列。如此快速地確定病原體搶占研究先機,宏基因組測序技術功不可沒。 宏基因組學(Metagenomics),以環境樣品中的微生物群體

    國家重點基礎研究發展計劃09申報指南發布

      科技部基礎研究司日前發布了《關于發布國家重點基礎研究發展計劃(含重大科學研究計劃)2009年度項目申報指南的通知》。   國家重點基礎研究發展計劃是以國家重大需求為導向,對我國未來發展和科學技術進步具有戰略性、前瞻性、全局性和帶動性的基礎研究發展計劃,主要支持面向國家重大需求的基礎研究領域和重

    水稻功能基因組研究:我國要繼續保持領先優勢

      以“水稻功能基因組研究的現狀和未來”為主題的第520次香山科學會議學術討論會近日在北京召開。與會專家就水稻基因組測序及注釋、水稻重要性狀的調控網絡、水稻多組學(表觀組、蛋白組、代謝組、表型組等)研究,以及水稻基因組解析等方面展開了深入的討論。   此次會議由中國科學院院士、華中農業大學教授張啟發

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