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    單細胞基因組測序如何實現:從實驗到分析,步步解析

    隨著生命科學研究的微觀化,基于細胞群體的研究方法已不適用于某些研究領域(如腫瘤異質性、早期胚胎發育等)。單細胞基因組測序通過在單個細胞水平上進行測序,解決了用組織樣本無法獲得不同細胞間的異質性信息或樣本量太少無法進行常規測序的難題,為科學家研究單個細胞的行為、機制等提供了新的方向。 【應用概覽】 從2011年Navin等人將全基因組擴增技術與高通量測序技術結合起來進行乳腺癌細胞研究開始,單細胞基因組測序技術已逐漸被應用于神經科學、生殖系演化、器官發生、腫瘤、臨床診斷、免疫學、微生物學、組織嵌合、胚胎發育以及產前遺傳學診斷等研究領域,并被《自然方法》雜志( Nature Methods )列入2013年度值得期待的技術之一。單細胞測序發展歷程及出版物數量和類目[1]單細胞基因組測序技術被廣泛應用于生物科學和生物醫學領域[1] 【技術流程】 單細胞基因組測序主要包括四個步驟:單細胞分離→全基因組擴增→高通量測序→數據分析......閱讀全文

    【盤點】單細胞測序研究進展一覽

      細胞是生物學的基本單位,近年來研究人員正努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。而應用而生的就是單細胞測序技術,該技術是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。而隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并對逐個細胞進行序列比較已經開始

    Science:宏基因組學測序技術

      宏基因組學技術(Metagenomic approaches)正快速拓寬我們對微生物代謝能力(microbial metabolic potential)的認識。   長期以來,對微生物(microorganism)功能開展的研究主要依賴的都是以在實驗室里培養的單一物種(individua

    單細胞基因組學:通往個體化醫療之門

      隨著第二代測序技術的普及,單細胞測序迎來了迅猛發展。  近日,南方科技大學生物學系副教授賀建奎在美國冷泉港參加了單細胞分析會議后,在科學網博客里寫道:“這是一個非常令人激動的前沿學術會議,我深深地體會到了單細胞基因組學時代的來臨。”  他對《中國科學報》表示:“單細胞基因測序技術的突破,只是開了

    腫瘤基因專家致力挖掘單細胞大數據潛能

      近年來,隨著測序技術的迅猛發展,單細胞測序技術已逐漸走入人們視野。2013年,單細胞測序技術成為《自然》評選的“Method of the Year”。大多數的基于NGS的基因檢測,都是在大量細胞宏觀水平上,對整個細胞群進行遺傳分析。單細胞測序技術則是在單個細胞的水平上,對其遺傳物質進行檢測,從

    安諾攜手居里研究所再登Nature子刊,揭染色體再活化機制

      在雌性哺乳動物胚胎形成過程中,兩條X染色體的其中一條失活,完成劑量補償效應。對于小鼠而言,X染色體失活(XCI)主要分為兩個階段,第一階段父源X染色體(Xp)啟動印記失活,此失活狀態在滋養外胚層細胞(TE)及原始內胚層細胞(PrE)中得以維持,但在囊胚內細胞團(ICM)的外胚層細胞中,Xp會出現

    2017單細胞擴增測序技術的最新進展

      細胞是構成生命體的結構和功能的基本單位,不同類型的細胞形態迥異,功能也各不相同。即使是同類細胞間看似相同,相互間也存在著廣泛的細胞異質性。傳統的群體細胞分析檢測能更快速方便的獲得大量數據并利于進行有效的統計學分析,但是隨著研究的深入,這種基于群體細胞分析所獲得的平均性數據,往往忽略了細胞個體間的

    一文看全!史上59家測序儀公司的“爭霸戰”

      要談測序,首先要向華人生物學家、DNA測序技術的奠基人吳瑞先生致敬。大家大多都聽過桑格,但很少有人知道吳瑞。其實吳瑞早在1968年就發表第一篇論文測定了DNA的堿基組成,1970年的新文章既測定DNA堿基組成又測定出順序,是真正的DNA測序第一人。而在吳瑞先生工作的啟發下,Sanger深入研究,

    單細胞基因組,一個新時代的到來

      單細胞基因組旨在通過組學方法研究單個細胞。近年來隨著技術的發展,這一年輕的領域正在迅速成熟起來。單細胞基因組研究的前身可以追溯到用芯片檢測單細胞的基因表達。不過,新一代DNA測序才是單細胞基因組學的大功臣,這些技術的出現讓單細胞基因組研究最終一飛沖天。  2012年7月,Nature Biote

    單細胞基因測序技術專利布局中的“中國力量”

      高通量單細胞基因測序技術是一項在單細胞水平對全基因組進行擴增與測序的新技術。有關研究顯示,該技術對于篩選新冠病毒特異性中和抗體具有獨特優勢。中和抗體是指當病原微生物侵入機體時,由B淋巴細胞產生的某些抗體;該抗體能夠阻止病原微生物侵入細胞。  3月20日,來自北京知識產權運營管理有限公司(以下簡稱

    Nat Methods: 2014年值得關注的技術

      單細胞測序被評為2013年年度技術   2014 年首刊,《Nature Methods》雜志將2013年度技術(Method of the Year 2013)授予了單細胞測序(single-cell sequencing)。同時,雜志還介紹了2014年值得關注的技術,包括

    謝曉亮院士:單分子技術透視生命之謎

      2012和2013年,由北京大學多個研究團隊合作完成的世界首個高精度人類男性和女性個人遺傳圖譜相關論文相繼發表于《科學》和《細胞》雜志。這一工作采用的單細胞DNA擴增技術MALBAC,與以前的技術相比,該技術將單細胞全基因組測序的精確度大幅度提高,以至于能夠發現個別細胞之間的遺傳差異。  MAL

    北大謝曉亮教授:單分子技術透視生命之謎

    2012和2013年,由北京大學多個研究團隊合作完成的世界首個高精度人類男性和女性個人遺傳圖譜相關論文相繼發表于《科學》和《細胞》雜志。這一工作采用的單細胞DNA擴增技術MALBAC,與以前的技術相比,該技術將單細胞全基因組測序的精確度大幅度提高,以至于能夠發現個別細胞之間的遺傳差

    華人學者Nature子刊單細胞基因組測序新突破

      在加州大學圣地亞哥分校生物工程師們的領導下,研究人員生成了來自單個大腸桿菌細胞以及人類大腦單個神經元的最完整基因組序列。采用一項新的單細胞基因組測序技術,他們在只有12納升體積、充滿液體的小孔中完成了基因組擴充,從而獲得了這一突破性的成果。該項研究發表在11月10日的《自然生物技術》(Natur

    單細胞測序的重要性及應用方向(一)

    單細胞測序研究一直是當今的熱門話題,想知道單細胞技術有哪些重要的應用?想深入了解當今主流的單細胞測序技術嗎?華大智造《單細胞測序技術講堂》開講啦!跟著小造一起尋找這些問題的答案。單細胞測序的重要性隨著第二代測序(next generation sequencing,NGS) 技術和第三代測序(

    單細胞測序技術“遍地開花”,精準醫療“如虎添翼”!

    作者:Carrie  單細胞測序技術  基因測序在體外診斷市場中的重要性日益突出。其中,單細胞測序技術自2009年問世,2013年被Nature Methods評為年度技術以來,越來越多地被應用在科研領域。2015年以來,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、S

    多篇研究共同解讀近期單細胞測序重磅級研究成果

      本文中,小編整理了近年來單細胞測序領域的重磅級研究成果,與大家一起學習!  【1】Cell:開發出空間單細胞測序技術,有助揭示早期乳腺癌產生浸潤性之謎  doi:10.1016/j.cell.2017.12.007  在一項新的研究中,來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的研究人員報道一種新的遺傳

    謝曉亮:單細胞全基因組測序曙光初現

       謝曉亮  12月21日出版的美國《科學》雜志發表了題為《單細胞全基因組測序探索精子重組規律和遺傳缺陷》的論文。同時,該期《科學》雜志也將單細胞全基因測序列為2013年六大值得關注的科學領域之一。  該論文由美國科學院院士、哈佛大學教授謝曉亮課題組與北京大學生物動態光學

    高通量測序技術的原理及各平臺優勢和實踐應用的分析

      隨著人類基因組計劃(human genome project )在2003年順利完成,基因組測序技術取得了長足的進步,這直接導致了每兆基因組成本的大幅下降以及檢測的基因組數量越來越多。人們對基因組的復雜性深感震驚,這也引導著測序技術的進一步發展。最近的一些突破性技術使得測序技術在更短的時間內可以

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    !單細胞測序的”CPU 2.0”時代

      對單個人類細胞的基因組進行準確的變異檢測和大范圍單倍體型分析一直以來都是測序領域的巔峰挑戰。單細胞測序使我們能在更高的分辨率下研究生命的機制。一方面,在像癌癥這樣的組織樣本中存在大量具有不同基因組類型的單個細胞,因此需要分析單細胞水平基因組而不是大量細胞的平均值;另一方面,對于非常珍貴的細胞樣品

    Cell Res重點論文:單細胞表觀多組學測序技術最新突破

      2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

    《自然—方法學》年度方法:單細胞測序

      2014年1月《自然—方法學》(Nature Methods)上發表年度特別報道,將“單細胞測序”(Singled out for sequencing)的應用列為2013年度最重要的方法學進展。   近幾年來,基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展,其成果有望為一些重

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      2017年6月16日,北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

    從人類基因組到人造生命:克雷格·文特爾領路生命科學

      2 Craig Venter挑戰人類基因組計劃    John Craig Venter 出生于1946年,曾應征加入美國海軍醫療隊參加越戰,越南戰場的殘酷使他認識到時間和生命的寶貴,“人生的每一分鐘都應該有所創新”。回國后,Venter僅用了6年時間先后就讀于圣馬特奧學院 (College o

    超1.7億 7大生物醫學“重大研究計劃”2017年度項目指南出爐

      自1月22日以來,國家自然科學基金委員會官網已先后公布了16個重大研究計劃2017年度項目指南,其中與生物醫學相關的共7個。具體如下:  備注:血管穩態與重構的調控機制重大研究計劃擬資助總直接費用并未在指南中直接標出,是根據信息計算所得  何為“重大研究計劃”?  據悉,國家自然科學基金委員會于

    情感和記憶的神經環路基礎重大研究計劃2017年項目指南

      一、科學目標  本重大研究計劃以情感和記憶的神經環路為主要研究內容,充分發揮醫學科學、生命科學和信息科學等學科的特點以及學科交叉的優勢,引入連接組、功能組等系統化的研究理念,結合臨床情感和記憶障礙疾病特點,對情感和記憶(尤其是情感相關的記憶)的神經環路的結構和功能進行定量化描述。  二、核心科學

    科學家分享基因測序技術研發成果

      臨床類   杜克大學分子遺傳學教授David Goldstein   David Goldstein提出運用精準醫學治療神經系統疾病。Goldstein專注于幾個癲癇患者大規模研究的課題,其中包括一項對超過350個患病的兒童及其父母進行測序來發現新突變的項目。盡管許多發現的突變屬罕見突變,但是它

    北大謝曉亮、黃巖誼教授PNAS開發單細胞測序新技術

       來自北京大學的研究人員報告稱,他們開發出了一種基于乳液的擴增方法來抑制擴增偏移檢測單細胞拷貝數變異(CNV),同時以高精確度檢測單核苷酸變異(SNV)。這一方法能夠與各種擴增實驗方案包括廣泛使用的多重置換擴增(MDA)相兼容。這一重要的成果發布在9月4日的《美國國家科學院院刊》(PNAS)上。

    微生物所開發新型微滴反應篩選技術及單細胞分析應用

      微生物所微生物資源前期開發國家重點實驗室杜文斌研究組和黃力研究組共同開發了一種新型的微流控界面納升注射技術(Interfacial Nanoinjection, INJ),該技術可以將傳統的生化反應體系微縮在一個納升體積的油包水微液滴體系中完成。針對這一技術創新,團隊申請了多項中國發明專利和美國

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