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  • 如何讓單細胞測序變得簡單?

    單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且最前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整的新的細胞類型。比如,當來自博德研究所的研究人員Aviv Regev等人利用scRNA-seq對2400個免疫系統細胞進行探查時,他們無意中發現了一些具有潛在T細胞激活活性的樹突狀細胞,Regev表示,一種刺激這些細胞的疫苗或能夠潛在增強機體免疫系統并且保護機體抵御癌癥。當然了,這些發現都是來之不易的,相比大量細胞而言,研究人員很難對單個細胞進行操作,因為每一種細胞僅會產生少量的RNA,對于研究者而言沒有犯錯的余地;另外一個問題就是如何對大量的數據進行分析,最重要的是,研究者使用的工具可能是并不直觀的。一般而言,RNA測序數據......閱讀全文

    單細胞測序需要準備什么再去測序

    DNA測序的測序原理: DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列,也就是腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)與鳥嘌呤的(G)排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    Nature:單細胞測序(上)

      Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年,冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織,一并將這些DNA進行測序,生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。

    Nature:單細胞測序(下)

      隨著技術的飛速發展,成本大大降低,使得基因組測序成為常規技術。然而,大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序,它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。   該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序,研究小

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    單細胞測序方法匯總

    單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整

    如何-解讀-單細胞-測序

    單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組,更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。

    Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序

    2018年11月,Namocell與CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞,并且將其進行單細胞測序,為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序(scRNA-s

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    單細胞測序和轉錄組測序的區別

    單細胞測序不同于傳統的高通量測序,它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序,它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達,能準確區分細胞群體,并進行細胞分類間比較,以及能找到稀有的細胞的表達情況。

    靶向深度測序和單細胞基因測序的區別

    1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序,有效降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序

    靶向深度測序和單細胞基因測序的區別

    1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序,有效降低了測序成本,提高了測序深度,能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序

    如何讓單細胞測序變得簡單?

    單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題,而且最前沿的領域就是單細胞RNA測序了(scRNA-seq)。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序,并給出平均差異,但并沒有兩個細胞是完全一樣的,而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變,甚至這種技術還能夠闡明完整

    Fluidigm推出單細胞TCR測序產品

      解析細胞表型是免疫學中一個共同的單細胞分析目標。然而,T細胞受體V(D)J基因區域的隨機重排帶來了T細胞群體的復雜變化。這形成了龐大的T細胞部隊,以便識別特定的外源蛋白,引發有效的免疫反應。  為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析,Fluidigm近日在C1?系統上推出了一個全新的免疫學應用 –

    !單細胞測序的”CPU-2.0”時代

      對單個人類細胞的基因組進行準確的變異檢測和大范圍單倍體型分析一直以來都是測序領域的巔峰挑戰。單細胞測序使我們能在更高的分辨率下研究生命的機制。一方面,在像癌癥這樣的組織樣本中存在大量具有不同基因組類型的單個細胞,因此需要分析單細胞水平基因組而不是大量細胞的平均值;另一方面,對于非常珍貴的細胞樣品

    漫談單細胞測序及其臨床應用

    一、概述隨著現代生物學的發展,細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題,為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。單細胞測序正在成為科研熱點。二、單細胞測序倍受青睞的原因人們最初以為一個細胞類群是均質的(即各細胞都是

    單細胞分離對單細胞測序領域有著很大的幫助

     單細胞分離可以采用特制的毛細管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來,然后移到合適的培養基進行培養,分離法對操作技術有比較高的要求,多限于高度專業化的科學研究中采用。  它不僅僅可以用于分離單細胞,還可以用于nl級別試劑的分配和磁珠的分選,對于單細胞測序領域有著很大的幫助。快速高效接種單個活細胞

    Namocell單細胞分離儀在單細胞測序領域的應用

    9月26至27日2019年細胞產業大會暨2019第四屆(上海)細胞與腫瘤醫療高峰論壇在上海新南雅酒店舉行。本屆會議,邀請了全國30位專家學者、人物演講、40家企業參展,400余人報名參會,逾500人參加了會議,就細胞儲存、細胞治療、細胞培養、細胞工程、細胞銀行、細胞能量與代謝、細胞免疫學、細胞生理學

    單細胞分離儀在單細胞測序領域有著很大的幫助

    ???單細胞分離儀可以實現從微孔芯片轉移單細胞到細胞收集管中。單細胞轉移分離系統集單細胞成像,單細胞隔離,單細胞選擇功能于一體,自動聚焦成像。? ? 轉移單細胞到微管,PCR微孔板或其它反應微管中,在隔離單細胞后,它可以對選定收集的細胞進行掃描并成像,采用倒置熒光顯微鏡,配備自動掃描顯微鏡載物臺,自

    Nature-methods發布單細胞測序新技術

      來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術,可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。   資深作者Ri

    《自然—方法學》年度方法:單細胞測序

      2014年1月《自然—方法學》(Nature Methods)上發表年度特別報道,將“單細胞測序”(Singled out for sequencing)的應用列為2013年度最重要的方法學進展。   近幾年來,基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展,其成果有望為一些重

    Science:單細胞分析?并行測序技術可以

      近日,一項發表于國際雜志Science上的研究論文中,來自美國的研究者描述了一種新型的大規模并行技術,通過利用新一代測序技術來在單細胞水平上實現對基因表達的監測;研究者表示,單細胞分析對于理解人類造血系統的必要性及重要性不斷凸顯,如果沒有這種分析的話,來自少許細胞的大量表達改變就和來自許多細胞的

    《細胞》:單細胞測序助力基因重組圖譜

      來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了來自一個成人男子91個

    Nature新技術:CRISPR+單細胞測序=?

    CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因組編輯技術是生物研究和新型靶向藥物研發的有力工具。比如利用CRISPR篩選基因(pooled CRISPR screens),可以通過CRISPR gRNAs靶向成百上千個不同的基因,同時編輯許多細胞,然后實驗篩選編輯細胞,gRNA可以幫助確定哪些基因對于生物

    北大生科院PNAS發布單細胞測序新技術

      來自北京大學生命科學學院等處的研究人員發表了題為“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的文章,開發出了一種新型微流控單細胞全轉錄測序新方法,這種方法有效地消除轉錄組高度動態特性所帶來的測量差異,提高單細胞全轉錄組分析的準

    單細胞RNA測序發現新的免疫細胞

      最近在《Nature Immunology》發表的一項新研究,詳細檢測了一組新發現的免疫細胞(被稱為ILC)。通過對單個扁桃體細胞的基因表達進行分析,瑞典卡羅林斯卡學院的科學家們,發現了三個以前未知的ILC子群,并揭示了關于“這些細胞在人體中如何發揮功能”的更多信息。  先天淋巴細胞(ILC)是

    Nature子刊:癌癥單細胞測序新技術

      只有通過近距離觀看修拉(Seurat)的繪畫,你才能鑒別出點描法背后的復雜性。其在模式中應用了不同的純色小點,從遠處看就形成了一幅圖像。與之相似,生物學家們和遺傳學長期以來也在尋求在單細胞水平上分析基因的圖譜,然而技術局限性使得直到現在也只能在遠處遙望。   發布在7月22日《自然生物技術》(

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