RNA免疫沉淀rPCR方法進行體內分離核糖核蛋白復合體實驗
RNA 免疫沉淀-隨機聚合鏈反應方法可用來鑒定細胞內 RNP 復合物中的 RNA 組分。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理RNA 免疫沉淀-隨機聚合鏈反應方法可用來鑒定細胞內 RNP 復合物中的 RNA 組分。實驗材料載體酵母 tRNARQ1 DNA 酶糖原小牛腸堿性磷酸酶T4 DNA 連接酶JMJ09 感受態細菌試劑、試劑盒PBSNET-2 緩沖液RNase 抑制劑酚氯仿異戊醇乙酸鈉乙醇M-MLV 反轉錄酶反轉錄緩沖液通用引物-dN6RNase H電泳緩沖液非變性瓊脂糖凝膠上樣緩沖液EcoR Ⅰ限制性內切核酸酶EDTA儀器、耗材蛋白 A 瓊脂糖凝膠無 RNA 酶離心柱PCR 擴增體系Promega PCR 試劑盒pGEM-7Z 質粒載體Falcon 2059 聚丙烯管SOC 培養基LB 平板培養基fmol DNA 循環測序系統微型凝膠水平電泳儀紫外透射儀PCR 擴增儀高速低溫離心機低溫微型離心機臺式低......閱讀全文
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技術可用在研究與胚胎發育相關基因的功能上,但是由于細胞分裂造成 dsRNA 的稀釋,使得這種方法在研究成體的基因功能時有一定的局限性。為彌補早期 RNAi 技術的不足,Tavernarakis 等將 RNAi 技術做了一些改進及更動,將目的基因之標的序列以反向重復的方式,由
RNA干擾技術(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物體內特定基因由于種種原因不表達的遺傳現象。一方面,基因沉默是生物遺傳操作創造新的遺傳修飾生物(genetically modified organisms)的障礙,另一方面,它又是植物抵抗外來核酸入侵(如病毒)的一種反應,為植物抗病毒的遺傳育
RNA提取時RNA降解原因
1 ) 新鮮細胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鮮組織: 某些含有內源性核酸酶的樣品,很難避免RNA酶的降解,建議采用的方法為在液氮條件下將組織研碎,并且,勻漿時采用更多的裂解液。 3 ) 冷凍樣品: 樣品取材后應該迅速置于液氮中冷凍存放,然后轉移到-70℃冰箱存
RNA提取心得(組織RNA提取和培養細胞的RNA提取)
一.組織RNA提取 1.最好新鮮組織,這樣RNA提取的效果比較好,這是肯定的。 2. 如果不是新鮮的(最好在半年之內,-80℃或者液氮中凍存的)組織,注意不要反復凍融,從冰凍狀態拿到0-4℃,注意不要拿到常溫,待組織解凍后,用 DEPC泡過的剪刀剪一小塊組織,稱重后,放到預冷的勻漿器中,然后
RNA干擾相關知識RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。
RNA干擾相關知識RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一種RNA-蛋白質復合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC,miRNA組裝miRISC。RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。
反義技術——RNA干擾(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干擾(RNA interference,RNAi)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在RNAi領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA干擾是由長的雙鏈 RNA
RNA分離與分析實驗_分離RNA
實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60
RNA標記
RNA labeling?(Amersham Pharmacia)For the generation of radiolabelled, single stranded RNA for use as hybridization probes??32P-pCp 3' End-labeling
RNA-Electrophoresis
Electrophoresis through agarose or polyacrylamide gels is the standard way to separate, identify and purify nucleic acid fragments. The location of th
Quantitating-RNA
RNA quantitation is an important and necessary step prior to most RNA analysis methods. Here we discuss three common methods used to quantitate RNA an
RNA-剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子,連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
RNA提取
RNA提取(主要內容如下)Tips for Handing RNA?Total RNA IsolationmRNA IsolationrRNA IsolationOthersQ & A posted in the Method Forum??Basic Procedures for Handing
RNA電泳
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RNA電泳
RNA Gel (Crawford Lab)Gel Electrophoresis of RNA (Beverly Faulkner-Jones)great tips on RNA gel electrophoresis.Northern Gel and ?TransferUsing glyoxal
RNA-電泳
①電泳RNA 所用器械如制膠的模具、梳子、電泳槽等用肥皂粉洗干凈后用雙蒸水沖洗二遍后在室溫晾干備用。②用新的1XTBE 配制1. 2 %瓊脂糖凝膠,倒膠時溴化乙錠(E直接加入凝膠中。③制備好的瓊脂糖凝膠板放入電泳槽后再加入經高壓滅菌過的1XTBE ,液面只能剛好同膠面平齊,緩沖液不要淹過膠面。④點樣
指導RNA
中文名稱指導RNA英文名稱guide RNA;gRNA定 義一種小分子RNA,約含60~80個核苷酸,在RNA編輯中起模板作用。其功能是提供核苷酸插入或刪除的信息。由小環DNA及大環DNA編碼的指導RNA均帶有編輯區的序列信息,可介導編輯過程。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調
RNA標記
RNA標記是將標記物(如放射性同位素、熒光素或酶)共價地連接到RNA,通過檢測標記物,進而實現對RNA鑒別和檢測的目的。RNA標記在分子探針領域應用廣泛,在疾病診斷方面也很有前景。 理想的RNA標記方法應符合以下要求: 1. ?操作簡單,靈敏度高 2. ?不影響堿基配對的特異性 3. ?不影響RN
RNA降解
新鮮細胞:如果試劑沒有問題,且外源性污染也可以排除,那么降解幾乎都來自裂解液的用量不足。如? 果將裂解液直接加入培養皿中裂解細胞,一定要使裂解液能覆蓋住細胞。 2. 新鮮組織:某些富含內源核酸酶的樣品(如肝臟,胸腺等),即使使用電動勻漿器勻漿也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮條件下將組織
RNA干擾相關知識Small-interfering-RNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。
關于小干擾RNA的RNA激活介紹
已經發現dsRNA還可以激活基因表達,這種機制被稱為“小RNA誘導的基因激活”或RNAa。已經顯示靶向基因啟動子的dsRNA誘導相關基因的有效轉錄激活。使用合成的dsRNA在人細胞中證明RNAa,稱為“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物體中是保守的。
純化RNA實驗——從組織中純化總RNA
實驗材料組織試劑、試劑盒RNA 抽提緩沖液氯仿實驗步驟1. 從動物取下組織,直接進行第 2 步或在液氮中快速冷凍新鮮解剖的組織。冷凍后的組織可以貯存在 -70℃。2. 組織(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提緩沖液中勻漿。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均勻,冰浴 15 分鐘
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(3)
SiRNASmall interfering RNA (siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短發夾RNAshRNA
Science聚焦:球形RNA讓RNA療法重獲新生
幾十年來,RNA療法在治療遺傳疾病的道路上走得并不順遂。不過,隨著新型RNA(球形核酸SNA)在人體試驗中取得成功,這一領域似乎煥發出新的活力。Science網站特別撰文介紹了這項重要突破。 RNA療法一般是用反義RNA破壞疾病相關蛋白的生產。在美國化學學會(ACS)上周的一次會議上,研究人員
什么是RNA?RNA的作用是什么?
核糖核酸(縮寫為RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和堿基構成。RNA的堿基主要有4種,即A(腺嘌呤)、G(鳥嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(2)
1RNA i的發現RNA i是在研究秀麗新小桿線蟲(C. elegans)反義RNA (antisenseRNA )的過程中發現的,由dsRNA 介導的同源RNA 降解過程。1995年,Guo等發現注射正義RNA (senseRNA )和反義RNA 均能有效并特異性地抑制秀麗新小桿線蟲par
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(1)
Rnai最近由于RNA 干擾(RNA interference,RNA i)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在 RNA i領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA 干擾是
什么叫做外源性RNA和內源性RNA
核糖核酸(縮寫為RNA,即RibonucleicAcid),存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和堿基構成。RNA的堿基主要有4種,即A腺嘌呤、G鳥嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA
RNA-Isolation-Protocol
RNA Isolation Protocol(Revised 5-15-2003)Stabilize RNAStart with 15 ml E. coli Culture containing 7.5* 109?cells (OD600= 0.2 Dilute cells or scale up)