PacBioRSII測序儀革新HLA檢測分型技術[創新技巧]
PacBio RS II測序系統一經推出,其長讀長、單分子堿基分辨率及無GC偏好性的特征即受到廣大研究者的推崇,尤其是在HLA檢測分型領域,國際上權威HLA檢測分型機構相繼引進PacBio RS II測序技術進行相關服務或試劑盒的研發,推起了PacBio在HLA研究應用領域的高潮。HistoGenetics公司引進PacBio RS II測序系統HistoGenetics公司和Pacific Bioscience公司于2014年4月29日共同宣布,鑒于PacBio測序平臺能夠測通HLA基因全長,從而提供更加精確的HLA分型的優勢,購進兩臺PacBio RS II系統取代之前Sanger一代測序用于HLA分型。HLA是具有高度多態性的同種異體抗原,含有上萬種等位基因以編碼抗原蛋白識別外來抗原。準確的HLA分型對于器官移植、自身免疫疾病相關研究、藥物超敏性研究等非常重要。之前采用Sanger及NGS短序列......閱讀全文
PacBio-RS-II測序儀革新HLA檢測分型技術[創新技巧]
PacBio RS II測序系統一經推出,其長讀長、單分子堿基分辨率及無GC偏好性的特征即受到廣大研究者的推崇,尤其是在HLA檢測分型領域,國際上權威HLA檢測分型機構相繼引進PacBio RS II測序技術進行相關服務或試劑盒的研發,推起了PacBio在HLA研究應用領域的高潮。His
PacBio-RS-II測序儀革新HLA檢測分型技術[創新技巧]
PacBio RS II測序系統一經推出,其長讀長、單分子堿基分辨率及無GC偏好性的特征即受到廣大研究者的推崇,尤其是在HLA檢測分型領域,國際上權威HLA檢測分型機構相繼引進PacBio RS II測序技術進行相關服務或試劑盒的研發,推起了PacBio在HLA研究應用領域的高潮。 His
百邁客測序陣營再添強援—PacBio-RS-II測序儀正式投產
日前,百邁客公司引進的三代單分子實時測序PacBio RS II已正式投入生產。在三代測序平臺上,實現了數據產量和讀長的雙重提升,一個SMRT Cell芯片可產出高達1.3Gb數據,reads平均長度達到14KB,N50超過20KB,最長reads超過45KB,為基因組測序、全長轉錄組測序、堿基
HLA分型技術
HLA分型技術主要組織相容性復合物(MHC)是脊椎動物體內最復雜且具有高度多態性的基因群。1984年George Snell 首次發現小鼠MHC即H-2,1958年Dausset 發現了人的MHC即HLA基因。MHC的表達產物稱為主要組織相容性抗原,MHC抗原是有核細胞表面膜蛋白分子,對抗原遞呈和免
HLA分型技術(二)
? (二)PCR/SSO技術 此法乃用人工合成的HLA型別特異的寡核苷酸序列作為探針,與待檢細胞經PCR擴增的HLA基因片段雜交,從而確定HLA型別,PCR技術可將HLA復合體上指定基因片段特異性地擴增5~6個數量級;而專門設計的SSO(序列特異的寡核苷酸sequencedpecific ol
HLA分型技術(一)
? HLA分型并不只是一種應用性的臨床檢測指標,免疫遺傳學研究的發展,很大程度上依賴于以分型為主要手段的HLA多態性分析。60年代建立的并不斷完善的血清學及細胞學分型技術主要側重于分析HLA產物特異性;80年代起建立的DNA分型方法則側重于基因的分型。 一、血清學分型技術 (一)HLA-Ⅰ類抗原
HLA分型方法
1.淋巴細胞毒試驗 為HLA抗原分型常用方法。2.混合淋巴細胞培養試驗本方法多用于組織相容性方面的研究,臨床上主要用于器官移植。3.分子生物學技術一類是PCR為基礎的基因分型。另一類是以測序為基礎的基因分型。
北京希望組新購5臺Sequel測序平臺
北京希望組生物科技有限公司(GrandOmics Biosciences, Co., Ltd., 以下簡稱“希望組”)與美國太平洋生物公司(Pacific Biosciences of California, Inc.,以下簡稱稱“PacBio”)今日宣布達成戰略合作,希望組與旗下科技服務公司
HLA的分型方法
HLA的分型方法是檢驗主管技師考試要求掌握的內容,醫學教育網搜集整理相關內容供大家參考。 1.淋巴細胞毒試驗:為HLA抗原分型常用方法。原理:淋巴細胞膜上的HLA抗原與相應抗體結合后,在補體作用下,細胞膜損傷,細胞溶解破裂被染色,計算顯微鏡下觀察著色細胞的百分率(>20%為陽性反應)。Ⅰ類抗原
HLA分型的方法
①淋巴細胞毒試驗:為HLA抗原分型常用方法。原理:淋巴細胞膜上的HLA抗原與相應抗體結合后,在補體作用下,細胞膜損傷,細胞溶解破裂被染色,計算顯微鏡下觀察著色細胞的百分率(>20%為陽性反應)。Ⅰ類抗原分型時可用T淋巴細胞或外周血淋巴細胞;進行Ⅱ類抗原分型時需用B淋巴細胞。②混合淋巴細胞培養試驗:多
關于HLA分型的技術發展介紹
HLA系統研究從70年代到80年代末期主要是血清學研究,90年代以來,HLA進入了分子水平研究階段。HLA分型技術同樣走過了這一歷程。建立于60年代的血清學及細胞學分型技術主要側重于分析HLA產物特異性。1991年第11屆國際HLA專題討論上提出了HLA的DNA分型方法,隨著測序技術的突飛猛進,
關于HLA分型的DNA分型方法介紹
DNA分型主要分為兩種方法:基于核酸序列識別的方法和基于序列分子構型的方法,常用的方法大致可分為大類: ①限制性片段長度多態性分析(restriction fragment length polymorphism,RFP)。其原理是不同的DNA膜板山于序列的差異在限制性內切酶作用下將被切成大小
HLA有哪些分型方法?
①淋巴細胞毒試驗:為HLA抗原分型常用方法。原理:淋巴細胞膜上的HLA抗原與相應抗體結合后,在補體作用下,細胞膜損傷,細胞溶解破裂被染色,計算顯微鏡下觀察著色細胞的百分率(>20%為陽性反應)。Ⅰ類抗原分型時可用T淋巴細胞或外周血淋巴細胞;進行Ⅱ類抗原分型時需用B淋巴細胞。②混合淋巴細胞培養試驗:多
PacBio推出小而強大的測序系統
之前,人們一直在猜測Pacific Biosciences可能會推出小型的單分子測序儀,但PacBio從未給出肯定的答復。而在2015年9月的最后一天,PacBio給了人們一個驚喜,突然宣布推出Sequel測序系統。Sequel系統保留了SMRT技術的優點,與現有的PacBio RS II系統相
關于HLA分型高分辨分型應用的介紹
1、地中海貧血治療 2、造血干細胞移植異基因造血干細胞移植是現能根治重型Β地貧的方法。如有HLA相配的造血干細胞供者,應作為治療重型Β地貧的首選方法。 3、急性白血病,骨髓移植。 4、對ANLL療效較好。 ①同基因骨髓移植,供者為同卵孿生子。 ②同種異基因骨髓移植,供者為患者的兄弟姐妹
Pacific-合作國內基因公司開展轉化醫學項目研究
Pacific Biosciences將向湖濱盤古基因公司提供PacBio? RS II DNA測序系統。 湖濱盤古基因公司已在天津東麗湖科技園建立了一個1500平方米的基因組學研究機構,致力于利用PacBio單分子實時( SMRT? )測序平臺,進行轉化醫學項目研究。 “我們的目標是要成為
羅氏聯手PacBio打造NGS診斷產品
美國Pacific Biosciences公司周三宣布與羅氏診斷簽訂一項協議,以PacBio的SMRT技術為基礎開發診斷產品。包括前期、里程碑和供應付款在內,羅氏將向PacBio支付7500萬美元。 羅氏選擇了PacBio公司的SMRT技術 去年,羅氏曾向 Illumina發起收
PacBio測序有望掀起下一場遺傳診斷的革命
從一代到二代再到三代,近年來測序技術的發展勢不可擋。單分子測序也逐漸表現出它的優勢,在測序舞臺上發揮著舉足輕重的作用。近日,比利時魯汶大學和瑞典烏普薩拉大學的研究人員在《Nucleic Acids Research》發表綜述文章,介紹了PacBio SMRT測序技術在臨床中的應用。 文章簡單回
HLA細胞法分型試驗簡介
HLA-D和DP位點的抗原須用細胞法分型進行鑒定,所以又稱LD抗原(lymphocytedefinedantigen),其鑒定方法普遍采用混合淋巴細胞培養(mixedlymphocyteculture,MLC),也稱混合淋巴細胞反應(mixedlymphocytereaction,MLR)。1.試驗
HLA的分型方法有什么?
①淋巴細胞毒試驗:為HLA抗原分型常用方法。原理:淋巴細胞膜上的HLA抗原與相應抗體結合后,在補體作用下,細胞膜損傷,細胞溶解破裂被染色,計算顯微鏡下觀察著色細胞的百分率(>20%為陽性反應)。Ⅰ類抗原分型時可用T淋巴細胞或外周血淋巴細胞;進行Ⅱ類抗原分型時需用B淋巴細胞。 ②混合淋巴細胞培養
HLA基因分型方法:RFLP法
RFLP法1)常規制備DNA鹽析法1.用淋巴細胞分離液從抗凝血中分離出白細胞。2.每3ml細胞懸液加10ml紅細胞裂解液溶解紅細胞兩次,再加2ml白細胞裂解液溶解白細胞。3.加50μl 10%?SDS和70μl蛋白酶K消化蛋白質,37℃過夜或55℃?3h。4.加0.25體積飽和醋酸鈉溶液,劇烈搖動1
HLA細胞法分型試驗介紹
HLA細胞法分型試驗介紹:HLA-D和DP位點的抗原須用細胞法分型進行鑒定,所以又稱LD抗原,其鑒定方法普遍采用混合淋巴細胞培養,也稱混合淋巴細胞反應。1.試驗方法將分離的反應細胞(通常是患者的淋巴細胞)與刺激細胞(通常是供者或已知的標準淋巴細胞)配制成1×106/ml濃度的懸液,各加0.2ml到反
HLA細胞法分型試驗簡介
HLA-D和DP位點的抗原須用細胞法分型進行鑒定,所以又稱LD抗原(lymphocytedefinedantigen),其鑒定方法普遍采用混合淋巴細胞培養(mixedlymphocyteculture,MLC),也稱混合淋巴細胞反應(mixedlymphocytereaction,MLR)。
HLA細胞法分型試驗介紹
HLA細胞法分型試驗介紹: HLA-D和DP位點的抗原須用細胞法分型進行鑒定,所以又稱LD抗原,其鑒定方法普遍采用混合淋巴細胞培養,也稱混合淋巴細胞反應。 1.試驗方法將分離的反應細胞(通常是患者的淋巴細胞)與刺激細胞(通常是供者或已知的標準淋巴細胞)配制成1×106/ml濃度的懸液,各加0.
關于HLA基因復合體的分型技術介紹
HLAⅠ類抗原的DQ、DR用血清學檢測法進行分型,因此在方法學上稱為血清學鑒定的抗原(serologicallydefinedantigen,SD抗原);DP和D特性需用細胞學方法進行檢測,因此稱為淋巴細胞鑒定的抗原(lymphocytedefinedantigen,LD抗原)。雖然HLA的基因
觀點:國人不要再在三代測序儀上犯同樣錯誤了!
作者:天津南開大學生命科學學院 高山 華大基因購入首臺單分子測序儀PacBio RS II。看到這個消息,華大進入單分子領域太晚了。 我剛到美國的時候,2011年看好這技術,2012年開始寫第一本中文手冊,后面就想到中國會大肆購買,然后2013年寫標書,2014年基金評審被斃。 其實當時就
新一代測序十年記:后起之秀PacBio
在新一代測序技術崛起的早期,市場主要被Illumina、Life Tech和Roche這三家公司占領。偶爾也有一些新的測序平臺出現,但大多是雷聲大雨點小,不久便沒了下文。面對這些強大、成熟的系統,新平臺要想站穩腳跟,的確不是件容易的事。 在2010年的AGBT年會上,Pacific Biosc
簡述HLA低分辨分型的內容
采用序列特異性引物擴增HLA等位基因的特異性片段,經電泳分離,根據PCR結果的反應格局具判斷被測標本的HLA等位基因型,具有通量大、正確性好的特點。反映了HLA抗原水平的等位基因類型,用于骨髓、器官移植組織配型的初篩。
HLA分型的常用方法有哪些?
1.分子生物學技術: 一類是PCR為基礎的基因分型,一類是以測序為基礎的基因分型。2.淋巴細胞毒試驗: 為HLA抗原分型常用方法。原理:淋巴細胞膜上的HLA抗原與相應抗體結合后,在補體作用下,細胞膜損傷,細胞溶解破裂被染色,計算顯微鏡下觀察著色細胞的百分率(>20%為陽性反應)。Ⅰ類抗原分型時可用T
HLA分型的基本信息介紹
HLA(humanleucocyteantigen)復合體是人類多態性最豐富的遺傳系統,定位于第6號染色體短臂6P21.31區,長3600kb。1999年已完成全部序列分析及基因定位,在此區域內共確認了224個基因座位中128個為功能性基因,其中39.8%和免疫功能相關。HLA基因根據其編碼分子