北京基因組所發表RNA甲基化新發現
在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從DNA、RNA最后流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以在不改變DNA序列的基礎上調控基因的表達，并由此決定細胞的分化和發育情況。實際上，mRNA和其他RNA上也存在類似的調控機制。 N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA上最常見的一種轉錄后修飾，介導了超過80%的RNA堿基甲基化。這種甲基化修飾非常普遍，出現頻率大約是3-5個殘基/mRNA。近年來，科學家們正在逐步揭開這種mRNA甲基化的神秘面紗。 最近中科院北京基因組研究所的研究團隊在二月十一日的Molecular Cell雜志上發表文章，闡明了m6A及其結合蛋白YTHDC1在pre-mRNA剪切中的調控作用。這篇文章的通訊作者是中科院北京基因組研究所的楊運桂研究員。 m6A研究中一般將插入甲基的蛋白稱為“書寫器”（writer），將去甲基化酶稱為“擦除器”（erase......閱讀全文
單堿基編輯系統在植物中建立mRNA剪接操控新方法
mRNA前體的剪接是高等生物體內基因轉錄后加工的重要過程，傳統mRNA的剪接遵循“GU-AG”法則，即主要剪接體包含三個保守的剪接位點，即位于內含子5’端的“GU”、3’端的“AG”和靠近3’端的分支點“A”。剪接體通過選擇一種或多種剪接位點可將mRNA前體加工為一種或多種成熟的mRNA，即組成
何川、賈桂芳Nature子刊發布表觀遺傳學新成果
來自芝加哥大學、北京大學的研究人員在新研究中，揭示出了擬南芥m6A甲基化組（methylome）的獨特特征。他們的研究結果發表在11月28日的《自然通訊》（Nature Communications）雜志上。 芝加哥大學的何川（Chuan He）教授、Joy Bergelson教授以及北京大學
RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
RNA甲基化（RNA methylation）是一類表觀遺傳修飾，在已經發現的超過100種不同的RNA化學修飾中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methylad
Cell綜述：RNA修飾的新作用
迄今為止，科學家們已經發現了上百種RNA修飾類型，但是其中大多數在mRNA和調控非編碼RNAs中還是很罕見的。近期的一些研究發現指出，這些修飾中有至少有一些含量豐富，且保守性強。本期Cell雜志以此為中心，介紹了兩種RNA修飾方式的分子機制，和生物學功能。 這兩種RNA修飾方式分別是N6-甲基
小白必看！RNA甲基化整體水平鑒定的方法匯總
RNA甲基化（RNA methylation）是一類表觀遺傳修飾，在已經發現的超過100種不同的RNA化學修飾中，主要有6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）、5-甲基胞嘧啶（C5-methylcytidine, m5C）和1-甲基腺嘌呤（N1-methyladenos
甲基化——腫瘤檢測治療的又一靶標？
前言在測序和相關技術不斷進步的今天，研究人員不僅能夠獲得DNA、RNA的堿基序列，更能夠獲得堿基修飾的復雜信息。目前已經證明DNA甲基化能夠導至的腫瘤產生，而Ribomed、基準醫療和鹍遠基因等公司作為該領域的先行者，已經開發出相關產品。RNA作為中心法則的下游分子，也有多種多樣的修飾，特別是m6A
上海藥物所小分子調控核酸去甲基化研究取得階段進展
中科院上海藥物研究所楊財廣課題組與蔣華良課題組合作，基于mRNA中N6位甲基化修飾的腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)去甲基化酶FTO結構開展小分子調控研究，首次獲得了對核酸去甲基化酶，例如FTO具有酶活和細胞活性的小分子抑制劑。論文于10月11日在線發表于《美國化學會
研究揭示RNA甲基化調控斑馬魚母源mRNA穩定性機制
斑馬魚母源-合子轉換 (maternal-to-zygotic transition, MZT)過程伴隨著母源RNA和蛋白質的降解以及合子基因組的激活(maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多種關鍵因素通過母源和合子途徑促進母源mRNA降解，其中包
Genome research：不同RNA m5C甲基化修飾存在巨大差異
近年來，RNA修飾的研究已成為當今生命科學領域最前沿最熱門的研究方向之一，不斷有CNS的文章問世，m5C RNA修飾的分子機理研究越來越清晰，也不斷有學者探尋如何更全面的獲得貼近真實的m5C修飾的原貌。近期，來自德國的Frank Lyko和Mark Helm團隊在GENOME RESEARCH（
細胞化學基礎--堿基的種類修飾堿基
DNA和RNA分子中還含有核酸鏈形成后經過修飾形成的其它非主要堿基。這些堿基大多是在上述嘌呤或嘧啶堿的不同部位甲基化（methylation）或進行其它的化學修飾而形成的衍生物。DNA中最常見的修飾堿基是5-甲基胞嘧啶（m5C）。RNA中有許多修飾的堿基，包括核苷類假尿苷（Ψ）、二氫尿苷（D）、肌苷