Nature發表表觀遺傳學重要發現決定性別的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和長非編碼RNA上最普遍的一種RNA修飾,介導了超過80%的RNA堿基甲基化。人們已經陸續鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白,但對其生物學功能還知之甚少。伯明翰大學的科學家們在Nature雜志上發表文章,揭示了m6A在Sxl(Sex-lethal)基因調控中起到的關鍵作用。Sxl是一個涉及性別決定的開關基因,果蠅的性別取決于Sxl蛋白是否合成。雄性果蠅和雌性果蠅的Sxl都會轉錄成mRNA,但只有雌性果蠅的mRNA能通過可變剪切生成功能性蛋白。可變剪切是一種廣泛存在的基因表達機制。研究人員發現,m6A介導果蠅Sxl的可變剪切,最終決定果蠅發育成雄性還是雌性。“大自然有許多方式來決定性別,m6A介導的基因表達調節可能就是一個古老的機制,”這項研究的領導者,伯明翰大學的Dr Matthias Soller說。除了決定果蠅性別,Sxl的m6A調控還是生殖干細胞開......閱讀全文
北京基因組所揭示半甲基化在基因表達調控中的作用
DNA甲基化是最早發現的表觀遺傳標記之一,在真核細胞基因表達調控中發揮重要作用。隨著DNA甲基化檢測技術的進步,研究發現DNA甲基化具有完全甲基化和半甲基化兩種狀態,以及可以穩定遺傳的半甲基化修飾。關于DNA半甲基化是否具有獨特的生物學功能仍有爭議,因而需要對DNA半甲基化進行研究。此外,傳統的
Nature發表表觀遺傳學重要發現決定性別的RNA甲基化
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA和長非編碼RNA上最普遍的一種RNA修飾,介導了超過80%的RNA堿基甲基化。人們已經陸續鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白,但對其生物學功能還知之甚少。伯明翰大學的科學家們在Nature雜志上發表文章,揭示了m6A在Sxl
基因組中表達基因的類型介紹
基因組中表達的基因分為兩類:⑴一類是維持細胞基本生命活動所必須的,稱管家基因(house keeping gene),如各種組蛋白基因;⑵另一類是指導合成組織特異性蛋白的基因,對分化有重要影響,稱奢侈基因(luxury gene),即組織特異性(tissue-specific gene)表達的基因,
北京大學Nature發布重要甲基化景觀圖
來自北京大學、教育部輔助生殖重點實驗室、哈佛大學等機構的研究人員,繪制出了人類早期胚胎全基因組水平的DNA甲基化景觀圖譜,提出了有別于以往小鼠研究結果的一些新見解。這些研究結果發表在7月23日的《自然》(Nature)雜志上。 北京大學第三醫院的喬杰(Jie Qiao)教授以及湯富酬(Fuch
徐國良院士Nature發表表觀遺傳學重要成果
表觀遺傳學修飾可以在不改變DNA序列的情況下調控基因的活性,而且這種修飾會受到環境因素的影響。DNA甲基轉移酶(DNMT)介導的胞嘧啶甲基化是哺乳動物基因組最常見的一種表觀遺傳學修飾,在基因組印記、X染色體失活等重要過程中起到了關鍵性作用。TET家族的雙加氧酶能夠逐步氧化5-甲基胞嘧啶,由此實現
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術,如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等,已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化,它是在擴增片段長度多態性技術的基
關于胚胎干細胞的全能原因分析
天然胚胎里的干細胞是一種“全能”細胞,可以分化成所有類型的細胞。瑞士科學家發現,胚胎細胞全能特性的秘密在于一種蛋白質。這種蛋白質稱為Pramel7,它存在于早期胚胎細胞里,可以阻止基因組里的DNA(脫氧核糖核酸)代碼被掛上“封存”的化學標簽,保持基因組的開放性 [4]。 所有細胞都攜帶生物體的
華東師大翁杰敏JBC發表新成果
四月二十一日,來自華東師范大學、中山大學癌癥研究中心和芝加哥大學的研究人員,在國際學術期刊《Journal of Biological Chemistry》在線發表題為“Non-germline Restoration of Genomic Imprinting for a Small Subs
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
中國科學家9月參與發表多篇Nature文章
9月中國學者參與的多項研究在Nature雜志及其重要子刊上發表,其中包括首次揭示m6A甲基化修飾的新作用,表觀遺傳調控核心復合物PRC2招募到基因組上重要位點的分子機制,以及蘭花基因關鍵演化機制。 來自中科院動物研究所,北京基因組研究所的研究人員通過m6A測序技術(m6A-Seq),首次揭示m
Cell:兩項研究解析胚胎干細胞的表觀遺傳機制
在干細胞研究領域中,表觀遺傳調控,尤其是細胞核內染色體高級組織形式一直是當前的前沿和熱點領域。近日,兩個研究小組在《細胞》(Cell)雜志上發表文章,分別報道了人類胚胎干細胞的轉錄和表觀遺傳動態機制 以及 多向分化胚胎干細胞的表觀遺傳作用機制。 在第一項研究中,來自哈佛麻省Broad研
動物所突破哺乳動物同性生殖障礙
同性生殖的現象在動物中并不罕見,例如在爬行類的蜥蜴、兩棲類的蛙,以及多種魚類中,都有“孤雌生殖”現象:即不經過與雄性的交配,雌性個體即可生下后代。作為有性生殖的補充,孤雌生殖能在缺乏雄性的情況下,維持個體的繁衍與種群的更新。與孤雌生殖對應的孤雄生殖則極其罕見,迄今只在一種斑馬魚中發現孤雄生殖。然
我國學者揭示發育過程中表觀遺傳修飾的協同調控
近期,哈爾濱工業大學和哈爾濱醫科大學的研究人員利用生物信息學方法,整合高通量的表觀基因組數據,發現了在小鼠發育過程中CpG島上各種表觀遺傳修飾的協同變化,并揭示了其對發育基因的共調控。相關成果公布在Nature出版集團旗下期刊Scientific Reports雜志上。 CpG島是指基
我國學者揭示發育過程中表觀遺傳修飾的協同調控
近期,哈爾濱工業大學和哈爾濱醫科大學的研究人員利用生物信息學方法,整合高通量的表觀基因組數據,發現了在小鼠發育過程中CpG島上各種表觀遺傳修飾的協同變化,并揭示了其對發育基因的共調控。相關成果公布在Nature出版集團旗下期刊Scientific Reports雜志上。 CpG島是指基
中大學子與學術牛人解析RNA修飾與癌癥干細胞
N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA上最常見的一種轉錄后修飾,這種可逆的RNA甲基化修飾與人類疾病有關。研究者們已經陸續定位了哺乳動物轉錄組中的m6A,鑒定了這種動態修飾所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白。不過,人們還對m6A起到的具體作用還知之甚少。 約翰霍普金斯
甲基化領域重要研究成果解讀!
本文中,小編整理了近年來科學家們在甲基化研究領域取得的重要研究成果,與大家一起學習! 【1】Science:重大進展!揭示DNA甲基化增強基因轉錄機制 doi:10.1126/science.aar7854 DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》(Nature Genetics)雜志上報告說,他們繪出了蘋果的基因組草圖,這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀,培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說,他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
研究人員揭示超級增強子動態甲基化調控轉錄異質性
CpG DNA甲基化早在70年代就被提出是一種用來控制基因表達的DNA化學修飾,而我們對DNA甲基化在基因組不同區域的具體功能,在疾病、發育過程中所扮演的具體角色,以及控制基因表達的詳細機理,直到今天并沒有全面詳細的認知。 2019年8月15日,美國Whitehead研究所Rudolf Jae
Nature:代謝讓干細胞永葆青春
早期胚胎中的干細胞擁有無限的潛力,它們能夠成為任何類型的細胞,人們一直希望利用這一點來治療疾病和修復創傷。怎樣才能將干細胞穩定在青春永駐的狀態下呢?正確的環境可以幫助人們做到這一點,就像彼得.潘德的永無島(Neverland)那樣。 Rockefeller大學和Memorial Sloan K
甲基化的基因組直接測序法
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法,用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理,并以連接介導的PCR來放大信號強度,然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解,故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定,但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來,科學家們開發出多種新方法,試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說,全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組,但它還是面臨技
陳柏仰博士Cell揭示DNA去甲基化動態
精子和卵子融合是動物個體發育的起點,不過這一過程并不僅僅是簡單的融合。人們發現,在哺乳動物胚胎的早期發育中,全基因組的甲基化模式會發生明顯的變化。在小鼠胚胎受精之前,雌雄生殖細胞具有較高的甲基化水平,受精后父源基因組迅速的發生主動去甲基化,而母源基因組發生被動的去甲基化。 為了了解人類生殖細胞
美國女院士表觀遺傳學新成果
TET(ten-eleven translocation)蛋白是生物體內存在的一種α-酮戊二酸(α-KG)和Fe2+依賴的雙加氧酶,是DNA去甲基化過程中的一種重要的酶,對于維持干細胞的多能性有重要作用。多年來,科學家了解到,TET蛋白家族有腫瘤抑制因子的作用,但是,它們是如何抑制失控的癌細胞增
基因是否表達:cfDNA全基因組測序可揭曉
《Nature Genetics》雜志上的研究表明,血循環游離DNA(cfDNA)可提供線索來預測基因的表達。 全基因組測序就能知道基因是否表達 基因表達(gene expression)是指細胞在生命過程中,把儲存在DNA順序中的遺傳信息經過轉錄和翻譯,最后轉變成具有生物活性的蛋白質分子的
Cell重要成果:構建初始態人類干細胞
來自英國Babraham研究所的科學家,與劍橋干細胞研究所和歐洲生物信息學研究所的同事們在9月11日的《細胞》(Cell)雜志上發表了他們的最新研究成果,這為研究人員能夠生成基礎狀態的、初始態(na?ve)人類干細胞滿足未來的醫學應用增添了希望。 在這項研究中研究人員證實,只需重設轉錄因子控制
科學家揭示克隆胚胎發育異常表觀遺傳機制
同濟大學教授高紹榮和張勇課題組通過對不同發育命運體細胞克隆胚胎進行全基因組DNA甲基化分析,揭示了異常的DNA再甲基化是導致克隆胚胎著床后發育異常的關鍵因素。該研究近日發表于《細胞—干細胞》。 雖然體細胞克隆在多種動物上已獲得成功,但克隆胚胎中DNA甲基化的重編程過程及其對克隆效率的影響在很大