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肥胖相關基因FTO主要作用底物是RNA中的6甲基腺嘌呤 近日，中國科學院北京基因組研究所“百人計劃”研究員楊運桂與美國芝加哥大學何川教授合作，發現了肥胖相關基因FTO(Fat mass and obesity-associated protein）主要作用底物是RNA中的6甲基腺嘌呤（m6A）。文章N6-Methyladenosine in Nuclear RNA is the Main Substrate of the Obesity-Associated FTO Protein于10月16日在線發表在Nature Chemical Biology雜志上。該研究為揭示FTO調控肥胖發生機制提供了重要線索。基因組所楊運桂研究組博士研究生趙旭參與了本課題研究工作，并為本論文的共同第一作者。 目前，肥胖已成為世界五大流行性疾病之一，嚴重危害著人口健康。全球約有16億成年人面臨著超重，4億人患有肥胖癥。在中國成......閱讀全文
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心，北大生命科學學院與第三醫院等處的研究人員發表了題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章，利用單細胞DNA甲基化組高通量測序方法，首次在單細胞分辨
2017年12月19日，北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心、生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組和北京大學第三醫院喬杰研究組合作在國際知名學術期刊《自然遺傳學》上在線發表題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimpla
摘要： DNA甲基化是表觀遺傳學(Epigenetics)的重要組成部分，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發育以及人類腫瘤發生中起著重要作用，是目前新的研究熱點之一。隨著對甲基化研究的不斷深入，各種各樣甲基化檢測方法被開發出來以滿足不同類型研究的要求。這些方法概括起來可分為三類：基因組整體水平的甲
中國科學院生物物理研究所朱冰課題組題為Stella safeguards the oocyte methylome by preventing de novo methylation mediated by DNMT1 的研究論文于11月28日在《自然》（Nature）雜志在線發表。該研究發現了
結核病是全球最常見的傳染病之一，據WTO“2015年全球結核病年報”報告，2014年全球新增感染人數960萬，死亡150萬，新增耐多藥結核（MDR）病例48萬（其中我國新增結核感染病例93萬，居全球第三位），其目前仍是全球第二大傳染病。結核分枝桿菌復合群（Mycobacterium tuberc
結核病是全球最常見的傳染病之一，據WTO“2015年全球結核病年報”報告，2014年全球新增感染人數960萬，死亡150萬，新增耐多藥結核（MDR）病例48萬（其中我國新增結核感染病例93萬，居全球第三位），其目前仍是全球第二大傳染病。結核分枝桿菌復合群（Mycobacterium tuberc
雌性哺乳動物的一生中只能提供有限數目的卵子。卵子的DNA甲基化水平很低，只有精子和絕大部分終末分化的體細胞的DNA甲基化水平的一半左右。然而，卵子的這種獨特的DNA甲基化狀態是怎樣形成的，受哪些因子調控，又有著怎樣的生物學意義卻并不清楚。 中科院生物物理研究所的研究人員發表了題為“Stell
DNA甲基化是基因組中重要的表觀遺傳學標志，在大多數生物的生命周期中基因組的甲基化模式都相對穩定。然而近期發表在Genome Biology雜志上的兩篇文章顯示，有的生物在一生中不斷累積著甲基化，有的生物則可能通過甲基化去除大量DNA。 吉林大學劉明遠教授所領導的研究團隊首次在線蟲中發
來自美國Emory大學華裔教授程曉東（Xiaodong Cheng）領導的研究組發現了小鼠基因組中DNA序列的一種特殊模式，該模式在DNA分子調節基因表達的方式中起到基礎性作用。該研究組與來自德國Jacobs大學的同事在8月22日的的《自然》雜志網絡版上公布了這些發現。 自從科學家破解了構成人類
表觀遺傳學是研究表觀遺傳變異的遺傳學分支學科從目前的研究來看,X 染色體劑量補償、DNA 甲基化、組蛋白密碼、基因組印記、表觀基因組學和人類表觀基因組計劃等問題都是表觀遺傳學研究的內容。其中甲基化是基因組DNA 的一種主要表觀遺傳修飾形式,是調節基因組功能的重要手段。在脊椎動物中,CpG二核
近期來自電子科技大學，清華大學等處的研究人員從CpG島等基本定義出發，闡述了高通量DNA甲基化的檢測技術以及針對芯片技術與下一代測序技術的低水平數據處理方法，并重點對比了基于機器學習理論對CpG位點及CpG島甲基化水平的預測算法，以及所利用的特征對預測效果的影響與發展趨勢。 DNA甲基化是表觀
在真核生物中，DNA甲基化通常發生在CG中的胞嘧啶上。由于甲基化不會改變DNA序列，它被視為一種表觀遺傳學標志。DNA甲基化可以在細胞分裂過程中延續到子代細胞，這一機制現在已經相當明確。而這種繼承性使DNA甲基化成為儲存表觀遺傳學記憶的潛在途徑，這種記憶包括環境或發育過程中的基因調控。不過要證實
最近，英國利物浦大學的科學家們，對小麥中調節基因活性的遺傳性分子變化，進行了首次全基因組范圍的調查，這可能成為提高作物育種技術的一種新工具。相關研究結果發表在最新一期的《Genome Biology》。延伸閱讀：權威期刊發布首個小麥單體型圖譜。 表觀遺傳標記是一種化學標簽，將自己附著在DNA上
近年來涌現出不少DNA甲基化的檢測技術，少說也有十幾種。大致可以分為兩類：特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析，后者也稱為甲基化圖譜分析(methylation profiling)。下面生物通給大家介紹一些常用的方法。 全基因組的甲基化分析 基于芯片的甲基化圖譜分析
第一類：基于引物設計功能的軟件。此類軟件主要是針對重亞硫酸鹽序列進行甲基化特異性PCR（methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP）和重亞硫酸鹽測序（bisulfite sequencing, BS）引物的設計。由于重亞酸鹽修飾的特殊性，使常規的分子生物學
表觀基因組學的變化，包括DNA的化學修飾，可以作為基因組的一層額外信息。表觀基因組學在學習和記憶及年齡相關的認知度方面扮演著重要的角色。新的研究發現DNA甲基化，一種特殊的表觀基因組學修飾的形式。從出生到成年，DNA甲基化形式在大腦細胞中是動態變化的。從而幫助理解大腦細胞中基因組學的信息是如何控
來自中國科學院上海植物逆境生物學研究中心、美國普渡大學的研究人員證實，在擬南芥雜交種中甲基化互作需要RNA介導的DNA甲基化（RdDM），并受到遺傳變異的影響。 中國科學院上海植物逆境生物學研究中心主任朱健康（Jian-Kang Zhu）是這篇論文的通訊作者。朱教授是植物抗逆生物學領域世界級領
近年來涌現出不少DNA甲基化的檢測技術，少說也有十幾種。大致可以分為兩類：特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析，后者也稱為甲基化圖譜分析(methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。一、特異位點的甲基化檢測1. 甲基化特異性PCR(MS-PCR)這種方法經濟實用，
甲基化是控制基因表達的關鍵表觀遺傳學修飾。加州大學Davis分校和加拿大英屬哥倫比亞大學的研究人員對胎盤進行研究，揭示了人類胎盤的甲基化組，文章發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。他們發現，37%的胎盤基因組具有低甲基化區域(部分甲基化區域PMD)，這與大多數人體組織不同，在大多數人體
甲基化是控制基因表達的關鍵表觀遺傳學修飾。加州大學Davis分校和加拿大英屬哥倫比亞大學的研究人員對胎盤進行研究，揭示了人類胎盤的甲基化組，文章發表在本周的美國國家科學院院刊PNAS雜志上。他們發現，37%的胎盤基因組具有低甲基化區域(部分甲基化區域PMD)，這與大多數人體組織不同，在大多數人體
封面設計源于中國古代象征生殖的圖騰——玄武，寓意哺乳動物通過有性生殖（蛇與龜）來維持完整的生命周期（圓環），而中心處的生殖細胞（紅色）則在遺傳信息的世代沿襲中起著非常關鍵的作用 人類生殖細胞系（精子、卵細胞及原始生殖細胞）、囊胚以及著床后胚胎體細胞的DNA甲基化水平示意圖 父本印跡基因
New England Biolabs聯合Pacific Biosciences的研究人員利用PacBio RS系統對6種細菌基因組進行了重測序，不僅鑒定出細菌基因組中新的胞嘧啶和腺嘌呤甲基化位點，還鑒定出介導這些表觀遺傳學標志的甲基轉移酶。該研究成果近日發表在《Nucleic Acid
DNA甲基化是近年來研究的熱點，因為越來越多的證據表明，它參與了胚胎發育、基因印跡等過程。同時，它在疾病發展中也起著舉足輕重的作用。甲基化狀態的改變被認為是引起癌癥的一個重要因素，這種變化包括基因組整體甲基化水平的降低和CpG島局部甲基化水平的異常升高，從而導致基因組的不穩定(如染色體的不穩定、
表觀遺傳修飾是指在不改變DNA序列的情況下，發生的一種可影響基因表達的基因組變化。像DNA一樣，當細胞分裂時某些表觀遺傳修飾可以被忠實地復制，使得子細胞中能夠保留來自親代的這一信息。這確保了沿著細胞譜系向下以一種穩定的方式維持基因表達。 近日發表在《自然》（Nature）雜志上的兩篇新研究論文
2017年6月16日，北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬課題組在《Cell Research》雜志在線發表了題為“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
近年來涌現出不少 DNA 甲基化的檢測技術，少說也有十幾種。大致可以分為兩類：特異位點的甲基化檢測和全基因組的甲基化分析，后者也稱為甲基化圖譜分析 (methylation profiling)。下面大家介紹一些常用的方法。 特異位點的甲基化檢測 甲基化特異性 PCR (MS-PCR)
DNA甲基化修飾是表觀遺傳研究的熱點之一，我們通常認為DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），卻不知道隨著測序技術的快速發展，科研者們已經在真核生物中（果蠅 、真菌、萊茵衣藻、秀麗隱桿線蟲等）發現了一種新的DNA甲基化修飾—DNA-6mA甲基化，且DNA-6m
幾年前，湯姆森科技信息集團旗下《科學觀察》(Science Watch)評出了的高影響力論文數量最多的研究人員。原北卡羅萊納大學醫學院生物化學與生物物理學系教授、霍華德?休斯醫學研究院(HHMI)研究員張毅（現就職于哈佛醫學院）成為分子生物學和遺傳學領域高影響力論文的數量最多的前十位頂級科學家之