人類基因組DNA甲基化數據分析
近期來自電子科技大學，清華大學等處的研究人員從CpG島等基本定義出發，闡述了高通量DNA甲基化的檢測技術以及針對芯片技術與下一代測序技術的低水平數據處理方法，并重點對比了基于機器學習理論對CpG位點及CpG島甲基化水平的預測算法，以及所利用的特征對預測效果的影響與發展趨勢。 DNA甲基化是表觀遺傳學中最早被人們認識的現象之一，曾被稱為有別于A,C,G,T的“第5種堿基”。在人類基因組中，約70%~80%的CpG處于甲基化狀態，即呈現整體甲基化的特點，同時這種甲基化模式存在時間和空間上的差異性。空間上的差異性表現為非甲基化的CpG不是均勻分布在基因組上，而是成簇出現形成CpG密度較高的非甲基化區域，即CpG島。 DNA甲基化與基因組印跡、干細胞分會化、胚胎發育以及包含癌癥在內的多種疾病的發生與發展密切相關。因此，對于DNA甲基化的深入研究受到廣泛關注,在2013年湯森路透的生物科學領域重點研究方向排名中，DNA甲基化被認為......閱讀全文
家蠶基因組甲基化譜研究獲突破
我國科學家利用新一代測序技術構建家蠶絲腺甲基化譜 由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”，5月2日在國際著名學術雜志《自然—生物技術》（Nature Biotechnology）上發表，這是中國科學家
DNA分析系統：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究對于基因的 調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中，基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后，這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化，把健康人的大便
Pyrosequencing－DNA分析系統：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究對于基因的調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中，基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后，這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《the Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化，把健康人的大便與結腸癌患
RNA甲基化研究
近期華人科學家辛辛那提大學陳建軍教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修飾在正常和惡性造血過程中的重要作用，表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信號軸在髓系分化以及白血病發生過程中的作用。該研究于2018年1月發表在干細胞頂級期刊《Cell Steam Cell》（影響因子：
核移植胚胎干細胞的印跡基因甲基化研究
核移植來源的胚胎干細胞(NTES? cells)在以干細胞為基礎的細胞治療中扮演著非常重要的角色，得到全能性良好且表觀遺傳修飾正常的核移植胚胎干細胞是解決治療性克隆安全問題的重要前提。DNA甲基化修飾在基因表達和印跡基因的表達中起非常重要的作用，兩步法克隆可能存在的不完全重編程問題很可能存在于印
甲基化研究新思路
????????組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向，然而傳統甲基化研究一般分四步走：尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制，上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士
甲基化研究新套路
組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向，然而傳統甲基化研究一般分四步走：尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。 為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制，上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士課
甲基化研究新套路
組蛋白甲基化研究與表觀調控是腫瘤機制研究中的重要方向，然而傳統甲基化研究一般分四步走：尋找甲基化位點、分析甲基化位點與生物表型相關性、驗證甲基化調控靶基因表達量變化、構建轉錄層面調控機制。 為更深入探索表觀調控與臨床現象間的具體機制，上海華盈生物合作伙伴——華中科技大學同濟醫院馬丁院士課
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通過海綿機制結合microRNA發揮生物學功能，這個ceRNA機制已經讓大家心生厭倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能輕松的變廢為寶，竟然能讓lncRNA的ceRNA思路變得瞬間高大上發表10分以上的文章，你一定和小編我一樣很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作為最新的國自然熱點受到
研究首次揭示DNA主動去甲基化可靶向病毒基因
βC1在體外和體內增強DME活性。中國農科院植保所供圖 近日，中國農業科學院植物保護研究所作物病原生物功能基因組研究創新團隊聯合清華大學生命科學學院，首次發現植物病毒可以利用植物的DNA主動去甲基化機制來逃逸植物的防御反應，相關研究結果在線發表于《自然—通訊》（Nature Communicati
羅氏甲基化捕獲試劑創新甲基化研究方法
自2004年美國批準Vidaza (azacitidine)可用于血液疾病( 如MDS)的治療以來，通過改變致病基因的表觀遺傳學特征進行疾病治療的方法，為人們帶來了疾病的新治療策略。然而，由于表觀遺傳檢測方法的局限，要確定基因的堿基在何處以何種程度被甲基化一直以來困擾著研究者，從而難以確定基
RNA甲基化研究深度剖析
一、聽說最近 RNA甲基化很火，它是何方神圣？ 1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達 17 篇。
基因組所等RNA甲基化表觀轉錄組學研究獲進展
2014年1月，中國科學院北京基因組研究所基因組變異與精準生物醫學實驗室“百人計劃”研究員楊運桂研究組，與中國科學院動物研究所“百人計劃”研究員劉峰研究組合作開展的“m6A甲基轉移酶復合物鑒定”研究，發現了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
研究發現TNFα會刺激炎癥基因響應，誘發DNA主動去甲基化
近期，中國科學院生物物理研究所生物大分子國家重點實驗室研究員朱冰課題組在eLife上，在線發表題為Sustained TNF-α stimulation leads to transcriptional memory that greatly enhances signal sensitivit
基因甲基化缺失是致癌重要成因
人體每個細胞都含有完整的DNA基因，其不僅含有人體所有遺傳信息，而且基因中的所謂甲基基團是人體組織的必要成分。德國耶拿人體老化研究所研究人員首次證實，DNA出錯并甲基化缺失是導致癌癥的一個重要成因。這項研究結果刊登在最新出版的《自然》雜志上。 人體每個組織由特定屬性的組織特異細胞構成。基因選擇
棉花“甲基化基因圖譜”首次繪成
30日出版的《基因組生物學》雜志刊登了中美科學家合作的一項重要研究成果：他們首次繪制出棉花表觀遺傳基因的“甲基化基因圖譜”，即野生棉和種植棉之間500多種表觀遺傳基因的差異，為生物技術公司通過表觀修飾育種培育出高產優質棉花提供了重要線索。 幾十年來，科學家們發現，許多動植物的表觀特征，既可用基
基因甲基化缺失是致癌重要成因
人體每個細胞都含有完整的DNA基因，其不僅含有人體所有遺傳信息，而且基因中的所謂甲基基團是人體組織的必要成分。德國耶拿人體老化研究所研究人員首次證實，DNA出錯并甲基化缺失是導致癌癥的一個重要成因。這項研究結果刊登在最新出版的《自然》雜志上。人體每個細胞都含有完整的DNA基因，其不僅含有人體所有遺傳
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術，如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等，已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化，它是在擴增片段長度多態性技術的基
基因甲基化缺失是致癌重要成因
人體每個細胞都含有完整的DNA基因，其不僅含有人體所有遺傳信息，而且基因中的所謂甲基基團是人體組織的必要成分。德國耶拿人體老化研究所研究人員首次證實，DNA出錯并甲基化缺失是導致癌癥的一個重要成因。這項研究結果刊登在最新出版的《自然》雜志上。 人體每個細胞都含有完整的DNA基因，其不僅含有
基因甲基化缺失是致癌重要成因
人體每個細胞都含有完整的DNA基因，其不僅含有人體所有遺傳信息，而且基因中的所謂甲基基團是人體組織的必要成分。德國耶拿人體老化研究所研究人員首次證實，DNA出錯并甲基化缺失是導致癌癥的一個重要成因。這項研究結果刊登在最新出版的《自然》雜志上。 人體每個細胞都含有完整的DNA基因，其不僅含有
線粒體DNA甲基化研究進展
DNA 甲基化是表觀遺傳修飾的重要方式之一. 線粒體是真核細胞內的關鍵細胞器, 線粒體DNA(mtDNA)編碼部分線粒體基因, 其 mtDNA 的甲基化修飾可能引起所編碼基因的異常表達, 從而參與調節生理和病理過程. 近期來自西安交通大學生命科學與技術學院的研究人員就目前 mtDNA 甲基化及其
RNA甲基化研究深度剖析（一）
一、聽說最近?RNA甲基化很火，它是何方神圣？1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點，RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一，亮點文章頻出，著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的，就有高達?17?篇。 圖：RNA甲基化近期高
“RNA－甲基化”研究匯總——擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature，Science，Cell等高分期刊上頻頻亮相，并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者，許多學者將它作為研究對象，并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合，證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育
Cell：染色體水平油松基因組組裝和甲基化研究取得進展
近期，北京林業大學生物科學與技術學院聯合安諾優達在國際知名期刊Cell（IF：41.582）在線發表了題為“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章，研究者對油松進行了
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定，但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來，科學家們開發出多種新方法，試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說，全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組，但它還是面臨技
甲基化的基因組直接測序法
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
揭示DNA甲基化與基因沉默的關系
DNA 甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關，但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen團隊在Science 在線發表題為“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
組蛋白甲基化修飾研究再獲突破
日前，復旦大學徐彥輝課題組在組蛋白甲基化修飾研究領域獲得新進展，相關成果發布在《分子細胞》上，該項研究得到了國家自然科學基金面上項目的資助。 組蛋白甲基化修飾是一種非常重要的表觀遺傳修飾，參與調節異染色質形成、X染色體失活、基因印記及DNA的損傷修復等多種生命過程。關于組蛋白去甲基化酶的研究是
最新DNA甲基化測序技術比較研究
在不同疾病中，DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具體模式通常與諸如疾病亞型、疾病預后以及藥物反應等臨床信息具有一一對應的聯系。在多種癌癥的治療過程中，DNA甲基化生物標志物可以幫助臨床醫生選擇恰當的治療方式。 對于擁有成千上萬個樣本的大量病人來說，全基因組映射與DNA甲基化分析是非常合
甲基化領域重要研究成果解讀！
本文中，小編整理了近年來科學家們在甲基化研究領域取得的重要研究成果，與大家一起學習！ 【1】Science：重大進展！揭示DNA甲基化增強基因轉錄機制 doi：10.1126/science.aar7854 DNA甲基化（DNA methylation）為DNA化學修飾的一種形式，能夠在不