如何實現單細胞ATACseq測序？Sanger研究所提出強大新工具
時至今日，我們體內許多細胞類型的工作方式，科學家們依然不清楚，比如對于保護機體不會患上嚴重疾病的免疫細胞。 DNA染色質的內部組織影響了每個細胞的功能，包括基因表達、DNA復制和DNA修復在內的一些基本的細胞過程。很久以前，人們就注意到易接近的染色質標記了一些調控序列，如啟動子、增強子、絕緣子和位點控制區域。這些元件與細胞類型特異性的轉錄因子互作，執行了一些指導細胞命運決定和發育的轉錄程序。 但是要了解“染色質可接近性”并不容易，ATAC-seq可以通過使用高通量測序對染色質可接近性核染色質區域進行分析，然而由于技術問題，在單細胞水平（scATAC-seq）進行的研究很少。 來自Sanger研究院的一組研究人員提出了一種簡單而強大的scATACseq新方法，可以觀測器官和組織內的微小單細胞。 這一研究成果公布在Nature Communications雜志上，由Sanger研究院發Kedar Nath Nataraj......閱讀全文
如何實現單細胞ATACseq測序？Sanger研究所提出強大新工具
時至今日，我們體內許多細胞類型的工作方式，科學家們依然不清楚，比如對于保護機體不會患上嚴重疾病的免疫細胞。 DNA染色質的內部組織影響了每個細胞的功能，包括基因表達、DNA復制和DNA修復在內的一些基本的細胞過程。很久以前，人們就注意到易接近的染色質標記了一些調控序列，如啟動子、增強子、絕緣子
單細胞測序需要準備什么再去測序
DNA測序的測序原理： DNA測序是指分析特定DNA片段的堿基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）與鳥嘌呤的（G）排列方式。快速的DNA測序方法的出現極大地推動了生物學和醫學的研究和發現。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
Nature：單細胞測序（上）
Nicholas Navin所需要的就只是一個細胞――問題是如何得到它。這是在2010年，冷泉港實驗室的博士后研究員正在探究驅動乳腺癌的遺傳改變。此前的大部分癌癥基因組研究都是碾碎少量的腫瘤組織，一并將這些DNA進行測序，生成的是一張癌癥基因組的一致圖像。但Navin想要解析來自單個細胞的序
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。
單細胞測序方法匯總
單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題，而且-前沿的領域就是單細胞RNA測序了（scRNA-seq）。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序，并給出平均差異，但并沒有兩個細胞是完全一樣的，而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變，甚至這種技術還能夠闡明完整
Nature：單細胞測序（下）
隨著技術的飛速發展，成本大大降低，使得基因組測序成為常規技術。然而，大多數的人類基因組、癌癥或其他仍然是通過從多個細胞中抽提DNA來進行測序，它所忽略的細胞間的差異對于控制基因表達、細胞行為和藥物反應卻有可能是至關重要的。 該研究小組也觀測了其他類型的乳腺癌。將腫瘤作為一個整體測序，研究小
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
如何－解讀－單細胞－測序
單細胞測序是指DNA研究中涉及測序單細胞微生物相對簡單的基因組，更大更復雜的人類細胞基因組。簡介編輯細胞是生物學的基本單位，研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降，破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變為現實。
Namocell單細胞分離儀應用——單細胞測序
2018年11月，Namocell與CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在單細胞測序領域做出了新的嘗試。CZ-Biohub利用Namocell單細胞分離儀分選出目的B細胞，并且將其進行單細胞測序，為抗體新藥的發現邁出了重要一步。單細胞RNA測序（scRNA-s
Nat－Comm|－張強鋒組利用人工智能算法分析單細胞ATACseq數據
近年來，深度學習等人工智能技術在圖像識別，自然語言處理等領域取得了令人矚目的成就。人工智能技術應用于生命科學，對生物信息多個領域產生了重大的影響。深度學習算法借助于生命科學大數據的飛速發展，從海量大數據中自動高效地提取特征進行學習，極大超越了依賴人工提取特征的傳統人工智能算法，在醫療圖像處理、結
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
單細胞測序和轉錄組測序的區別
單細胞測序不同于傳統的高通量測序，它是對于一個細胞群中的某一個細胞進行測序分析。單細胞轉錄組測序就是對單個細胞轉錄組水平進行測序，它的優勢是準確地分析每一個細胞的基因表達，能準確區分細胞群體，并進行細胞分類間比較，以及能找到稀有的細胞的表達情況。
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序，有效降低了測序成本，提高了測序深度，能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
靶向深度測序和單細胞基因測序的區別
1、目標序列靶向測序是一種對感興趣的基因組區域進行富集測序的研究策略。目標區域測序的主要優勢在于可針對特定區域進行測序，有效降低了測序成本，提高了測序深度，能夠更為經濟有效地研究特定區域的遺傳變異。2 單細胞測序是指單個細胞水平上對基因組進行測序。3、靶向測序步驟為 樣品準備、探針/引物設計、目標序
如何讓單細胞測序變得簡單？
單細胞生物學研究一直是當今的熱門話題，而且最前沿的領域就是單細胞RNA測序了（scRNA-seq）。常規RNA測序方法一次性能夠對成千上萬個細胞進行加工測序，并給出平均差異，但并沒有兩個細胞是完全一樣的，而新型的scRNA-seq方法就能夠揭示出制造每一種特異性的微小改變，甚至這種技術還能夠闡明完整
！單細胞測序的”CPU－2.0”時代
對單個人類細胞的基因組進行準確的變異檢測和大范圍單倍體型分析一直以來都是測序領域的巔峰挑戰。單細胞測序使我們能在更高的分辨率下研究生命的機制。一方面，在像癌癥這樣的組織樣本中存在大量具有不同基因組類型的單個細胞,因此需要分析單細胞水平基因組而不是大量細胞的平均值；另一方面，對于非常珍貴的細胞樣品
Fluidigm推出單細胞TCR測序產品
解析細胞表型是免疫學中一個共同的單細胞分析目標。然而，T細胞受體V(D)J基因區域的隨機重排帶來了T細胞群體的復雜變化。這形成了龐大的T細胞部隊，以便識別特定的外源蛋白，引發有效的免疫反應。 為了在單細胞水平實現深度的T細胞分析，Fluidigm近日在C1?系統上推出了一個全新的免疫學應用 –
漫談單細胞測序及其臨床應用
一、概述隨著現代生物學的發展，細胞群體的研究已不再能滿足科研需求。單細胞測序解決了用組織樣本測序或樣本少時無法解決的細胞異質性難題，為科學家研究解析單個細胞的行為、機制、與機體的關系等提供了新方向。單細胞測序正在成為科研熱點。二、單細胞測序倍受青睞的原因人們最初以為一個細胞類群是均質的（即各細胞都是
單細胞分離對單細胞測序領域有著很大的幫助
單細胞分離可以采用特制的毛細管在載玻片的瓊脂涂層上選取單孢子并切割下來，然后移到合適的培養基進行培養，分離法對操作技術有比較高的要求，多限于高度專業化的科學研究中采用。 它不僅僅可以用于分離單細胞，還可以用于nl級別試劑的分配和磁珠的分選，對于單細胞測序領域有著很大的幫助。快速高效接種單個活細胞
Namocell單細胞分離儀在單細胞測序領域的應用
9月26至27日2019年細胞產業大會暨2019第四屆（上海）細胞與腫瘤醫療高峰論壇在上海新南雅酒店舉行。本屆會議，邀請了全國30位專家學者、人物演講、40家企業參展，400余人報名參會，逾500人參加了會議，就細胞儲存、細胞治療、細胞培養、細胞工程、細胞銀行、細胞能量與代謝、細胞免疫學、細胞生理學
單細胞分離儀在單細胞測序領域有著很大的幫助
???單細胞分離儀可以實現從微孔芯片轉移單細胞到細胞收集管中。單細胞轉移分離系統集單細胞成像，單細胞隔離，單細胞選擇功能于一體，自動聚焦成像。? ? 轉移單細胞到微管，PCR微孔板或其它反應微管中，在隔離單細胞后，它可以對選定收集的細胞進行掃描并成像，采用倒置熒光顯微鏡，配備自動掃描顯微鏡載物臺，自
Science：單細胞分析？并行測序技術可以
近日，一項發表于國際雜志Science上的研究論文中，來自美國的研究者描述了一種新型的大規模并行技術，通過利用新一代測序技術來在單細胞水平上實現對基因表達的監測；研究者表示，單細胞分析對于理解人類造血系統的必要性及重要性不斷凸顯，如果沒有這種分析的話，來自少許細胞的大量表達改變就和來自許多細胞的
《細胞》：單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章，首次公布了來自一個成人男子91個
《自然—方法學》年度方法：單細胞測序
2014年1月《自然—方法學》(Nature Methods)上發表年度特別報道，將“單細胞測序”(Singled out for sequencing)的應用列為2013年度最重要的方法學進展。 近幾年來，基于單細胞測序技術的科學研究取得了突飛猛進的發展，其成果有望為一些重
Nature－methods發布單細胞測序新技術
來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員，在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術，可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。 資深作者Ri
Nature新技術：CRISPR+單細胞測序=？
CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因組編輯技術是生物研究和新型靶向藥物研發的有力工具。比如利用CRISPR篩選基因（pooled CRISPR screens），可以通過CRISPR gRNAs靶向成百上千個不同的基因，同時編輯許多細胞，然后實驗篩選編輯細胞，gRNA可以幫助確定哪些基因對于生物
新的基因組工具組合或可梳理疾病的因果關系
近日，奧地利科學院分子醫學研究中心（CeMM）的研究人員Christoph Bock在基因組生物學會議上發言稱，新的基因組工具組合可以幫助研究人員梳理疾病的因果關系。 他認為，單細胞RNA-seq和ATAC-seq等方法可以幫助人們深入了解疾病發展過程中發生的情況，但它們無法建立因果關系。Bo